MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016633	ATC	2	6	67695	67700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314510
1003	NC_016633	GAA	2	6	67764	67769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314510
1004	NC_016633	GA	3	6	67877	67882	50 %	0 %	50 %	0 %	374314510
1005	NC_016633	T	7	7	67886	67892	0 %	100 %	0 %	0 %	374314510
1006	NC_016633	CCTTT	2	10	67894	67903	0 %	60 %	0 %	40 %	374314510
1007	NC_016633	GAA	2	6	68280	68285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314511
1008	NC_016633	AAG	2	6	68290	68295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314511
1009	NC_016633	A	6	6	68325	68330	100 %	0 %	0 %	0 %	374314511
1010	NC_016633	T	6	6	68368	68373	0 %	100 %	0 %	0 %	374314511
1011	NC_016633	GTTG	2	8	68376	68383	0 %	50 %	50 %	0 %	374314511
1012	NC_016633	CCTT	2	8	68435	68442	0 %	50 %	0 %	50 %	374314511
1013	NC_016633	TGG	2	6	68475	68480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314511
1014	NC_016633	CTC	2	6	68538	68543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314511
1015	NC_016633	GCTG	2	8	68550	68557	0 %	25 %	50 %	25 %	374314511
1016	NC_016633	GCTC	2	8	68571	68578	0 %	25 %	25 %	50 %	374314511
1017	NC_016633	A	6	6	68665	68670	100 %	0 %	0 %	0 %	374314511
1018	NC_016633	CGT	2	6	68757	68762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314511
1019	NC_016633	TAT	2	6	68797	68802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314511
1020	NC_016633	GGA	2	6	68819	68824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314511
1021	NC_016633	AAG	2	6	68972	68977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314511
1022	NC_016633	CCTGT	2	10	69098	69107	0 %	40 %	20 %	40 %	374314511
1023	NC_016633	AGT	2	6	69180	69185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314511
1024	NC_016633	GGT	2	6	69196	69201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314511
1025	NC_016633	AGC	2	6	69248	69253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314511
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1027	NC_016633	GGA	2	6	69324	69329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314511
1028	NC_016633	CTT	2	6	69353	69358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314511
1029	NC_016633	GCC	2	6	69382	69387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314511
1030	NC_016633	TGTT	2	8	69476	69483	0 %	75 %	25 %	0 %	374314511
1031	NC_016633	CCTG	2	8	69528	69535	0 %	25 %	25 %	50 %	374314511
1032	NC_016633	GAAGG	2	10	69557	69566	40 %	0 %	60 %	0 %	374314511
1033	NC_016633	CGC	2	6	69578	69583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314511
1034	NC_016633	GAA	2	6	69589	69594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314511
1035	NC_016633	GCAA	2	8	69598	69605	50 %	0 %	25 %	25 %	374314511
1036	NC_016633	AAT	2	6	69666	69671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314511
1037	NC_016633	GGA	2	6	69726	69731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314511
1038	NC_016633	AAG	2	6	69847	69852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314511
1039	NC_016633	ATA	2	6	69855	69860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314511
1040	NC_016633	GTCA	2	8	69935	69942	25 %	25 %	25 %	25 %	374314512
1041	NC_016633	TTC	2	6	69947	69952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314512
1042	NC_016633	TCT	2	6	69963	69968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314512
1043	NC_016633	ACC	2	6	69981	69986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314512
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1045	NC_016633	ACC	2	6	70025	70030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314512
1046	NC_016633	T	8	8	70227	70234	0 %	100 %	0 %	0 %	374314512
1047	NC_016633	CTG	2	6	70430	70435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314513
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1050	NC_016633	AG	3	6	70565	70570	50 %	0 %	50 %	0 %	374314513
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1052	NC_016633	AAT	2	6	70705	70710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314513
1053	NC_016633	CTGCAC	2	12	70712	70723	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374314513
1054	NC_016633	GGCT	2	8	70832	70839	0 %	25 %	50 %	25 %	374314513
1055	NC_016633	TCC	2	6	70840	70845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314513
1056	NC_016633	TTTC	2	8	70897	70904	0 %	75 %	0 %	25 %	374314513
1057	NC_016633	GGAA	2	8	70983	70990	50 %	0 %	50 %	0 %	374314513
1058	NC_016633	CTTGGC	2	12	71019	71030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314513
1059	NC_016633	CCAG	2	8	71042	71049	25 %	0 %	25 %	50 %	374314513
1060	NC_016633	CAGCC	2	10	71081	71090	20 %	0 %	20 %	60 %	374314513
1061	NC_016633	GAG	2	6	71095	71100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314513
1062	NC_016633	TAG	2	6	71140	71145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314513
1063	NC_016633	CAT	2	6	71192	71197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314513
1064	NC_016633	ATC	2	6	71239	71244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314513
1065	NC_016633	TTGG	2	8	71262	71269	0 %	50 %	50 %	0 %	374314513
1066	NC_016633	GTATC	2	10	71353	71362	20 %	40 %	20 %	20 %	374314513
1067	NC_016633	TGT	2	6	71369	71374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314513
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1073	NC_016633	TGA	2	6	71618	71623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314513
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1089	NC_016633	TGCT	2	8	72821	72828	0 %	50 %	25 %	25 %	374314515
1090	NC_016633	GAG	2	6	72943	72948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314515
1091	NC_016633	C	6	6	73314	73319	0 %	0 %	0 %	100 %	374314516
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1098	NC_016633	CAG	2	6	73469	73474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314516
1099	NC_016633	TTG	2	6	73491	73496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314516
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1101	NC_016633	GAT	2	6	73975	73980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314517
1102	NC_016633	TTG	2	6	74066	74071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314517
1103	NC_016633	TCC	2	6	74096	74101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314517
1104	NC_016633	CTG	2	6	74119	74124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314517
1105	NC_016633	GCTGA	2	10	74143	74152	20 %	20 %	40 %	20 %	374314517
1106	NC_016633	GAA	2	6	74160	74165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
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1109	NC_016633	TTA	2	6	74523	74528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314517
1110	NC_016633	A	6	6	74617	74622	100 %	0 %	0 %	0 %	374314517
1111	NC_016633	GAA	2	6	74638	74643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
1112	NC_016633	CAC	2	6	74758	74763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314517
1113	NC_016633	TAT	2	6	74838	74843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314517
1114	NC_016633	ATG	2	6	74852	74857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314517
1115	NC_016633	AAG	2	6	74882	74887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
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1118	NC_016633	GTA	2	6	74950	74955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314517
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1121	NC_016633	TCT	2	6	75238	75243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314518
1122	NC_016633	ATTG	2	8	75255	75262	25 %	50 %	25 %	0 %	374314518
1123	NC_016633	TTGGG	2	10	75301	75310	0 %	40 %	60 %	0 %	374314518
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1251	NC_016633	GA	3	6	82842	82847	50 %	0 %	50 %	0 %	374314524
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1254	NC_016633	ATC	2	6	83100	83105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314525
1255	NC_016633	TACCT	2	10	83154	83163	20 %	40 %	0 %	40 %	374314525
1256	NC_016633	GTT	2	6	83223	83228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314525
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1260	NC_016633	TAC	2	6	83561	83566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314525
1261	NC_016633	CTG	2	6	83769	83774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314525
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1268	NC_016633	TGGA	2	8	84068	84075	25 %	25 %	50 %	0 %	374314525
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