MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 87040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016822	ATG	2	6	252731	252736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176821
4502	NC_016822	CTT	2	6	252750	252755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176821
4503	NC_016822	TGATC	2	10	252784	252793	20 %	40 %	20 %	20 %	383176821
4504	NC_016822	CTG	2	6	252844	252849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176821
4505	NC_016822	TC	3	6	252865	252870	0 %	50 %	0 %	50 %	383176821
4506	NC_016822	ATAA	2	8	252880	252887	75 %	25 %	0 %	0 %	383176821
4507	NC_016822	ATT	2	6	252924	252929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176822
4508	NC_016822	GCC	2	6	252950	252955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176822
4509	NC_016822	TTC	2	6	252971	252976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383176822
4510	NC_016822	AGC	3	9	252977	252985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176822
4511	NC_016822	TTCTGC	2	12	253043	253054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383176822
4512	NC_016822	CAT	2	6	253062	253067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176822
4513	NC_016822	CTGTTG	2	12	253288	253299	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383176822
4514	NC_016822	CAT	2	6	253333	253338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176822
4515	NC_016822	AAG	2	6	253378	253383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176822
4516	NC_016822	TTG	2	6	253384	253389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176822
4517	NC_016822	TGC	2	6	253438	253443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176822
4518	NC_016822	TGC	3	9	253475	253483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176822
4519	NC_016822	CCA	3	9	253498	253506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176822
4520	NC_016822	CAGG	2	8	253632	253639	25 %	0 %	50 %	25 %	383176822
4521	NC_016822	GCG	2	6	253724	253729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176822
4522	NC_016822	TGC	2	6	253775	253780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176822
4523	NC_016822	CG	3	6	253803	253808	0 %	0 %	50 %	50 %	383176822
4524	NC_016822	CTG	2	6	253828	253833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176822
4525	NC_016822	GCC	2	6	253972	253977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176822
4526	NC_016822	GCC	2	6	254015	254020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176822
4527	NC_016822	TGTCCG	2	12	254059	254070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176822
4528	NC_016822	TAG	2	6	254081	254086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176822
4529	NC_016822	GT	3	6	254093	254098	0 %	50 %	50 %	0 %	383176822
4530	NC_016822	CGCCAG	2	12	254125	254136	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383176822
4531	NC_016822	CCA	2	6	254142	254147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176822
4532	NC_016822	TGGC	2	8	254177	254184	0 %	25 %	50 %	25 %	383176822
4533	NC_016822	CG	3	6	254226	254231	0 %	0 %	50 %	50 %	383176822
4534	NC_016822	GCT	2	6	257860	257865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4535	NC_016822	CCA	2	6	257890	257895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176823
4536	NC_016822	AAC	2	6	257916	257921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176823
4537	NC_016822	CTG	3	9	257930	257938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4538	NC_016822	GCC	2	6	258045	258050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176823
4539	NC_016822	GCCA	2	8	258141	258148	25 %	0 %	25 %	50 %	383176823
4540	NC_016822	GT	3	6	258175	258180	0 %	50 %	50 %	0 %	383176823
4541	NC_016822	CAG	2	6	258191	258196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4542	NC_016822	CCAG	2	8	258310	258317	25 %	0 %	25 %	50 %	383176823
4543	NC_016822	CAG	2	6	258326	258331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4544	NC_016822	CTG	2	6	258347	258352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4545	NC_016822	CCA	2	6	258397	258402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176823
4546	NC_016822	CGG	2	6	258406	258411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176823
4547	NC_016822	GGC	2	6	258484	258489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176823
4548	NC_016822	GCC	2	6	258537	258542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176823
4549	NC_016822	GTC	2	6	258572	258577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4550	NC_016822	CGC	2	6	258625	258630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176823
4551	NC_016822	GGT	2	6	258644	258649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176823
4552	NC_016822	GCC	2	6	258669	258674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176823
4553	NC_016822	ACGC	2	8	258709	258716	25 %	0 %	25 %	50 %	383176823
4554	NC_016822	ATC	2	6	258734	258739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176823
4555	NC_016822	CGCTG	2	10	258819	258828	0 %	20 %	40 %	40 %	383176823
4556	NC_016822	GGC	2	6	258830	258835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176823
4557	NC_016822	A	6	6	258844	258849	100 %	0 %	0 %	0 %	383176823
4558	NC_016822	CTGG	2	8	258881	258888	0 %	25 %	50 %	25 %	383176823
4559	NC_016822	T	6	6	258896	258901	0 %	100 %	0 %	0 %	383176823
4560	NC_016822	GCG	2	6	258916	258921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176823
4561	NC_016822	CAG	2	6	258956	258961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4562	NC_016822	CAG	2	6	259016	259021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4563	NC_016822	CAG	2	6	259196	259201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176823
4564	NC_016822	GGCA	2	8	259265	259272	25 %	0 %	50 %	25 %	383176824
4565	NC_016822	CGG	2	6	259328	259333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176824
4566	NC_016822	TCA	2	6	259390	259395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176824
4567	NC_016822	CAG	2	6	259422	259427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176824
4568	NC_016822	GGT	2	6	259602	259607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176824
4569	NC_016822	CAC	2	6	259611	259616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383176824
4570	NC_016822	CAG	2	6	259647	259652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176824
4571	NC_016822	CAG	2	6	259767	259772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176824
4572	NC_016822	CCG	2	6	259812	259817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176824
4573	NC_016822	CGG	2	6	259854	259859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176824
4574	NC_016822	GTG	2	6	259864	259869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176824
4575	NC_016822	TCA	2	6	259937	259942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176824
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4577	NC_016822	GCC	2	6	260100	260105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176825
4578	NC_016822	CAG	3	9	260117	260125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176825
4579	NC_016822	GCG	2	6	260131	260136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176825
4580	NC_016822	CG	3	6	260186	260191	0 %	0 %	50 %	50 %	383176825
4581	NC_016822	CGTC	2	8	260212	260219	0 %	25 %	25 %	50 %	383176825
4582	NC_016822	GCA	2	6	260260	260265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176825
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4585	NC_016822	CAG	2	6	260354	260359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176825
4586	NC_016822	GAA	2	6	260369	260374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176825
4587	NC_016822	GAA	2	6	260465	260470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383176825
4588	NC_016822	GGC	2	6	260494	260499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176825
4589	NC_016822	TAC	2	6	260588	260593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176825
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4591	NC_016822	GT	3	6	260685	260690	0 %	50 %	50 %	0 %	383176825
4592	NC_016822	TGG	2	6	260716	260721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176825
4593	NC_016822	CCG	2	6	260736	260741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176825
4594	NC_016822	AGC	2	6	260745	260750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176825
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4596	NC_016822	GCCA	2	8	260795	260802	25 %	0 %	25 %	50 %	383176825
4597	NC_016822	GAC	2	6	260830	260835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176825
4598	NC_016822	TGA	2	6	260932	260937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176825
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4600	NC_016822	T	6	6	261008	261013	0 %	100 %	0 %	0 %	383176825
4601	NC_016822	GTT	2	6	261121	261126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383176825
4602	NC_016822	TCA	2	6	261138	261143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176825
4603	NC_016822	TAT	2	6	261160	261165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383176825
4604	NC_016822	CTCTGA	6	36	261170	261205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383176825
4605	NC_016822	TCC	2	6	261219	261224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383176825
4606	NC_016822	CTG	2	6	261278	261283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176825
4607	NC_016822	CTG	3	9	261314	261322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176825
4608	NC_016822	TCA	2	6	261363	261368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176825
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4611	NC_016822	CGG	2	6	261494	261499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176825
4612	NC_016822	CGA	2	6	261500	261505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176825
4613	NC_016822	GA	3	6	261576	261581	50 %	0 %	50 %	0 %	383176825
4614	NC_016822	CGCT	2	8	261585	261592	0 %	25 %	25 %	50 %	383176825
4615	NC_016822	TCA	3	9	261618	261626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176825
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4619	NC_016822	GGC	2	6	261737	261742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176825
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4621	NC_016822	GGT	2	6	261776	261781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383176825
4622	NC_016822	GGC	2	6	261782	261787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383176825
4623	NC_016822	CGC	2	6	261802	261807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176825
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4730	NC_016822	CCAGC	2	10	266772	266781	20 %	0 %	20 %	60 %	383176830
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4732	NC_016822	CCG	2	6	267307	267312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383176830
4733	NC_016822	CCAGG	2	10	267429	267438	20 %	0 %	40 %	40 %	383176830
4734	NC_016822	TAA	2	6	267448	267453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383176830
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4737	NC_016822	TCG	2	6	267604	267609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176830
4738	NC_016822	A	7	7	267675	267681	100 %	0 %	0 %	0 %	383176830
4739	NC_016822	TGC	2	6	267771	267776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383176830
4740	NC_016822	AGCC	2	8	267947	267954	25 %	0 %	25 %	50 %	383176831
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4742	NC_016822	GCCGT	2	10	268036	268045	0 %	20 %	40 %	40 %	383176831
4743	NC_016822	GAT	2	6	268051	268056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176831
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4850	NC_016822	A	6	6	275297	275302	100 %	0 %	0 %	0 %	383176839
4851	NC_016822	AAC	2	6	275308	275313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383176839
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4862	NC_016822	A	6	6	276209	276214	100 %	0 %	0 %	0 %	383176840
4863	NC_016822	TCA	2	6	276234	276239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176840
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4988	NC_016822	GCA	2	6	282175	282180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383176843
4989	NC_016822	ATG	2	6	282183	282188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383176843
4990	NC_016822	TAC	2	6	282203	282208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383176843
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