MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 65703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015976	GGC	2	6	219	224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526386
2	NC_015976	AGC	2	6	284	289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526386
3	NC_015976	CAT	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526386
4	NC_015976	GGA	2	6	306	311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526386
5	NC_015976	AGC	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526386
6	NC_015976	TCG	2	6	407	412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526386
7	NC_015976	CGC	2	6	413	418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526386
8	NC_015976	TCT	2	6	447	452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526386
9	NC_015976	ATG	3	9	545	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526386
10	NC_015976	GGA	2	6	573	578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526386
11	NC_015976	CGC	4	12	686	697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526386
12	NC_015976	GTC	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526386
13	NC_015976	CGG	2	6	740	745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526386
14	NC_015976	GCT	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526386
15	NC_015976	CGG	3	9	920	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526386
16	NC_015976	GAA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526386
17	NC_015976	CGC	2	6	966	971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526386
18	NC_015976	GCC	3	9	1036	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526387
19	NC_015976	CTG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
20	NC_015976	TGG	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526387
21	NC_015976	CGA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526387
22	NC_015976	GCC	2	6	1284	1289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526387
23	NC_015976	CTG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
24	NC_015976	GCG	2	6	1335	1340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526387
25	NC_015976	GCG	2	6	1354	1359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526387
26	NC_015976	GGT	2	6	1459	1464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526387
27	NC_015976	GCT	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
28	NC_015976	CTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526387
29	NC_015976	TGC	2	6	1738	1743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
30	NC_015976	GCG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
31	NC_015976	CGG	2	6	1921	1926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
32	NC_015976	TCC	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526388
33	NC_015976	GCT	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
34	NC_015976	GCG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
35	NC_015976	TCG	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
36	NC_015976	GCT	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
37	NC_015976	CTG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
38	NC_015976	TCC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526388
39	NC_015976	GCC	2	6	2185	2190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526388
40	NC_015976	GTC	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526388
41	NC_015976	CGC	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526388
42	NC_015976	GGC	2	6	2332	2337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526388
43	NC_015976	TCT	2	6	2352	2357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526388
44	NC_015976	CCG	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526389
45	NC_015976	ATG	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526389
46	NC_015976	CAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526389
47	NC_015976	GGC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526389
48	NC_015976	TGC	2	6	2760	2765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526389
49	NC_015976	CTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526389
50	NC_015976	GTC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526389
51	NC_015976	TCC	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526389
52	NC_015976	GCC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526389
53	NC_015976	CCG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526389
54	NC_015976	TCG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526390
55	NC_015976	CGG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526390
56	NC_015976	GCC	2	6	3284	3289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526390
57	NC_015976	GCT	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526390
58	NC_015976	CGA	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526390
59	NC_015976	TGG	2	6	3321	3326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526390
60	NC_015976	GCT	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526390
61	NC_015976	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526390
62	NC_015976	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526391
63	NC_015976	GCC	2	6	4073	4078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
64	NC_015976	AGC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526391
65	NC_015976	GCC	2	6	4113	4118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
66	NC_015976	CCG	2	6	4140	4145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
67	NC_015976	CGA	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526391
68	NC_015976	GTC	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526391
69	NC_015976	GGA	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526391
70	NC_015976	GGT	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526391
71	NC_015976	TGA	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526391
72	NC_015976	GCT	2	6	4336	4341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526391
73	NC_015976	CCG	2	6	4381	4386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526391
74	NC_015976	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526392
75	NC_015976	AGC	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526392
76	NC_015976	CGG	3	9	4829	4837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526392
77	NC_015976	ATC	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526392
78	NC_015976	CGT	3	9	4886	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526392
79	NC_015976	CGA	2	6	4928	4933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526392
80	NC_015976	TGC	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526392
81	NC_015976	GCG	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526392
82	NC_015976	CTG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526392
83	NC_015976	CGG	2	6	5093	5098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526392
84	NC_015976	CGG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526393
85	NC_015976	CAC	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526393
86	NC_015976	GCG	2	6	5451	5456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526393
87	NC_015976	CCA	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526393
88	NC_015976	AGC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526393
89	NC_015976	CGA	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526394
90	NC_015976	GGC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526394
91	NC_015976	GCA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526394
92	NC_015976	ATG	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526394
93	NC_015976	CGC	3	9	5891	5899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526394
94	NC_015976	GCT	2	6	5910	5915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526394
95	NC_015976	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526395
96	NC_015976	CGC	2	6	6114	6119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526395
97	NC_015976	GTC	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
98	NC_015976	CGC	2	6	6278	6283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526395
99	NC_015976	AGC	2	6	6296	6301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526395
100	NC_015976	CGC	2	6	6324	6329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526395
101	NC_015976	GCG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526395
102	NC_015976	TTA	2	6	6384	6389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526395
103	NC_015976	GTC	2	6	6436	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
104	NC_015976	CCA	2	6	6470	6475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526395
105	NC_015976	GCG	2	6	6482	6487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526395
106	NC_015976	GTC	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526395
107	NC_015976	CTT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526395
108	NC_015976	TCT	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526395
109	NC_015976	CGG	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526396
110	NC_015976	CAT	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526396
111	NC_015976	GCA	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526396
112	NC_015976	ATT	2	6	7026	7031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526396
113	NC_015976	CGG	2	6	7065	7070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526396
114	NC_015976	TCG	2	6	7128	7133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526396
115	NC_015976	ATG	2	6	7143	7148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526396
116	NC_015976	CGC	2	6	7223	7228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526396
117	NC_015976	GCC	2	6	7229	7234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526396
118	NC_015976	CGC	2	6	7235	7240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526396
119	NC_015976	CCG	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526397
120	NC_015976	CGA	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526397
121	NC_015976	CGC	2	6	7760	7765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526397
122	NC_015976	CGA	2	6	7826	7831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526397
123	NC_015976	GAT	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526397
124	NC_015976	GGC	2	6	7961	7966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526397
125	NC_015976	GTG	2	6	8010	8015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526397
126	NC_015976	TCA	3	9	8074	8082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526397
127	NC_015976	CGA	2	6	8087	8092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526397
128	NC_015976	CGA	2	6	8135	8140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526397
129	NC_015976	TCG	2	6	8176	8181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526397
130	NC_015976	GCG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526397
131	NC_015976	CGG	2	6	8192	8197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526397
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254	NC_015976	AGC	2	6	15308	15313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526400
255	NC_015976	GTC	2	6	15373	15378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526400
256	NC_015976	GCA	2	6	15381	15386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526400
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258	NC_015976	CAT	2	6	15511	15516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526400
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283	NC_015976	GGC	2	6	17208	17213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526401
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371	NC_015976	CAC	2	6	24709	24714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526409
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373	NC_015976	TGC	2	6	24724	24729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526409
374	NC_015976	CAG	2	6	24757	24762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
375	NC_015976	AGG	2	6	24950	24955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526409
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495	NC_015976	TCA	2	6	32325	32330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526420
496	NC_015976	CTT	2	6	32398	32403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526420
497	NC_015976	GTC	2	6	32477	32482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526420
498	NC_015976	GCC	2	6	32520	32525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526420
499	NC_015976	GCT	2	6	32590	32595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526420
500	NC_015976	GGC	2	6	32611	32616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526420

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