MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016814	TCC	2	6	59434	59439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775857
1002	NC_016814	GAA	2	6	59449	59454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775857
1003	NC_016814	GC	3	6	59489	59494	0 %	0 %	50 %	50 %	378775857
1004	NC_016814	TGA	2	6	59516	59521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775857
1005	NC_016814	TGT	2	6	59547	59552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775857
1006	NC_016814	CCT	2	6	59571	59576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775858
1007	NC_016814	GCT	2	6	59646	59651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775858
1008	NC_016814	C	6	6	59658	59663	0 %	0 %	0 %	100 %	378775858
1009	NC_016814	GCCG	2	8	59722	59729	0 %	0 %	50 %	50 %	378775858
1010	NC_016814	ACA	2	6	59917	59922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775858
1011	NC_016814	CGG	2	6	59935	59940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775858
1012	NC_016814	CCA	2	6	59942	59947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775858
1013	NC_016814	ACC	2	6	60084	60089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775858
1014	NC_016814	CAGG	2	8	60094	60101	25 %	0 %	50 %	25 %	378775858
1015	NC_016814	AGAA	2	8	60111	60118	75 %	0 %	25 %	0 %	378775858
1016	NC_016814	CGC	2	6	60131	60136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775858
1017	NC_016814	GCCG	2	8	60142	60149	0 %	0 %	50 %	50 %	378775858
1018	NC_016814	GAG	2	6	60209	60214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775858
1019	NC_016814	TCG	2	6	60251	60256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775858
1020	NC_016814	GCG	2	6	60313	60318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775858
1021	NC_016814	CGA	2	6	60394	60399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775858
1022	NC_016814	GTC	2	6	60536	60541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1023	NC_016814	GCCT	2	8	60545	60552	0 %	25 %	25 %	50 %	378775859
1024	NC_016814	TTC	2	6	60557	60562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775859
1025	NC_016814	GCG	2	6	60652	60657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775859
1026	NC_016814	GGTTC	2	10	60703	60712	0 %	40 %	40 %	20 %	378775859
1027	NC_016814	TCA	2	6	60805	60810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775859
1028	NC_016814	GC	3	6	60825	60830	0 %	0 %	50 %	50 %	378775859
1029	NC_016814	TTG	2	6	60855	60860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775859
1030	NC_016814	GAT	2	6	60901	60906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775859
1031	NC_016814	TTC	2	6	60954	60959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775859
1032	NC_016814	ATC	2	6	60999	61004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775859
1033	NC_016814	GTCC	2	8	61069	61076	0 %	25 %	25 %	50 %	378775859
1034	NC_016814	CTT	2	6	61115	61120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775859
1035	NC_016814	TCA	2	6	61153	61158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775859
1036	NC_016814	CTG	2	6	61169	61174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1037	NC_016814	CGA	2	6	61177	61182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1038	NC_016814	CAT	2	6	61315	61320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775859
1039	NC_016814	CTT	2	6	61337	61342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775859
1040	NC_016814	TTG	2	6	61353	61358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775859
1041	NC_016814	TAG	2	6	61359	61364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775859
1042	NC_016814	CGGCA	2	10	61388	61397	20 %	0 %	40 %	40 %	378775859
1043	NC_016814	TTGC	2	8	61400	61407	0 %	50 %	25 %	25 %	378775859
1044	NC_016814	GTC	2	6	61475	61480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1045	NC_016814	ATG	2	6	61545	61550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775859
1046	NC_016814	GCT	2	6	61569	61574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1047	NC_016814	CGT	2	6	61616	61621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1048	NC_016814	CGC	3	9	61693	61701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775859
1049	NC_016814	GAA	2	6	61703	61708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775859
1050	NC_016814	CAC	2	6	61713	61718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775859
1051	NC_016814	GGC	2	6	61739	61744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775859
1052	NC_016814	TCA	2	6	61750	61755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775859
1053	NC_016814	ACC	2	6	61757	61762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775859
1054	NC_016814	CAG	2	6	61769	61774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775859
1055	NC_016814	CGG	2	6	61886	61891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775860
1056	NC_016814	CCTCG	2	10	61976	61985	0 %	20 %	20 %	60 %	378775860
1057	NC_016814	TCG	2	6	61989	61994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775860
1058	NC_016814	GAT	2	6	62239	62244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775860
1059	NC_016814	GCC	2	6	62254	62259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775860
1060	NC_016814	GCG	2	6	62342	62347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775860
1061	NC_016814	TGA	2	6	62359	62364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775860
1062	NC_016814	CAG	2	6	62408	62413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775860
1063	NC_016814	TCG	2	6	62490	62495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775860
1064	NC_016814	TGC	2	6	62527	62532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775860
1065	NC_016814	CGC	2	6	62551	62556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775860
1066	NC_016814	TCT	3	9	62611	62619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775860
1067	NC_016814	GGA	2	6	62723	62728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775860
1068	NC_016814	TCG	2	6	62754	62759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775860
1069	NC_016814	CGG	2	6	62806	62811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775860
1070	NC_016814	CCAT	2	8	62838	62845	25 %	25 %	0 %	50 %	378775860
1071	NC_016814	GGC	2	6	62899	62904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775860
1072	NC_016814	GCC	2	6	62924	62929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775860
1073	NC_016814	CGA	2	6	62947	62952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775860
1074	NC_016814	CG	3	6	62974	62979	0 %	0 %	50 %	50 %	378775860
1075	NC_016814	CAT	2	6	62999	63004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775860
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1079	NC_016814	GATC	2	8	63196	63203	25 %	25 %	25 %	25 %	378775860
1080	NC_016814	GC	3	6	63332	63337	0 %	0 %	50 %	50 %	378775860
1081	NC_016814	C	6	6	63369	63374	0 %	0 %	0 %	100 %	378775860
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1085	NC_016814	CGA	2	6	63635	63640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775861
1086	NC_016814	CCA	2	6	63702	63707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775861
1087	NC_016814	TTC	2	6	63874	63879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775861
1088	NC_016814	TTG	2	6	63889	63894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775861
1089	NC_016814	AAG	2	6	63981	63986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775861
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1091	NC_016814	TTC	2	6	64248	64253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775861
1092	NC_016814	TCGA	2	8	64283	64290	25 %	25 %	25 %	25 %	378775861
1093	NC_016814	CAT	2	6	64302	64307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775861
1094	NC_016814	ATCA	2	8	64359	64366	50 %	25 %	0 %	25 %	378775861
1095	NC_016814	TC	3	6	64880	64885	0 %	50 %	0 %	50 %	378775862
1096	NC_016814	CAC	2	6	65007	65012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775862
1097	NC_016814	CG	3	6	65024	65029	0 %	0 %	50 %	50 %	378775862
1098	NC_016814	CGC	2	6	65126	65131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775862
1099	NC_016814	CAG	2	6	65263	65268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775862
1100	NC_016814	TGC	2	6	65274	65279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775862
1101	NC_016814	CG	3	6	65305	65310	0 %	0 %	50 %	50 %	378775862
1102	NC_016814	TCAC	2	8	65316	65323	25 %	25 %	0 %	50 %	378775862
1103	NC_016814	TC	3	6	65337	65342	0 %	50 %	0 %	50 %	378775863
1104	NC_016814	GGCC	2	8	65375	65382	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
1105	NC_016814	GCG	2	6	65469	65474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775863
1106	NC_016814	ATC	2	6	65476	65481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775863
1107	NC_016814	TCC	2	6	65500	65505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775863
1108	NC_016814	GTTGT	2	10	65511	65520	0 %	60 %	40 %	0 %	378775863
1109	NC_016814	GCC	2	6	65530	65535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775863
1110	NC_016814	GTT	2	6	65566	65571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775863
1111	NC_016814	CGC	2	6	65598	65603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775863
1112	NC_016814	TAG	2	6	65623	65628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775863
1113	NC_016814	CGC	2	6	65703	65708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775863
1114	NC_016814	TCTG	2	8	65710	65717	0 %	50 %	25 %	25 %	378775863
1115	NC_016814	CAA	2	6	65727	65732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378775863
1116	NC_016814	TCTGCC	2	12	65797	65808	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378775863
1117	NC_016814	TGA	2	6	65821	65826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775863
1118	NC_016814	ACG	2	6	65848	65853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775863
1119	NC_016814	GC	4	8	65855	65862	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
1120	NC_016814	GCCCA	2	10	65938	65947	20 %	0 %	20 %	60 %	378775863
1121	NC_016814	GC	3	6	66036	66041	0 %	0 %	50 %	50 %	378775863
1122	NC_016814	ATG	2	6	66196	66201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775863
1123	NC_016814	CCT	2	6	66230	66235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775863
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1125	NC_016814	TGA	2	6	66449	66454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775863
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