MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016633	CAG	2	6	161790	161795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314596
2503	NC_016633	CAT	2	6	161851	161856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314596
2504	NC_016633	CAA	2	6	161874	161879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314596
2505	NC_016633	ATTCC	2	10	161894	161903	20 %	40 %	0 %	40 %	374314596
2506	NC_016633	A	7	7	161957	161963	100 %	0 %	0 %	0 %	374314596
2507	NC_016633	ATT	2	6	162090	162095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314597
2508	NC_016633	TAG	2	6	162147	162152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314597
2509	NC_016633	TGA	2	6	162198	162203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314597
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2511	NC_016633	GCT	2	6	162307	162312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314597
2512	NC_016633	TCT	2	6	162329	162334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314597
2513	NC_016633	CCA	2	6	162378	162383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314597
2514	NC_016633	ATT	2	6	162479	162484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314597
2515	NC_016633	GGA	2	6	162585	162590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314597
2516	NC_016633	CAT	2	6	162645	162650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314597
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2518	NC_016633	CTT	2	6	162806	162811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314597
2519	NC_016633	T	6	6	162873	162878	0 %	100 %	0 %	0 %	374314597
2520	NC_016633	TCA	2	6	162921	162926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314597
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2522	NC_016633	CTGA	2	8	162986	162993	25 %	25 %	25 %	25 %	374314597
2523	NC_016633	CAT	2	6	163278	163283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314597
2524	NC_016633	CTG	2	6	163335	163340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314597
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2529	NC_016633	CAT	2	6	163441	163446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314597
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2534	NC_016633	TAG	2	6	163658	163663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314598
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2558	NC_016633	GAA	2	6	165517	165522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314600
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2561	NC_016633	TTTC	2	8	165674	165681	0 %	75 %	0 %	25 %	374314600
2562	NC_016633	TCCT	2	8	165686	165693	0 %	50 %	0 %	50 %	374314600
2563	NC_016633	TGCTT	2	10	165723	165732	0 %	60 %	20 %	20 %	374314600
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2584	NC_016633	T	8	8	166643	166650	0 %	100 %	0 %	0 %	374314600
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2589	NC_016633	CGA	2	6	167053	167058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314601
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2593	NC_016633	TGAC	2	8	167454	167461	25 %	25 %	25 %	25 %	374314601
2594	NC_016633	ATG	2	6	167562	167567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314601
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2600	NC_016633	GT	3	6	167793	167798	0 %	50 %	50 %	0 %	374314602
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2606	NC_016633	TAT	2	6	167930	167935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314602
2607	NC_016633	CCAT	2	8	167991	167998	25 %	25 %	0 %	50 %	374314602
2608	NC_016633	CATA	2	8	168006	168013	50 %	25 %	0 %	25 %	374314602
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2610	NC_016633	ATC	2	6	168164	168169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314602
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2612	NC_016633	GTGA	2	8	168350	168357	25 %	25 %	50 %	0 %	374314602
2613	NC_016633	ACAAA	2	10	168374	168383	80 %	0 %	0 %	20 %	374314603
2614	NC_016633	AAG	2	6	168441	168446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314603
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2618	NC_016633	ATCT	2	8	168588	168595	25 %	50 %	0 %	25 %	374314603
2619	NC_016633	AGA	2	6	168733	168738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314603
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2994	NC_016633	GGA	2	6	190957	190962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314622
2995	NC_016633	TTTCAA	2	12	191013	191024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374314622
2996	NC_016633	TAA	2	6	191049	191054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314622
2997	NC_016633	TTC	2	6	191104	191109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314622
2998	NC_016633	T	6	6	191123	191128	0 %	100 %	0 %	0 %	374314622
2999	NC_016633	TGC	2	6	191156	191161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314622
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