MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016810	TC	3	6	187261	187266	0 %	50 %	0 %	50 %	378698137
3503	NC_016810	TGC	3	9	187309	187317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3504	NC_016810	CGG	2	6	187334	187339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3505	NC_016810	CGG	2	6	187378	187383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3506	NC_016810	TCTGG	2	10	187386	187395	0 %	40 %	40 %	20 %	378698137
3507	NC_016810	GCC	2	6	187404	187409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698137
3508	NC_016810	CTG	2	6	187536	187541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3509	NC_016810	GAA	2	6	187550	187555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698137
3510	NC_016810	TCT	2	6	187570	187575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698137
3511	NC_016810	CCG	2	6	187648	187653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698137
3512	NC_016810	TTG	2	6	187699	187704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698137
3513	NC_016810	CTG	2	6	187728	187733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3514	NC_016810	GAT	2	6	187739	187744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698137
3515	NC_016810	CCG	2	6	187763	187768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698137
3516	NC_016810	CGT	2	6	187779	187784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3517	NC_016810	TGGC	2	8	187803	187810	0 %	25 %	50 %	25 %	378698137
3518	NC_016810	GCT	2	6	187820	187825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3519	NC_016810	CGG	2	6	187852	187857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3520	NC_016810	GAC	2	6	187917	187922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3521	NC_016810	CTG	2	6	187929	187934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3522	NC_016810	CGA	2	6	187958	187963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3523	NC_016810	GCT	2	6	188018	188023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3524	NC_016810	GCC	2	6	188066	188071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698137
3525	NC_016810	CGC	2	6	188084	188089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698137
3526	NC_016810	GAA	2	6	188100	188105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698137
3527	NC_016810	TAC	2	6	188109	188114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698137
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3529	NC_016810	GGC	2	6	188282	188287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3530	NC_016810	GCG	2	6	188292	188297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3531	NC_016810	CGG	2	6	188359	188364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3532	NC_016810	TATTTT	2	12	188532	188543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378698138
3533	NC_016810	CTT	2	6	188546	188551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698138
3534	NC_016810	CT	3	6	188568	188573	0 %	50 %	0 %	50 %	378698138
3535	NC_016810	TA	3	6	188578	188583	50 %	50 %	0 %	0 %	378698138
3536	NC_016810	GTAT	2	8	188656	188663	25 %	50 %	25 %	0 %	378698138
3537	NC_016810	TGG	2	6	188674	188679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698138
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3539	NC_016810	TCA	2	6	188851	188856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698138
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3541	NC_016810	GGTT	2	8	189007	189014	0 %	50 %	50 %	0 %	378698138
3542	NC_016810	ATG	2	6	189049	189054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698138
3543	NC_016810	TGC	2	6	189060	189065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698138
3544	NC_016810	T	6	6	189089	189094	0 %	100 %	0 %	0 %	378698138
3545	NC_016810	ATT	2	6	189096	189101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698138
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3547	NC_016810	TAT	2	6	189141	189146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698138
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3550	NC_016810	T	6	6	189246	189251	0 %	100 %	0 %	0 %	378698138
3551	NC_016810	TGTT	2	8	189280	189287	0 %	75 %	25 %	0 %	378698138
3552	NC_016810	AAG	2	6	189312	189317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698138
3553	NC_016810	GGT	2	6	189664	189669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698139
3554	NC_016810	CG	3	6	189733	189738	0 %	0 %	50 %	50 %	378698139
3555	NC_016810	TGGA	2	8	189794	189801	25 %	25 %	50 %	0 %	378698139
3556	NC_016810	GAA	2	6	189806	189811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698139
3557	NC_016810	TGA	2	6	189813	189818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698139
3558	NC_016810	TTA	2	6	189871	189876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698139
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3560	NC_016810	GGA	2	6	189907	189912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698139
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3563	NC_016810	CGG	2	6	190228	190233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698140
3564	NC_016810	ATG	2	6	190235	190240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698140
3565	NC_016810	CGG	2	6	190300	190305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698140
3566	NC_016810	CTG	2	6	190358	190363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698140
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3569	NC_016810	ATG	2	6	190623	190628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698140
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3577	NC_016810	GGGC	2	8	190812	190819	0 %	0 %	75 %	25 %	378698140
3578	NC_016810	CGTT	2	8	190881	190888	0 %	50 %	25 %	25 %	378698140
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3582	NC_016810	GCT	2	6	191030	191035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698140
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3588	NC_016810	CTT	2	6	191127	191132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698140
3589	NC_016810	GAT	2	6	191167	191172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698141
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3591	NC_016810	CGC	2	6	191260	191265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698141
3592	NC_016810	GGC	2	6	191316	191321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698141
3593	NC_016810	GTG	2	6	191349	191354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698141
3594	NC_016810	A	7	7	191383	191389	100 %	0 %	0 %	0 %	378698141
3595	NC_016810	CGG	2	6	191429	191434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698141
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3597	NC_016810	CGC	3	9	191469	191477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698141
3598	NC_016810	ACG	2	6	191497	191502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698141
3599	NC_016810	CGG	2	6	191658	191663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698141
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3601	NC_016810	TCG	2	6	191711	191716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698141
3602	NC_016810	GCG	2	6	191758	191763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698141
3603	NC_016810	AAC	2	6	191768	191773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698141
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3607	NC_016810	GC	3	6	192014	192019	0 %	0 %	50 %	50 %	378698141
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3609	NC_016810	GCGA	2	8	192128	192135	25 %	0 %	50 %	25 %	378698141
3610	NC_016810	CGT	2	6	192153	192158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698141
3611	NC_016810	CGG	2	6	192207	192212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698141
3612	NC_016810	CCG	2	6	192224	192229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698141
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3614	NC_016810	GCGG	2	8	192343	192350	0 %	0 %	75 %	25 %	378698141
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3620	NC_016810	TGG	2	6	192510	192515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698142
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3622	NC_016810	TGAT	2	8	192633	192640	25 %	50 %	25 %	0 %	378698142
3623	NC_016810	CAGGCG	2	12	192683	192694	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378698142
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3745	NC_016810	CGG	2	6	200135	200140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698148
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3970	NC_016810	ACGT	2	8	212031	212038	25 %	25 %	25 %	25 %	378698160
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3982	NC_016810	GCAC	2	8	212727	212734	25 %	0 %	25 %	50 %	378698161
3983	NC_016810	CCAGCA	2	12	212736	212747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378698161
3984	NC_016810	CAG	2	6	212785	212790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698161
3985	NC_016810	GCC	2	6	212827	212832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698161
3986	NC_016810	CCAG	2	8	212916	212923	25 %	0 %	25 %	50 %	378698161
3987	NC_016810	GCC	2	6	212926	212931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698161
3988	NC_016810	CGCA	2	8	212956	212963	25 %	0 %	25 %	50 %	378698161
3989	NC_016810	GC	3	6	213045	213050	0 %	0 %	50 %	50 %	378698161
3990	NC_016810	CG	3	6	213061	213066	0 %	0 %	50 %	50 %	378698161
3991	NC_016810	CAGG	2	8	213096	213103	25 %	0 %	50 %	25 %	378698161
3992	NC_016810	AG	3	6	213134	213139	50 %	0 %	50 %	0 %	378698161
3993	NC_016810	TCG	2	6	213167	213172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698161
3994	NC_016810	T	6	6	213223	213228	0 %	100 %	0 %	0 %	378698161
3995	NC_016810	CTTG	2	8	213231	213238	0 %	50 %	25 %	25 %	378698161
3996	NC_016810	GCA	2	6	213246	213251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698161
3997	NC_016810	TGG	3	9	213258	213266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698161
3998	NC_016810	GCA	2	6	213413	213418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698162
3999	NC_016810	AGATC	2	10	213462	213471	40 %	20 %	20 %	20 %	378698162
4000	NC_016810	CGGT	2	8	213542	213549	0 %	25 %	50 %	25 %	378698162

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