MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016810	GCG	3	9	213738	213746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698162
4003	NC_016810	GAA	2	6	213758	213763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698162
4004	NC_016810	CGA	2	6	213768	213773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698162
4005	NC_016810	GGC	2	6	213808	213813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698162
4006	NC_016810	CGCGG	2	10	213884	213893	0 %	0 %	60 %	40 %	378698163
4007	NC_016810	CG	3	6	213894	213899	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4008	NC_016810	ACG	2	6	213915	213920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4009	NC_016810	GCG	2	6	213921	213926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698163
4010	NC_016810	TCG	2	6	213937	213942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4011	NC_016810	CGG	2	6	213972	213977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698163
4012	NC_016810	CAC	2	6	214000	214005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698163
4013	NC_016810	TAT	2	6	214028	214033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698163
4014	NC_016810	GC	3	6	214045	214050	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4015	NC_016810	CGCGG	2	10	214068	214077	0 %	0 %	60 %	40 %	378698163
4016	NC_016810	CAT	2	6	214214	214219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698163
4017	NC_016810	CGT	2	6	214238	214243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4018	NC_016810	T	6	6	214271	214276	0 %	100 %	0 %	0 %	378698163
4019	NC_016810	CAG	2	6	214287	214292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4020	NC_016810	GGC	2	6	214308	214313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698163
4021	NC_016810	TTC	2	6	214366	214371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698163
4022	NC_016810	ATG	2	6	214384	214389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698163
4023	NC_016810	AAC	2	6	214441	214446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698163
4024	NC_016810	GGT	2	6	214457	214462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698163
4025	NC_016810	GTT	2	6	214472	214477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698163
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4027	NC_016810	GGA	2	6	214540	214545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698163
4028	NC_016810	GC	3	6	214633	214638	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4029	NC_016810	CTT	2	6	214700	214705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698163
4030	NC_016810	CCG	2	6	214720	214725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698163
4031	NC_016810	GTA	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698163
4032	NC_016810	TCT	2	6	214798	214803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698163
4033	NC_016810	TGT	2	6	214820	214825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698163
4034	NC_016810	GCA	3	9	214829	214837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698163
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4039	NC_016810	CGC	3	9	215063	215071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698163
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4041	NC_016810	GCA	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698164
4042	NC_016810	CTC	2	6	215519	215524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698164
4043	NC_016810	ACG	2	6	215547	215552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698164
4044	NC_016810	GCCA	2	8	215695	215702	25 %	0 %	25 %	50 %	378698164
4045	NC_016810	TCG	2	6	215787	215792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698164
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4047	NC_016810	CGG	2	6	215829	215834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698164
4048	NC_016810	ATA	2	6	215838	215843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698164
4049	NC_016810	TCGC	2	8	215850	215857	0 %	25 %	25 %	50 %	378698164
4050	NC_016810	CGC	2	6	215881	215886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698164
4051	NC_016810	CAT	2	6	215893	215898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698164
4052	NC_016810	TGC	2	6	215916	215921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698164
4053	NC_016810	CGG	2	6	215935	215940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698164
4054	NC_016810	CGT	2	6	215977	215982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698164
4055	NC_016810	AGT	2	6	216025	216030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698164
4056	NC_016810	GCCAG	2	10	216052	216061	20 %	0 %	40 %	40 %	378698164
4057	NC_016810	G	6	6	216177	216182	0 %	0 %	100 %	0 %	378698164
4058	NC_016810	GCG	2	6	216249	216254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698164
4059	NC_016810	AGTC	2	8	216316	216323	25 %	25 %	25 %	25 %	378698164
4060	NC_016810	TGC	2	6	216325	216330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698164
4061	NC_016810	CAGC	2	8	216423	216430	25 %	0 %	25 %	50 %	378698165
4062	NC_016810	GGC	2	6	216474	216479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698165
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4064	NC_016810	TCT	2	6	216546	216551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698165
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4066	NC_016810	GCGCG	2	10	216618	216627	0 %	0 %	60 %	40 %	378698165
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4069	NC_016810	GTTC	2	8	217046	217053	0 %	50 %	25 %	25 %	378698166
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4071	NC_016810	GCA	2	6	217187	217192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698166
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4085	NC_016810	GC	4	8	217953	217960	0 %	0 %	50 %	50 %	378698167
4086	NC_016810	CAA	2	6	217978	217983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698167
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4090	NC_016810	CGC	2	6	218158	218163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698167
4091	NC_016810	CGTC	2	8	218174	218181	0 %	25 %	25 %	50 %	378698167
4092	NC_016810	GCG	2	6	218198	218203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698167
4093	NC_016810	GC	5	10	218220	218229	0 %	0 %	50 %	50 %	378698167
4094	NC_016810	GTC	2	6	218230	218235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698167
4095	NC_016810	A	6	6	218251	218256	100 %	0 %	0 %	0 %	378698167
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4097	NC_016810	AAAG	2	8	218322	218329	75 %	0 %	25 %	0 %	378698168
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4101	NC_016810	TGT	2	6	218420	218425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698168
4102	NC_016810	CGGGG	2	10	218436	218445	0 %	0 %	80 %	20 %	378698168
4103	NC_016810	TCC	2	6	218501	218506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698168
4104	NC_016810	CGT	2	6	218518	218523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698168
4105	NC_016810	GGC	2	6	218526	218531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698168
4106	NC_016810	TGAA	2	8	218564	218571	50 %	25 %	25 %	0 %	378698168
4107	NC_016810	GC	4	8	218601	218608	0 %	0 %	50 %	50 %	378698168
4108	NC_016810	GTG	2	6	218641	218646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698168
4109	NC_016810	CGA	2	6	218864	218869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698168
4110	NC_016810	GC	3	6	218883	218888	0 %	0 %	50 %	50 %	378698168
4111	NC_016810	GCG	2	6	218920	218925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698168
4112	NC_016810	TGA	2	6	218937	218942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698168
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4118	NC_016810	CG	3	6	219246	219251	0 %	0 %	50 %	50 %	378698168
4119	NC_016810	TCAG	2	8	219284	219291	25 %	25 %	25 %	25 %	378698168
4120	NC_016810	GC	3	6	219306	219311	0 %	0 %	50 %	50 %	378698168
4121	NC_016810	GC	3	6	219315	219320	0 %	0 %	50 %	50 %	378698168
4122	NC_016810	GAC	2	6	219323	219328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698168
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4131	NC_016810	GGC	2	6	219582	219587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698168
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4231	NC_016810	GGC	2	6	223830	223835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698170
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4235	NC_016810	A	6	6	223964	223969	100 %	0 %	0 %	0 %	378698170
4236	NC_016810	GGT	2	6	223986	223991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698170
4237	NC_016810	AGATGC	2	12	224003	224014	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378698170
4238	NC_016810	CAGT	2	8	224023	224030	25 %	25 %	25 %	25 %	378698170
4239	NC_016810	AAG	2	6	224033	224038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698170
4240	NC_016810	AGC	2	6	224068	224073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698170
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4242	NC_016810	GTTGA	2	10	224218	224227	20 %	40 %	40 %	0 %	378698170
4243	NC_016810	CGTC	2	8	224240	224247	0 %	25 %	25 %	50 %	378698170
4244	NC_016810	ACT	2	6	224302	224307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698170
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4246	NC_016810	TTCAA	2	10	224324	224333	40 %	40 %	0 %	20 %	378698170
4247	NC_016810	GGAC	2	8	224339	224346	25 %	0 %	50 %	25 %	378698170
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4251	NC_016810	CTA	2	6	224559	224564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698170
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4351	NC_016810	TGGCGG	2	12	228942	228953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378698173
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4362	NC_016810	ATG	2	6	229214	229219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698173
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4364	NC_016810	CGC	2	6	229355	229360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698173
4365	NC_016810	GCG	2	6	229383	229388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698173
4366	NC_016810	CG	3	6	229393	229398	0 %	0 %	50 %	50 %	378698173
4367	NC_016810	GCT	2	6	229435	229440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698173
4368	NC_016810	GGC	2	6	229447	229452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698173
4369	NC_016810	CGA	2	6	229470	229475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698173
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4484	NC_016810	CG	3	6	237229	237234	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
4485	NC_016810	TAT	2	6	237245	237250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698181
4486	NC_016810	GTC	2	6	237255	237260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4487	NC_016810	TG	3	6	237266	237271	0 %	50 %	50 %	0 %	378698181
4488	NC_016810	CGAC	2	8	237272	237279	25 %	0 %	25 %	50 %	378698181
4489	NC_016810	TCC	2	6	237322	237327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698181
4490	NC_016810	GAA	2	6	237339	237344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698181
4491	NC_016810	GAA	2	6	237411	237416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698181
4492	NC_016810	GCC	2	6	237429	237434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
4493	NC_016810	GAC	2	6	237444	237449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4494	NC_016810	CCT	2	6	237464	237469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698181
4495	NC_016810	GTG	2	6	237502	237507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698181
4496	NC_016810	TTCA	2	8	237546	237553	25 %	50 %	0 %	25 %	378698181
4497	NC_016810	GCC	2	6	237568	237573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
4498	NC_016810	CGA	2	6	237649	237654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4499	NC_016810	CGC	2	6	237680	237685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
4500	NC_016810	GAT	2	6	237687	237692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698181

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