MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 5485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015951	GCC	2	6	54409	54414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007512
1002	NC_015951	GAC	2	6	54487	54492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1003	NC_015951	TC	3	6	54503	54508	0 %	50 %	0 %	50 %	345007512
1004	NC_015951	GTT	2	6	54558	54563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007512
1005	NC_015951	CGA	2	6	54608	54613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1006	NC_015951	T	6	6	54626	54631	0 %	100 %	0 %	0 %	345007512
1007	NC_015951	CAAG	2	8	54744	54751	50 %	0 %	25 %	25 %	345007512
1008	NC_015951	GACT	2	8	54828	54835	25 %	25 %	25 %	25 %	345007512
1009	NC_015951	CCTTT	2	10	54918	54927	0 %	60 %	0 %	40 %	345007512
1010	NC_015951	GC	3	6	54938	54943	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
1011	NC_015951	CTC	2	6	55299	55304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007512
1012	NC_015951	CCG	2	6	55316	55321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007512
1013	NC_015951	CG	3	6	55327	55332	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
1014	NC_015951	TCG	2	6	55378	55383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1015	NC_015951	TAG	2	6	55437	55442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1016	NC_015951	TGG	2	6	55474	55479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007512
1017	NC_015951	CGAAA	2	10	55514	55523	60 %	0 %	20 %	20 %	345007512
1018	NC_015951	GAC	2	6	55564	55569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1019	NC_015951	CGT	2	6	55733	55738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1020	NC_015951	GC	3	6	55742	55747	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
1021	NC_015951	GAA	2	6	55830	55835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007512
1022	NC_015951	CTG	2	6	55928	55933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1023	NC_015951	TCG	2	6	55946	55951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1024	NC_015951	GAAA	2	8	56045	56052	75 %	0 %	25 %	0 %	345007512
1025	NC_015951	GATC	2	8	56072	56079	25 %	25 %	25 %	25 %	345007512
1026	NC_015951	TCT	2	6	56110	56115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007512
1027	NC_015951	GGT	2	6	56166	56171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007512
1028	NC_015951	ACGG	2	8	56242	56249	25 %	0 %	50 %	25 %	345007512
1029	NC_015951	TCG	2	6	56296	56301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1030	NC_015951	AT	3	6	56305	56310	50 %	50 %	0 %	0 %	345007512
1031	NC_015951	GT	3	6	56327	56332	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
1032	NC_015951	CTG	2	6	56463	56468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1033	NC_015951	TTG	2	6	56599	56604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007512
1034	NC_015951	CAG	2	6	56620	56625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1035	NC_015951	CCG	2	6	56629	56634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007512
1036	NC_015951	AT	3	6	56635	56640	50 %	50 %	0 %	0 %	345007512
1037	NC_015951	GTC	3	9	56676	56684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1038	NC_015951	GTG	2	6	56698	56703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007512
1039	NC_015951	AGT	2	6	56728	56733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1040	NC_015951	GA	3	6	56864	56869	50 %	0 %	50 %	0 %	345007512
1041	NC_015951	AGG	2	6	56890	56895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007512
1042	NC_015951	TG	3	6	56906	56911	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
1043	NC_015951	GCT	2	6	56927	56932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1044	NC_015951	AGG	2	6	56938	56943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007512
1045	NC_015951	TGA	2	6	56966	56971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1046	NC_015951	AG	3	6	57110	57115	50 %	0 %	50 %	0 %	345007512
1047	NC_015951	CGTT	2	8	57122	57129	0 %	50 %	25 %	25 %	345007512
1048	NC_015951	GGT	2	6	57182	57187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007512
1049	NC_015951	TA	3	6	57227	57232	50 %	50 %	0 %	0 %	345007512
1050	NC_015951	ATC	2	6	57246	57251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007512
1051	NC_015951	TCA	2	6	57464	57469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007512
1052	NC_015951	GTTG	2	8	57566	57573	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
1053	NC_015951	CT	3	6	57575	57580	0 %	50 %	0 %	50 %	345007512
1054	NC_015951	AG	3	6	57597	57602	50 %	0 %	50 %	0 %	345007512
1055	NC_015951	TG	3	6	57631	57636	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
1056	NC_015951	CTG	2	6	57651	57656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1057	NC_015951	CGA	2	6	57719	57724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1058	NC_015951	GAG	2	6	57747	57752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007512
1059	NC_015951	GCTG	2	8	57838	57845	0 %	25 %	50 %	25 %	345007512
1060	NC_015951	CTT	2	6	57890	57895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007512
1061	NC_015951	AGCG	2	8	58065	58072	25 %	0 %	50 %	25 %	345007512
1062	NC_015951	TTG	2	6	58107	58112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007512
1063	NC_015951	TGA	2	6	58178	58183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1064	NC_015951	CGA	2	6	58190	58195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1065	NC_015951	GGC	2	6	58223	58228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007512
1066	NC_015951	GAC	2	6	58248	58253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1067	NC_015951	CGC	2	6	58262	58267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007512
1068	NC_015951	AGC	3	9	58279	58287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1069	NC_015951	GCTC	2	8	58357	58364	0 %	25 %	25 %	50 %	345007512
1070	NC_015951	CTC	2	6	58386	58391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007512
1071	NC_015951	CCCGG	2	10	58399	58408	0 %	0 %	40 %	60 %	345007512
1072	NC_015951	TG	3	6	58432	58437	0 %	50 %	50 %	0 %	345007512
1073	NC_015951	GGC	2	6	58531	58536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007512
1074	NC_015951	CGA	2	6	58583	58588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1075	NC_015951	GAT	2	6	58626	58631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1076	NC_015951	CAG	2	6	58644	58649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1077	NC_015951	G	6	6	58696	58701	0 %	0 %	100 %	0 %	345007512
1078	NC_015951	GTC	2	6	58773	58778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
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1081	NC_015951	CCT	2	6	59039	59044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007512
1082	NC_015951	GGT	2	6	59058	59063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007512
1083	NC_015951	GATT	2	8	59102	59109	25 %	50 %	25 %	0 %	345007512
1084	NC_015951	TCC	2	6	59259	59264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007512
1085	NC_015951	GAA	2	6	59271	59276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007512
1086	NC_015951	TCG	2	6	59281	59286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1087	NC_015951	GCA	2	6	59353	59358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1088	NC_015951	CAG	2	6	59397	59402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1089	NC_015951	A	6	6	59484	59489	100 %	0 %	0 %	0 %	345007512
1090	NC_015951	TTCA	2	8	59490	59497	25 %	50 %	0 %	25 %	345007512
1091	NC_015951	TTG	2	6	59511	59516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007512
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1093	NC_015951	CTT	2	6	59805	59810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007512
1094	NC_015951	GTA	2	6	59811	59816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1095	NC_015951	GTT	2	6	59883	59888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007512
1096	NC_015951	GCA	2	6	59944	59949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1097	NC_015951	TCA	2	6	60047	60052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007512
1098	NC_015951	TGC	2	6	60054	60059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1099	NC_015951	GAGC	2	8	60107	60114	25 %	0 %	50 %	25 %	345007512
1100	NC_015951	CCA	2	6	60191	60196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007512
1101	NC_015951	AGG	2	6	60200	60205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007512
1102	NC_015951	CCA	2	6	60217	60222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007512
1103	NC_015951	TCA	2	6	60251	60256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007512
1104	NC_015951	AGA	2	6	60263	60268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007512
1105	NC_015951	CAGA	2	8	60274	60281	50 %	0 %	25 %	25 %	345007512
1106	NC_015951	TCT	2	6	60302	60307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007512
1107	NC_015951	GAC	2	6	60312	60317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1108	NC_015951	GTC	2	6	60318	60323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1109	NC_015951	GAC	2	6	60366	60371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1110	NC_015951	GAT	2	6	60426	60431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007512
1111	NC_015951	ATC	2	6	60441	60446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007512
1112	NC_015951	CGG	2	6	60452	60457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007512
1113	NC_015951	TC	3	6	60459	60464	0 %	50 %	0 %	50 %	345007512
1114	NC_015951	GCT	2	6	60479	60484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1115	NC_015951	GGA	2	6	60485	60490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007512
1116	NC_015951	CG	3	6	60528	60533	0 %	0 %	50 %	50 %	345007512
1117	NC_015951	GTC	2	6	60588	60593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1118	NC_015951	AGC	2	6	60670	60675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1119	NC_015951	GTC	2	6	60798	60803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1120	NC_015951	GTC	2	6	60876	60881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007512
1121	NC_015951	AGG	2	6	61679	61684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007513
1122	NC_015951	GAA	3	9	61717	61725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007513
1123	NC_015951	GATC	2	8	61731	61738	25 %	25 %	25 %	25 %	345007513
1124	NC_015951	TG	3	6	61775	61780	0 %	50 %	50 %	0 %	345007513
1125	NC_015951	AGC	2	6	61784	61789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007513
1126	NC_015951	GCC	2	6	61795	61800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007513
1127	NC_015951	GAA	2	6	61807	61812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007513
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1129	NC_015951	TCA	2	6	61985	61990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007513
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1131	NC_015951	AGG	2	6	62171	62176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007513
1132	NC_015951	GTC	2	6	62224	62229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007513
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1135	NC_015951	GA	3	6	62313	62318	50 %	0 %	50 %	0 %	345007513
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1251	NC_015951	GCG	2	6	68422	68427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007518
1252	NC_015951	ACG	2	6	68449	68454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007518
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1372	NC_015951	GTC	4	12	86110	86121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007523
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1498	NC_015951	TGACGC	2	12	95177	95188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007531
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