MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 96648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015976	AGGCG	2	10	168276	168285	20 %	0 %	60 %	20 %	347526552
4003	NC_015976	AAGGG	2	10	168305	168314	40 %	0 %	60 %	0 %	347526552
4004	NC_015976	CAG	2	6	168333	168338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4005	NC_015976	CGA	2	6	168401	168406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4006	NC_015976	CG	3	6	168426	168431	0 %	0 %	50 %	50 %	347526552
4007	NC_015976	ACG	2	6	168478	168483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4008	NC_015976	GCG	2	6	168566	168571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526552
4009	NC_015976	GGCC	2	8	168590	168597	0 %	0 %	50 %	50 %	347526552
4010	NC_015976	TCG	2	6	168640	168645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4011	NC_015976	GCG	2	6	168658	168663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526552
4012	NC_015976	ATCG	2	8	168669	168676	25 %	25 %	25 %	25 %	347526552
4013	NC_015976	GGC	2	6	168849	168854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526552
4014	NC_015976	CCTG	2	8	168860	168867	0 %	25 %	25 %	50 %	347526552
4015	NC_015976	CTTC	2	8	168932	168939	0 %	50 %	0 %	50 %	347526552
4016	NC_015976	GCC	2	6	169021	169026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526552
4017	NC_015976	GCA	2	6	169034	169039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4018	NC_015976	ACGG	2	8	169051	169058	25 %	0 %	50 %	25 %	347526552
4019	NC_015976	GGGC	2	8	169073	169080	0 %	0 %	75 %	25 %	347526552
4020	NC_015976	GCG	2	6	169091	169096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526552
4021	NC_015976	CAG	2	6	169107	169112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4022	NC_015976	GAA	2	6	169122	169127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526552
4023	NC_015976	CGT	2	6	169222	169227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526553
4024	NC_015976	GCG	2	6	169233	169238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526553
4025	NC_015976	CCG	2	6	169263	169268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526553
4026	NC_015976	GCG	2	6	169302	169307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526553
4027	NC_015976	GGGAA	2	10	169320	169329	40 %	0 %	60 %	0 %	347526553
4028	NC_015976	AGCCG	2	10	169349	169358	20 %	0 %	40 %	40 %	347526553
4029	NC_015976	CGG	2	6	169390	169395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526553
4030	NC_015976	CG	5	10	169399	169408	0 %	0 %	50 %	50 %	347526553
4031	NC_015976	GGA	2	6	169424	169429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526553
4032	NC_015976	CGG	2	6	169462	169467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526553
4033	NC_015976	TCC	2	6	169539	169544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526553
4034	NC_015976	GC	4	8	169561	169568	0 %	0 %	50 %	50 %	347526553
4035	NC_015976	CAC	2	6	169574	169579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526553
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4037	NC_015976	CCGC	2	8	169632	169639	0 %	0 %	25 %	75 %	347526553
4038	NC_015976	CCGT	2	8	169660	169667	0 %	25 %	25 %	50 %	347526553
4039	NC_015976	TTC	3	9	169707	169715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526553
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4041	NC_015976	CAT	2	6	169738	169743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526553
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4043	NC_015976	CCG	2	6	169792	169797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526553
4044	NC_015976	GCGG	2	8	169810	169817	0 %	0 %	75 %	25 %	347526553
4045	NC_015976	GAT	2	6	169826	169831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526553
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4051	NC_015976	CTG	2	6	170087	170092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526553
4052	NC_015976	AGCGA	2	10	170110	170119	40 %	0 %	40 %	20 %	347526553
4053	NC_015976	GCG	2	6	170149	170154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526553
4054	NC_015976	CAT	2	6	170203	170208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526553
4055	NC_015976	CGG	2	6	170247	170252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526553
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4057	NC_015976	CCA	2	6	170293	170298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526553
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4060	NC_015976	GAT	2	6	170396	170401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526553
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4063	NC_015976	CAT	2	6	170576	170581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526553
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4065	NC_015976	CAT	2	6	170762	170767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526553
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4104	NC_015976	GC	3	6	172098	172103	0 %	0 %	50 %	50 %	347526554
4105	NC_015976	CAGC	2	8	172163	172170	25 %	0 %	25 %	50 %	347526554
4106	NC_015976	CGA	2	6	172189	172194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526554
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4109	NC_015976	TGCCT	2	10	172280	172289	0 %	40 %	20 %	40 %	347526554
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4120	NC_015976	GCTG	2	8	172725	172732	0 %	25 %	50 %	25 %	347526555
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4245	NC_015976	CCG	2	6	177857	177862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526558
4246	NC_015976	TGC	2	6	177866	177871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4247	NC_015976	GA	3	6	177872	177877	50 %	0 %	50 %	0 %	347526558
4248	NC_015976	CG	3	6	177920	177925	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4249	NC_015976	CGA	2	6	177957	177962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4251	NC_015976	GCA	2	6	178097	178102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4252	NC_015976	GC	5	10	178109	178118	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4253	NC_015976	TCGATG	2	12	178175	178186	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347526558
4254	NC_015976	CGG	2	6	178189	178194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
4255	NC_015976	CGG	2	6	178206	178211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
4256	NC_015976	GGAT	2	8	178243	178250	25 %	25 %	50 %	0 %	347526558
4257	NC_015976	CAG	2	6	178267	178272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4259	NC_015976	GGC	2	6	178322	178327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
4260	NC_015976	AAT	2	6	178371	178376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526558
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4263	NC_015976	CTG	2	6	178495	178500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4264	NC_015976	GC	3	6	178573	178578	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4265	NC_015976	GCA	2	6	178593	178598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4270	NC_015976	GCA	2	6	178751	178756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4271	NC_015976	CAT	2	6	178764	178769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526558
4272	NC_015976	CG	3	6	178817	178822	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4273	NC_015976	GCC	2	6	178824	178829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526558
4274	NC_015976	TCA	2	6	178851	178856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526558
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4276	NC_015976	GCG	3	9	178883	178891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
4277	NC_015976	GCA	2	6	178902	178907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4280	NC_015976	CAG	3	9	178954	178962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4284	NC_015976	AGC	2	6	179039	179044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4297	NC_015976	CCGG	2	8	179501	179508	0 %	0 %	50 %	50 %	347526559
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4327	NC_015976	CG	4	8	180509	180516	0 %	0 %	50 %	50 %	347526559
4328	NC_015976	TCG	2	6	180526	180531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526559
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4340	NC_015976	GCCGC	2	10	181004	181013	0 %	0 %	40 %	60 %	347526560
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4345	NC_015976	GGTCA	2	10	181204	181213	20 %	20 %	40 %	20 %	347526560
4346	NC_015976	GCC	2	6	181228	181233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526560
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4351	NC_015976	AGC	2	6	181322	181327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526560
4352	NC_015976	TGG	2	6	181416	181421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526560
4353	NC_015976	GCG	2	6	181424	181429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526560
4354	NC_015976	CGG	2	6	181473	181478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526560
4355	NC_015976	GCC	2	6	181521	181526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526560
4356	NC_015976	CCG	2	6	181538	181543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526560
4357	NC_015976	GGC	2	6	181607	181612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526560
4358	NC_015976	CATG	2	8	181659	181666	25 %	25 %	25 %	25 %	347526560
4359	NC_015976	C	6	6	182026	182031	0 %	0 %	0 %	100 %	347526561
4360	NC_015976	GCT	3	9	182040	182048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526561
4361	NC_015976	GAT	2	6	182177	182182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526561
4362	NC_015976	CGT	2	6	182234	182239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526561
4363	NC_015976	CCA	2	6	182272	182277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526561
4364	NC_015976	ATG	2	6	182481	182486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526562
4365	NC_015976	GGC	2	6	182519	182524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526562
4366	NC_015976	GC	3	6	182548	182553	0 %	0 %	50 %	50 %	347526562
4367	NC_015976	GTG	2	6	182574	182579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526562
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4421	NC_015976	GC	3	6	184976	184981	0 %	0 %	50 %	50 %	347526565
4422	NC_015976	GGC	2	6	185016	185021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526565
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4442	NC_015976	GC	3	6	185860	185865	0 %	0 %	50 %	50 %	347526566
4443	NC_015976	CG	4	8	185887	185894	0 %	0 %	50 %	50 %	347526566
4444	NC_015976	TCG	2	6	185915	185920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526566
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4477	NC_015976	GA	3	6	187277	187282	50 %	0 %	50 %	0 %	347526566
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4490	NC_015976	CGC	2	6	187882	187887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526567
4491	NC_015976	GCT	2	6	187896	187901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526567
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4493	NC_015976	GC	3	6	188187	188192	0 %	0 %	50 %	50 %	347526568
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