MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 55528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016633	T	6	6	293028	293033	0 %	100 %	0 %	0 %	374314714
4502	NC_016633	TTC	2	6	293037	293042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314714
4503	NC_016633	AGAT	2	8	293053	293060	50 %	25 %	25 %	0 %	374314714
4504	NC_016633	TTC	2	6	293061	293066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314714
4505	NC_016633	AAC	2	6	293138	293143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314714
4506	NC_016633	ATATA	2	10	293155	293164	60 %	40 %	0 %	0 %	374314714
4507	NC_016633	TC	3	6	293167	293172	0 %	50 %	0 %	50 %	374314714
4508	NC_016633	ATA	2	6	293178	293183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314714
4509	NC_016633	GTT	2	6	293232	293237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314714
4510	NC_016633	GTT	2	6	293240	293245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314714
4511	NC_016633	CTT	2	6	293398	293403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314715
4512	NC_016633	T	6	6	293447	293452	0 %	100 %	0 %	0 %	374314715
4513	NC_016633	TTTTC	2	10	293458	293467	0 %	80 %	0 %	20 %	374314715
4514	NC_016633	TTC	2	6	293486	293491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314715
4515	NC_016633	TGA	2	6	293500	293505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314715
4516	NC_016633	TTC	2	6	293542	293547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314715
4517	NC_016633	TTA	2	6	293593	293598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314715
4518	NC_016633	AGA	2	6	293634	293639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314715
4519	NC_016633	GTA	2	6	293643	293648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314715
4520	NC_016633	AGG	2	6	293685	293690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314715
4521	NC_016633	T	7	7	293745	293751	0 %	100 %	0 %	0 %	374314715
4522	NC_016633	T	6	6	293852	293857	0 %	100 %	0 %	0 %	374314715
4523	NC_016633	TGCAA	2	10	293864	293873	40 %	20 %	20 %	20 %	374314715
4524	NC_016633	AC	3	6	293875	293880	50 %	0 %	0 %	50 %	374314715
4525	NC_016633	CTG	2	6	293882	293887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314715
4526	NC_016633	TCT	3	9	293907	293915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314715
4527	NC_016633	TTCA	2	8	293972	293979	25 %	50 %	0 %	25 %	374314715
4528	NC_016633	CAA	2	6	294137	294142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314715
4529	NC_016633	CAT	2	6	294185	294190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314715
4530	NC_016633	TGA	2	6	294249	294254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314715
4531	NC_016633	AT	3	6	294255	294260	50 %	50 %	0 %	0 %	374314715
4532	NC_016633	AGC	2	6	294284	294289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314715
4533	NC_016633	CT	3	6	294293	294298	0 %	50 %	0 %	50 %	374314715
4534	NC_016633	CTT	2	6	294343	294348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314715
4535	NC_016633	T	8	8	294347	294354	0 %	100 %	0 %	0 %	374314715
4536	NC_016633	ATT	2	6	294428	294433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314715
4537	NC_016633	ATAGG	2	10	294465	294474	40 %	20 %	40 %	0 %	374314715
4538	NC_016633	GTT	2	6	294477	294482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314715
4539	NC_016633	TAT	2	6	295455	295460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
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4541	NC_016633	TAT	2	6	295475	295480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
4542	NC_016633	ATT	2	6	295489	295494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
4543	NC_016633	T	6	6	295503	295508	0 %	100 %	0 %	0 %	374314716
4544	NC_016633	CAA	2	6	295514	295519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314716
4545	NC_016633	TGA	2	6	295524	295529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314716
4546	NC_016633	TGA	2	6	295542	295547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314716
4547	NC_016633	TGA	2	6	295566	295571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314716
4548	NC_016633	GAA	2	6	295672	295677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314716
4549	NC_016633	TTATT	2	10	295678	295687	20 %	80 %	0 %	0 %	374314716
4550	NC_016633	A	7	7	295764	295770	100 %	0 %	0 %	0 %	374314716
4551	NC_016633	A	7	7	295778	295784	100 %	0 %	0 %	0 %	374314716
4552	NC_016633	ATG	2	6	295826	295831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314716
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4554	NC_016633	TGA	2	6	295926	295931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314716
4555	NC_016633	ATTTTG	2	12	295985	295996	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374314716
4556	NC_016633	AAAT	2	8	296081	296088	75 %	25 %	0 %	0 %	374314716
4557	NC_016633	ATT	2	6	296094	296099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
4558	NC_016633	ACTC	2	8	296240	296247	25 %	25 %	0 %	50 %	374314716
4559	NC_016633	TTA	2	6	296254	296259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
4560	NC_016633	TTA	2	6	296273	296278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
4561	NC_016633	AAGA	2	8	296358	296365	75 %	0 %	25 %	0 %	374314716
4562	NC_016633	AGA	2	6	296376	296381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314716
4563	NC_016633	AG	3	6	296403	296408	50 %	0 %	50 %	0 %	374314716
4564	NC_016633	GA	3	6	296446	296451	50 %	0 %	50 %	0 %	374314716
4565	NC_016633	ATA	2	6	296465	296470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314716
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4568	NC_016633	TGAA	2	8	296654	296661	50 %	25 %	25 %	0 %	374314716
4569	NC_016633	ATT	2	6	296665	296670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314716
4570	NC_016633	TA	4	8	296849	296856	50 %	50 %	0 %	0 %	374314716
4571	NC_016633	TGT	2	6	296871	296876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314716
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4574	NC_016633	AAATC	2	10	297001	297010	60 %	20 %	0 %	20 %	374314716
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4579	NC_016633	TAC	2	6	297204	297209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314717
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4581	NC_016633	GA	3	6	297290	297295	50 %	0 %	50 %	0 %	374314717
4582	NC_016633	ACTC	2	8	297300	297307	25 %	25 %	0 %	50 %	374314717
4583	NC_016633	GTTT	2	8	297329	297336	0 %	75 %	25 %	0 %	374314717
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4589	NC_016633	ATC	2	6	297547	297552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314717
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4591	NC_016633	TTC	2	6	297603	297608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314717
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4593	NC_016633	TTC	2	6	297712	297717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314717
4594	NC_016633	TTC	2	6	297763	297768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314717
4595	NC_016633	CTAT	2	8	297769	297776	25 %	50 %	0 %	25 %	374314717
4596	NC_016633	GAG	2	6	297899	297904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314717
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4598	NC_016633	GAG	2	6	298169	298174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314717
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4601	NC_016633	GAAG	2	8	298322	298329	50 %	0 %	50 %	0 %	374314717
4602	NC_016633	ATG	2	6	298371	298376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314717
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4604	NC_016633	T	6	6	298437	298442	0 %	100 %	0 %	0 %	374314717
4605	NC_016633	GAT	2	6	298475	298480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314717
4606	NC_016633	AGA	2	6	298572	298577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314717
4607	NC_016633	TA	3	6	298667	298672	50 %	50 %	0 %	0 %	374314717
4608	NC_016633	CCAA	2	8	299750	299757	50 %	0 %	0 %	50 %	374314718
4609	NC_016633	TTGA	2	8	299785	299792	25 %	50 %	25 %	0 %	374314718
4610	NC_016633	TAC	2	6	299895	299900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314718
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4612	NC_016633	ATG	2	6	299938	299943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314718
4613	NC_016633	A	6	6	300005	300010	100 %	0 %	0 %	0 %	374314718
4614	NC_016633	AGC	3	9	300126	300134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314718
4615	NC_016633	TTG	2	6	300341	300346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314719
4616	NC_016633	GCTTT	2	10	300363	300372	0 %	60 %	20 %	20 %	374314719
4617	NC_016633	CAC	2	6	300435	300440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314719
4618	NC_016633	ACAT	2	8	300443	300450	50 %	25 %	0 %	25 %	374314719
4619	NC_016633	CAAC	2	8	300491	300498	50 %	0 %	0 %	50 %	374314719
4620	NC_016633	TGGCA	2	10	300501	300510	20 %	20 %	40 %	20 %	374314719
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4623	NC_016633	CAT	2	6	300594	300599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314719
4624	NC_016633	TCA	2	6	300716	300721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314719
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4994	NC_016633	AAGGA	2	10	323993	324002	60 %	0 %	40 %	0 %	374314745
4995	NC_016633	GTCT	2	8	324006	324013	0 %	50 %	25 %	25 %	374314745
4996	NC_016633	GA	3	6	324072	324077	50 %	0 %	50 %	0 %	374314745
4997	NC_016633	TGG	2	6	324113	324118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314745
4998	NC_016633	CTGC	2	8	324197	324204	0 %	25 %	25 %	50 %	374314746
4999	NC_016633	T	6	6	324239	324244	0 %	100 %	0 %	0 %	374314746
5000	NC_016633	AGAGGG	2	12	324283	324294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314746

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