MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016633	AGA	2	6	100052	100057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314542
1502	NC_016633	ATAA	2	8	100062	100069	75 %	25 %	0 %	0 %	374314542
1503	NC_016633	GTC	2	6	100073	100078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314542
1504	NC_016633	GAG	2	6	100095	100100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314542
1505	NC_016633	CTTG	2	8	100105	100112	0 %	50 %	25 %	25 %	374314542
1506	NC_016633	GGA	2	6	100348	100353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314542
1507	NC_016633	CAT	2	6	100466	100471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314542
1508	NC_016633	AT	3	6	100470	100475	50 %	50 %	0 %	0 %	374314542
1509	NC_016633	CTG	2	6	100479	100484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314542
1510	NC_016633	TC	3	6	100489	100494	0 %	50 %	0 %	50 %	374314542
1511	NC_016633	GTA	2	6	100527	100532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314542
1512	NC_016633	CCT	2	6	100547	100552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314543
1513	NC_016633	GGTA	2	8	100739	100746	25 %	25 %	50 %	0 %	374314543
1514	NC_016633	TGA	2	6	100748	100753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314543
1515	NC_016633	TTTG	2	8	100779	100786	0 %	75 %	25 %	0 %	374314543
1516	NC_016633	GTA	2	6	100971	100976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314543
1517	NC_016633	GGA	2	6	101112	101117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314543
1518	NC_016633	GTCA	2	8	101118	101125	25 %	25 %	25 %	25 %	374314543
1519	NC_016633	GAT	2	6	101165	101170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314543
1520	NC_016633	CTT	2	6	101172	101177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314543
1521	NC_016633	ACC	2	6	101218	101223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314543
1522	NC_016633	GAG	2	6	101307	101312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314543
1523	NC_016633	GA	3	6	101649	101654	50 %	0 %	50 %	0 %	374314543
1524	NC_016633	T	6	6	101685	101690	0 %	100 %	0 %	0 %	374314543
1525	NC_016633	TC	3	6	101697	101702	0 %	50 %	0 %	50 %	374314543
1526	NC_016633	GTT	2	6	101714	101719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314543
1527	NC_016633	ATCG	2	8	101831	101838	25 %	25 %	25 %	25 %	374314543
1528	NC_016633	TGT	3	9	101845	101853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314543
1529	NC_016633	T	7	7	102114	102120	0 %	100 %	0 %	0 %	374314544
1530	NC_016633	GTTTG	2	10	102222	102231	0 %	60 %	40 %	0 %	374314544
1531	NC_016633	ATC	2	6	102424	102429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314545
1532	NC_016633	AGT	2	6	102586	102591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314545
1533	NC_016633	G	6	6	102786	102791	0 %	0 %	100 %	0 %	374314545
1534	NC_016633	GA	3	6	102997	103002	50 %	0 %	50 %	0 %	374314545
1535	NC_016633	GGA	2	6	103170	103175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314545
1536	NC_016633	GCAG	2	8	103195	103202	25 %	0 %	50 %	25 %	374314545
1537	NC_016633	T	6	6	103221	103226	0 %	100 %	0 %	0 %	374314545
1538	NC_016633	AG	3	6	103237	103242	50 %	0 %	50 %	0 %	374314545
1539	NC_016633	A	6	6	103273	103278	100 %	0 %	0 %	0 %	374314545
1540	NC_016633	GAA	2	6	103304	103309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314545
1541	NC_016633	AGT	2	6	103570	103575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314546
1542	NC_016633	CTT	2	6	103584	103589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
1543	NC_016633	TTG	2	6	103643	103648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314546
1544	NC_016633	CTGG	2	8	103686	103693	0 %	25 %	50 %	25 %	374314546
1545	NC_016633	T	6	6	103741	103746	0 %	100 %	0 %	0 %	374314546
1546	NC_016633	CCG	2	6	103802	103807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314546
1547	NC_016633	CTT	2	6	103845	103850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
1548	NC_016633	GGCCAA	2	12	103926	103937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314546
1549	NC_016633	CGA	2	6	103995	104000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314546
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1551	NC_016633	CCTT	2	8	104063	104070	0 %	50 %	0 %	50 %	374314546
1552	NC_016633	GTT	2	6	104132	104137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314546
1553	NC_016633	TTCTG	2	10	104286	104295	0 %	60 %	20 %	20 %	374314546
1554	NC_016633	GTT	2	6	104315	104320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314546
1555	NC_016633	TTC	2	6	104365	104370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
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1557	NC_016633	TCG	2	6	104420	104425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314546
1558	NC_016633	CTT	2	6	104523	104528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
1559	NC_016633	GCA	2	6	104546	104551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314546
1560	NC_016633	CTT	2	6	104595	104600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
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1562	NC_016633	TCT	2	6	104623	104628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
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1564	NC_016633	TCT	2	6	104798	104803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314546
1565	NC_016633	GCAA	2	8	104852	104859	50 %	0 %	25 %	25 %	374314546
1566	NC_016633	GGGA	2	8	104862	104869	25 %	0 %	75 %	0 %	374314546
1567	NC_016633	T	7	7	104908	104914	0 %	100 %	0 %	0 %	374314546
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1570	NC_016633	CTGT	2	8	105043	105050	0 %	50 %	25 %	25 %	374314546
1571	NC_016633	T	6	6	105087	105092	0 %	100 %	0 %	0 %	374314546
1572	NC_016633	T	6	6	105099	105104	0 %	100 %	0 %	0 %	374314546
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1579	NC_016633	TTCC	2	8	105461	105468	0 %	50 %	0 %	50 %	374314547
1580	NC_016633	T	6	6	105483	105488	0 %	100 %	0 %	0 %	374314547
1581	NC_016633	T	6	6	105567	105572	0 %	100 %	0 %	0 %	374314547
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1604	NC_016633	TTC	2	6	107101	107106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314549
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1611	NC_016633	TC	3	6	107496	107501	0 %	50 %	0 %	50 %	374314549
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1616	NC_016633	TGG	2	6	107842	107847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314549
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1622	NC_016633	GCG	2	6	108244	108249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314549
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1624	NC_016633	AGA	2	6	108336	108341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314549
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1991	NC_016633	TCC	2	6	129952	129957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314569
1992	NC_016633	TTG	2	6	130014	130019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314569
1993	NC_016633	TGC	2	6	130069	130074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314569
1994	NC_016633	TA	4	8	130165	130172	50 %	50 %	0 %	0 %	374314570
1995	NC_016633	A	7	7	130181	130187	100 %	0 %	0 %	0 %	374314570
1996	NC_016633	TTC	2	6	130195	130200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314570
1997	NC_016633	TTG	2	6	130241	130246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314570
1998	NC_016633	TTC	2	6	130249	130254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314570
1999	NC_016633	TCG	2	6	130264	130269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314570
2000	NC_016633	T	6	6	130298	130303	0 %	100 %	0 %	0 %	374314570

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