MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016633	AGA	2	6	33817	33822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314479
502	NC_016633	TG	3	6	33842	33847	0 %	50 %	50 %	0 %	374314479
503	NC_016633	AGC	2	6	33853	33858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314479
504	NC_016633	CTG	2	6	33862	33867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314479
505	NC_016633	CAA	2	6	34215	34220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314480
506	NC_016633	CGTTT	2	10	34294	34303	0 %	60 %	20 %	20 %	374314480
507	NC_016633	GAC	2	6	34331	34336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314480
508	NC_016633	GAA	2	6	34374	34379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314480
509	NC_016633	ATT	2	6	34431	34436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314480
510	NC_016633	CAT	2	6	34601	34606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314480
511	NC_016633	TTGC	2	8	34695	34702	0 %	50 %	25 %	25 %	374314480
512	NC_016633	GGC	2	6	34730	34735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314480
513	NC_016633	GAA	2	6	34766	34771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314480
514	NC_016633	TCC	2	6	34836	34841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314480
515	NC_016633	CCTT	2	8	35027	35034	0 %	50 %	0 %	50 %	374314481
516	NC_016633	GAT	2	6	35119	35124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314481
517	NC_016633	AAT	2	6	35168	35173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314481
518	NC_016633	GCAG	2	8	35181	35188	25 %	0 %	50 %	25 %	374314481
519	NC_016633	CGG	2	6	35193	35198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314481
520	NC_016633	AGA	2	6	35216	35221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314481
521	NC_016633	AAG	2	6	35551	35556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314482
522	NC_016633	CGG	2	6	35559	35564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314482
523	NC_016633	GAG	2	6	35679	35684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314482
524	NC_016633	AAGG	2	8	35878	35885	50 %	0 %	50 %	0 %	374314483
525	NC_016633	TGG	2	6	35897	35902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314483
526	NC_016633	ACC	2	6	35927	35932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314483
527	NC_016633	TCT	2	6	35982	35987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314483
528	NC_016633	ATT	2	6	35988	35993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314483
529	NC_016633	TCTG	2	8	36043	36050	0 %	50 %	25 %	25 %	374314483
530	NC_016633	TGC	2	6	36098	36103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
531	NC_016633	AAG	2	6	36113	36118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314483
532	NC_016633	TCG	2	6	36158	36163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
533	NC_016633	ACTT	2	8	36266	36273	25 %	50 %	0 %	25 %	374314483
534	NC_016633	TGC	2	6	36384	36389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
535	NC_016633	CGCT	2	8	36496	36503	0 %	25 %	25 %	50 %	374314483
536	NC_016633	T	6	6	36532	36537	0 %	100 %	0 %	0 %	374314483
537	NC_016633	ATCC	2	8	36550	36557	25 %	25 %	0 %	50 %	374314483
538	NC_016633	TGG	2	6	36607	36612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314483
539	NC_016633	ATC	2	6	36691	36696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314483
540	NC_016633	ATG	2	6	36698	36703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314483
541	NC_016633	TCA	2	6	36803	36808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314483
542	NC_016633	TTTGC	2	10	36833	36842	0 %	60 %	20 %	20 %	374314483
543	NC_016633	TCC	2	6	37012	37017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314483
544	NC_016633	GAA	2	6	37104	37109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314483
545	NC_016633	CTT	2	6	37134	37139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314483
546	NC_016633	CAAG	2	8	37146	37153	50 %	0 %	25 %	25 %	374314483
547	NC_016633	GGC	2	6	37189	37194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314483
548	NC_016633	GCT	2	6	37197	37202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
549	NC_016633	CTT	2	6	37291	37296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314483
550	NC_016633	TCA	2	6	37373	37378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314483
551	NC_016633	CAG	2	6	37431	37436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314483
552	NC_016633	ATT	2	6	37483	37488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314483
553	NC_016633	AAG	2	6	37498	37503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314483
554	NC_016633	CAC	2	6	37509	37514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314483
555	NC_016633	T	6	6	37569	37574	0 %	100 %	0 %	0 %	374314483
556	NC_016633	GAC	2	6	37581	37586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314483
557	NC_016633	GGGGC	2	10	37591	37600	0 %	0 %	80 %	20 %	374314483
558	NC_016633	GTCG	2	8	37798	37805	0 %	25 %	50 %	25 %	374314483
559	NC_016633	GAG	2	6	37927	37932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314483
560	NC_016633	TCG	2	6	38045	38050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
561	NC_016633	ATC	2	6	38054	38059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314483
562	NC_016633	CGAT	2	8	38106	38113	25 %	25 %	25 %	25 %	374314483
563	NC_016633	GCCG	2	8	38149	38156	0 %	0 %	50 %	50 %	374314483
564	NC_016633	GT	3	6	38174	38179	0 %	50 %	50 %	0 %	374314483
565	NC_016633	GCC	2	6	38200	38205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314483
566	NC_016633	GAG	2	6	38225	38230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314483
567	NC_016633	GAAA	2	8	38257	38264	75 %	0 %	25 %	0 %	374314484
568	NC_016633	GGA	2	6	38316	38321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314484
569	NC_016633	CCT	2	6	38344	38349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314484
570	NC_016633	GAT	2	6	38439	38444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314484
571	NC_016633	CTG	2	6	38592	38597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314484
572	NC_016633	GAAA	2	8	38607	38614	75 %	0 %	25 %	0 %	374314484
573	NC_016633	AAGG	2	8	38713	38720	50 %	0 %	50 %	0 %	374314484
574	NC_016633	CTG	2	6	38750	38755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314484
575	NC_016633	TGA	2	6	38795	38800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314484
576	NC_016633	TAT	2	6	38910	38915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314484
577	NC_016633	TGC	2	6	38921	38926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314484
578	NC_016633	TCA	2	6	38965	38970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314484
579	NC_016633	GAA	2	6	39087	39092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314484
580	NC_016633	GGTC	2	8	39223	39230	0 %	25 %	50 %	25 %	374314484
581	NC_016633	AAG	2	6	39259	39264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314484
582	NC_016633	TTG	2	6	39352	39357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314484
583	NC_016633	TGC	2	6	39437	39442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314484
584	NC_016633	TTG	2	6	39499	39504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314484
585	NC_016633	CTTTTT	2	12	39553	39564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374314485
586	NC_016633	TTCC	2	8	39754	39761	0 %	50 %	0 %	50 %	374314485
587	NC_016633	TTCT	2	8	39854	39861	0 %	75 %	0 %	25 %	374314485
588	NC_016633	TTTC	2	8	39872	39879	0 %	75 %	0 %	25 %	374314485
589	NC_016633	ACC	2	6	39894	39899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314485
590	NC_016633	GCA	2	6	40020	40025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314485
591	NC_016633	TCTA	2	8	40067	40074	25 %	50 %	0 %	25 %	374314485
592	NC_016633	CTG	2	6	40118	40123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314485
593	NC_016633	CAA	2	6	40182	40187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314485
594	NC_016633	TCA	2	6	40245	40250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314485
595	NC_016633	T	6	6	40260	40265	0 %	100 %	0 %	0 %	374314485
596	NC_016633	CTG	2	6	40292	40297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314485
597	NC_016633	ATT	2	6	40415	40420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314486
598	NC_016633	GGTT	2	8	40434	40441	0 %	50 %	50 %	0 %	374314486
599	NC_016633	TCC	2	6	40554	40559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314486
600	NC_016633	GCTT	2	8	40689	40696	0 %	50 %	25 %	25 %	374314486
601	NC_016633	TTC	2	6	40726	40731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314486
602	NC_016633	GGA	2	6	40749	40754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314486
603	NC_016633	ATT	2	6	40806	40811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314486
604	NC_016633	TTC	2	6	40848	40853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314486
605	NC_016633	CGA	2	6	40964	40969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314486
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607	NC_016633	C	6	6	41058	41063	0 %	0 %	0 %	100 %	374314486
608	NC_016633	ATT	2	6	41134	41139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314486
609	NC_016633	GAGT	2	8	41153	41160	25 %	25 %	50 %	0 %	374314486
610	NC_016633	GAA	2	6	41221	41226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314486
611	NC_016633	CTG	2	6	41248	41253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314486
612	NC_016633	TGC	2	6	41301	41306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314486
613	NC_016633	CGT	2	6	41331	41336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314486
614	NC_016633	GCT	2	6	41346	41351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314486
615	NC_016633	C	6	6	41505	41510	0 %	0 %	0 %	100 %	374314486
616	NC_016633	CTT	2	6	41518	41523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314486
617	NC_016633	ATCGAA	2	12	41616	41627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374314486
618	NC_016633	ATGG	2	8	41717	41724	25 %	25 %	50 %	0 %	374314487
619	NC_016633	CGG	2	6	41758	41763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314487
620	NC_016633	AGT	2	6	41832	41837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314487
621	NC_016633	ATA	2	6	41859	41864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314487
622	NC_016633	CTTC	2	8	41959	41966	0 %	50 %	0 %	50 %	374314487
623	NC_016633	GGTT	2	8	41980	41987	0 %	50 %	50 %	0 %	374314487
624	NC_016633	T	6	6	41986	41991	0 %	100 %	0 %	0 %	374314487
625	NC_016633	TAC	2	6	42077	42082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314487
626	NC_016633	ATC	2	6	42092	42097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314487
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628	NC_016633	AAG	2	6	42149	42154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314487
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