MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016810	GCG	2	6	322251	322256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698254
6002	NC_016810	CGG	2	6	322268	322273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698254
6003	NC_016810	TCG	2	6	322297	322302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698254
6004	NC_016810	CGGG	2	8	322346	322353	0 %	0 %	75 %	25 %	378698254
6005	NC_016810	TGAA	2	8	322389	322396	50 %	25 %	25 %	0 %	378698254
6006	NC_016810	TGA	2	6	322397	322402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698255
6007	NC_016810	A	6	6	322402	322407	100 %	0 %	0 %	0 %	378698255
6008	NC_016810	ATG	2	6	322415	322420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698255
6009	NC_016810	TCA	2	6	322425	322430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698255
6010	NC_016810	ATT	2	6	322457	322462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698255
6011	NC_016810	T	7	7	322505	322511	0 %	100 %	0 %	0 %	378698255
6012	NC_016810	ATC	2	6	322513	322518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698255
6013	NC_016810	A	6	6	322645	322650	100 %	0 %	0 %	0 %	378698255
6014	NC_016810	GGA	2	6	322680	322685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698255
6015	NC_016810	CTC	2	6	322854	322859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698255
6016	NC_016810	T	6	6	322933	322938	0 %	100 %	0 %	0 %	378698255
6017	NC_016810	GGA	2	6	323001	323006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698255
6018	NC_016810	TGTGG	2	10	323024	323033	0 %	40 %	60 %	0 %	378698255
6019	NC_016810	TTTA	2	8	323040	323047	25 %	75 %	0 %	0 %	378698255
6020	NC_016810	CG	3	6	323116	323121	0 %	0 %	50 %	50 %	378698255
6021	NC_016810	ATAA	2	8	323134	323141	75 %	25 %	0 %	0 %	378698255
6022	NC_016810	AT	3	6	323162	323167	50 %	50 %	0 %	0 %	378698255
6023	NC_016810	GTCT	2	8	323375	323382	0 %	50 %	25 %	25 %	378698256
6024	NC_016810	TGG	2	6	323385	323390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698256
6025	NC_016810	TCA	2	6	323453	323458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698256
6026	NC_016810	A	6	6	323473	323478	100 %	0 %	0 %	0 %	378698256
6027	NC_016810	CTA	2	6	323499	323504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698256
6028	NC_016810	GGAT	2	8	323580	323587	25 %	25 %	50 %	0 %	378698256
6029	NC_016810	A	6	6	323630	323635	100 %	0 %	0 %	0 %	378698256
6030	NC_016810	TGA	2	6	323749	323754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698256
6031	NC_016810	T	6	6	323859	323864	0 %	100 %	0 %	0 %	378698257
6032	NC_016810	GC	4	8	323869	323876	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6033	NC_016810	GTTCTG	2	12	323891	323902	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378698257
6034	NC_016810	GCT	2	6	323905	323910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6035	NC_016810	TGC	2	6	324003	324008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6036	NC_016810	ATC	2	6	324041	324046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698257
6037	NC_016810	GCT	2	6	324088	324093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6038	NC_016810	CTG	2	6	324158	324163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6039	NC_016810	AAC	2	6	324216	324221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698257
6040	NC_016810	TGC	2	6	324222	324227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6041	NC_016810	CG	3	6	324243	324248	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6042	NC_016810	CTGG	2	8	324354	324361	0 %	25 %	50 %	25 %	378698257
6043	NC_016810	TGG	2	6	324411	324416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
6044	NC_016810	CTG	2	6	324449	324454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6045	NC_016810	GGC	2	6	324524	324529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
6046	NC_016810	TGG	2	6	324545	324550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
6047	NC_016810	TTGA	2	8	324569	324576	25 %	50 %	25 %	0 %	378698257
6048	NC_016810	CCG	2	6	324579	324584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698257
6049	NC_016810	CGCC	2	8	324592	324599	0 %	0 %	25 %	75 %	378698257
6050	NC_016810	GGT	2	6	324608	324613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
6051	NC_016810	AGCG	2	8	324616	324623	25 %	0 %	50 %	25 %	378698257
6052	NC_016810	CTG	2	6	324665	324670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6053	NC_016810	GC	3	6	324687	324692	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6054	NC_016810	CGG	2	6	324747	324752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
6055	NC_016810	GGC	2	6	324760	324765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
6056	NC_016810	TGG	2	6	324834	324839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
6057	NC_016810	TTG	2	6	324854	324859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698257
6058	NC_016810	CGC	2	6	324973	324978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698257
6059	NC_016810	GC	3	6	324981	324986	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6060	NC_016810	GC	3	6	324995	325000	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6061	NC_016810	GCC	2	6	325062	325067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698257
6062	NC_016810	CGC	2	6	325096	325101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698257
6063	NC_016810	CGCAGG	2	12	325209	325220	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378698257
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6065	NC_016810	CT	3	6	325300	325305	0 %	50 %	0 %	50 %	378698257
6066	NC_016810	CTG	2	6	325352	325357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6067	NC_016810	TGG	2	6	325386	325391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
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6069	NC_016810	CGG	2	6	325435	325440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
6070	NC_016810	CTG	2	6	325445	325450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
6071	NC_016810	TGT	2	6	325470	325475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698257
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6074	NC_016810	CG	3	6	325535	325540	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6075	NC_016810	TCCCG	2	10	325591	325600	0 %	20 %	20 %	60 %	378698257
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6080	NC_016810	CTG	3	9	325745	325753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698257
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6086	NC_016810	GC	3	6	325954	325959	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6087	NC_016810	GTG	2	6	326003	326008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
6088	NC_016810	CG	3	6	326092	326097	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
6089	NC_016810	GGC	2	6	326104	326109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
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6091	NC_016810	GGC	3	9	326278	326286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
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6093	NC_016810	CTGA	2	8	326336	326343	25 %	25 %	25 %	25 %	378698257
6094	NC_016810	CCG	2	6	326395	326400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698257
6095	NC_016810	CGC	2	6	326423	326428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698257
6096	NC_016810	GGCCT	2	10	326489	326498	0 %	20 %	40 %	40 %	378698257
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6101	NC_016810	AAC	2	6	326616	326621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698257
6102	NC_016810	GC	3	6	326629	326634	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
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6105	NC_016810	TGG	2	6	326715	326720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698257
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6107	NC_016810	CGGA	2	8	326759	326766	25 %	0 %	50 %	25 %	378698257
6108	NC_016810	CGG	2	6	326767	326772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
6109	NC_016810	GCG	2	6	326778	326783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698257
6110	NC_016810	TCGCT	2	10	326799	326808	0 %	40 %	20 %	40 %	378698257
6111	NC_016810	GC	3	6	326856	326861	0 %	0 %	50 %	50 %	378698257
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6240	NC_016810	ATC	2	6	332599	332604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698263
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6243	NC_016810	TCCA	2	8	332734	332741	25 %	25 %	0 %	50 %	378698263
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6246	NC_016810	CAGC	2	8	332889	332896	25 %	0 %	25 %	50 %	378698263
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6359	NC_016810	AAT	2	6	339819	339824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698266
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6489	NC_016810	GCT	2	6	350552	350557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698275
6490	NC_016810	CGG	2	6	350564	350569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698275
6491	NC_016810	CTGA	2	8	350637	350644	25 %	25 %	25 %	25 %	378698275
6492	NC_016810	GTT	2	6	350657	350662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698275
6493	NC_016810	T	6	6	350670	350675	0 %	100 %	0 %	0 %	378698275
6494	NC_016810	GGGC	2	8	350729	350736	0 %	0 %	75 %	25 %	378698275
6495	NC_016810	GGA	2	6	350740	350745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698275
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6497	NC_016810	CGA	2	6	351261	351266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698276
6498	NC_016810	GA	3	6	351265	351270	50 %	0 %	50 %	0 %	378698276
6499	NC_016810	CGG	2	6	351306	351311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698276
6500	NC_016810	CGC	2	6	351351	351356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698276

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