MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 188705

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015953	GCC	2	6	23802	23807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
502	NC_015953	CTC	2	6	23817	23822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
503	NC_015953	GAT	2	6	23828	23833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997668
504	NC_015953	CAG	2	6	23864	23869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
505	NC_015953	GC	3	6	23929	23934	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
506	NC_015953	GCAG	2	8	23990	23997	25 %	0 %	50 %	25 %	344997668
507	NC_015953	AGC	2	6	24022	24027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
508	NC_015953	GGA	2	6	24062	24067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997668
509	NC_015953	GGGC	2	8	24119	24126	0 %	0 %	75 %	25 %	344997668
510	NC_015953	TG	3	6	24157	24162	0 %	50 %	50 %	0 %	344997668
511	NC_015953	GC	3	6	24193	24198	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
512	NC_015953	GGA	2	6	24203	24208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997668
513	NC_015953	AGA	2	6	24241	24246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997668
514	NC_015953	GCT	2	6	24254	24259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
515	NC_015953	GGGCA	2	10	24273	24282	20 %	0 %	60 %	20 %	344997668
516	NC_015953	CTG	2	6	24291	24296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
517	NC_015953	CGC	2	6	24302	24307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
518	NC_015953	GGCC	2	8	24327	24334	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
519	NC_015953	TGG	2	6	24340	24345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
520	NC_015953	TGAG	2	8	24379	24386	25 %	25 %	50 %	0 %	344997668
521	NC_015953	TCC	2	6	24430	24435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
522	NC_015953	CGC	2	6	24446	24451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
523	NC_015953	CGA	2	6	24506	24511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
524	NC_015953	GCT	2	6	24533	24538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
525	NC_015953	TGG	2	6	24580	24585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
526	NC_015953	TGG	2	6	24613	24618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
527	NC_015953	GCT	2	6	24711	24716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
528	NC_015953	CGGC	2	8	24811	24818	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
529	NC_015953	GCC	2	6	24960	24965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
530	NC_015953	TGA	2	6	24989	24994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997668
531	NC_015953	CTC	2	6	25062	25067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
532	NC_015953	GGCATC	3	18	25113	25130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344997668
533	NC_015953	CGA	2	6	25154	25159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
534	NC_015953	CGT	2	6	25163	25168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
535	NC_015953	CGGT	2	8	25170	25177	0 %	25 %	50 %	25 %	344997668
536	NC_015953	CCA	2	6	25187	25192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997668
537	NC_015953	GGCC	2	8	25218	25225	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
538	NC_015953	GCTG	2	8	25252	25259	0 %	25 %	50 %	25 %	344997668
539	NC_015953	GCC	2	6	25266	25271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
540	NC_015953	TCG	2	6	25327	25332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
541	NC_015953	CTG	2	6	25335	25340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
542	NC_015953	CCG	2	6	25369	25374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
543	NC_015953	GCC	2	6	25381	25386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
544	NC_015953	CTG	2	6	25407	25412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
545	NC_015953	GCA	2	6	25444	25449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
546	NC_015953	AACG	2	8	25461	25468	50 %	0 %	25 %	25 %	344997668
547	NC_015953	CTC	2	6	25479	25484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
548	NC_015953	CTG	2	6	25563	25568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
549	NC_015953	ACGCG	2	10	25616	25625	20 %	0 %	40 %	40 %	344997668
550	NC_015953	TGG	2	6	25626	25631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
551	NC_015953	GCT	2	6	25679	25684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
552	NC_015953	ACCCC	2	10	25702	25711	20 %	0 %	0 %	80 %	344997668
553	NC_015953	CGTCC	2	10	25729	25738	0 %	20 %	20 %	60 %	344997668
554	NC_015953	GTC	2	6	25806	25811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
555	NC_015953	GGC	2	6	25817	25822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997668
556	NC_015953	GAC	2	6	25823	25828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
557	NC_015953	TCC	2	6	25848	25853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
558	NC_015953	GCT	2	6	25895	25900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
559	NC_015953	CCT	2	6	25928	25933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
560	NC_015953	CGA	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
561	NC_015953	GTG	2	6	26013	26018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
562	NC_015953	CGGCG	2	10	26022	26031	0 %	0 %	60 %	40 %	344997668
563	NC_015953	GAG	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997668
564	NC_015953	CCT	2	6	26051	26056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
565	NC_015953	CG	3	6	26066	26071	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
566	NC_015953	TCG	2	6	26077	26082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
567	NC_015953	ATCGC	2	10	26100	26109	20 %	20 %	20 %	40 %	344997668
568	NC_015953	GCT	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
569	NC_015953	CGC	2	6	26174	26179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
570	NC_015953	GAA	2	6	26196	26201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997668
571	NC_015953	GGA	3	9	26255	26263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997668
572	NC_015953	CGG	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997668
573	NC_015953	CCA	2	6	26375	26380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344997668
574	NC_015953	CCG	2	6	26414	26419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
575	NC_015953	GAT	2	6	26439	26444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997668
576	NC_015953	GTG	2	6	26451	26456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
577	NC_015953	GTCC	2	8	26498	26505	0 %	25 %	25 %	50 %	344997668
578	NC_015953	AGC	2	6	26536	26541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
579	NC_015953	GACCAG	2	12	26574	26585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
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581	NC_015953	GCC	2	6	26612	26617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
582	NC_015953	GCC	2	6	26664	26669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
583	NC_015953	GGTG	2	8	26671	26678	0 %	25 %	75 %	0 %	344997668
584	NC_015953	AAG	2	6	26790	26795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997668
585	NC_015953	TGG	2	6	26821	26826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997668
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587	NC_015953	TCCC	3	12	26921	26932	0 %	25 %	0 %	75 %	344997668
588	NC_015953	CCCGG	2	10	26933	26942	0 %	0 %	40 %	60 %	344997668
589	NC_015953	GAA	2	6	26964	26969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997668
590	NC_015953	GCA	2	6	26974	26979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
591	NC_015953	CCG	2	6	27007	27012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
592	NC_015953	CGA	2	6	27068	27073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
593	NC_015953	CAGGG	2	10	27135	27144	20 %	0 %	60 %	20 %	344997668
594	NC_015953	ACG	2	6	27181	27186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
595	NC_015953	CCAC	2	8	27202	27209	25 %	0 %	0 %	75 %	344997668
596	NC_015953	CGA	2	6	27254	27259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
597	NC_015953	CA	3	6	27302	27307	50 %	0 %	0 %	50 %	344997668
598	NC_015953	GAT	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344997668
599	NC_015953	GACC	2	8	27380	27387	25 %	0 %	25 %	50 %	344997668
600	NC_015953	GAA	2	6	27426	27431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344997668
601	NC_015953	AGG	2	6	27555	27560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344997668
602	NC_015953	AG	3	6	27563	27568	50 %	0 %	50 %	0 %	344997668
603	NC_015953	CGA	2	6	27620	27625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
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607	NC_015953	GCT	2	6	27791	27796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
608	NC_015953	GA	3	6	27812	27817	50 %	0 %	50 %	0 %	344997668
609	NC_015953	GCGAC	2	10	27827	27836	20 %	0 %	40 %	40 %	344997668
610	NC_015953	CTG	2	6	27848	27853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
611	NC_015953	ACG	2	6	27856	27861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344997668
612	NC_015953	CCT	2	6	27923	27928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344997668
613	NC_015953	AG	3	6	27936	27941	50 %	0 %	50 %	0 %	344997668
614	NC_015953	GCT	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997668
615	NC_015953	GCC	2	6	28014	28019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344997668
616	NC_015953	CG	3	6	28067	28072	0 %	0 %	50 %	50 %	344997668
617	NC_015953	CGG	2	6	28077	28082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997668
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621	NC_015953	GGT	2	6	28396	28401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344997669
622	NC_015953	GTC	2	6	28402	28407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344997669
623	NC_015953	GTGC	2	8	28491	28498	0 %	25 %	50 %	25 %	344997669
624	NC_015953	GGTG	2	8	28512	28519	0 %	25 %	75 %	0 %	344997669
625	NC_015953	GCG	2	6	28523	28528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344997669
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