MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016814	GCC	2	6	115228	115233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775926
2002	NC_016814	CGC	2	6	115253	115258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775926
2003	NC_016814	GCG	2	6	115285	115290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775926
2004	NC_016814	GTC	3	9	115301	115309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775926
2005	NC_016814	GCC	2	6	115331	115336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775926
2006	NC_016814	TGA	2	6	115364	115369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775926
2007	NC_016814	GC	3	6	115372	115377	0 %	0 %	50 %	50 %	378775926
2008	NC_016814	TGC	2	6	115378	115383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775926
2009	NC_016814	CGC	2	6	115664	115669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775927
2010	NC_016814	GTC	2	6	115698	115703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775927
2011	NC_016814	GAC	2	6	115734	115739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775927
2012	NC_016814	CGA	2	6	115798	115803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775927
2013	NC_016814	GCT	2	6	115816	115821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775927
2014	NC_016814	GCC	2	6	115862	115867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775927
2015	NC_016814	GAAA	2	8	115925	115932	75 %	0 %	25 %	0 %	378775927
2016	NC_016814	TCG	2	6	116008	116013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775928
2017	NC_016814	TCAG	2	8	116014	116021	25 %	25 %	25 %	25 %	378775928
2018	NC_016814	TCG	2	6	116023	116028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775928
2019	NC_016814	TGC	2	6	116042	116047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775928
2020	NC_016814	TGC	2	6	116054	116059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775928
2021	NC_016814	GTC	2	6	116127	116132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775928
2022	NC_016814	TTC	2	6	116163	116168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775928
2023	NC_016814	GC	3	6	116179	116184	0 %	0 %	50 %	50 %	378775928
2024	NC_016814	CCGG	2	8	116186	116193	0 %	0 %	50 %	50 %	378775928
2025	NC_016814	GAT	2	6	116205	116210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775928
2026	NC_016814	GA	3	6	116245	116250	50 %	0 %	50 %	0 %	378775928
2027	NC_016814	GAA	2	6	116298	116303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775928
2028	NC_016814	CGC	2	6	116351	116356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775928
2029	NC_016814	GACGC	2	10	116509	116518	20 %	0 %	40 %	40 %	378775928
2030	NC_016814	GCC	2	6	116646	116651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775929
2031	NC_016814	CGGC	2	8	116659	116666	0 %	0 %	50 %	50 %	378775929
2032	NC_016814	CCG	2	6	116684	116689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775929
2033	NC_016814	CTTT	2	8	116739	116746	0 %	75 %	0 %	25 %	378775929
2034	NC_016814	TTTC	2	8	116753	116760	0 %	75 %	0 %	25 %	378775929
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2036	NC_016814	CGGG	2	8	116795	116802	0 %	0 %	75 %	25 %	378775929
2037	NC_016814	AGCG	2	8	116835	116842	25 %	0 %	50 %	25 %	378775929
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2042	NC_016814	GCG	2	6	117139	117144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775930
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2044	NC_016814	TGC	2	6	117237	117242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775930
2045	NC_016814	GC	3	6	117251	117256	0 %	0 %	50 %	50 %	378775930
2046	NC_016814	CGG	2	6	117289	117294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775930
2047	NC_016814	TCG	2	6	117339	117344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775930
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2050	NC_016814	GACGA	2	10	117437	117446	40 %	0 %	40 %	20 %	378775930
2051	NC_016814	GCCC	2	8	117491	117498	0 %	0 %	25 %	75 %	378775930
2052	NC_016814	CGC	2	6	117552	117557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775930
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2054	NC_016814	TGG	2	6	117607	117612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775930
2055	NC_016814	CGA	2	6	117615	117620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775930
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2057	NC_016814	GCA	3	9	117792	117800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775931
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2062	NC_016814	TGC	2	6	118030	118035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775931
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2069	NC_016814	TGGC	2	8	118398	118405	0 %	25 %	50 %	25 %	378775932
2070	NC_016814	GA	3	6	118421	118426	50 %	0 %	50 %	0 %	378775932
2071	NC_016814	CGA	2	6	118438	118443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775932
2072	NC_016814	GCG	2	6	118459	118464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775932
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2079	NC_016814	CTTG	2	8	118829	118836	0 %	50 %	25 %	25 %	378775933
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2087	NC_016814	GGC	3	9	119504	119512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775935
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2089	NC_016814	AATC	2	8	119558	119565	50 %	25 %	0 %	25 %	378775935
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2103	NC_016814	TGG	2	6	120178	120183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775935
2104	NC_016814	CGA	2	6	120274	120279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775935
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2106	NC_016814	CGT	2	6	120349	120354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775935
2107	NC_016814	GA	3	6	120510	120515	50 %	0 %	50 %	0 %	378775936
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2109	NC_016814	GC	4	8	120565	120572	0 %	0 %	50 %	50 %	378775936
2110	NC_016814	AGCGA	2	10	120612	120621	40 %	0 %	40 %	20 %	378775936
2111	NC_016814	GA	3	6	121101	121106	50 %	0 %	50 %	0 %	378775937
2112	NC_016814	GTGAC	2	10	121108	121117	20 %	20 %	40 %	20 %	378775937
2113	NC_016814	TCT	2	6	121160	121165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775937
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2120	NC_016814	GCT	2	6	121395	121400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775937
2121	NC_016814	ACC	2	6	121405	121410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775937
2122	NC_016814	TGT	2	6	121494	121499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775937
2123	NC_016814	CAT	2	6	121525	121530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775937
2124	NC_016814	GAA	2	6	121539	121544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775937
2125	NC_016814	GGC	2	6	121665	121670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775937
2126	NC_016814	CA	3	6	121714	121719	50 %	0 %	0 %	50 %	378775937
2127	NC_016814	GAC	3	9	121762	121770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775937
2128	NC_016814	CAA	2	6	121848	121853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775937
2129	NC_016814	TCG	2	6	121856	121861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775937
2130	NC_016814	GCA	2	6	121877	121882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775937
2131	NC_016814	GC	3	6	121933	121938	0 %	0 %	50 %	50 %	378775937
2132	NC_016814	AGCG	2	8	121943	121950	25 %	0 %	50 %	25 %	378775937
2133	NC_016814	GAT	2	6	121964	121969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775937
2134	NC_016814	GCA	2	6	122007	122012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775937
2135	NC_016814	CGCA	2	8	122569	122576	25 %	0 %	25 %	50 %	378775938
2136	NC_016814	GAT	2	6	122581	122586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775938
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2138	NC_016814	GCA	2	6	122772	122777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2139	NC_016814	GAAA	2	8	122900	122907	75 %	0 %	25 %	0 %	378775938
2140	NC_016814	TGC	2	6	122915	122920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2141	NC_016814	GCGATT	2	12	122924	122935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378775938
2142	NC_016814	TGC	2	6	122949	122954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2143	NC_016814	AGA	2	6	122958	122963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775938
2144	NC_016814	GCG	2	6	123012	123017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775938
2145	NC_016814	CTG	2	6	123053	123058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775938
2146	NC_016814	GCG	2	6	123122	123127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775938
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2150	NC_016814	GGC	2	6	123481	123486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775939
2151	NC_016814	TCC	2	6	123602	123607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775939
2152	NC_016814	CGT	2	6	123616	123621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775939
2153	NC_016814	TTG	2	6	123647	123652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775939
2154	NC_016814	ATC	2	6	123692	123697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775939
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2157	NC_016814	TCG	2	6	123851	123856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775939
2158	NC_016814	CGG	2	6	123937	123942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775939
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2162	NC_016814	TTTTCA	2	12	124089	124100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378775939
2163	NC_016814	CAGCG	2	10	124133	124142	20 %	0 %	40 %	40 %	378775940
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2176	NC_016814	CAG	2	6	124642	124647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775940
2177	NC_016814	CGG	2	6	124683	124688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775940
2178	NC_016814	ACG	2	6	124727	124732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775940
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2180	NC_016814	ACG	2	6	124778	124783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775940
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2194	NC_016814	GCA	2	6	125285	125290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775941
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2198	NC_016814	GAT	2	6	125552	125557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775941
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2201	NC_016814	CCATA	2	10	125615	125624	40 %	20 %	0 %	40 %	378775941
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2203	NC_016814	CGAGC	2	10	125864	125873	20 %	0 %	40 %	40 %	378775941
2204	NC_016814	GGT	2	6	125889	125894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775941
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2207	NC_016814	CGAC	2	8	125990	125997	25 %	0 %	25 %	50 %	378775941
2208	NC_016814	GATC	2	8	126004	126011	25 %	25 %	25 %	25 %	378775941
2209	NC_016814	GGCA	2	8	126015	126022	25 %	0 %	50 %	25 %	378775941
2210	NC_016814	CCG	2	6	126043	126048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775941
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2212	NC_016814	TCG	2	6	126062	126067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775941
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2216	NC_016814	CGAT	2	8	126251	126258	25 %	25 %	25 %	25 %	378775941
2217	NC_016814	CCT	2	6	126320	126325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775941
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2220	NC_016814	CGA	2	6	126362	126367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775941
2221	NC_016814	GATC	2	8	126371	126378	25 %	25 %	25 %	25 %	378775941
2222	NC_016814	CCT	2	6	126450	126455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775942
2223	NC_016814	CAT	2	6	126466	126471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775942
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2225	NC_016814	GC	3	6	126646	126651	0 %	0 %	50 %	50 %	378775942
2226	NC_016814	TGCAA	2	10	126656	126665	40 %	20 %	20 %	20 %	378775942
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2228	NC_016814	GCGA	2	8	126829	126836	25 %	0 %	50 %	25 %	378775942
2229	NC_016814	GCG	2	6	126855	126860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775942
2230	NC_016814	CCG	2	6	126897	126902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775942
2231	NC_016814	CGG	2	6	126977	126982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775942
2232	NC_016814	GCG	2	6	126983	126988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775942
2233	NC_016814	TTCG	2	8	127019	127026	0 %	50 %	25 %	25 %	378775942
2234	NC_016814	GGC	3	9	127085	127093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775942
2235	NC_016814	GC	3	6	127250	127255	0 %	0 %	50 %	50 %	378775942
2236	NC_016814	TGC	2	6	127355	127360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775942
2237	NC_016814	AGC	2	6	127362	127367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775942
2238	NC_016814	CG	3	6	127406	127411	0 %	0 %	50 %	50 %	378775942
2239	NC_016814	GAC	2	6	127430	127435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775942
2240	NC_016814	GCCC	2	8	127450	127457	0 %	0 %	25 %	75 %	378775942
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2242	NC_016814	TCGA	2	8	127487	127494	25 %	25 %	25 %	25 %	378775942
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2359	NC_016814	CTCC	2	8	133961	133968	0 %	25 %	0 %	75 %	378775950
2360	NC_016814	CAG	2	6	133994	133999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775950
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2362	NC_016814	GCCT	2	8	134077	134084	0 %	25 %	25 %	50 %	378775950
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2364	NC_016814	GAC	2	6	134172	134177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775950
2365	NC_016814	GGC	3	9	134192	134200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775950
2366	NC_016814	GCA	2	6	134222	134227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775950
2367	NC_016814	GAC	2	6	134262	134267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775950
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2485	NC_016814	ACC	2	6	140986	140991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775956
2486	NC_016814	CCA	2	6	141079	141084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775957
2487	NC_016814	CG	3	6	141169	141174	0 %	0 %	50 %	50 %	378775957
2488	NC_016814	CGG	2	6	141191	141196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775957
2489	NC_016814	GAA	2	6	141203	141208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775957
2490	NC_016814	CTA	2	6	141230	141235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775957
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2493	NC_016814	ATC	2	6	141315	141320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775957
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2497	NC_016814	GGC	2	6	141583	141588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775958
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2499	NC_016814	GC	3	6	141658	141663	0 %	0 %	50 %	50 %	378775958
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