MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 96648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015976	CTC	2	6	22184	22189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526407
502	NC_015976	TGG	2	6	22201	22206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526407
503	NC_015976	TCG	2	6	22303	22308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526407
504	NC_015976	CGC	2	6	22718	22723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526408
505	NC_015976	CTG	2	6	22727	22732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526408
506	NC_015976	GAG	2	6	22783	22788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526408
507	NC_015976	GCC	2	6	22855	22860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526408
508	NC_015976	CTG	2	6	22897	22902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526408
509	NC_015976	CGC	2	6	22925	22930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526408
510	NC_015976	TG	3	6	22933	22938	0 %	50 %	50 %	0 %	347526408
511	NC_015976	ATCG	2	8	22968	22975	25 %	25 %	25 %	25 %	347526408
512	NC_015976	GGA	2	6	23012	23017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526408
513	NC_015976	CCGC	2	8	23087	23094	0 %	0 %	25 %	75 %	347526408
514	NC_015976	CGG	2	6	23135	23140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526408
515	NC_015976	GGC	2	6	23148	23153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526408
516	NC_015976	CGT	2	6	23176	23181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526408
517	NC_015976	TGG	2	6	23198	23203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526408
518	NC_015976	GCT	2	6	23266	23271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526408
519	NC_015976	CAG	2	6	23339	23344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526408
520	NC_015976	CTC	2	6	23391	23396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526408
521	NC_015976	TGT	2	6	23422	23427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526408
522	NC_015976	CG	3	6	23533	23538	0 %	0 %	50 %	50 %	347526408
523	NC_015976	CGC	2	6	23599	23604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526408
524	NC_015976	ACCTCG	2	12	23605	23616	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347526408
525	NC_015976	CTG	2	6	23892	23897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526408
526	NC_015976	CG	3	6	23916	23921	0 %	0 %	50 %	50 %	347526408
527	NC_015976	GCCG	2	8	23949	23956	0 %	0 %	50 %	50 %	347526408
528	NC_015976	CGAC	2	8	23957	23964	25 %	0 %	25 %	50 %	347526408
529	NC_015976	CCA	2	6	23990	23995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526408
530	NC_015976	AGC	2	6	24042	24047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526408
531	NC_015976	TCGA	2	8	24114	24121	25 %	25 %	25 %	25 %	347526408
532	NC_015976	TGA	2	6	24125	24130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526408
533	NC_015976	GC	3	6	24215	24220	0 %	0 %	50 %	50 %	347526408
534	NC_015976	CGC	2	6	24242	24247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526408
535	NC_015976	CCGT	2	8	24254	24261	0 %	25 %	25 %	50 %	347526408
536	NC_015976	GC	3	6	24283	24288	0 %	0 %	50 %	50 %	347526408
537	NC_015976	CG	3	6	24298	24303	0 %	0 %	50 %	50 %	347526408
538	NC_015976	CAG	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526408
539	NC_015976	TGCC	2	8	24341	24348	0 %	25 %	25 %	50 %	347526408
540	NC_015976	TTTCCC	2	12	24450	24461	0 %	50 %	0 %	50 %	347526409
541	NC_015976	AGC	2	6	24470	24475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
542	NC_015976	GCCG	2	8	24499	24506	0 %	0 %	50 %	50 %	347526409
543	NC_015976	CCA	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526409
544	NC_015976	ATG	2	6	24529	24534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526409
545	NC_015976	GCGG	2	8	24565	24572	0 %	0 %	75 %	25 %	347526409
546	NC_015976	TCG	2	6	24603	24608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526409
547	NC_015976	CGA	2	6	24618	24623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
548	NC_015976	ACA	2	6	24684	24689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526409
549	NC_015976	GA	3	6	24703	24708	50 %	0 %	50 %	0 %	347526409
550	NC_015976	CAC	2	6	24709	24714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526409
551	NC_015976	CGC	2	6	24718	24723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526409
552	NC_015976	TGC	2	6	24724	24729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526409
553	NC_015976	CAG	2	6	24757	24762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
554	NC_015976	GCCA	2	8	24821	24828	25 %	0 %	25 %	50 %	347526409
555	NC_015976	AGG	2	6	24950	24955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526409
556	NC_015976	AGC	2	6	24959	24964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
557	NC_015976	AGC	2	6	24971	24976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
558	NC_015976	GCA	2	6	24983	24988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526409
559	NC_015976	TGT	2	6	24996	25001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526409
560	NC_015976	AACG	2	8	25203	25210	50 %	0 %	25 %	25 %	347526410
561	NC_015976	CCG	2	6	25237	25242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526410
562	NC_015976	CCG	2	6	25258	25263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526410
563	NC_015976	TGGC	2	8	25266	25273	0 %	25 %	50 %	25 %	347526410
564	NC_015976	CGG	2	6	25287	25292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526410
565	NC_015976	CATG	2	8	25323	25330	25 %	25 %	25 %	25 %	347526410
566	NC_015976	CCCG	2	8	25342	25349	0 %	0 %	25 %	75 %	347526411
567	NC_015976	GCT	2	6	25380	25385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526411
568	NC_015976	GCT	3	9	25392	25400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526411
569	NC_015976	CTCG	2	8	25410	25417	0 %	25 %	25 %	50 %	347526411
570	NC_015976	GGC	2	6	25421	25426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
571	NC_015976	GGA	2	6	25428	25433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526411
572	NC_015976	CGC	2	6	25455	25460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526411
573	NC_015976	CTG	3	9	25495	25503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526411
574	NC_015976	GCG	2	6	25536	25541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
575	NC_015976	TGA	2	6	25613	25618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526411
576	NC_015976	ATC	2	6	25642	25647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526411
577	NC_015976	GCCG	2	8	25734	25741	0 %	0 %	50 %	50 %	347526411
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579	NC_015976	CG	3	6	25839	25844	0 %	0 %	50 %	50 %	347526411
580	NC_015976	GAT	2	6	25845	25850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526411
581	NC_015976	CG	4	8	25853	25860	0 %	0 %	50 %	50 %	347526411
582	NC_015976	CGGGG	2	10	25908	25917	0 %	0 %	80 %	20 %	347526411
583	NC_015976	TCG	2	6	25925	25930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526411
584	NC_015976	GA	3	6	25964	25969	50 %	0 %	50 %	0 %	347526411
585	NC_015976	GCC	2	6	25975	25980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526411
586	NC_015976	CGG	2	6	26039	26044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
587	NC_015976	GC	5	10	26089	26098	0 %	0 %	50 %	50 %	347526411
588	NC_015976	CGG	2	6	26108	26113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
589	NC_015976	CCG	2	6	26114	26119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526411
590	NC_015976	CGG	2	6	26144	26149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
591	NC_015976	CCG	2	6	26162	26167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526411
592	NC_015976	GGC	2	6	26188	26193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
593	NC_015976	TCT	2	6	26267	26272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526411
594	NC_015976	CGAT	2	8	26309	26316	25 %	25 %	25 %	25 %	347526411
595	NC_015976	CGG	2	6	26333	26338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526411
596	NC_015976	CG	4	8	26396	26403	0 %	0 %	50 %	50 %	347526411
597	NC_015976	CG	3	6	26449	26454	0 %	0 %	50 %	50 %	347526411
598	NC_015976	CCG	3	9	26534	26542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526411
599	NC_015976	CGG	2	6	26827	26832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526412
600	NC_015976	CG	4	8	26877	26884	0 %	0 %	50 %	50 %	347526412
601	NC_015976	CG	3	6	26943	26948	0 %	0 %	50 %	50 %	347526412
602	NC_015976	CGC	2	6	26962	26967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526412
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608	NC_015976	CG	3	6	27174	27179	0 %	0 %	50 %	50 %	347526412
609	NC_015976	GCG	2	6	27181	27186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526412
610	NC_015976	CAG	2	6	27226	27231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526412
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612	NC_015976	TGA	2	6	27246	27251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526412
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614	NC_015976	GCG	2	6	27315	27320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526412
615	NC_015976	AGC	2	6	27326	27331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526412
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617	NC_015976	GC	3	6	27388	27393	0 %	0 %	50 %	50 %	347526412
618	NC_015976	ATG	2	6	27413	27418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526412
619	NC_015976	GC	3	6	27423	27428	0 %	0 %	50 %	50 %	347526412
620	NC_015976	TCC	2	6	27455	27460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526412
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622	NC_015976	AGC	2	6	27524	27529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526412
623	NC_015976	CGCC	2	8	27540	27547	0 %	0 %	25 %	75 %	347526412
624	NC_015976	CG	4	8	27594	27601	0 %	0 %	50 %	50 %	347526412
625	NC_015976	G	6	6	27635	27640	0 %	0 %	100 %	0 %	347526412
626	NC_015976	GAA	2	6	27643	27648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526412
627	NC_015976	CGG	2	6	27684	27689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526412
628	NC_015976	CGA	2	6	27729	27734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526412
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630	NC_015976	CGGCAT	2	12	27762	27773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526412
631	NC_015976	CGT	2	6	27793	27798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526412
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740	NC_015976	CTT	2	6	32398	32403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526420
741	NC_015976	GCTATG	2	12	32448	32459	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347526420
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743	NC_015976	GCC	2	6	32520	32525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526420
744	NC_015976	GCT	2	6	32590	32595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526420
745	NC_015976	GGC	2	6	32611	32616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526420
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748	NC_015976	CCG	2	6	32691	32696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526420
749	NC_015976	ATC	2	6	32732	32737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526420
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751	NC_015976	GC	3	6	32776	32781	0 %	0 %	50 %	50 %	347526420
752	NC_015976	GC	3	6	32793	32798	0 %	0 %	50 %	50 %	347526420
753	NC_015976	GAG	2	6	32805	32810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526420
754	NC_015976	TCA	2	6	32829	32834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526421
755	NC_015976	CAA	2	6	32839	32844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526421
756	NC_015976	TGGC	2	8	32873	32880	0 %	25 %	50 %	25 %	347526421
757	NC_015976	GCCC	2	8	32941	32948	0 %	0 %	25 %	75 %	347526421
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879	NC_015976	CAGA	2	8	37247	37254	50 %	0 %	25 %	25 %	347526426
880	NC_015976	GCCAT	2	10	37282	37291	20 %	20 %	20 %	40 %	347526426
881	NC_015976	CG	4	8	37298	37305	0 %	0 %	50 %	50 %	347526426
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