MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 96648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015976	GCC	2	6	126811	126816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3002	NC_015976	CACCG	2	10	126823	126832	20 %	0 %	20 %	60 %	347526514
3003	NC_015976	TCA	2	6	126950	126955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526514
3004	NC_015976	GCA	2	6	126960	126965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3005	NC_015976	CTG	2	6	127039	127044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3006	NC_015976	TCA	2	6	127058	127063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526514
3007	NC_015976	CTT	2	6	127074	127079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526514
3008	NC_015976	GAG	2	6	127117	127122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526514
3009	NC_015976	TGC	2	6	127140	127145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3010	NC_015976	GCA	2	6	127194	127199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3011	NC_015976	CGAT	2	8	127220	127227	25 %	25 %	25 %	25 %	347526514
3012	NC_015976	TCG	2	6	127232	127237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3013	NC_015976	GAG	2	6	127306	127311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526514
3014	NC_015976	GCT	2	6	127353	127358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3015	NC_015976	GCT	2	6	127365	127370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3016	NC_015976	GC	3	6	127390	127395	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3017	NC_015976	TGG	2	6	127472	127477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526514
3018	NC_015976	CGC	2	6	127583	127588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3019	NC_015976	CCG	2	6	127598	127603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3020	NC_015976	GCCG	2	8	127626	127633	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3021	NC_015976	CGC	2	6	127758	127763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3022	NC_015976	CAC	2	6	127779	127784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526514
3023	NC_015976	G	6	6	127785	127790	0 %	0 %	100 %	0 %	347526514
3024	NC_015976	TCG	2	6	127802	127807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3025	NC_015976	G	6	6	127816	127821	0 %	0 %	100 %	0 %	347526514
3026	NC_015976	GGC	2	6	127840	127845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526514
3027	NC_015976	CAAG	2	8	127860	127867	50 %	0 %	25 %	25 %	347526514
3028	NC_015976	GC	3	6	127896	127901	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3029	NC_015976	CGG	2	6	127914	127919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526514
3030	NC_015976	GGGCA	2	10	127933	127942	20 %	0 %	60 %	20 %	347526514
3031	NC_015976	GCGAC	2	10	128018	128027	20 %	0 %	40 %	40 %	347526514
3032	NC_015976	AGG	2	6	128039	128044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526514
3033	NC_015976	AAGGC	2	10	128051	128060	40 %	0 %	40 %	20 %	347526514
3034	NC_015976	GCC	2	6	128104	128109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3035	NC_015976	CGAGGA	2	12	128148	128159	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347526514
3036	NC_015976	GAA	2	6	128169	128174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526514
3037	NC_015976	GAA	2	6	128176	128181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526514
3038	NC_015976	ACA	2	6	128210	128215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526514
3039	NC_015976	CGA	2	6	128220	128225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3040	NC_015976	CGCGC	2	10	128325	128334	0 %	0 %	40 %	60 %	347526514
3041	NC_015976	CG	3	6	128374	128379	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3042	NC_015976	GCCG	2	8	128439	128446	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3043	NC_015976	CG	3	6	128465	128470	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3044	NC_015976	GC	3	6	128523	128528	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3045	NC_015976	CG	3	6	128543	128548	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3046	NC_015976	TGG	2	6	128555	128560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526514
3047	NC_015976	TC	3	6	128667	128672	0 %	50 %	0 %	50 %	347526514
3048	NC_015976	GCC	2	6	128682	128687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3049	NC_015976	CG	3	6	128692	128697	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3050	NC_015976	GGA	2	6	128700	128705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526514
3051	NC_015976	TGG	2	6	128717	128722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526514
3052	NC_015976	CGC	2	6	128783	128788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3053	NC_015976	CG	4	8	128907	128914	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3054	NC_015976	CGG	2	6	128967	128972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526514
3055	NC_015976	TGGG	2	8	128990	128997	0 %	25 %	75 %	0 %	347526514
3056	NC_015976	CCG	2	6	129024	129029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3057	NC_015976	TCT	2	6	129089	129094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526514
3058	NC_015976	CGA	2	6	129135	129140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3059	NC_015976	CCGGG	2	10	129191	129200	0 %	0 %	60 %	40 %	347526514
3060	NC_015976	GCC	3	9	129213	129221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3061	NC_015976	CTG	2	6	129250	129255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3062	NC_015976	TGG	2	6	129341	129346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526514
3063	NC_015976	GCC	2	6	129366	129371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526514
3064	NC_015976	GCA	2	6	129393	129398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3065	NC_015976	CTG	2	6	129403	129408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3066	NC_015976	GC	4	8	129432	129439	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3067	NC_015976	TGC	2	6	129491	129496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3068	NC_015976	GC	3	6	129618	129623	0 %	0 %	50 %	50 %	347526514
3069	NC_015976	CGG	2	6	129693	129698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526514
3070	NC_015976	GTC	2	6	129772	129777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526514
3071	NC_015976	GTG	2	6	129817	129822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526514
3072	NC_015976	CTGC	2	8	129870	129877	0 %	25 %	25 %	50 %	347526514
3073	NC_015976	CGG	2	6	129945	129950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526514
3074	NC_015976	GGT	2	6	129976	129981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526514
3075	NC_015976	ATG	2	6	129989	129994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526514
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3077	NC_015976	GAG	2	6	130087	130092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526514
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3079	NC_015976	C	6	6	130131	130136	0 %	0 %	0 %	100 %	347526514
3080	NC_015976	CGG	2	6	130206	130211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526515
3081	NC_015976	AGCC	2	8	130214	130221	25 %	0 %	25 %	50 %	347526515
3082	NC_015976	GC	3	6	130240	130245	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3083	NC_015976	GCCGG	2	10	130296	130305	0 %	0 %	60 %	40 %	347526515
3084	NC_015976	GGC	2	6	130311	130316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526515
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3088	NC_015976	TGCC	2	8	130546	130553	0 %	25 %	25 %	50 %	347526515
3089	NC_015976	ACT	2	6	130576	130581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526515
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3092	NC_015976	GC	3	6	130647	130652	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3093	NC_015976	CGG	2	6	130658	130663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526515
3094	NC_015976	GACG	2	8	130748	130755	25 %	0 %	50 %	25 %	347526515
3095	NC_015976	TTC	2	6	130794	130799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526515
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3098	NC_015976	TGG	2	6	130930	130935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526515
3099	NC_015976	TGACC	2	10	130943	130952	20 %	20 %	20 %	40 %	347526515
3100	NC_015976	CTG	2	6	131034	131039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526515
3101	NC_015976	CG	3	6	131057	131062	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3102	NC_015976	TGG	2	6	131143	131148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526515
3103	NC_015976	CGCC	2	8	131152	131159	0 %	0 %	25 %	75 %	347526515
3104	NC_015976	TGG	2	6	131232	131237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526515
3105	NC_015976	AGA	2	6	131245	131250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526515
3106	NC_015976	GC	4	8	131267	131274	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3107	NC_015976	TGCC	2	8	131317	131324	0 %	25 %	25 %	50 %	347526515
3108	NC_015976	CGC	2	6	131348	131353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526515
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3110	NC_015976	GC	3	6	131372	131377	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3111	NC_015976	CGA	2	6	131443	131448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526515
3112	NC_015976	CGG	2	6	131462	131467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526515
3113	NC_015976	CTC	2	6	131472	131477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526515
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3117	NC_015976	GGGCGA	2	12	131594	131605	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347526515
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3119	NC_015976	TCG	2	6	131626	131631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526515
3120	NC_015976	CGA	2	6	131633	131638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526515
3121	NC_015976	GCT	2	6	131657	131662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526515
3122	NC_015976	GGC	2	6	131717	131722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526515
3123	NC_015976	TCT	2	6	131731	131736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526515
3124	NC_015976	GC	3	6	131742	131747	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3125	NC_015976	TGC	2	6	131770	131775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526515
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3227	NC_015976	CGT	2	6	136048	136053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526520
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3229	NC_015976	GGC	2	6	136121	136126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526520
3230	NC_015976	GCCA	2	8	136169	136176	25 %	0 %	25 %	50 %	347526520
3231	NC_015976	CTT	2	6	136186	136191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526520
3232	NC_015976	GGCC	2	8	136236	136243	0 %	0 %	50 %	50 %	347526521
3233	NC_015976	GAT	2	6	136287	136292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526521
3234	NC_015976	TCC	2	6	136300	136305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526521
3235	NC_015976	GAT	2	6	136349	136354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526521
3236	NC_015976	CGGGG	2	10	136393	136402	0 %	0 %	80 %	20 %	347526521
3237	NC_015976	TCG	2	6	136414	136419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526521
3238	NC_015976	GCG	2	6	136472	136477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526521
3239	NC_015976	GC	4	8	136485	136492	0 %	0 %	50 %	50 %	347526521
3240	NC_015976	CG	3	6	136541	136546	0 %	0 %	50 %	50 %	347526521
3241	NC_015976	GCG	2	6	136582	136587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526521
3242	NC_015976	CGC	2	6	136673	136678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526521
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3244	NC_015976	GAT	2	6	136698	136703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526521
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3367	NC_015976	GACGGT	2	12	141694	141705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347526527
3368	NC_015976	GTC	2	6	141766	141771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526527
3369	NC_015976	GCA	2	6	141852	141857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526527
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3371	NC_015976	CCAT	2	8	141948	141955	25 %	25 %	0 %	50 %	347526528
3372	NC_015976	CGC	2	6	142016	142021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526528
3373	NC_015976	GC	4	8	142020	142027	0 %	0 %	50 %	50 %	347526528
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3375	NC_015976	CGGC	2	8	142174	142181	0 %	0 %	50 %	50 %	347526528
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3379	NC_015976	ATC	2	6	142238	142243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526528
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3385	NC_015976	AGCG	2	8	142436	142443	25 %	0 %	50 %	25 %	347526528
3386	NC_015976	CGA	2	6	142459	142464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526528
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3488	NC_015976	CGT	2	6	146910	146915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526531
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3491	NC_015976	GCC	2	6	147110	147115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526531
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