MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 198282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015957	GCT	2	6	204	209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
2	NC_015957	GCT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
3	NC_015957	CGT	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
4	NC_015957	GCC	2	6	395	400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
5	NC_015957	CGA	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
6	NC_015957	CCG	2	6	431	436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
7	NC_015957	GTC	2	6	445	450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
8	NC_015957	CCG	2	6	451	456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
9	NC_015957	AGC	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
10	NC_015957	ACG	2	6	521	526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
11	NC_015957	GCC	2	6	542	547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
12	NC_015957	CAG	2	6	595	600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
13	NC_015957	GAC	2	6	637	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
14	NC_015957	GCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
15	NC_015957	CGG	2	6	666	671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
16	NC_015957	CAG	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
17	NC_015957	CAG	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
18	NC_015957	CGG	3	9	798	806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
19	NC_015957	CGG	3	9	810	818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
20	NC_015957	CCG	2	6	841	846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
21	NC_015957	AGC	2	6	851	856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
22	NC_015957	CGG	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
23	NC_015957	CCT	2	6	903	908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007965
24	NC_015957	CGC	2	6	939	944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
25	NC_015957	CGC	2	6	1047	1052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
26	NC_015957	CTG	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
27	NC_015957	GGA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007965
28	NC_015957	TCA	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007965
29	NC_015957	CTG	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007965
30	NC_015957	CGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
31	NC_015957	AGG	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007965
32	NC_015957	TTC	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007965
33	NC_015957	CAA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007965
34	NC_015957	CTC	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007965
35	NC_015957	AGC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
36	NC_015957	GGA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007965
37	NC_015957	GCC	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
38	NC_015957	TCC	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007965
39	NC_015957	AAG	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007965
40	NC_015957	AGC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
41	NC_015957	CGC	2	6	1544	1549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
42	NC_015957	CGG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
43	NC_015957	CCG	2	6	1751	1756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007965
44	NC_015957	ACT	2	6	1757	1762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007965
45	NC_015957	CGA	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
46	NC_015957	CGG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
47	NC_015957	ACG	2	6	1906	1911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007965
48	NC_015957	GCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007965
49	NC_015957	CCG	2	6	2912	2917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
50	NC_015957	GGA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007966
51	NC_015957	GAC	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
52	NC_015957	CTC	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007966
53	NC_015957	CGT	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
54	NC_015957	CTC	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007966
55	NC_015957	GGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007966
56	NC_015957	CGC	4	12	3235	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
57	NC_015957	CGC	2	6	3262	3267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
58	NC_015957	GAC	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
59	NC_015957	CCG	2	6	3405	3410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007966
60	NC_015957	ACC	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007966
61	NC_015957	GCT	2	6	3553	3558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
62	NC_015957	TCG	2	6	3636	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
63	NC_015957	CGA	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
64	NC_015957	CGA	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007966
65	NC_015957	CTG	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
66	NC_015957	CAC	2	6	3865	3870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007966
67	NC_015957	GCT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007966
68	NC_015957	GGC	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
69	NC_015957	CGC	2	6	4132	4137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
70	NC_015957	CAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007967
71	NC_015957	CGA	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007967
72	NC_015957	GCT	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
73	NC_015957	GTG	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007967
74	NC_015957	CGG	2	6	4323	4328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
75	NC_015957	AGC	2	6	4364	4369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007967
76	NC_015957	TCG	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
77	NC_015957	CGG	2	6	4410	4415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
78	NC_015957	CGG	2	6	4452	4457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
79	NC_015957	CGC	2	6	4458	4463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
80	NC_015957	GAT	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007967
81	NC_015957	GCT	2	6	4623	4628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
82	NC_015957	AGG	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007967
83	NC_015957	GCT	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007967
84	NC_015957	GGA	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007967
85	NC_015957	GGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
86	NC_015957	AGG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007967
87	NC_015957	CGC	2	6	4883	4888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
88	NC_015957	GAT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007967
89	NC_015957	CGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007967
90	NC_015957	CGG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007967
91	NC_015957	AGC	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007967
92	NC_015957	ACC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007967
93	NC_015957	TCG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
94	NC_015957	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
95	NC_015957	TCC	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007968
96	NC_015957	GTC	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
97	NC_015957	GCA	2	6	5248	5253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007968
98	NC_015957	CGA	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007968
99	NC_015957	AGC	2	6	5487	5492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007968
100	NC_015957	CTG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
101	NC_015957	CGG	2	6	5525	5530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007968
102	NC_015957	GGC	2	6	5549	5554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007968
103	NC_015957	TGC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
104	NC_015957	GAG	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007968
105	NC_015957	GCT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
106	NC_015957	GCC	2	6	5783	5788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007968
107	NC_015957	TGG	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007968
108	NC_015957	CGA	2	6	5848	5853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007968
109	NC_015957	CCT	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007968
110	NC_015957	CTG	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007968
111	NC_015957	CGA	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007968
112	NC_015957	GCG	2	6	6016	6021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007968
113	NC_015957	CGG	2	6	6075	6080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007968
114	NC_015957	GGA	2	6	6082	6087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007968
115	NC_015957	CAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007969
116	NC_015957	AAG	2	6	6292	6297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007969
117	NC_015957	GCG	2	6	6364	6369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007969
118	NC_015957	CGG	2	6	6417	6422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007969
119	NC_015957	TGG	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007969
120	NC_015957	GCA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007969
121	NC_015957	ACG	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007969
122	NC_015957	GCT	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007969
123	NC_015957	GAT	2	6	6612	6617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007969
124	NC_015957	CGG	2	6	6633	6638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007969
125	NC_015957	CGC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007969
126	NC_015957	CCG	2	6	7103	7108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007970
127	NC_015957	ACG	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007970
128	NC_015957	GTC	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007970
129	NC_015957	CGA	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007970
130	NC_015957	CGG	2	6	7294	7299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007970
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