MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 261423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015957	GCATCC	2	12	224049	224060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345008172
5502	NC_015957	CGG	2	6	224065	224070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008172
5503	NC_015957	CGG	2	6	224076	224081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008172
5504	NC_015957	CCCCT	2	10	224131	224140	0 %	20 %	0 %	80 %	345008172
5505	NC_015957	CGG	2	6	224184	224189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008172
5506	NC_015957	TGGC	2	8	224231	224238	0 %	25 %	50 %	25 %	345008172
5507	NC_015957	TGC	3	9	224263	224271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008172
5508	NC_015957	GCT	2	6	224311	224316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008172
5509	NC_015957	TGG	2	6	224335	224340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008172
5510	NC_015957	GC	3	6	224358	224363	0 %	0 %	50 %	50 %	345008172
5511	NC_015957	GCGG	2	8	224405	224412	0 %	0 %	75 %	25 %	345008172
5512	NC_015957	GCC	2	6	224422	224427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008172
5513	NC_015957	GC	4	8	224429	224436	0 %	0 %	50 %	50 %	345008172
5514	NC_015957	GCC	2	6	224452	224457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008172
5515	NC_015957	GCTGCG	2	12	224509	224520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345008172
5516	NC_015957	CTT	2	6	224751	224756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008173
5517	NC_015957	CAG	2	6	224796	224801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008173
5518	NC_015957	GCC	3	9	224870	224878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008173
5519	NC_015957	CAA	2	6	224930	224935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008173
5520	NC_015957	CCCGG	2	10	224945	224954	0 %	0 %	40 %	60 %	345008173
5521	NC_015957	TCG	2	6	224974	224979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008173
5522	NC_015957	TCG	2	6	225103	225108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008173
5523	NC_015957	GCT	2	6	225363	225368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008174
5524	NC_015957	ACCG	2	8	225442	225449	25 %	0 %	25 %	50 %	345008174
5525	NC_015957	GGT	2	6	225547	225552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008174
5526	NC_015957	GCG	3	9	225649	225657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008174
5527	NC_015957	GACCG	2	10	225683	225692	20 %	0 %	40 %	40 %	345008175
5528	NC_015957	GAC	2	6	225729	225734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008175
5529	NC_015957	CTG	2	6	225819	225824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008175
5530	NC_015957	GGCCCT	2	12	225922	225933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345008176
5531	NC_015957	TGG	2	6	225953	225958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008176
5532	NC_015957	TGAC	2	8	226065	226072	25 %	25 %	25 %	25 %	345008176
5533	NC_015957	GCC	2	6	226151	226156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008176
5534	NC_015957	TGCC	2	8	226187	226194	0 %	25 %	25 %	50 %	345008176
5535	NC_015957	GCGG	2	8	226219	226226	0 %	0 %	75 %	25 %	345008176
5536	NC_015957	GGA	2	6	226363	226368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008176
5537	NC_015957	GTGAGC	2	12	226412	226423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345008176
5538	NC_015957	CCT	2	6	226554	226559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008176
5539	NC_015957	TCG	2	6	226605	226610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008176
5540	NC_015957	GCG	2	6	226660	226665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008176
5541	NC_015957	CTG	2	6	226691	226696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008176
5542	NC_015957	GAA	2	6	226702	226707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
5543	NC_015957	CGG	2	6	226728	226733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008176
5544	NC_015957	CA	3	6	226767	226772	50 %	0 %	0 %	50 %	345008176
5545	NC_015957	GAA	2	6	226810	226815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
5546	NC_015957	CGC	2	6	226819	226824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008176
5547	NC_015957	GCTG	2	8	226825	226832	0 %	25 %	50 %	25 %	345008176
5548	NC_015957	TGG	2	6	226848	226853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008176
5549	NC_015957	GAA	2	6	226864	226869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
5550	NC_015957	ATC	2	6	226895	226900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008176
5551	NC_015957	AGA	2	6	226977	226982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
5552	NC_015957	GGA	2	6	227011	227016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008176
5553	NC_015957	GCT	2	6	227197	227202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008176
5554	NC_015957	GGA	2	6	227203	227208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008176
5555	NC_015957	GAC	2	6	227234	227239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008176
5556	NC_015957	ACCGTG	2	12	227343	227354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345008177
5557	NC_015957	CAT	2	6	227363	227368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008177
5558	NC_015957	TCT	2	6	227386	227391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008177
5559	NC_015957	GCCCTG	2	12	227409	227420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345008177
5560	NC_015957	CCCCG	2	10	227432	227441	0 %	0 %	20 %	80 %	345008177
5561	NC_015957	CGT	2	6	227477	227482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008177
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5563	NC_015957	GCG	2	6	227518	227523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008177
5564	NC_015957	GCT	2	6	227573	227578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008177
5565	NC_015957	TCG	2	6	227608	227613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008177
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5567	NC_015957	CTGGG	2	10	227664	227673	0 %	20 %	60 %	20 %	345008177
5568	NC_015957	CGC	2	6	227720	227725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008177
5569	NC_015957	TCG	2	6	227739	227744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008177
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5577	NC_015957	TCG	2	6	228265	228270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008178
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5579	NC_015957	CG	3	6	228312	228317	0 %	0 %	50 %	50 %	345008178
5580	NC_015957	CTG	2	6	228325	228330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008178
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5588	NC_015957	CGT	2	6	228511	228516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008178
5589	NC_015957	CAC	2	6	228539	228544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008178
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5591	NC_015957	CGA	2	6	228593	228598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008178
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5593	NC_015957	CTAC	2	8	228628	228635	25 %	25 %	0 %	50 %	345008178
5594	NC_015957	CAC	2	6	228692	228697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008178
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5601	NC_015957	CACTG	2	10	229113	229122	20 %	20 %	20 %	40 %	345008178
5602	NC_015957	CGA	2	6	229166	229171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008178
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5605	NC_015957	CCA	2	6	229354	229359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008178
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5607	NC_015957	AGCA	2	8	229402	229409	50 %	0 %	25 %	25 %	345008178
5608	NC_015957	GAC	2	6	229419	229424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008178
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5612	NC_015957	GATG	2	8	229839	229846	25 %	25 %	50 %	0 %	345008179
5613	NC_015957	CAG	2	6	229851	229856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008179
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5616	NC_015957	TCAG	2	8	229916	229923	25 %	25 %	25 %	25 %	345008179
5617	NC_015957	GCTC	2	8	229976	229983	0 %	25 %	25 %	50 %	345008179
5618	NC_015957	GCA	2	6	230019	230024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008179
5619	NC_015957	GGA	2	6	230028	230033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008179
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5621	NC_015957	TGG	3	9	230148	230156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008179
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5862	NC_015957	AGGT	2	8	239699	239706	25 %	25 %	50 %	0 %	345008183
5863	NC_015957	GTG	2	6	239794	239799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008183
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5865	NC_015957	GAT	2	6	239842	239847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008183
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5881	NC_015957	GAA	2	6	240732	240737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008184
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5981	NC_015957	CGG	2	6	244106	244111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008186
5982	NC_015957	GGC	2	6	244134	244139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008186
5983	NC_015957	CCG	2	6	244140	244145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008186
5984	NC_015957	GCC	2	6	244160	244165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008186
5985	NC_015957	ACGG	2	8	244177	244184	25 %	0 %	50 %	25 %	345008186
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5987	NC_015957	CG	3	6	244228	244233	0 %	0 %	50 %	50 %	345008186
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5995	NC_015957	CG	4	8	244582	244589	0 %	0 %	50 %	50 %	345008187
5996	NC_015957	GCT	2	6	244597	244602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008187
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5998	NC_015957	CAT	2	6	244660	244665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008187
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