MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016810	CGC	2	6	159354	159359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3002	NC_016810	CCGGC	2	10	159369	159378	0 %	0 %	40 %	60 %	378698116
3003	NC_016810	A	6	6	159401	159406	100 %	0 %	0 %	0 %	378698116
3004	NC_016810	AGA	2	6	159445	159450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698116
3005	NC_016810	TGA	2	6	159487	159492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698116
3006	NC_016810	GC	3	6	159497	159502	0 %	0 %	50 %	50 %	378698116
3007	NC_016810	AAG	2	6	159555	159560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698116
3008	NC_016810	CCG	2	6	159624	159629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3009	NC_016810	GC	4	8	159634	159641	0 %	0 %	50 %	50 %	378698116
3010	NC_016810	TCA	2	6	159690	159695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698116
3011	NC_016810	TTG	2	6	159696	159701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698116
3012	NC_016810	AAG	2	6	159771	159776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698116
3013	NC_016810	ACT	2	6	159828	159833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698116
3014	NC_016810	CGG	2	6	159870	159875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698116
3015	NC_016810	CTAT	2	8	159900	159907	25 %	50 %	0 %	25 %	378698116
3016	NC_016810	CGT	2	6	159919	159924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698116
3017	NC_016810	GAT	2	6	159943	159948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698116
3018	NC_016810	A	6	6	159990	159995	100 %	0 %	0 %	0 %	378698116
3019	NC_016810	AG	3	6	160091	160096	50 %	0 %	50 %	0 %	378698116
3020	NC_016810	GCG	2	6	160184	160189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698116
3021	NC_016810	CGC	2	6	160261	160266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3022	NC_016810	GAA	2	6	160283	160288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698116
3023	NC_016810	CGG	2	6	160345	160350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698116
3024	NC_016810	CCG	2	6	160384	160389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3025	NC_016810	TTC	2	6	160438	160443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698116
3026	NC_016810	ATG	2	6	160508	160513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698116
3027	NC_016810	CTG	2	6	160625	160630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698116
3028	NC_016810	ATG	3	9	160635	160643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698116
3029	NC_016810	CTG	2	6	160688	160693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698116
3030	NC_016810	CCG	2	6	160769	160774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3031	NC_016810	GAG	2	6	160886	160891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698116
3032	NC_016810	AGA	2	6	160942	160947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698116
3033	NC_016810	GGT	2	6	160948	160953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698116
3034	NC_016810	ATG	2	6	160964	160969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698116
3035	NC_016810	TGC	2	6	160992	160997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698116
3036	NC_016810	GGC	2	6	161029	161034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698116
3037	NC_016810	CGC	2	6	161125	161130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3038	NC_016810	GCA	2	6	161254	161259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698116
3039	NC_016810	GCC	2	6	161282	161287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3040	NC_016810	GCC	2	6	161303	161308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698116
3041	NC_016810	CCTTGC	2	12	161342	161353	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378698116
3042	NC_016810	A	6	6	161553	161558	100 %	0 %	0 %	0 %	378698117
3043	NC_016810	ACG	2	6	161593	161598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698117
3044	NC_016810	TTA	2	6	161605	161610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698117
3045	NC_016810	CGC	2	6	161618	161623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698117
3046	NC_016810	CGG	2	6	161657	161662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698117
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3049	NC_016810	ATT	2	6	161913	161918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698117
3050	NC_016810	GTC	2	6	162285	162290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698118
3051	NC_016810	CGC	2	6	162305	162310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698118
3052	NC_016810	CGG	2	6	162332	162337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698118
3053	NC_016810	C	6	6	162401	162406	0 %	0 %	0 %	100 %	378698118
3054	NC_016810	GAC	2	6	162408	162413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698118
3055	NC_016810	ACG	2	6	162439	162444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698118
3056	NC_016810	GCA	2	6	162608	162613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698119
3057	NC_016810	GATCA	2	10	162687	162696	40 %	20 %	20 %	20 %	378698119
3058	NC_016810	TGT	2	6	162772	162777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698119
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3060	NC_016810	GCT	2	6	162878	162883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698119
3061	NC_016810	CCG	2	6	162917	162922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698119
3062	NC_016810	CTG	2	6	162930	162935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698119
3063	NC_016810	GCT	2	6	162998	163003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698119
3064	NC_016810	CAG	2	6	163020	163025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698119
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3066	NC_016810	TCT	2	6	163169	163174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698119
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3069	NC_016810	CG	3	6	163384	163389	0 %	0 %	50 %	50 %	378698120
3070	NC_016810	CAT	2	6	163393	163398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698120
3071	NC_016810	CGTCA	2	10	163433	163442	20 %	20 %	20 %	40 %	378698120
3072	NC_016810	ACC	2	6	163443	163448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698120
3073	NC_016810	CAG	2	6	163487	163492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698120
3074	NC_016810	CTG	2	6	163526	163531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698120
3075	NC_016810	CTG	2	6	163550	163555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698120
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3078	NC_016810	CGG	2	6	163648	163653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698120
3079	NC_016810	GGGC	2	8	163693	163700	0 %	0 %	75 %	25 %	378698120
3080	NC_016810	GC	3	6	163721	163726	0 %	0 %	50 %	50 %	378698120
3081	NC_016810	ATA	2	6	163728	163733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698120
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3084	NC_016810	CTG	2	6	164274	164279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698121
3085	NC_016810	GAA	2	6	164300	164305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698121
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3087	NC_016810	TCG	2	6	164478	164483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698121
3088	NC_016810	ACG	2	6	164615	164620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698121
3089	NC_016810	CGG	2	6	164655	164660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
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3091	NC_016810	GGC	3	9	164753	164761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
3092	NC_016810	GGC	2	6	164780	164785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
3093	NC_016810	AG	3	6	164803	164808	50 %	0 %	50 %	0 %	378698121
3094	NC_016810	CGG	2	6	164809	164814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698121
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3098	NC_016810	CAC	2	6	165046	165051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698121
3099	NC_016810	ATCCC	2	10	165133	165142	20 %	20 %	0 %	60 %	378698122
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3102	NC_016810	GCA	2	6	165301	165306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698122
3103	NC_016810	T	6	6	165378	165383	0 %	100 %	0 %	0 %	378698122
3104	NC_016810	GAA	2	6	165490	165495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698122
3105	NC_016810	AGA	2	6	165591	165596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698122
3106	NC_016810	CGCTGC	2	12	165597	165608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378698122
3107	NC_016810	AAT	2	6	165713	165718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698122
3108	NC_016810	AGA	2	6	165729	165734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698122
3109	NC_016810	GGC	2	6	165764	165769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698122
3110	NC_016810	GCA	2	6	165790	165795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698122
3111	NC_016810	GGC	2	6	165812	165817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698122
3112	NC_016810	AAT	2	6	165827	165832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698122
3113	NC_016810	AGCGC	2	10	165841	165850	20 %	0 %	40 %	40 %	378698122
3114	NC_016810	AGC	2	6	165907	165912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698122
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3118	NC_016810	TGA	2	6	166137	166142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698122
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3121	NC_016810	TGA	2	6	166234	166239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698122
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3123	NC_016810	CAC	2	6	166608	166613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698123
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3364	NC_016810	GCG	2	6	179201	179206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698133
3365	NC_016810	GCA	3	9	179210	179218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698133
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3367	NC_016810	GCG	2	6	179231	179236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698133
3368	NC_016810	ACGTTC	2	12	179241	179252	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378698133
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3382	NC_016810	GCT	2	6	180047	180052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698133
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3384	NC_016810	TGC	2	6	180075	180080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698133
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3469	NC_016810	GCT	2	6	186057	186062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
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3474	NC_016810	TGC	2	6	186194	186199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3475	NC_016810	CTG	2	6	186219	186224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698137
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3479	NC_016810	A	6	6	186343	186348	100 %	0 %	0 %	0 %	378698137
3480	NC_016810	TCACCG	2	12	186349	186360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378698137
3481	NC_016810	CGA	2	6	186389	186394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698137
3482	NC_016810	TC	4	8	186395	186402	0 %	50 %	0 %	50 %	378698137
3483	NC_016810	CAAA	2	8	186512	186519	75 %	0 %	0 %	25 %	378698137
3484	NC_016810	A	6	6	186534	186539	100 %	0 %	0 %	0 %	378698137
3485	NC_016810	GTG	2	6	186567	186572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698137
3486	NC_016810	TTC	2	6	186581	186586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698137
3487	NC_016810	GCG	3	9	186655	186663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3488	NC_016810	CGG	2	6	186674	186679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698137
3489	NC_016810	TCT	2	6	186694	186699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698137
3490	NC_016810	GC	3	6	186721	186726	0 %	0 %	50 %	50 %	378698137
3491	NC_016810	GTGC	2	8	186867	186874	0 %	25 %	50 %	25 %	378698137
3492	NC_016810	GGT	2	6	186876	186881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698137
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3494	NC_016810	AGC	2	6	186984	186989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698137
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3496	NC_016810	TCCG	2	8	187045	187052	0 %	25 %	25 %	50 %	378698137
3497	NC_016810	TAC	2	6	187097	187102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698137
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