MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 89353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016810	CAGGT	2	10	237703	237712	20 %	20 %	40 %	20 %	378698181
4502	NC_016810	ACG	2	6	237718	237723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4503	NC_016810	GTA	2	6	237726	237731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698181
4504	NC_016810	TCG	2	6	237775	237780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4505	NC_016810	CAG	2	6	237786	237791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4506	NC_016810	GC	3	6	237814	237819	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
4507	NC_016810	GCG	2	6	237842	237847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698181
4508	NC_016810	CGA	2	6	237878	237883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4509	NC_016810	CG	3	6	237921	237926	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
4510	NC_016810	GC	3	6	238016	238021	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
4511	NC_016810	CAG	2	6	238038	238043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4512	NC_016810	AGC	2	6	238064	238069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4513	NC_016810	TCG	2	6	238130	238135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698181
4514	NC_016810	GC	3	6	238226	238231	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
4515	NC_016810	CAT	2	6	238349	238354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698181
4516	NC_016810	GCC	2	6	238395	238400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
4517	NC_016810	CGC	2	6	238433	238438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
4518	NC_016810	CGC	2	6	238748	238753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698182
4519	NC_016810	GGC	2	6	238770	238775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4520	NC_016810	GC	3	6	238853	238858	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
4521	NC_016810	CGG	2	6	238968	238973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4522	NC_016810	GGA	2	6	239004	239009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698182
4523	NC_016810	TGG	2	6	239026	239031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698182
4524	NC_016810	CGG	2	6	239055	239060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4525	NC_016810	CGGCG	2	10	239196	239205	0 %	0 %	60 %	40 %	378698182
4526	NC_016810	CT	3	6	239212	239217	0 %	50 %	0 %	50 %	378698182
4527	NC_016810	GCG	2	6	239218	239223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4528	NC_016810	CGC	2	6	239231	239236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698182
4529	NC_016810	TAT	2	6	239253	239258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
4530	NC_016810	TCA	2	6	239321	239326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698182
4531	NC_016810	ATT	2	6	239368	239373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
4532	NC_016810	TAT	2	6	239433	239438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
4533	NC_016810	TGC	2	6	239474	239479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698182
4534	NC_016810	GGC	2	6	239509	239514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4535	NC_016810	A	6	6	239521	239526	100 %	0 %	0 %	0 %	378698182
4536	NC_016810	GCG	2	6	239540	239545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4537	NC_016810	CGG	2	6	239550	239555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4538	NC_016810	TTGA	2	8	239575	239582	25 %	50 %	25 %	0 %	378698182
4539	NC_016810	GCCG	2	8	239583	239590	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
4540	NC_016810	GGC	2	6	239596	239601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4541	NC_016810	CGC	2	6	239622	239627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698182
4542	NC_016810	CTG	2	6	239653	239658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698182
4543	NC_016810	TTA	2	6	239666	239671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
4544	NC_016810	ACG	2	6	239683	239688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698182
4545	NC_016810	TGCTT	2	10	239690	239699	0 %	60 %	20 %	20 %	378698182
4546	NC_016810	TTC	2	6	239700	239705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698182
4547	NC_016810	GC	3	6	239708	239713	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
4548	NC_016810	G	6	6	239715	239720	0 %	0 %	100 %	0 %	378698182
4549	NC_016810	GCT	2	6	239751	239756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698182
4550	NC_016810	GGC	3	9	239775	239783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4551	NC_016810	GGC	2	6	239850	239855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4552	NC_016810	GC	3	6	239862	239867	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
4553	NC_016810	TGCTGG	2	12	239885	239896	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378698182
4554	NC_016810	GC	3	6	240004	240009	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
4555	NC_016810	GGC	2	6	240036	240041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
4556	NC_016810	TGA	2	6	240165	240170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698183
4557	NC_016810	GCA	2	6	240199	240204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698183
4558	NC_016810	CGG	2	6	240273	240278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698183
4559	NC_016810	TGG	2	6	240365	240370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698183
4560	NC_016810	TGG	2	6	240395	240400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698183
4561	NC_016810	AACC	2	8	240450	240457	50 %	0 %	0 %	50 %	378698183
4562	NC_016810	CTTC	2	8	240488	240495	0 %	50 %	0 %	50 %	378698183
4563	NC_016810	GCC	2	6	240660	240665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698184
4564	NC_016810	ACC	2	6	240684	240689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698184
4565	NC_016810	CAT	2	6	240695	240700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698184
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4567	NC_016810	AAT	2	6	240830	240835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698184
4568	NC_016810	CGC	2	6	240838	240843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698184
4569	NC_016810	ACAG	2	8	240866	240873	50 %	0 %	25 %	25 %	378698184
4570	NC_016810	TGGC	2	8	240983	240990	0 %	25 %	50 %	25 %	378698184
4571	NC_016810	CGA	2	6	241027	241032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698184
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4573	NC_016810	ACG	2	6	241116	241121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698184
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4576	NC_016810	ATA	2	6	241311	241316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698185
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4581	NC_016810	CTGC	2	8	241660	241667	0 %	25 %	25 %	50 %	378698185
4582	NC_016810	GGC	2	6	241694	241699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698185
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4584	NC_016810	CCG	2	6	241803	241808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698185
4585	NC_016810	CGA	2	6	241816	241821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698185
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4588	NC_016810	CGGG	2	8	241900	241907	0 %	0 %	75 %	25 %	378698185
4589	NC_016810	GCT	2	6	241919	241924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698185
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4591	NC_016810	GA	3	6	241975	241980	50 %	0 %	50 %	0 %	378698185
4592	NC_016810	CG	3	6	241990	241995	0 %	0 %	50 %	50 %	378698185
4593	NC_016810	AGC	2	6	242025	242030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698185
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4598	NC_016810	CT	3	6	242352	242357	0 %	50 %	0 %	50 %	378698186
4599	NC_016810	CGG	2	6	242372	242377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698186
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4601	NC_016810	CGT	2	6	242459	242464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698186
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4604	NC_016810	GCC	2	6	242590	242595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698186
4605	NC_016810	GCC	2	6	242667	242672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698186
4606	NC_016810	GCA	2	6	242708	242713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698186
4607	NC_016810	CTT	3	9	242720	242728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698186
4608	NC_016810	ATG	2	6	242740	242745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698186
4609	NC_016810	ATCG	2	8	242846	242853	25 %	25 %	25 %	25 %	378698187
4610	NC_016810	TCG	2	6	242879	242884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698187
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4612	NC_016810	A	6	6	242989	242994	100 %	0 %	0 %	0 %	378698187
4613	NC_016810	GCA	2	6	243059	243064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698187
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4619	NC_016810	GAA	2	6	243336	243341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698187
4620	NC_016810	CGC	2	6	243357	243362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698187
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4622	NC_016810	TGG	2	6	243489	243494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698187
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4985	NC_016810	AG	3	6	262343	262348	50 %	0 %	50 %	0 %	378698202
4986	NC_016810	GCT	2	6	262404	262409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698203
4987	NC_016810	CAG	2	6	262413	262418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698203
4988	NC_016810	CATT	2	8	262458	262465	25 %	50 %	0 %	25 %	378698203
4989	NC_016810	CTC	2	6	262501	262506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698203
4990	NC_016810	ATG	2	6	262538	262543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698203
4991	NC_016810	CAC	2	6	262755	262760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698203
4992	NC_016810	GTC	2	6	262834	262839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698203
4993	NC_016810	CGC	2	6	262841	262846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698203
4994	NC_016810	AGG	2	6	262883	262888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698203
4995	NC_016810	TCG	2	6	262919	262924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698203
4996	NC_016810	GAA	2	6	262945	262950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698203
4997	NC_016810	GTG	2	6	262986	262991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698203
4998	NC_016810	CGT	2	6	262995	263000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698203
4999	NC_016810	GGCG	2	8	263031	263038	0 %	0 %	75 %	25 %	378698203
5000	NC_016810	CTA	2	6	263058	263063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698203

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