MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016810	GTA	2	6	51767	51772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698026
1002	NC_016810	ATG	2	6	51779	51784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698026
1003	NC_016810	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698027
1004	NC_016810	AGC	2	6	52355	52360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698027
1005	NC_016810	GCA	2	6	52404	52409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698027
1006	NC_016810	TGA	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698027
1007	NC_016810	CAT	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698027
1008	NC_016810	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	378698027
1009	NC_016810	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698028
1010	NC_016810	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698028
1011	NC_016810	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698028
1012	NC_016810	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698028
1013	NC_016810	TTAACC	2	12	52814	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698028
1014	NC_016810	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	378698029
1015	NC_016810	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	378698029
1016	NC_016810	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	378698029
1017	NC_016810	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698029
1018	NC_016810	GGT	3	9	53015	53023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698029
1019	NC_016810	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698029
1020	NC_016810	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	378698029
1021	NC_016810	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698029
1022	NC_016810	CTG	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698029
1023	NC_016810	GAT	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698029
1024	NC_016810	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	378698029
1025	NC_016810	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698029
1026	NC_016810	GGC	2	6	53346	53351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698029
1027	NC_016810	AGT	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698029
1028	NC_016810	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698029
1029	NC_016810	CGA	2	6	53462	53467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698029
1030	NC_016810	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	378698029
1031	NC_016810	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698029
1032	NC_016810	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698029
1033	NC_016810	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698029
1034	NC_016810	TGA	2	6	53735	53740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698029
1035	NC_016810	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	378698029
1036	NC_016810	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1037	NC_016810	GCG	2	6	53907	53912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698030
1038	NC_016810	GAT	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1039	NC_016810	CAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698030
1040	NC_016810	A	6	6	53987	53992	100 %	0 %	0 %	0 %	378698030
1041	NC_016810	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	378698030
1042	NC_016810	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1043	NC_016810	GCA	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1044	NC_016810	CAT	2	6	54346	54351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698030
1045	NC_016810	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
1046	NC_016810	GCGGAA	2	12	54440	54451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378698030
1047	NC_016810	ACC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698030
1048	NC_016810	CTG	2	6	54761	54766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1049	NC_016810	CTG	2	6	55010	55015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1050	NC_016810	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
1051	NC_016810	A	6	6	55044	55049	100 %	0 %	0 %	0 %	378698030
1052	NC_016810	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1053	NC_016810	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
1054	NC_016810	AAG	2	6	55134	55139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698030
1055	NC_016810	GCT	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1056	NC_016810	GGC	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698030
1057	NC_016810	GTG	2	6	55381	55386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698030
1058	NC_016810	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	378698030
1059	NC_016810	CCA	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698030
1060	NC_016810	TGC	2	6	55522	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1061	NC_016810	TCC	2	6	55574	55579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698030
1062	NC_016810	TGA	2	6	55581	55586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1063	NC_016810	TGA	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1064	NC_016810	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1065	NC_016810	TCG	2	6	55816	55821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1066	NC_016810	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
1067	NC_016810	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1068	NC_016810	TGG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698030
1069	NC_016810	GCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1070	NC_016810	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	378698030
1071	NC_016810	CAT	2	6	56047	56052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698030
1072	NC_016810	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	378698030
1073	NC_016810	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1074	NC_016810	ACG	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698030
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1077	NC_016810	CAA	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698030
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1080	NC_016810	TGA	3	9	56497	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1081	NC_016810	GCT	2	6	56580	56585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698030
1082	NC_016810	CACTA	2	10	56588	56597	40 %	20 %	0 %	40 %	378698030
1083	NC_016810	AAC	2	6	56670	56675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698030
1084	NC_016810	TGA	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698030
1085	NC_016810	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698031
1086	NC_016810	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698031
1087	NC_016810	TCC	2	6	56777	56782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698031
1088	NC_016810	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698031
1089	NC_016810	TGA	2	6	56942	56947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698031
1090	NC_016810	ATC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698031
1091	NC_016810	GGC	2	6	57004	57009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698031
1092	NC_016810	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	378698031
1093	NC_016810	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698031
1094	NC_016810	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	378698031
1095	NC_016810	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	378698032
1096	NC_016810	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698032
1097	NC_016810	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698032
1098	NC_016810	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	378698032
1099	NC_016810	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698032
1100	NC_016810	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698032
1101	NC_016810	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	378698032
1102	NC_016810	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698032
1103	NC_016810	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698032
1104	NC_016810	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	378698032
1105	NC_016810	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698033
1106	NC_016810	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	378698033
1107	NC_016810	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	378698033
1108	NC_016810	G	6	6	58210	58215	0 %	0 %	100 %	0 %	378698033
1109	NC_016810	TGG	2	6	58223	58228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698033
1110	NC_016810	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	378698033
1111	NC_016810	TCG	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698033
1112	NC_016810	TGG	2	6	58448	58453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698033
1113	NC_016810	TCTAAC	2	12	58471	58482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698033
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1118	NC_016810	GCC	2	6	58570	58575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698033
1119	NC_016810	GGC	3	9	58651	58659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698033
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1121	NC_016810	AAAAT	2	10	58952	58961	80 %	20 %	0 %	0 %	378698034
1122	NC_016810	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	378698034
1123	NC_016810	CAA	2	6	59004	59009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698034
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1125	NC_016810	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	378698034
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