MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016633	TA	3	6	191313	191318	50 %	50 %	0 %	0 %	374314622
3002	NC_016633	GTT	2	6	191385	191390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314622
3003	NC_016633	CTTT	2	8	191400	191407	0 %	75 %	0 %	25 %	374314622
3004	NC_016633	A	6	6	191462	191467	100 %	0 %	0 %	0 %	374314622
3005	NC_016633	T	6	6	191955	191960	0 %	100 %	0 %	0 %	374314623
3006	NC_016633	A	7	7	191965	191971	100 %	0 %	0 %	0 %	374314623
3007	NC_016633	TC	3	6	191990	191995	0 %	50 %	0 %	50 %	374314623
3008	NC_016633	TAA	2	6	192042	192047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314623
3009	NC_016633	AAT	2	6	192102	192107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314623
3010	NC_016633	A	6	6	192151	192156	100 %	0 %	0 %	0 %	374314624
3011	NC_016633	TCACTT	2	12	192187	192198	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374314624
3012	NC_016633	TGA	2	6	192236	192241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314624
3013	NC_016633	GAA	2	6	192280	192285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314624
3014	NC_016633	GTCT	2	8	192293	192300	0 %	50 %	25 %	25 %	374314624
3015	NC_016633	CATG	2	8	192327	192334	25 %	25 %	25 %	25 %	374314624
3016	NC_016633	TCT	2	6	192366	192371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314624
3017	NC_016633	GTAGGG	2	12	192445	192456	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	374314624
3018	NC_016633	CTT	2	6	192538	192543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314624
3019	NC_016633	CTTG	2	8	192555	192562	0 %	50 %	25 %	25 %	374314624
3020	NC_016633	AAC	2	6	192613	192618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314624
3021	NC_016633	TCA	2	6	192853	192858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314625
3022	NC_016633	GCA	2	6	192864	192869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314625
3023	NC_016633	AGCG	2	8	192974	192981	25 %	0 %	50 %	25 %	374314625
3024	NC_016633	CTT	2	6	192997	193002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314625
3025	NC_016633	CTGC	2	8	193183	193190	0 %	25 %	25 %	50 %	374314625
3026	NC_016633	CTT	2	6	193282	193287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314625
3027	NC_016633	CAA	2	6	193315	193320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314625
3028	NC_016633	CCA	2	6	193396	193401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314625
3029	NC_016633	TCA	2	6	193764	193769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314626
3030	NC_016633	TCG	2	6	193833	193838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314626
3031	NC_016633	TTG	2	6	193927	193932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314626
3032	NC_016633	CAT	2	6	194065	194070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314626
3033	NC_016633	ATC	2	6	194099	194104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314626
3034	NC_016633	CCA	2	6	194187	194192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314626
3035	NC_016633	TGCA	2	8	194210	194217	25 %	25 %	25 %	25 %	374314626
3036	NC_016633	CTT	2	6	194344	194349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314626
3037	NC_016633	TTG	2	6	194352	194357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314626
3038	NC_016633	CAT	2	6	194377	194382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314626
3039	NC_016633	TTG	2	6	194457	194462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314626
3040	NC_016633	TCT	2	6	194467	194472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314626
3041	NC_016633	CAGG	2	8	194571	194578	25 %	0 %	50 %	25 %	374314627
3042	NC_016633	TGG	2	6	194703	194708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314627
3043	NC_016633	ATC	2	6	194753	194758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314627
3044	NC_016633	GTA	2	6	194765	194770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314627
3045	NC_016633	TGA	2	6	194790	194795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314627
3046	NC_016633	CTT	2	6	194946	194951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314627
3047	NC_016633	TATC	2	8	194997	195004	25 %	50 %	0 %	25 %	374314628
3048	NC_016633	CTT	2	6	195008	195013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314628
3049	NC_016633	C	6	6	195186	195191	0 %	0 %	0 %	100 %	374314628
3050	NC_016633	TTG	2	6	195333	195338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314628
3051	NC_016633	AG	3	6	195380	195385	50 %	0 %	50 %	0 %	374314628
3052	NC_016633	TGA	2	6	195387	195392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314628
3053	NC_016633	ACT	2	6	195426	195431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314628
3054	NC_016633	GAT	2	6	195437	195442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314628
3055	NC_016633	GCA	2	6	195638	195643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314628
3056	NC_016633	CAAG	2	8	195652	195659	50 %	0 %	25 %	25 %	374314628
3057	NC_016633	TGC	2	6	195719	195724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314628
3058	NC_016633	AG	3	6	195758	195763	50 %	0 %	50 %	0 %	374314628
3059	NC_016633	GCC	2	6	195770	195775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314628
3060	NC_016633	CAT	2	6	195791	195796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314628
3061	NC_016633	ATG	2	6	195888	195893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314628
3062	NC_016633	ATT	2	6	195929	195934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314628
3063	NC_016633	GAA	2	6	195950	195955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314628
3064	NC_016633	CAT	2	6	196213	196218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314629
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3067	NC_016633	AAG	2	6	196412	196417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314629
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3070	NC_016633	GCT	2	6	196594	196599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314629
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3074	NC_016633	TCCC	2	8	196791	196798	0 %	25 %	0 %	75 %	374314629
3075	NC_016633	AAGG	2	8	196882	196889	50 %	0 %	50 %	0 %	374314629
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3079	NC_016633	GTT	2	6	197026	197031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314630
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3087	NC_016633	T	6	6	197396	197401	0 %	100 %	0 %	0 %	374314630
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3089	NC_016633	CGATG	2	10	197494	197503	20 %	20 %	40 %	20 %	374314630
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3091	NC_016633	AG	3	6	197587	197592	50 %	0 %	50 %	0 %	374314630
3092	NC_016633	ACTTC	2	10	197601	197610	20 %	40 %	0 %	40 %	374314630
3093	NC_016633	GGA	2	6	197710	197715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314630
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3095	NC_016633	TCTG	2	8	197852	197859	0 %	50 %	25 %	25 %	374314630
3096	NC_016633	CAC	2	6	197897	197902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314630
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3101	NC_016633	T	6	6	198131	198136	0 %	100 %	0 %	0 %	374314630
3102	NC_016633	TCT	2	6	198148	198153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314630
3103	NC_016633	GGTC	2	8	198154	198161	0 %	25 %	50 %	25 %	374314630
3104	NC_016633	T	6	6	198245	198250	0 %	100 %	0 %	0 %	374314630
3105	NC_016633	GATA	2	8	198251	198258	50 %	25 %	25 %	0 %	374314630
3106	NC_016633	GGCAA	2	10	198374	198383	40 %	0 %	40 %	20 %	374314630
3107	NC_016633	TC	3	6	198388	198393	0 %	50 %	0 %	50 %	374314630
3108	NC_016633	A	6	6	198468	198473	100 %	0 %	0 %	0 %	374314630
3109	NC_016633	GGC	2	6	198928	198933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314631
3110	NC_016633	CTT	2	6	198996	199001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314631
3111	NC_016633	TTG	2	6	199007	199012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314631
3112	NC_016633	TTCTGC	2	12	199076	199087	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374314631
3113	NC_016633	TG	3	6	199116	199121	0 %	50 %	50 %	0 %	374314631
3114	NC_016633	TTG	2	6	199217	199222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314631
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3119	NC_016633	CAA	2	6	199584	199589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314631
3120	NC_016633	T	8	8	199619	199626	0 %	100 %	0 %	0 %	374314631
3121	NC_016633	CTA	2	6	199945	199950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314632
3122	NC_016633	TC	4	8	199951	199958	0 %	50 %	0 %	50 %	374314632
3123	NC_016633	AACTA	2	10	200023	200032	60 %	20 %	0 %	20 %	374314632
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3244	NC_016633	TTGCAA	2	12	207048	207059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374314640
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3366	NC_016633	TGC	2	6	215731	215736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314646
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3368	NC_016633	G	7	7	215885	215891	0 %	0 %	100 %	0 %	374314646
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3371	NC_016633	CCG	2	6	216128	216133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314646
3372	NC_016633	AAT	2	6	216134	216139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314646
3373	NC_016633	ATCG	2	8	216355	216362	25 %	25 %	25 %	25 %	374314646
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3375	NC_016633	G	6	6	216431	216436	0 %	0 %	100 %	0 %	374314646
3376	NC_016633	CGG	2	6	216478	216483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314646
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3400	NC_016633	TGA	2	6	217719	217724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314646
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3475	NC_016633	T	8	8	222827	222834	0 %	100 %	0 %	0 %	374314652
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3482	NC_016633	TA	3	6	223178	223183	50 %	50 %	0 %	0 %	374314652
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3489	NC_016633	GAG	2	6	223755	223760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314653
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3491	NC_016633	TTGCT	2	10	223919	223928	0 %	60 %	20 %	20 %	374314653
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