MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016810	CCT	2	6	78086	78091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698050
1503	NC_016810	ACC	2	6	78172	78177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698050
1504	NC_016810	TCGG	2	8	78187	78194	0 %	25 %	50 %	25 %	378698050
1505	NC_016810	CGCA	2	8	78214	78221	25 %	0 %	25 %	50 %	378698050
1506	NC_016810	CGA	2	6	78294	78299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698050
1507	NC_016810	CCG	2	6	78321	78326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698050
1508	NC_016810	GGCG	2	8	78564	78571	0 %	0 %	75 %	25 %	378698050
1509	NC_016810	GCG	2	6	78646	78651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1510	NC_016810	GCGAA	2	10	78701	78710	40 %	0 %	40 %	20 %	378698050
1511	NC_016810	CGG	3	9	78744	78752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1512	NC_016810	ACT	2	6	78785	78790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698050
1513	NC_016810	CGG	2	6	78975	78980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1514	NC_016810	CGC	2	6	78986	78991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698050
1515	NC_016810	GC	5	10	79000	79009	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
1516	NC_016810	CG	3	6	79060	79065	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
1517	NC_016810	CTGAAG	2	12	79102	79113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378698050
1518	NC_016810	TGG	2	6	79184	79189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698050
1519	NC_016810	CTT	2	6	79196	79201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698050
1520	NC_016810	CGG	2	6	79268	79273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1521	NC_016810	TGC	2	6	79298	79303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698050
1522	NC_016810	TGA	2	6	79317	79322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698050
1523	NC_016810	GTGGAC	2	12	79333	79344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378698050
1524	NC_016810	GGC	2	6	79375	79380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1525	NC_016810	GGCG	2	8	79401	79408	0 %	0 %	75 %	25 %	378698050
1526	NC_016810	CAG	2	6	79480	79485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698050
1527	NC_016810	TGA	2	6	79523	79528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698050
1528	NC_016810	GCG	2	6	79585	79590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1529	NC_016810	CGTAC	2	10	79591	79600	20 %	20 %	20 %	40 %	378698050
1530	NC_016810	GGC	2	6	79641	79646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1531	NC_016810	GC	3	6	79645	79650	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
1532	NC_016810	TAC	2	6	79708	79713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698050
1533	NC_016810	GTG	2	6	79726	79731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698050
1534	NC_016810	CAA	2	6	79740	79745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698050
1535	NC_016810	CCA	2	6	79859	79864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698050
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1537	NC_016810	GCT	2	6	79884	79889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698050
1538	NC_016810	TCCG	2	8	79891	79898	0 %	25 %	25 %	50 %	378698050
1539	NC_016810	GTG	2	6	79918	79923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698050
1540	NC_016810	CGC	2	6	79929	79934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698050
1541	NC_016810	GCT	2	6	79938	79943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698050
1542	NC_016810	CCAC	2	8	79967	79974	25 %	0 %	0 %	75 %	378698050
1543	NC_016810	GTC	2	6	80039	80044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698050
1544	NC_016810	TAT	2	6	80085	80090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698050
1545	NC_016810	ACC	2	6	80095	80100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698050
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1547	NC_016810	CGC	2	6	80137	80142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698050
1548	NC_016810	GC	3	6	80144	80149	0 %	0 %	50 %	50 %	378698050
1549	NC_016810	CGG	2	6	80184	80189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698050
1550	NC_016810	ACG	2	6	80197	80202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698050
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1552	NC_016810	GAT	2	6	80601	80606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698051
1553	NC_016810	TTGT	2	8	80714	80721	0 %	75 %	25 %	0 %	378698051
1554	NC_016810	GAT	2	6	80730	80735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698051
1555	NC_016810	TGCCAG	2	12	80761	80772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378698051
1556	NC_016810	GAAA	2	8	80836	80843	75 %	0 %	25 %	0 %	378698051
1557	NC_016810	C	6	6	80881	80886	0 %	0 %	0 %	100 %	378698051
1558	NC_016810	GAT	2	6	80916	80921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698051
1559	NC_016810	CGTC	2	8	81046	81053	0 %	25 %	25 %	50 %	378698052
1560	NC_016810	CGGT	2	8	81068	81075	0 %	25 %	50 %	25 %	378698052
1561	NC_016810	TTC	2	6	81077	81082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698052
1562	NC_016810	GTA	2	6	81196	81201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698052
1563	NC_016810	CG	3	6	81202	81207	0 %	0 %	50 %	50 %	378698052
1564	NC_016810	CCA	2	6	81217	81222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698052
1565	NC_016810	TTGCC	2	10	81227	81236	0 %	40 %	20 %	40 %	378698052
1566	NC_016810	GGC	2	6	81269	81274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698052
1567	NC_016810	CT	3	6	81282	81287	0 %	50 %	0 %	50 %	378698052
1568	NC_016810	CGTCC	2	10	81337	81346	0 %	20 %	20 %	60 %	378698052
1569	NC_016810	CAC	2	6	81347	81352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698052
1570	NC_016810	GGTATC	2	12	81404	81415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378698052
1571	NC_016810	GCCT	2	8	81455	81462	0 %	25 %	25 %	50 %	378698052
1572	NC_016810	CAC	2	6	81581	81586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698052
1573	NC_016810	TCT	2	6	81789	81794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698053
1574	NC_016810	GCA	2	6	81799	81804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698053
1575	NC_016810	CGC	2	6	81826	81831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698053
1576	NC_016810	CTT	2	6	81850	81855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698053
1577	NC_016810	CG	3	6	81875	81880	0 %	0 %	50 %	50 %	378698053
1578	NC_016810	GTT	2	6	81928	81933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698053
1579	NC_016810	CG	3	6	81943	81948	0 %	0 %	50 %	50 %	378698053
1580	NC_016810	CTT	2	6	82006	82011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698053
1581	NC_016810	GCA	2	6	82063	82068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698053
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1583	NC_016810	CCG	2	6	82165	82170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698053
1584	NC_016810	CCG	2	6	82188	82193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698053
1585	NC_016810	GCC	2	6	82265	82270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698053
1586	NC_016810	CAGC	2	8	82323	82330	25 %	0 %	25 %	50 %	378698053
1587	NC_016810	CGC	2	6	82348	82353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698053
1588	NC_016810	GGTC	2	8	82452	82459	0 %	25 %	50 %	25 %	378698053
1589	NC_016810	ACTC	2	8	82504	82511	25 %	25 %	0 %	50 %	378698053
1590	NC_016810	T	8	8	82577	82584	0 %	100 %	0 %	0 %	378698054
1591	NC_016810	ATT	2	6	82586	82591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698054
1592	NC_016810	TCA	2	6	82739	82744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698054
1593	NC_016810	ACCA	2	8	82762	82769	50 %	0 %	0 %	50 %	378698054
1594	NC_016810	ATA	2	6	82802	82807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698054
1595	NC_016810	CCG	2	6	82838	82843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698054
1596	NC_016810	CGA	2	6	82869	82874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1597	NC_016810	CATCCT	2	12	82887	82898	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	378698054
1598	NC_016810	CGG	2	6	83031	83036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698054
1599	NC_016810	TCG	2	6	83054	83059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1600	NC_016810	AAT	2	6	83134	83139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698054
1601	NC_016810	CAG	2	6	83173	83178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1602	NC_016810	TGC	2	6	83258	83263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1603	NC_016810	GCG	2	6	83276	83281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698054
1604	NC_016810	ATC	3	9	83303	83311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698054
1605	NC_016810	AGC	2	6	83384	83389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1606	NC_016810	TGC	2	6	83397	83402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1607	NC_016810	CGG	2	6	83403	83408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698054
1608	NC_016810	GCG	2	6	83423	83428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698054
1609	NC_016810	TCA	2	6	83477	83482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698054
1610	NC_016810	AGT	2	6	83508	83513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698054
1611	NC_016810	ACC	2	6	83546	83551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698054
1612	NC_016810	GGT	2	6	83566	83571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698054
1613	NC_016810	CCG	2	6	83592	83597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698054
1614	NC_016810	CGT	2	6	83676	83681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1615	NC_016810	GCT	2	6	83691	83696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1616	NC_016810	CAGA	2	8	83704	83711	50 %	0 %	25 %	25 %	378698054
1617	NC_016810	CAG	2	6	83782	83787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1618	NC_016810	TTC	2	6	83821	83826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698054
1619	NC_016810	A	6	6	83958	83963	100 %	0 %	0 %	0 %	378698054
1620	NC_016810	GTC	2	6	84076	84081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698054
1621	NC_016810	TCA	2	6	85561	85566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698055
1622	NC_016810	ACC	2	6	85569	85574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698055
1623	NC_016810	GGT	2	6	85619	85624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698055
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1996	NC_016810	GCCT	2	8	107325	107332	0 %	25 %	25 %	50 %	378698074
1997	NC_016810	ATA	2	6	107362	107367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698074
1998	NC_016810	CGG	2	6	107374	107379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698074
1999	NC_016810	TGG	2	6	107399	107404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698074
2000	NC_016810	TTC	2	6	107595	107600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698074

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