MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016822	GCG	2	6	282713	282718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176843
5002	NC_016822	TGGA	2	8	282774	282781	25 %	25 %	50 %	0 %	383176843
5003	NC_016822	ATG	2	6	282832	282837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176844
5004	NC_016822	TGAA	2	8	282896	282903	50 %	25 %	25 %	0 %	383176844
5005	NC_016822	TG	3	6	282905	282910	0 %	50 %	50 %	0 %	383176844
5006	NC_016822	ATAG	2	8	282913	282920	50 %	25 %	25 %	0 %	383176844
5007	NC_016822	TAAT	2	8	282938	282945	50 %	50 %	0 %	0 %	383176844
5008	NC_016822	AAGG	2	8	282982	282989	50 %	0 %	50 %	0 %	383176844
5009	NC_016822	GTG	3	9	283015	283023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176844
5010	NC_016822	AGAAA	2	10	283084	283093	80 %	0 %	20 %	0 %	383176844
5011	NC_016822	G	7	7	283112	283118	0 %	0 %	100 %	0 %	383176844
5012	NC_016822	TAA	3	9	283137	283145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176844
5013	NC_016822	ATTT	2	8	283153	283160	25 %	75 %	0 %	0 %	383176844
5014	NC_016822	GT	3	6	283201	283206	0 %	50 %	50 %	0 %	383176844
5015	NC_016822	A	7	7	283211	283217	100 %	0 %	0 %	0 %	383176844
5016	NC_016822	A	6	6	283237	283242	100 %	0 %	0 %	0 %	383176844
5017	NC_016822	A	6	6	283262	283267	100 %	0 %	0 %	0 %	383176844
5018	NC_016822	A	6	6	283552	283557	100 %	0 %	0 %	0 %	383176845
5019	NC_016822	TAT	2	6	283575	283580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176845
5020	NC_016822	T	6	6	283710	283715	0 %	100 %	0 %	0 %	383176845
5021	NC_016822	TTA	2	6	283811	283816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176845
5022	NC_016822	TTC	2	6	283836	283841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176846
5023	NC_016822	GAT	2	6	283843	283848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176846
5024	NC_016822	CGC	2	6	283903	283908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176846
5025	NC_016822	CAA	2	6	283940	283945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176846
5026	NC_016822	CTT	2	6	284014	284019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176846
5027	NC_016822	ATC	2	6	284044	284049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176846
5028	NC_016822	AGA	2	6	284087	284092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176846
5029	NC_016822	ATT	2	6	284111	284116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176846
5030	NC_016822	TAAA	2	8	284147	284154	75 %	25 %	0 %	0 %	383176846
5031	NC_016822	AAT	2	6	284188	284193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176846
5032	NC_016822	AGA	2	6	284238	284243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176846
5033	NC_016822	TGA	2	6	284274	284279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176846
5034	NC_016822	GAA	2	6	284313	284318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176846
5035	NC_016822	AAT	2	6	284346	284351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176846
5036	NC_016822	AAAG	2	8	284361	284368	75 %	0 %	25 %	0 %	383176846
5037	NC_016822	CTG	2	6	284402	284407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176846
5038	NC_016822	AATG	2	8	284490	284497	50 %	25 %	25 %	0 %	383176846
5039	NC_016822	GAC	2	6	284500	284505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176846
5040	NC_016822	AAG	2	6	284514	284519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176846
5041	NC_016822	CGC	2	6	284526	284531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176846
5042	NC_016822	ATT	2	6	284535	284540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176846
5043	NC_016822	AGC	2	6	284622	284627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176846
5044	NC_016822	T	7	7	284835	284841	0 %	100 %	0 %	0 %	383176847
5045	NC_016822	AGC	2	6	284843	284848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176847
5046	NC_016822	TGA	2	6	284853	284858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176847
5047	NC_016822	GAC	2	6	284905	284910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176847
5048	NC_016822	TTA	2	6	284970	284975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176847
5049	NC_016822	GTG	2	6	285137	285142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176847
5050	NC_016822	TG	3	6	285291	285296	0 %	50 %	50 %	0 %	383176847
5051	NC_016822	CAG	2	6	285359	285364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176847
5052	NC_016822	GAT	2	6	285479	285484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176847
5053	NC_016822	GCC	2	6	285511	285516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176847
5054	NC_016822	T	7	7	285739	285745	0 %	100 %	0 %	0 %	383176848
5055	NC_016822	AT	3	6	285747	285752	50 %	50 %	0 %	0 %	383176848
5056	NC_016822	GGC	2	6	285853	285858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176848
5057	NC_016822	ATT	2	6	285995	286000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176848
5058	NC_016822	GCA	2	6	286079	286084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176849
5059	NC_016822	CAG	2	6	286204	286209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176849
5060	NC_016822	TGG	2	6	286247	286252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176849
5061	NC_016822	TTGG	2	8	286301	286308	0 %	50 %	50 %	0 %	383176849
5062	NC_016822	AGC	3	9	286340	286348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176849
5063	NC_016822	TTC	2	6	286357	286362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176849
5064	NC_016822	AT	3	6	286402	286407	50 %	50 %	0 %	0 %	383176850
5065	NC_016822	TA	3	6	286415	286420	50 %	50 %	0 %	0 %	383176850
5066	NC_016822	A	6	6	286422	286427	100 %	0 %	0 %	0 %	383176850
5067	NC_016822	CAT	2	6	286431	286436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176850
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5070	NC_016822	TC	3	6	286515	286520	0 %	50 %	0 %	50 %	383176850
5071	NC_016822	A	6	6	286540	286545	100 %	0 %	0 %	0 %	383176850
5072	NC_016822	A	6	6	286575	286580	100 %	0 %	0 %	0 %	383176850
5073	NC_016822	ATGGT	2	10	286599	286608	20 %	40 %	40 %	0 %	383176850
5074	NC_016822	TGA	3	9	286615	286623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176850
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5078	NC_016822	TTA	2	6	287508	287513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176851
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5080	NC_016822	GAT	2	6	287540	287545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176851
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5083	NC_016822	CTT	2	6	287711	287716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176851
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5089	NC_016822	AGA	2	6	287935	287940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176851
5090	NC_016822	TGA	2	6	287971	287976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176851
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5092	NC_016822	ATA	2	6	288044	288049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176851
5093	NC_016822	AAAG	2	8	288058	288065	75 %	0 %	25 %	0 %	383176851
5094	NC_016822	CTG	2	6	288099	288104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176851
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5096	NC_016822	GAC	2	6	288197	288202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176851
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5103	NC_016822	TGCC	2	8	288664	288671	0 %	25 %	25 %	50 %	383176852
5104	NC_016822	AG	3	6	288677	288682	50 %	0 %	50 %	0 %	383176852
5105	NC_016822	GCC	2	6	288889	288894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176852
5106	NC_016822	CTGC	2	8	288950	288957	0 %	25 %	25 %	50 %	383176852
5107	NC_016822	CTG	2	6	288973	288978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176852
5108	NC_016822	CGA	2	6	289021	289026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176852
5109	NC_016822	CCAT	2	8	289136	289143	25 %	25 %	0 %	50 %	383176852
5110	NC_016822	TGC	2	6	289157	289162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176852
5111	NC_016822	ATG	2	6	289366	289371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176853
5112	NC_016822	CGC	2	6	289392	289397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176853
5113	NC_016822	CCA	2	6	289409	289414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176853
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5117	NC_016822	CTGC	2	8	289507	289514	0 %	25 %	25 %	50 %	383176853
5118	NC_016822	TGA	2	6	289520	289525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176853
5119	NC_016822	GAT	2	6	289567	289572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176853
5120	NC_016822	TGA	2	6	289583	289588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176853
5121	NC_016822	TGA	2	6	289680	289685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176853
5122	NC_016822	AAT	2	6	289811	289816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176853
5123	NC_016822	TCG	2	6	289905	289910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176854
5124	NC_016822	TCA	2	6	289931	289936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176854
5125	NC_016822	TTC	2	6	289960	289965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176854
5126	NC_016822	ATCA	2	8	289996	290003	50 %	25 %	0 %	25 %	383176854
5127	NC_016822	TGA	2	6	290084	290089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176854
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5153	NC_016822	CGA	2	6	291323	291328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176854
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5194	NC_016822	GCT	2	6	293934	293939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176856
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5206	NC_016822	CTG	2	6	294731	294736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176857
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5216	NC_016822	CG	3	6	295374	295379	0 %	0 %	50 %	50 %	383176859
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5224	NC_016822	TTGCT	2	10	295756	295765	0 %	60 %	20 %	20 %	383176860
5225	NC_016822	TTC	2	6	295773	295778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176860
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5229	NC_016822	A	6	6	295879	295884	100 %	0 %	0 %	0 %	383176861
5230	NC_016822	AAC	2	6	296026	296031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176861
5231	NC_016822	AGC	2	6	296041	296046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176861
5232	NC_016822	AGC	3	9	296090	296098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176861
5233	NC_016822	GGC	2	6	296119	296124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176861
5234	NC_016822	T	6	6	296162	296167	0 %	100 %	0 %	0 %	383176861
5235	NC_016822	ACA	2	6	296174	296179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176861
5236	NC_016822	T	6	6	296415	296420	0 %	100 %	0 %	0 %	383176861
5237	NC_016822	GC	3	6	296423	296428	0 %	0 %	50 %	50 %	383176861
5238	NC_016822	TGC	2	6	296849	296854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176862
5239	NC_016822	GCCA	2	8	296943	296950	25 %	0 %	25 %	50 %	383176862
5240	NC_016822	CAC	2	6	296965	296970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176862
5241	NC_016822	CAG	2	6	296983	296988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176862
5242	NC_016822	CAA	2	6	297039	297044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176862
5243	NC_016822	CAGC	2	8	297076	297083	25 %	0 %	25 %	50 %	383176862
5244	NC_016822	T	6	6	297190	297195	0 %	100 %	0 %	0 %	383176862
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5361	NC_016822	AAG	2	6	305286	305291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176873
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5366	NC_016822	TCAG	2	8	305635	305642	25 %	25 %	25 %	25 %	383176873
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5371	NC_016822	TCAG	2	8	305903	305910	25 %	25 %	25 %	25 %	383176874
5372	NC_016822	T	6	6	306016	306021	0 %	100 %	0 %	0 %	383176874
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5375	NC_016822	GCCA	2	8	306172	306179	25 %	0 %	25 %	50 %	383176874
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5378	NC_016822	CAC	2	6	306280	306285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176874
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5393	NC_016822	GAC	2	6	307117	307122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176874
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5403	NC_016822	CGT	2	6	308018	308023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176875
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5421	NC_016822	TCGCG	2	10	308937	308946	0 %	20 %	40 %	40 %	383176876
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5470	NC_016822	GGC	2	6	311861	311866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176879
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5472	NC_016822	GCA	2	6	311934	311939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176879
5473	NC_016822	GTGAT	2	10	311955	311964	20 %	40 %	40 %	0 %	383176879
5474	NC_016822	GCC	2	6	312043	312048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176879
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5480	NC_016822	AAGC	2	8	312370	312377	50 %	0 %	25 %	25 %	383176880
5481	NC_016822	A	7	7	312410	312416	100 %	0 %	0 %	0 %	383176880
5482	NC_016822	A	6	6	312428	312433	100 %	0 %	0 %	0 %	383176880
5483	NC_016822	ATC	2	6	312463	312468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176880
5484	NC_016822	CG	3	6	312498	312503	0 %	0 %	50 %	50 %	383176880
5485	NC_016822	AGCGA	2	10	312517	312526	40 %	0 %	40 %	20 %	383176880
5486	NC_016822	CGA	2	6	312573	312578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176880
5487	NC_016822	GGC	2	6	312628	312633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176880
5488	NC_016822	CGT	2	6	312661	312666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176880
5489	NC_016822	GC	3	6	312703	312708	0 %	0 %	50 %	50 %	383176880
5490	NC_016822	TCGCT	2	10	312728	312737	0 %	40 %	20 %	40 %	383176880
5491	NC_016822	CGG	2	6	312848	312853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176880
5492	NC_016822	TGC	2	6	312902	312907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176880
5493	NC_016822	GTG	2	6	312941	312946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176880
5494	NC_016822	GGT	2	6	313000	313005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176880
5495	NC_016822	TGA	2	6	313029	313034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176880
5496	NC_016822	CAAA	2	8	313164	313171	75 %	0 %	0 %	25 %	383176880
5497	NC_016822	GCG	2	6	313181	313186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176880
5498	NC_016822	GCAG	2	8	313224	313231	25 %	0 %	50 %	25 %	383176880
5499	NC_016822	GGT	2	6	313242	313247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176880
5500	NC_016822	CA	3	6	313353	313358	50 %	0 %	0 %	50 %	383176880

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