MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 96648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_015976	GACCC	2	10	63691	63700	20 %	0 %	20 %	60 %	347526452
1503	NC_015976	ATG	2	6	63730	63735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526452
1504	NC_015976	CGT	2	6	63769	63774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526452
1505	NC_015976	GATC	2	8	63909	63916	25 %	25 %	25 %	25 %	347526453
1506	NC_015976	TCG	2	6	63929	63934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1507	NC_015976	CCG	2	6	63935	63940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526453
1508	NC_015976	CCCGAT	2	12	63952	63963	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347526453
1509	NC_015976	GC	3	6	63966	63971	0 %	0 %	50 %	50 %	347526453
1510	NC_015976	CGC	3	9	63969	63977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526453
1511	NC_015976	TGC	2	6	64046	64051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1512	NC_015976	GCG	2	6	64073	64078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526453
1513	NC_015976	CTG	2	6	64126	64131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1514	NC_015976	CGT	2	6	64159	64164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1515	NC_015976	GC	3	6	64206	64211	0 %	0 %	50 %	50 %	347526453
1516	NC_015976	ATCCC	2	10	64235	64244	20 %	20 %	0 %	60 %	347526453
1517	NC_015976	CGC	3	9	64251	64259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526453
1518	NC_015976	TGT	2	6	64283	64288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526453
1519	NC_015976	CGA	2	6	64290	64295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1520	NC_015976	TGG	2	6	64298	64303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526453
1521	NC_015976	AAC	2	6	64306	64311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526453
1522	NC_015976	GCCG	2	8	64391	64398	0 %	0 %	50 %	50 %	347526453
1523	NC_015976	GAC	2	6	64399	64404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1524	NC_015976	CCTTC	2	10	64437	64446	0 %	40 %	0 %	60 %	347526453
1525	NC_015976	CTG	2	6	64453	64458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1526	NC_015976	TGC	2	6	64475	64480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1527	NC_015976	CGAC	2	8	64493	64500	25 %	0 %	25 %	50 %	347526453
1528	NC_015976	CGA	2	6	64551	64556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1529	NC_015976	GAC	2	6	64557	64562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1530	NC_015976	TCT	2	6	64580	64585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526453
1531	NC_015976	GC	3	6	64616	64621	0 %	0 %	50 %	50 %	347526453
1532	NC_015976	CGAT	2	8	64643	64650	25 %	25 %	25 %	25 %	347526453
1533	NC_015976	GGCG	2	8	64651	64658	0 %	0 %	75 %	25 %	347526453
1534	NC_015976	GCG	2	6	64718	64723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526453
1535	NC_015976	GCGA	2	8	64735	64742	25 %	0 %	50 %	25 %	347526453
1536	NC_015976	TCA	2	6	64775	64780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526453
1537	NC_015976	TCG	2	6	64781	64786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1538	NC_015976	GGC	2	6	64821	64826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526453
1539	NC_015976	GC	3	6	64825	64830	0 %	0 %	50 %	50 %	347526453
1540	NC_015976	GCT	2	6	64885	64890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526453
1541	NC_015976	CGG	2	6	64898	64903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526453
1542	NC_015976	TTCGAG	2	12	64930	64941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347526453
1543	NC_015976	ACCG	2	8	65039	65046	25 %	0 %	25 %	50 %	347526454
1544	NC_015976	CAT	2	6	65069	65074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526454
1545	NC_015976	GGC	2	6	65093	65098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526454
1546	NC_015976	CTG	2	6	65109	65114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526454
1547	NC_015976	TCG	2	6	65164	65169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526454
1548	NC_015976	CG	3	6	65213	65218	0 %	0 %	50 %	50 %	347526454
1549	NC_015976	CG	3	6	65227	65232	0 %	0 %	50 %	50 %	347526454
1550	NC_015976	CCG	2	6	65299	65304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526454
1551	NC_015976	GCA	2	6	65336	65341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526454
1552	NC_015976	GATCG	2	10	65370	65379	20 %	20 %	40 %	20 %	347526454
1553	NC_015976	TGG	3	9	65398	65406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526454
1554	NC_015976	GCC	2	6	65410	65415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526454
1555	NC_015976	GGCG	2	8	65420	65427	0 %	0 %	75 %	25 %	347526454
1556	NC_015976	CTCGC	2	10	65479	65488	0 %	20 %	20 %	60 %	347526454
1557	NC_015976	CG	3	6	65500	65505	0 %	0 %	50 %	50 %	347526454
1558	NC_015976	ATCCG	2	10	65513	65522	20 %	20 %	20 %	40 %	347526454
1559	NC_015976	TGA	2	6	65536	65541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526454
1560	NC_015976	GCTC	2	8	65563	65570	0 %	25 %	25 %	50 %	347526454
1561	NC_015976	GC	3	6	65620	65625	0 %	0 %	50 %	50 %	347526454
1562	NC_015976	AAGC	2	8	65684	65691	50 %	0 %	25 %	25 %	347526454
1563	NC_015976	CTT	2	6	65724	65729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526454
1564	NC_015976	CGGG	2	8	65744	65751	0 %	0 %	75 %	25 %	347526454
1565	NC_015976	TGG	2	6	65782	65787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526454
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1567	NC_015976	CGG	2	6	65878	65883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526454
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1570	NC_015976	GCC	2	6	66003	66008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526454
1571	NC_015976	TGG	2	6	66048	66053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526454
1572	NC_015976	CAT	2	6	66074	66079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526454
1573	NC_015976	CTT	2	6	66113	66118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526454
1574	NC_015976	CGCGC	2	10	66178	66187	0 %	0 %	40 %	60 %	347526455
1575	NC_015976	ATG	2	6	66212	66217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526455
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1577	NC_015976	GTCG	2	8	66280	66287	0 %	25 %	50 %	25 %	347526455
1578	NC_015976	GTC	2	6	66296	66301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526455
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1580	NC_015976	GCCG	2	8	66345	66352	0 %	0 %	50 %	50 %	347526455
1581	NC_015976	ACC	2	6	66353	66358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526455
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1584	NC_015976	CGCT	2	8	66576	66583	0 %	25 %	25 %	50 %	347526456
1585	NC_015976	GTG	2	6	66629	66634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526456
1586	NC_015976	TC	3	6	66664	66669	0 %	50 %	0 %	50 %	347526456
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1589	NC_015976	CGA	2	6	66793	66798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526456
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1592	NC_015976	GGCG	2	8	66958	66965	0 %	0 %	75 %	25 %	347526456
1593	NC_015976	GC	3	6	66977	66982	0 %	0 %	50 %	50 %	347526456
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1595	NC_015976	CGA	2	6	67108	67113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526456
1596	NC_015976	GC	3	6	67163	67168	0 %	0 %	50 %	50 %	347526456
1597	NC_015976	GCG	4	12	67176	67187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526456
1598	NC_015976	TCG	2	6	67191	67196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526456
1599	NC_015976	CTG	2	6	67199	67204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526456
1600	NC_015976	CGGCT	2	10	67210	67219	0 %	20 %	40 %	40 %	347526456
1601	NC_015976	CCA	2	6	67233	67238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526456
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1603	NC_015976	GCGG	2	8	67361	67368	0 %	0 %	75 %	25 %	347526456
1604	NC_015976	CGAAG	2	10	67402	67411	40 %	0 %	40 %	20 %	347526456
1605	NC_015976	CTG	2	6	67448	67453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526456
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1607	NC_015976	TCA	2	6	67587	67592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526457
1608	NC_015976	GGC	2	6	67685	67690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526457
1609	NC_015976	AAG	2	6	67739	67744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526457
1610	NC_015976	CAGC	2	8	67755	67762	25 %	0 %	25 %	50 %	347526457
1611	NC_015976	GCC	3	9	67774	67782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526457
1612	NC_015976	GCT	2	6	67787	67792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526457
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1620	NC_015976	GAC	2	6	68147	68152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526457
1621	NC_015976	ATC	2	6	68165	68170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526457
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1623	NC_015976	GAG	2	6	68198	68203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526457
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1998	NC_015976	CTC	2	6	84193	84198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526470
1999	NC_015976	CGC	3	9	84227	84235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526470
2000	NC_015976	GC	3	6	84239	84244	0 %	0 %	50 %	50 %	347526470

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