MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 96648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015976	CTT	2	6	42245	42250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526432
1003	NC_015976	CAG	2	6	42296	42301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1004	NC_015976	GC	3	6	42356	42361	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1005	NC_015976	GCA	2	6	42364	42369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1006	NC_015976	ACG	2	6	42396	42401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1007	NC_015976	GC	3	6	42423	42428	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1008	NC_015976	AGC	2	6	42462	42467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1009	NC_015976	GC	3	6	42481	42486	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1010	NC_015976	GCCAGT	2	12	42492	42503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1011	NC_015976	GCCAGC	2	12	42504	42515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347526432
1012	NC_015976	CGC	2	6	42524	42529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1013	NC_015976	AGG	2	6	42573	42578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526432
1014	NC_015976	CAG	2	6	42698	42703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1015	NC_015976	CGC	2	6	42721	42726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1016	NC_015976	CCA	2	6	42742	42747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526432
1017	NC_015976	CGA	2	6	42805	42810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1018	NC_015976	CTGA	2	8	42824	42831	25 %	25 %	25 %	25 %	347526432
1019	NC_015976	CGC	2	6	42845	42850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1020	NC_015976	CTG	2	6	42938	42943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1021	NC_015976	ATA	2	6	42950	42955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526432
1022	NC_015976	GCC	2	6	43090	43095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1023	NC_015976	CG	3	6	43099	43104	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1024	NC_015976	GCA	2	6	43120	43125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1025	NC_015976	GTCC	2	8	43183	43190	0 %	25 %	25 %	50 %	347526432
1026	NC_015976	TAGAAA	2	12	43200	43211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347526432
1027	NC_015976	CGGA	2	8	43260	43267	25 %	0 %	50 %	25 %	347526432
1028	NC_015976	TGC	2	6	43268	43273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1029	NC_015976	GCA	2	6	43342	43347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1030	NC_015976	AGC	2	6	43404	43409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1031	NC_015976	CCG	2	6	43411	43416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1032	NC_015976	CAG	2	6	43439	43444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1033	NC_015976	GCG	2	6	43536	43541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526432
1034	NC_015976	AAGCG	2	10	43564	43573	40 %	0 %	40 %	20 %	347526432
1035	NC_015976	GCCG	2	8	43597	43604	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1036	NC_015976	CG	3	6	43624	43629	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1037	NC_015976	GCA	2	6	43639	43644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1038	NC_015976	GCCC	3	12	43662	43673	0 %	0 %	25 %	75 %	347526432
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1041	NC_015976	GA	3	6	43847	43852	50 %	0 %	50 %	0 %	347526433
1042	NC_015976	GGC	2	6	43942	43947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526433
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1045	NC_015976	TTCC	2	8	44035	44042	0 %	50 %	0 %	50 %	347526433
1046	NC_015976	TCG	2	6	44064	44069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526433
1047	NC_015976	CG	3	6	44126	44131	0 %	0 %	50 %	50 %	347526433
1048	NC_015976	CG	3	6	44171	44176	0 %	0 %	50 %	50 %	347526433
1049	NC_015976	GCGCG	2	10	44181	44190	0 %	0 %	60 %	40 %	347526433
1050	NC_015976	CTCC	2	8	44211	44218	0 %	25 %	0 %	75 %	347526433
1051	NC_015976	CGC	2	6	44223	44228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526433
1052	NC_015976	CGC	2	6	44256	44261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526433
1053	NC_015976	TCG	2	6	44282	44287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526433
1054	NC_015976	CGC	2	6	44386	44391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526433
1055	NC_015976	CG	4	8	44451	44458	0 %	0 %	50 %	50 %	347526433
1056	NC_015976	GCG	2	6	44526	44531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526433
1057	NC_015976	CG	3	6	44548	44553	0 %	0 %	50 %	50 %	347526433
1058	NC_015976	GGGC	2	8	44562	44569	0 %	0 %	75 %	25 %	347526433
1059	NC_015976	CAC	2	6	44572	44577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526433
1060	NC_015976	GCC	2	6	44585	44590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526433
1061	NC_015976	CGTC	2	8	44613	44620	0 %	25 %	25 %	50 %	347526433
1062	NC_015976	CCA	2	6	44691	44696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526433
1063	NC_015976	GCC	2	6	44731	44736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526433
1064	NC_015976	CGC	2	6	44775	44780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526433
1065	NC_015976	CATGCT	2	12	44803	44814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347526433
1066	NC_015976	CCG	3	9	44840	44848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526434
1067	NC_015976	GGGC	2	8	44866	44873	0 %	0 %	75 %	25 %	347526434
1068	NC_015976	ATC	2	6	44932	44937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526434
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1072	NC_015976	CGC	2	6	45041	45046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526434
1073	NC_015976	CGA	2	6	45050	45055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526434
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1075	NC_015976	GGTCC	2	10	45096	45105	0 %	20 %	40 %	40 %	347526434
1076	NC_015976	CGA	2	6	45116	45121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526434
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1081	NC_015976	C	6	6	45301	45306	0 %	0 %	0 %	100 %	347526434
1082	NC_015976	CCGAGC	2	12	45313	45324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347526434
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1084	NC_015976	GTC	2	6	45370	45375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526434
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1095	NC_015976	GCC	2	6	45655	45660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526434
1096	NC_015976	CGA	2	6	45662	45667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526434
1097	NC_015976	GC	5	10	45689	45698	0 %	0 %	50 %	50 %	347526434
1098	NC_015976	CAC	2	6	45711	45716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526434
1099	NC_015976	GCC	2	6	45717	45722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526434
1100	NC_015976	GAT	2	6	45765	45770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526434
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1102	NC_015976	CCA	2	6	45785	45790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526434
1103	NC_015976	GCC	3	9	45793	45801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526434
1104	NC_015976	TCG	2	6	45805	45810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526434
1105	NC_015976	GAT	2	6	45831	45836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526434
1106	NC_015976	CG	3	6	46219	46224	0 %	0 %	50 %	50 %	347526435
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1108	NC_015976	TGGC	2	8	46283	46290	0 %	25 %	50 %	25 %	347526435
1109	NC_015976	CG	3	6	46291	46296	0 %	0 %	50 %	50 %	347526435
1110	NC_015976	CCA	2	6	46321	46326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526435
1111	NC_015976	GCG	2	6	46327	46332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526435
1112	NC_015976	GGC	2	6	46365	46370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526435
1113	NC_015976	CCGG	2	8	46460	46467	0 %	0 %	50 %	50 %	347526435
1114	NC_015976	ATCGCC	2	12	46473	46484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347526435
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1121	NC_015976	CCG	2	6	46749	46754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526435
1122	NC_015976	TGCG	2	8	46866	46873	0 %	25 %	50 %	25 %	347526435
1123	NC_015976	GC	4	8	46880	46887	0 %	0 %	50 %	50 %	347526435
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1125	NC_015976	CGG	2	6	46901	46906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526435
1126	NC_015976	CGG	2	6	46946	46951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526435
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1128	NC_015976	TGC	2	6	47017	47022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526435
1129	NC_015976	CGA	2	6	47072	47077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526435
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1245	NC_015976	CG	3	6	51978	51983	0 %	0 %	50 %	50 %	347526441
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1248	NC_015976	GC	3	6	52136	52141	0 %	0 %	50 %	50 %	347526441
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1251	NC_015976	TGCG	2	8	52282	52289	0 %	25 %	50 %	25 %	347526441
1252	NC_015976	GCCA	2	8	52308	52315	25 %	0 %	25 %	50 %	347526441
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1491	NC_015976	GCTGC	2	10	63343	63352	0 %	20 %	40 %	40 %	347526452
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1494	NC_015976	CAC	2	6	63393	63398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526452
1495	NC_015976	GTC	2	6	63451	63456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526452
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1497	NC_015976	GC	3	6	63503	63508	0 %	0 %	50 %	50 %	347526452
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