MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016822	CGG	2	6	313464	313469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176880
5502	NC_016822	CA	3	6	313503	313508	50 %	0 %	0 %	50 %	383176880
5503	NC_016822	CG	3	6	313518	313523	0 %	0 %	50 %	50 %	383176880
5504	NC_016822	TAAA	2	8	313594	313601	75 %	25 %	0 %	0 %	383176880
5505	NC_016822	GCA	2	6	314404	314409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176881
5506	NC_016822	TAA	2	6	314418	314423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176881
5507	NC_016822	AG	4	8	314489	314496	50 %	0 %	50 %	0 %	383176881
5508	NC_016822	GAA	2	6	314500	314505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176881
5509	NC_016822	AG	3	6	314536	314541	50 %	0 %	50 %	0 %	383176881
5510	NC_016822	ACGA	2	8	316178	316185	50 %	0 %	25 %	25 %	383176882
5511	NC_016822	CCAT	2	8	316202	316209	25 %	25 %	0 %	50 %	383176882
5512	NC_016822	AC	3	6	316213	316218	50 %	0 %	0 %	50 %	383176882
5513	NC_016822	GACT	2	8	316238	316245	25 %	25 %	25 %	25 %	383176882
5514	NC_016822	ATGCTG	2	12	316249	316260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383176882
5515	NC_016822	CTG	2	6	316299	316304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176882
5516	NC_016822	CTG	2	6	316489	316494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176882
5517	NC_016822	CGC	2	6	316546	316551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176882
5518	NC_016822	TG	3	6	316572	316577	0 %	50 %	50 %	0 %	383176882
5519	NC_016822	GCA	2	6	316633	316638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176882
5520	NC_016822	ATGAAG	2	12	316685	316696	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383176882
5521	NC_016822	GGT	2	6	316758	316763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176882
5522	NC_016822	TG	3	6	316831	316836	0 %	50 %	50 %	0 %	383176882
5523	NC_016822	GGC	2	6	316837	316842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176882
5524	NC_016822	TCA	2	6	316865	316870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176882
5525	NC_016822	CTG	2	6	316873	316878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176882
5526	NC_016822	GCTG	2	8	316967	316974	0 %	25 %	50 %	25 %	383176882
5527	NC_016822	GGCA	2	8	317048	317055	25 %	0 %	50 %	25 %	383176882
5528	NC_016822	ATC	2	6	317078	317083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176882
5529	NC_016822	A	6	6	317110	317115	100 %	0 %	0 %	0 %	383176882
5530	NC_016822	CCT	2	6	317458	317463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176883
5531	NC_016822	GTG	2	6	317481	317486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176883
5532	NC_016822	A	6	6	317684	317689	100 %	0 %	0 %	0 %	383176883
5533	NC_016822	GCTG	2	8	317796	317803	0 %	25 %	50 %	25 %	383176884
5534	NC_016822	GTT	2	6	317834	317839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176884
5535	NC_016822	CTG	2	6	317891	317896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176884
5536	NC_016822	GTG	2	6	317909	317914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176884
5537	NC_016822	TGGC	2	8	317929	317936	0 %	25 %	50 %	25 %	383176884
5538	NC_016822	GCA	2	6	318025	318030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176884
5539	NC_016822	CCT	2	6	318250	318255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176885
5540	NC_016822	GTG	2	6	318273	318278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176885
5541	NC_016822	A	6	6	318476	318481	100 %	0 %	0 %	0 %	383176885
5542	NC_016822	GCTG	2	8	318588	318595	0 %	25 %	50 %	25 %	383176886
5543	NC_016822	GTT	2	6	318626	318631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176886
5544	NC_016822	CTG	2	6	318683	318688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176886
5545	NC_016822	GTG	2	6	318701	318706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176886
5546	NC_016822	TGGC	2	8	318721	318728	0 %	25 %	50 %	25 %	383176886
5547	NC_016822	GCA	2	6	318817	318822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176886
5548	NC_016822	GCA	2	6	318996	319001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176887
5549	NC_016822	AGGCA	2	10	319009	319018	40 %	0 %	40 %	20 %	383176887
5550	NC_016822	CAA	2	6	319023	319028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176887
5551	NC_016822	AGC	2	6	319031	319036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176887
5552	NC_016822	TC	3	6	319100	319105	0 %	50 %	0 %	50 %	383176887
5553	NC_016822	AG	3	6	319140	319145	50 %	0 %	50 %	0 %	383176887
5554	NC_016822	ACA	2	6	319211	319216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176887
5555	NC_016822	CAA	2	6	319218	319223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176887
5556	NC_016822	GGA	2	6	319269	319274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383176887
5557	NC_016822	GCT	3	9	319323	319331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176887
5558	NC_016822	TGG	2	6	319424	319429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176887
5559	NC_016822	ACTT	2	8	319441	319448	25 %	50 %	0 %	25 %	383176887
5560	NC_016822	AAT	2	6	319449	319454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176887
5561	NC_016822	T	7	7	319681	319687	0 %	100 %	0 %	0 %	383176888
5562	NC_016822	AGC	2	6	319689	319694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176888
5563	NC_016822	TGA	2	6	319699	319704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176888
5564	NC_016822	GAC	2	6	319751	319756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176888
5565	NC_016822	TTA	2	6	319816	319821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176888
5566	NC_016822	CAGAC	2	10	319920	319929	40 %	0 %	20 %	40 %	383176888
5567	NC_016822	GTG	2	6	319983	319988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176888
5568	NC_016822	TG	3	6	320137	320142	0 %	50 %	50 %	0 %	383176888
5569	NC_016822	CAG	2	6	320205	320210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176888
5570	NC_016822	GAT	2	6	320325	320330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176888
5571	NC_016822	GCC	2	6	320357	320362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176888
5572	NC_016822	T	7	7	320585	320591	0 %	100 %	0 %	0 %	383176889
5573	NC_016822	AT	3	6	320593	320598	50 %	50 %	0 %	0 %	383176889
5574	NC_016822	GGC	2	6	320699	320704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176889
5575	NC_016822	ATT	2	6	320841	320846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176889
5576	NC_016822	AATG	2	8	320913	320920	50 %	25 %	25 %	0 %	383176890
5577	NC_016822	CTG	2	6	320966	320971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176890
5578	NC_016822	GTC	2	6	321035	321040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176890
5579	NC_016822	GAC	2	6	321055	321060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176890
5580	NC_016822	CTC	2	6	321061	321066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176890
5581	NC_016822	AG	3	6	321097	321102	50 %	0 %	50 %	0 %	383176890
5582	NC_016822	GCC	2	6	321130	321135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176890
5583	NC_016822	GAT	2	6	321250	321255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176891
5584	NC_016822	CA	3	6	321292	321297	50 %	0 %	0 %	50 %	383176891
5585	NC_016822	CAG	2	6	321317	321322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176891
5586	NC_016822	AGC	2	6	321373	321378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176891
5587	NC_016822	AGGA	2	8	321411	321418	50 %	0 %	50 %	0 %	383176891
5588	NC_016822	CTG	2	6	321426	321431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176891
5589	NC_016822	CGC	2	6	321433	321438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176891
5590	NC_016822	GTT	2	6	321449	321454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176891
5591	NC_016822	TGC	2	6	321469	321474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176891
5592	NC_016822	CTC	2	6	321536	321541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176891
5593	NC_016822	AAG	2	6	321543	321548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176891
5594	NC_016822	A	6	6	321568	321573	100 %	0 %	0 %	0 %	383176891
5595	NC_016822	TGGA	2	8	321685	321692	25 %	25 %	50 %	0 %	383176892
5596	NC_016822	GCC	2	6	321695	321700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176892
5597	NC_016822	GTC	2	6	321704	321709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5598	NC_016822	TGA	2	6	321714	321719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176892
5599	NC_016822	TCG	2	6	321777	321782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5600	NC_016822	GCT	2	6	321792	321797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5601	NC_016822	CTG	2	6	321893	321898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5602	NC_016822	GAAA	2	8	321939	321946	75 %	0 %	25 %	0 %	383176892
5603	NC_016822	CTG	2	6	321981	321986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5604	NC_016822	GA	4	8	321995	322002	50 %	0 %	50 %	0 %	383176892
5605	NC_016822	CTG	2	6	322026	322031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5606	NC_016822	GCACT	2	10	322042	322051	20 %	20 %	20 %	40 %	383176892
5607	NC_016822	CGG	2	6	322065	322070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176892
5608	NC_016822	CGC	2	6	322117	322122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176892
5609	NC_016822	CGT	2	6	322139	322144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5610	NC_016822	AGTGG	2	10	322149	322158	20 %	20 %	60 %	0 %	383176892
5611	NC_016822	GAA	2	6	322230	322235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176892
5612	NC_016822	CGG	2	6	322238	322243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176892
5613	NC_016822	AG	3	6	322272	322277	50 %	0 %	50 %	0 %	383176892
5614	NC_016822	GCA	2	6	322339	322344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176892
5615	NC_016822	TCGC	2	8	322407	322414	0 %	25 %	25 %	50 %	383176892
5616	NC_016822	GAT	2	6	322778	322783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176893
5617	NC_016822	CAGT	2	8	322827	322834	25 %	25 %	25 %	25 %	383176893
5618	NC_016822	TTAT	2	8	322956	322963	25 %	75 %	0 %	0 %	383176893
5619	NC_016822	GCA	3	9	323007	323015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176893
5620	NC_016822	CAT	2	6	323026	323031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176893
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5622	NC_016822	TATT	2	8	323064	323071	25 %	75 %	0 %	0 %	383176893
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5988	NC_016822	GCCA	2	8	344481	344488	25 %	0 %	25 %	50 %	383176911
5989	NC_016822	CAG	2	6	344491	344496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176911
5990	NC_016822	GCG	2	6	344502	344507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176911
5991	NC_016822	AAT	2	6	344530	344535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176911
5992	NC_016822	CCG	2	6	344568	344573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176911
5993	NC_016822	CGA	2	6	344599	344604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176911
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5997	NC_016822	TATT	2	8	345004	345011	25 %	75 %	0 %	0 %	383176912
5998	NC_016822	TAA	2	6	345171	345176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176912
5999	NC_016822	T	6	6	345201	345206	0 %	100 %	0 %	0 %	383176912
6000	NC_016822	GAT	2	6	345223	345228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176912

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