MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103c complete sequence

Total Repeats: 2542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016814	TGGG	2	8	32173	32180	0 %	25 %	75 %	0 %	378775827
502	NC_016814	GCC	2	6	32647	32652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
503	NC_016814	ATG	2	6	32698	32703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
504	NC_016814	GCG	2	6	32706	32711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
505	NC_016814	CTC	2	6	32793	32798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775828
506	NC_016814	CAC	2	6	32849	32854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775828
507	NC_016814	TGC	2	6	32922	32927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
508	NC_016814	CCG	2	6	32972	32977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
509	NC_016814	CGG	2	6	32978	32983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
510	NC_016814	CGCTGG	2	12	33006	33017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378775828
511	NC_016814	C	6	6	33043	33048	0 %	0 %	0 %	100 %	378775828
512	NC_016814	GAA	2	6	33165	33170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775828
513	NC_016814	ATC	2	6	33217	33222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775828
514	NC_016814	CCT	2	6	33245	33250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775828
515	NC_016814	CAT	2	6	33255	33260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775828
516	NC_016814	GCG	2	6	33294	33299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
517	NC_016814	AGGC	2	8	33300	33307	25 %	0 %	50 %	25 %	378775828
518	NC_016814	GC	3	6	33362	33367	0 %	0 %	50 %	50 %	378775828
519	NC_016814	TTC	2	6	33475	33480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775828
520	NC_016814	GAT	2	6	33489	33494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
521	NC_016814	CATC	2	8	33548	33555	25 %	25 %	0 %	50 %	378775828
522	NC_016814	TCG	2	6	33574	33579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
523	NC_016814	AGG	2	6	33580	33585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775828
524	NC_016814	GGGA	2	8	33595	33602	25 %	0 %	75 %	0 %	378775828
525	NC_016814	CTG	2	6	33639	33644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
526	NC_016814	GAG	2	6	33657	33662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775828
527	NC_016814	GCA	2	6	33668	33673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
528	NC_016814	AGATCG	2	12	33704	33715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378775828
529	NC_016814	CAG	2	6	33810	33815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
530	NC_016814	GGC	3	9	33822	33830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
531	NC_016814	CGC	2	6	33932	33937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
532	NC_016814	GTCG	2	8	34104	34111	0 %	25 %	50 %	25 %	378775828
533	NC_016814	TCT	2	6	34163	34168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378775828
534	NC_016814	CGA	2	6	34210	34215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
535	NC_016814	CCG	2	6	34220	34225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775828
536	NC_016814	ATC	2	6	34261	34266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775828
537	NC_016814	GAT	2	6	34332	34337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
538	NC_016814	GAT	2	6	34340	34345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775828
539	NC_016814	GAA	2	6	34364	34369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775828
540	NC_016814	CCGA	2	8	34383	34390	25 %	0 %	25 %	50 %	378775828
541	NC_016814	AGCGA	2	10	34429	34438	40 %	0 %	40 %	20 %	378775828
542	NC_016814	GCA	2	6	34450	34455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
543	NC_016814	GCT	2	6	34467	34472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
544	NC_016814	CAG	2	6	34512	34517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775828
545	NC_016814	GCAGG	2	10	34550	34559	20 %	0 %	60 %	20 %	378775828
546	NC_016814	TCG	2	6	34613	34618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775828
547	NC_016814	AGA	2	6	34643	34648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775828
548	NC_016814	AACG	2	8	34683	34690	50 %	0 %	25 %	25 %	378775828
549	NC_016814	GGC	2	6	34716	34721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775828
550	NC_016814	AGA	2	6	34756	34761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378775829
551	NC_016814	GCC	2	6	34781	34786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775829
552	NC_016814	CGG	2	6	34791	34796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775829
553	NC_016814	CCG	2	6	34858	34863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775829
554	NC_016814	TGC	2	6	34875	34880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775829
555	NC_016814	ATC	2	6	34881	34886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775829
556	NC_016814	TGC	2	6	34939	34944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775829
557	NC_016814	GGA	2	6	34969	34974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775829
558	NC_016814	CGA	2	6	35005	35010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775829
559	NC_016814	GCG	2	6	35119	35124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775829
560	NC_016814	TGA	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775829
561	NC_016814	CAGG	2	8	35183	35190	25 %	0 %	50 %	25 %	378775829
562	NC_016814	GGA	2	6	35213	35218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378775829
563	NC_016814	GCC	2	6	35222	35227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775829
564	NC_016814	GC	3	6	35289	35294	0 %	0 %	50 %	50 %	378775829
565	NC_016814	GCC	2	6	35330	35335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775829
566	NC_016814	CTC	2	6	35378	35383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775829
567	NC_016814	GAC	2	6	35399	35404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775829
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570	NC_016814	GGC	2	6	35445	35450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775829
571	NC_016814	TGA	2	6	35512	35517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775829
572	NC_016814	TCA	2	6	35562	35567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378775829
573	NC_016814	GAT	2	6	35587	35592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378775829
574	NC_016814	TTG	2	6	35640	35645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378775829
575	NC_016814	CCA	2	6	35656	35661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775829
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578	NC_016814	GCG	2	6	35751	35756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378775829
579	NC_016814	GTC	2	6	35796	35801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775830
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584	NC_016814	TCG	2	6	35995	36000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775830
585	NC_016814	CGA	2	6	36035	36040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775830
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592	NC_016814	CTG	2	6	36695	36700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775830
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594	NC_016814	GTC	3	9	36757	36765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775830
595	NC_016814	TCG	2	6	36775	36780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775830
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597	NC_016814	C	6	6	36844	36849	0 %	0 %	0 %	100 %	378775830
598	NC_016814	GCC	2	6	36919	36924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775830
599	NC_016814	CTC	2	6	36966	36971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378775831
600	NC_016814	TCG	2	6	36979	36984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378775831
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606	NC_016814	GAAT	2	8	37265	37272	50 %	25 %	25 %	0 %	378775831
607	NC_016814	CGC	2	6	37319	37324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378775831
608	NC_016814	GCA	2	6	37350	37355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775831
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610	NC_016814	TGG	2	6	37471	37476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378775831
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613	NC_016814	CAC	2	6	37631	37636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378775831
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615	NC_016814	ACG	2	6	37653	37658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775831
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617	NC_016814	GCA	2	6	37701	37706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378775831
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