MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 261423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015957	CCACC	2	10	58558	58567	20 %	0 %	0 %	80 %	345008016
1502	NC_015957	GCC	2	6	58572	58577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008016
1503	NC_015957	CTG	2	6	58589	58594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008016
1504	NC_015957	TGC	2	6	58629	58634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008016
1505	NC_015957	CCCGC	2	10	58743	58752	0 %	0 %	20 %	80 %	345008016
1506	NC_015957	TGG	2	6	58761	58766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008016
1507	NC_015957	CGG	2	6	58788	58793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008016
1508	NC_015957	CTG	2	6	58802	58807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008016
1509	NC_015957	GCT	2	6	58822	58827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008016
1510	NC_015957	GCC	2	6	58842	58847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008016
1511	NC_015957	GCCCG	2	10	58858	58867	0 %	0 %	40 %	60 %	345008016
1512	NC_015957	CGG	2	6	58941	58946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008016
1513	NC_015957	CGGCC	2	10	58963	58972	0 %	0 %	40 %	60 %	345008016
1514	NC_015957	TGC	2	6	58974	58979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008016
1515	NC_015957	CCCG	2	8	59014	59021	0 %	0 %	25 %	75 %	345008016
1516	NC_015957	CGAGGT	2	12	59041	59052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345008016
1517	NC_015957	AGCC	2	8	59143	59150	25 %	0 %	25 %	50 %	345008016
1518	NC_015957	AGC	2	6	59242	59247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008016
1519	NC_015957	GAG	2	6	59279	59284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008016
1520	NC_015957	ACG	2	6	59309	59314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1521	NC_015957	GCC	2	6	59317	59322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008017
1522	NC_015957	CGG	2	6	59337	59342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008017
1523	NC_015957	CG	3	6	59368	59373	0 %	0 %	50 %	50 %	345008017
1524	NC_015957	GCT	3	9	59400	59408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1525	NC_015957	GCT	2	6	59412	59417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1526	NC_015957	GGTGCT	2	12	59418	59429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345008017
1527	NC_015957	CGA	2	6	59478	59483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1528	NC_015957	CTA	2	6	59508	59513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008017
1529	NC_015957	CGA	2	6	59531	59536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1530	NC_015957	ACAGCG	2	12	59561	59572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1531	NC_015957	CG	3	6	59571	59576	0 %	0 %	50 %	50 %	345008017
1532	NC_015957	CTG	2	6	59590	59595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1533	NC_015957	ATC	2	6	59623	59628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008017
1534	NC_015957	CAC	2	6	59637	59642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008017
1535	NC_015957	CGAA	2	8	59658	59665	50 %	0 %	25 %	25 %	345008017
1536	NC_015957	CGT	3	9	59718	59726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1537	NC_015957	GTGGTC	2	12	59794	59805	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345008017
1538	NC_015957	GGC	2	6	59829	59834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008017
1539	NC_015957	GTG	2	6	59857	59862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008017
1540	NC_015957	GCGAC	2	10	59864	59873	20 %	0 %	40 %	40 %	345008017
1541	NC_015957	GC	3	6	59892	59897	0 %	0 %	50 %	50 %	345008017
1542	NC_015957	GC	3	6	59907	59912	0 %	0 %	50 %	50 %	345008017
1543	NC_015957	GGC	2	6	60003	60008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008017
1544	NC_015957	GAG	3	9	60016	60024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008017
1545	NC_015957	CGC	2	6	60029	60034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008017
1546	NC_015957	TGC	2	6	60035	60040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
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1548	NC_015957	CTG	2	6	60091	60096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
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1552	NC_015957	CGA	2	6	60222	60227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1553	NC_015957	GTG	2	6	60232	60237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008017
1554	NC_015957	TGC	2	6	60242	60247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1555	NC_015957	GCT	2	6	60258	60263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1556	NC_015957	ACG	2	6	60269	60274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008017
1557	NC_015957	GGC	2	6	60297	60302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008017
1558	NC_015957	CG	3	6	60325	60330	0 %	0 %	50 %	50 %	345008017
1559	NC_015957	CATG	2	8	60358	60365	25 %	25 %	25 %	25 %	345008018
1560	NC_015957	GCC	3	9	60461	60469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008018
1561	NC_015957	CG	3	6	60479	60484	0 %	0 %	50 %	50 %	345008018
1562	NC_015957	TGC	2	6	60489	60494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008018
1563	NC_015957	C	6	6	60518	60523	0 %	0 %	0 %	100 %	345008018
1564	NC_015957	CGA	2	6	60604	60609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008018
1565	NC_015957	GGT	3	9	60649	60657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008018
1566	NC_015957	GCC	2	6	60707	60712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008018
1567	NC_015957	CCGG	2	8	60769	60776	0 %	0 %	50 %	50 %	345008018
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1581	NC_015957	GCG	2	6	61187	61192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008018
1582	NC_015957	GGC	2	6	61223	61228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008018
1583	NC_015957	GTC	2	6	61241	61246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008018
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1589	NC_015957	GGC	2	6	61581	61586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008019
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1593	NC_015957	CCA	2	6	61616	61621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008019
1594	NC_015957	CCG	2	6	61625	61630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008019
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1599	NC_015957	C	6	6	61804	61809	0 %	0 %	0 %	100 %	345008019
1600	NC_015957	CCG	2	6	61819	61824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008019
1601	NC_015957	CTC	2	6	61833	61838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008019
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1603	NC_015957	GAACGA	4	24	61887	61910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345008019
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1605	NC_015957	CCA	2	6	61986	61991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008019
1606	NC_015957	GC	3	6	61993	61998	0 %	0 %	50 %	50 %	345008019
1607	NC_015957	CCG	3	9	62039	62047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008019
1608	NC_015957	AGCG	2	8	62053	62060	25 %	0 %	50 %	25 %	345008019
1609	NC_015957	TGC	2	6	62072	62077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008019
1610	NC_015957	TCGGCC	2	12	62108	62119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345008019
1611	NC_015957	TTC	2	6	62125	62130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008019
1612	NC_015957	GCC	2	6	62144	62149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008019
1613	NC_015957	GAAC	2	8	62232	62239	50 %	0 %	25 %	25 %	345008020
1614	NC_015957	GTC	2	6	62266	62271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008020
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1619	NC_015957	GCA	2	6	62393	62398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008020
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1622	NC_015957	GC	3	6	62424	62429	0 %	0 %	50 %	50 %	345008020
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1624	NC_015957	GGA	2	6	62496	62501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008020
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1995	NC_015957	CCGT	2	8	77054	77061	0 %	25 %	25 %	50 %	345008031
1996	NC_015957	GCC	2	6	77107	77112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008031
1997	NC_015957	GCT	2	6	77121	77126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008031
1998	NC_015957	CGT	3	9	77286	77294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008031
1999	NC_015957	CGGCTG	2	12	77323	77334	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345008031
2000	NC_015957	GGA	2	6	77337	77342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008031

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