MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016810	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698005
502	NC_016810	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	378698006
503	NC_016810	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
504	NC_016810	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
505	NC_016810	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
506	NC_016810	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	378698006
507	NC_016810	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
508	NC_016810	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
509	NC_016810	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
510	NC_016810	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
511	NC_016810	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
512	NC_016810	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698006
513	NC_016810	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
514	NC_016810	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
515	NC_016810	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
516	NC_016810	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
517	NC_016810	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	378698006
518	NC_016810	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
519	NC_016810	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698006
520	NC_016810	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
521	NC_016810	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
522	NC_016810	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
523	NC_016810	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698006
524	NC_016810	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
525	NC_016810	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
526	NC_016810	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
527	NC_016810	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	378698006
528	NC_016810	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
529	NC_016810	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698006
530	NC_016810	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
531	NC_016810	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
532	NC_016810	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
533	NC_016810	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698006
534	NC_016810	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	378698006
535	NC_016810	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698006
536	NC_016810	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	378698006
537	NC_016810	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
538	NC_016810	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698006
539	NC_016810	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
540	NC_016810	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
541	NC_016810	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698006
542	NC_016810	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
543	NC_016810	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
544	NC_016810	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698006
545	NC_016810	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698006
546	NC_016810	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698006
547	NC_016810	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	378698006
548	NC_016810	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
549	NC_016810	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698006
550	NC_016810	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
551	NC_016810	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
552	NC_016810	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698006
553	NC_016810	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	378698006
554	NC_016810	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
555	NC_016810	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	378698006
556	NC_016810	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378698006
557	NC_016810	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698006
558	NC_016810	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	378698006
559	NC_016810	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698006
560	NC_016810	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	378698006
561	NC_016810	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698006
562	NC_016810	ACA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698006
563	NC_016810	CTG	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698007
564	NC_016810	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	378698007
565	NC_016810	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	378698007
566	NC_016810	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	378698007
567	NC_016810	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	378698007
568	NC_016810	CCG	2	6	28627	28632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698007
569	NC_016810	TTC	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698007
570	NC_016810	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	378698007
571	NC_016810	ATG	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698007
572	NC_016810	TCG	2	6	28891	28896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698007
573	NC_016810	CCG	2	6	28945	28950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698007
574	NC_016810	A	6	6	29118	29123	100 %	0 %	0 %	0 %	378698007
575	NC_016810	ATG	2	6	29284	29289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698007
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577	NC_016810	GAC	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698008
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579	NC_016810	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698008
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583	NC_016810	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	378698008
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587	NC_016810	GCA	2	6	30223	30228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698009
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589	NC_016810	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698009
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591	NC_016810	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	378698009
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593	NC_016810	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	378698010
594	NC_016810	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	378698010
595	NC_016810	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	378698010
596	NC_016810	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	378698010
597	NC_016810	TGG	2	6	30684	30689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698010
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599	NC_016810	ATT	2	6	30747	30752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698010
600	NC_016810	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	378698010
601	NC_016810	GGT	2	6	30786	30791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698010
602	NC_016810	CCG	2	6	30812	30817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698010
603	NC_016810	CGC	2	6	30846	30851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698010
604	NC_016810	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	378698010
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607	NC_016810	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	378698010
608	NC_016810	TTA	2	6	31036	31041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698010
609	NC_016810	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	378698010
610	NC_016810	TAT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698011
611	NC_016810	TAT	2	6	31277	31282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698011
612	NC_016810	CGC	2	6	31351	31356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698011
613	NC_016810	CGG	2	6	31389	31394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698011
614	NC_016810	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	378698011
615	NC_016810	CGC	2	6	31474	31479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698011
616	NC_016810	CAG	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698011
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622	NC_016810	T	6	6	31722	31727	0 %	100 %	0 %	0 %	378698011
623	NC_016810	GGC	2	6	31753	31758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698011
624	NC_016810	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	378698011
625	NC_016810	GCC	2	6	31910	31915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698011
626	NC_016810	AAG	2	6	31920	31925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698011
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