MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016633	ATATA	2	10	324483	324492	60 %	40 %	0 %	0 %	374314746
5003	NC_016633	CGTTT	2	10	324538	324547	0 %	60 %	20 %	20 %	374314746
5004	NC_016633	TTCCT	2	10	324578	324587	0 %	60 %	0 %	40 %	374314746
5005	NC_016633	AAG	2	6	324787	324792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314746
5006	NC_016633	CAG	2	6	324799	324804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314746
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5009	NC_016633	CAA	2	6	325007	325012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314746
5010	NC_016633	T	6	6	325040	325045	0 %	100 %	0 %	0 %	374314746
5011	NC_016633	TGG	2	6	325364	325369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314747
5012	NC_016633	TGG	2	6	325391	325396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314747
5013	NC_016633	ACC	2	6	325461	325466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314747
5014	NC_016633	AAT	2	6	325467	325472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314747
5015	NC_016633	A	6	6	325530	325535	100 %	0 %	0 %	0 %	374314747
5016	NC_016633	ATC	2	6	325539	325544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314747
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5018	NC_016633	ATTGA	2	10	325722	325731	40 %	40 %	20 %	0 %	374314747
5019	NC_016633	TTTC	2	8	325829	325836	0 %	75 %	0 %	25 %	374314748
5020	NC_016633	G	6	6	325846	325851	0 %	0 %	100 %	0 %	374314748
5021	NC_016633	AGT	2	6	325899	325904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314748
5022	NC_016633	GAT	2	6	325930	325935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314748
5023	NC_016633	ATC	2	6	325975	325980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314748
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5025	NC_016633	TCG	2	6	326036	326041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314748
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5030	NC_016633	CAT	2	6	326223	326228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314748
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5033	NC_016633	T	6	6	326373	326378	0 %	100 %	0 %	0 %	374314749
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5041	NC_016633	GCA	2	6	326853	326858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314749
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5043	NC_016633	CTCC	2	8	326931	326938	0 %	25 %	0 %	75 %	374314750
5044	NC_016633	CTT	2	6	326970	326975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314750
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5055	NC_016633	TCCA	2	8	327643	327650	25 %	25 %	0 %	50 %	374314751
5056	NC_016633	TGA	2	6	327722	327727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314751
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5059	NC_016633	T	6	6	327897	327902	0 %	100 %	0 %	0 %	374314751
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5062	NC_016633	GCA	2	6	328135	328140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314751
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5093	NC_016633	A	6	6	330110	330115	100 %	0 %	0 %	0 %	374314753
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5103	NC_016633	TGGA	2	8	330753	330760	25 %	25 %	50 %	0 %	374314754
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5108	NC_016633	CCTT	2	8	331183	331190	0 %	50 %	0 %	50 %	374314754
5109	NC_016633	CCTGC	2	10	331358	331367	0 %	20 %	20 %	60 %	374314754
5110	NC_016633	CATA	2	8	331382	331389	50 %	25 %	0 %	25 %	374314754
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5116	NC_016633	CAT	2	6	332275	332280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314755
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5118	NC_016633	GAT	2	6	332309	332314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314755
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5489	NC_016633	ACGT	2	8	356568	356575	25 %	25 %	25 %	25 %	374314773
5490	NC_016633	CAA	2	6	356722	356727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314774
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5492	NC_016633	ATC	2	6	356870	356875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314774
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