MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 188705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015953	GGC	2	6	43705	43710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1002	NC_015953	GCC	2	6	43770	43775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1003	NC_015953	CGA	2	6	43787	43792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1004	NC_015953	TCC	2	6	43796	43801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997682
1005	NC_015953	CGG	2	6	43852	43857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1006	NC_015953	GTC	2	6	43954	43959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1007	NC_015953	CGG	2	6	43968	43973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1008	NC_015953	CAG	2	6	44014	44019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1009	NC_015953	CG	3	6	44045	44050	0 %	0 %	50 %	50 %	344997682
1010	NC_015953	GAC	2	6	44062	44067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1011	NC_015953	CGCC	2	8	44091	44098	0 %	0 %	25 %	75 %	344997682
1012	NC_015953	CGC	2	6	44173	44178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1013	NC_015953	CCG	2	6	44204	44209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1014	NC_015953	AGC	2	6	44228	44233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1015	NC_015953	CGCC	2	8	44256	44263	0 %	0 %	25 %	75 %	344997682
1016	NC_015953	CCT	2	6	44286	44291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997682
1017	NC_015953	CCG	2	6	44313	44318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1018	NC_015953	GTC	2	6	44322	44327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1019	NC_015953	CGC	2	6	44331	44336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1020	NC_015953	GAG	2	6	44345	44350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997682
1021	NC_015953	GCC	2	6	44452	44457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1022	NC_015953	GTGTCC	2	12	44459	44470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1023	NC_015953	AGC	2	6	44492	44497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1024	NC_015953	GGC	2	6	44602	44607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1025	NC_015953	TCCG	2	8	44632	44639	0 %	25 %	25 %	50 %	344997682
1026	NC_015953	CGGC	2	8	44693	44700	0 %	0 %	50 %	50 %	344997682
1027	NC_015953	GCC	2	6	44714	44719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1028	NC_015953	AGC	2	6	44721	44726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1029	NC_015953	GGC	2	6	44734	44739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1030	NC_015953	GAGAGC	2	12	44780	44791	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344997682
1031	NC_015953	TCG	2	6	44810	44815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1032	NC_015953	CAG	2	6	44836	44841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1033	NC_015953	GCC	2	6	44928	44933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1034	NC_015953	GGC	2	6	44942	44947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1035	NC_015953	GCCC	2	8	44977	44984	0 %	0 %	25 %	75 %	344997682
1036	NC_015953	CTG	2	6	44995	45000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1037	NC_015953	ACG	2	6	45047	45052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1038	NC_015953	CGGT	2	8	45110	45117	0 %	25 %	50 %	25 %	344997682
1039	NC_015953	CGA	3	9	45249	45257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997682
1040	NC_015953	GGAGCG	2	12	45281	45292	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344997682
1041	NC_015953	GTCGAG	2	12	45340	45351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344997682
1042	NC_015953	GCC	3	9	45357	45365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997682
1043	NC_015953	CG	3	6	45558	45563	0 %	0 %	50 %	50 %	344997682
1044	NC_015953	GGAC	2	8	45573	45580	25 %	0 %	50 %	25 %	344997682
1045	NC_015953	CGCCGG	2	12	45610	45621	0 %	0 %	50 %	50 %	344997682
1046	NC_015953	TTC	2	6	45622	45627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344997682
1047	NC_015953	CGG	2	6	45648	45653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997682
1048	NC_015953	GCCA	2	8	45665	45672	25 %	0 %	25 %	50 %	344997682
1049	NC_015953	CCGTC	2	10	45690	45699	0 %	20 %	20 %	60 %	344997682
1050	NC_015953	CCT	2	6	45832	45837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997683
1051	NC_015953	CGG	3	9	45838	45846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997683
1052	NC_015953	CTCC	2	8	45847	45854	0 %	25 %	0 %	75 %	344997683
1053	NC_015953	CGCC	2	8	45916	45923	0 %	0 %	25 %	75 %	344997683
1054	NC_015953	CGA	2	6	45934	45939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1055	NC_015953	GCC	2	6	45996	46001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997683
1056	NC_015953	ACC	2	6	46002	46007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997683
1057	NC_015953	CGC	2	6	46008	46013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997683
1058	NC_015953	CGGCAT	2	12	46028	46039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1059	NC_015953	GGC	2	6	46067	46072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997683
1060	NC_015953	CGCAC	2	10	46123	46132	20 %	0 %	20 %	60 %	344997683
1061	NC_015953	CACGTC	2	12	46178	46189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344997683
1062	NC_015953	GTC	3	9	46187	46195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1063	NC_015953	CAG	2	6	46247	46252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1064	NC_015953	TCG	2	6	46287	46292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1065	NC_015953	GCT	2	6	46309	46314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1066	NC_015953	GCA	2	6	46333	46338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1067	NC_015953	GTC	2	6	46379	46384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1068	NC_015953	CGC	2	6	46396	46401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997683
1069	NC_015953	CGT	2	6	46432	46437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1070	NC_015953	TGC	2	6	46462	46467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1071	NC_015953	TGA	2	6	46525	46530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997683
1072	NC_015953	CGA	2	6	46532	46537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1073	NC_015953	CAG	3	9	46562	46570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1074	NC_015953	GCG	2	6	46590	46595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997683
1075	NC_015953	CGA	2	6	46606	46611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997683
1076	NC_015953	GGC	2	6	46620	46625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997683
1077	NC_015953	GCG	2	6	46669	46674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997683
1078	NC_015953	G	6	6	46696	46701	0 %	0 %	100 %	0 %	344997683
1079	NC_015953	TC	3	6	46743	46748	0 %	50 %	0 %	50 %	344997684
1080	NC_015953	AGG	2	6	46863	46868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997684
1081	NC_015953	GGC	2	6	46876	46881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1082	NC_015953	CAT	2	6	46969	46974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997684
1083	NC_015953	CCGG	2	8	47019	47026	0 %	0 %	50 %	50 %	344997684
1084	NC_015953	CAGCGC	2	12	47032	47043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344997684
1085	NC_015953	GCC	2	6	47044	47049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997684
1086	NC_015953	AGC	2	6	47052	47057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1087	NC_015953	CCA	2	6	47073	47078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997684
1088	NC_015953	GGCCG	2	10	47128	47137	0 %	0 %	60 %	40 %	344997684
1089	NC_015953	TCG	2	6	47147	47152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1090	NC_015953	GTA	2	6	47233	47238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997684
1091	NC_015953	CAG	2	6	47279	47284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1092	NC_015953	AGC	2	6	47288	47293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1093	NC_015953	GCG	2	6	47294	47299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1094	NC_015953	TCA	2	6	47420	47425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344997684
1095	NC_015953	TCG	2	6	47480	47485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1096	NC_015953	ACC	2	6	47507	47512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997684
1097	NC_015953	CGG	2	6	47529	47534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1098	NC_015953	GCG	2	6	47549	47554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1099	NC_015953	CGA	2	6	47562	47567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1100	NC_015953	CGC	2	6	47620	47625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997684
1101	NC_015953	GCG	2	6	47648	47653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1102	NC_015953	GCA	2	6	47730	47735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1103	NC_015953	CGGACG	2	12	47748	47759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344997684
1104	NC_015953	GCCG	3	12	47763	47774	0 %	0 %	50 %	50 %	344997684
1105	NC_015953	GAC	2	6	47828	47833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
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1107	NC_015953	CGG	2	6	47907	47912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1108	NC_015953	GCC	2	6	47933	47938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997684
1109	NC_015953	TCC	2	6	48029	48034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997684
1110	NC_015953	CAG	2	6	48049	48054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1111	NC_015953	CCT	2	6	48165	48170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997684
1112	NC_015953	GCG	2	6	48180	48185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997684
1113	NC_015953	GCA	2	6	48219	48224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1114	NC_015953	CAG	2	6	48286	48291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1115	NC_015953	CCA	2	6	48372	48377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997684
1116	NC_015953	CCAGGG	2	12	48408	48419	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344997684
1117	NC_015953	AGC	2	6	48422	48427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997684
1118	NC_015953	CCG	2	6	48428	48433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997684
1119	NC_015953	TCGC	2	8	48470	48477	0 %	25 %	25 %	50 %	344997684
1120	NC_015953	GTG	2	6	48509	48514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997684
1121	NC_015953	CGGCCC	2	12	48552	48563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997684
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1495	NC_015953	CAG	2	6	66218	66223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997697
1496	NC_015953	CTC	2	6	66324	66329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997697
1497	NC_015953	CGA	2	6	66338	66343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997697
1498	NC_015953	ACCTCC	2	12	66358	66369	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	344997697
1499	NC_015953	AGCG	2	8	66470	66477	25 %	0 %	50 %	25 %	344997697
1500	NC_015953	GCT	2	6	66485	66490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997697

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