MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015947	CCG	2	6	164567	164572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205567
4002	NC_015947	CCG	2	6	164607	164612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205567
4003	NC_015947	CGG	2	6	164620	164625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205567
4004	NC_015947	TCG	2	6	164642	164647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205567
4005	NC_015947	TTG	2	6	164648	164653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205567
4006	NC_015947	GGA	2	6	164671	164676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205567
4007	NC_015947	GCT	2	6	164802	164807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205568
4008	NC_015947	GGC	2	6	164821	164826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205568
4009	NC_015947	GTA	2	6	164837	164842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205568
4010	NC_015947	GTA	2	6	164852	164857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205568
4011	NC_015947	GCG	2	6	164873	164878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205568
4012	NC_015947	GTA	2	6	164909	164914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205568
4013	NC_015947	GTA	2	6	164948	164953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205568
4014	NC_015947	CGG	2	6	164979	164984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205568
4015	NC_015947	CGC	2	6	165010	165015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205568
4016	NC_015947	CCG	2	6	165027	165032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205568
4017	NC_015947	GCCAC	2	10	165072	165081	20 %	0 %	20 %	60 %	344205568
4018	NC_015947	TCCT	2	8	165111	165118	0 %	50 %	0 %	50 %	344205568
4019	NC_015947	CTG	2	6	165501	165506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4020	NC_015947	CTG	3	9	165513	165521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4021	NC_015947	GCA	2	6	165524	165529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4022	NC_015947	GC	3	6	165536	165541	0 %	0 %	50 %	50 %	344205569
4023	NC_015947	CGC	2	6	165551	165556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4024	NC_015947	GCC	2	6	165613	165618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4025	NC_015947	CAC	2	6	165672	165677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205569
4026	NC_015947	CGG	2	6	165698	165703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4027	NC_015947	GCG	2	6	165730	165735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4028	NC_015947	CCG	2	6	165767	165772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4029	NC_015947	TCG	2	6	165829	165834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4030	NC_015947	CAG	2	6	165837	165842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4031	NC_015947	CCT	2	6	165857	165862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205569
4032	NC_015947	CCG	2	6	165935	165940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4033	NC_015947	GCT	2	6	166016	166021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4034	NC_015947	GC	3	6	166049	166054	0 %	0 %	50 %	50 %	344205569
4035	NC_015947	GGC	3	9	166083	166091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4036	NC_015947	CGG	2	6	166100	166105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4037	NC_015947	CAG	2	6	166149	166154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205569
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4039	NC_015947	TCC	2	6	166228	166233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205569
4040	NC_015947	TGC	2	6	166256	166261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4041	NC_015947	CAG	2	6	166278	166283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4042	NC_015947	CAC	2	6	166305	166310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205569
4043	NC_015947	CCTT	2	8	166381	166388	0 %	50 %	0 %	50 %	344205569
4044	NC_015947	GCC	2	6	166461	166466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4045	NC_015947	TGAT	2	8	166528	166535	25 %	50 %	25 %	0 %	344205569
4046	NC_015947	TCG	2	6	166666	166671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4047	NC_015947	CGT	2	6	166685	166690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
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4049	NC_015947	GGC	2	6	166725	166730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4050	NC_015947	GCC	2	6	166744	166749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4051	NC_015947	GCG	3	9	166759	166767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4052	NC_015947	GCCTGG	2	12	166801	166812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205569
4053	NC_015947	CGGTGC	2	12	166821	166832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205569
4054	NC_015947	CGC	2	6	166872	166877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
4055	NC_015947	GTA	2	6	166890	166895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205569
4056	NC_015947	CGT	2	6	166922	166927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4057	NC_015947	GCG	2	6	167001	167006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4058	NC_015947	CTG	2	6	167097	167102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205569
4059	NC_015947	CGC	2	6	167138	167143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205569
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4061	NC_015947	GCG	2	6	167215	167220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205569
4062	NC_015947	CGGGT	2	10	167233	167242	0 %	20 %	60 %	20 %	344205569
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4069	NC_015947	TGG	2	6	167667	167672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205570
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4073	NC_015947	CAG	3	9	167866	167874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205570
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4080	NC_015947	CGC	2	6	168060	168065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205570
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4082	NC_015947	CCGG	2	8	168113	168120	0 %	0 %	50 %	50 %	344205570
4083	NC_015947	CTG	2	6	168121	168126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205570
4084	NC_015947	GTA	2	6	168175	168180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205570
4085	NC_015947	GGT	2	6	168181	168186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205570
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4087	NC_015947	CGG	2	6	168318	168323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205570
4088	NC_015947	TGCAGC	2	12	168827	168838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205571
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4091	NC_015947	GCCG	2	8	168937	168944	0 %	0 %	50 %	50 %	344205571
4092	NC_015947	CGA	2	6	169027	169032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205571
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4097	NC_015947	TCGAT	2	10	169287	169296	20 %	40 %	20 %	20 %	344205571
4098	NC_015947	GAT	3	9	169339	169347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205571
4099	NC_015947	GCT	2	6	169458	169463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4100	NC_015947	CTG	3	9	169465	169473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4101	NC_015947	CTG	2	6	169519	169524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4102	NC_015947	TGG	2	6	169553	169558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205572
4103	NC_015947	C	6	6	169600	169605	0 %	0 %	0 %	100 %	344205572
4104	NC_015947	CAG	2	6	169627	169632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4105	NC_015947	GC	3	6	169693	169698	0 %	0 %	50 %	50 %	344205572
4106	NC_015947	GGACT	2	10	169707	169716	20 %	20 %	40 %	20 %	344205572
4107	NC_015947	GCA	2	6	169729	169734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4108	NC_015947	GTG	2	6	169753	169758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205572
4109	NC_015947	CCG	2	6	169805	169810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205572
4110	NC_015947	GGCC	2	8	169840	169847	0 %	0 %	50 %	50 %	344205572
4111	NC_015947	GTG	2	6	169894	169899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205572
4112	NC_015947	GTGC	2	8	169930	169937	0 %	25 %	50 %	25 %	344205572
4113	NC_015947	GAC	2	6	170002	170007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4114	NC_015947	GTG	2	6	170077	170082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205572
4115	NC_015947	CTG	2	6	170083	170088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4116	NC_015947	GCAA	2	8	170138	170145	50 %	0 %	25 %	25 %	344205572
4117	NC_015947	CCAG	2	8	170183	170190	25 %	0 %	25 %	50 %	344205572
4118	NC_015947	GCTG	2	8	170216	170223	0 %	25 %	50 %	25 %	344205572
4119	NC_015947	TCGGCA	2	12	170239	170250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4120	NC_015947	AGC	2	6	170288	170293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4121	NC_015947	GGCC	2	8	170350	170357	0 %	0 %	50 %	50 %	344205572
4122	NC_015947	TGGCC	2	10	170361	170370	0 %	20 %	40 %	40 %	344205572
4123	NC_015947	CGC	2	6	170458	170463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205572
4124	NC_015947	CAGC	2	8	170529	170536	25 %	0 %	25 %	50 %	344205572
4125	NC_015947	TCA	2	6	170540	170545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205572
4126	NC_015947	GCT	2	6	170586	170591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4127	NC_015947	TGC	2	6	170621	170626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4128	NC_015947	TGC	2	6	170657	170662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4129	NC_015947	ATC	2	6	170683	170688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205572
4130	NC_015947	GC	3	6	170692	170697	0 %	0 %	50 %	50 %	344205572
4131	NC_015947	ATC	2	6	170771	170776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205572
4132	NC_015947	TGC	2	6	170777	170782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4133	NC_015947	GGC	2	6	170798	170803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205572
4134	NC_015947	CCGG	2	8	170818	170825	0 %	0 %	50 %	50 %	344205572
4135	NC_015947	CCA	2	6	170876	170881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205572
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4138	NC_015947	TGC	2	6	170984	170989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
4139	NC_015947	CTG	2	6	171007	171012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
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4143	NC_015947	GTT	2	6	171201	171206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205572
4144	NC_015947	GCA	2	6	171219	171224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205572
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4146	NC_015947	CG	3	6	171306	171311	0 %	0 %	50 %	50 %	344205572
4147	NC_015947	GCG	2	6	171347	171352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205572
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4152	NC_015947	GCC	2	6	171502	171507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205572
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4160	NC_015947	CTG	2	6	171826	171831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205572
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4203	NC_015947	CTG	3	9	173325	173333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205573
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4210	NC_015947	TCG	2	6	173751	173756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
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4212	NC_015947	GCT	2	6	173765	173770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
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4220	NC_015947	CTG	2	6	173999	174004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
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4223	NC_015947	CAG	2	6	174218	174223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205574
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4225	NC_015947	CG	5	10	174239	174248	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
4226	NC_015947	GCC	2	6	174266	174271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205574
4227	NC_015947	GGGT	2	8	174294	174301	0 %	25 %	75 %	0 %	344205574
4228	NC_015947	GCC	2	6	174383	174388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205574
4229	NC_015947	CGC	2	6	174409	174414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205574
4230	NC_015947	CGG	2	6	174442	174447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205574
4231	NC_015947	CAC	2	6	174452	174457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205574
4232	NC_015947	GATGCC	2	12	174503	174514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205574
4233	NC_015947	GC	3	6	174551	174556	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
4234	NC_015947	GGC	2	6	174565	174570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205574
4235	NC_015947	CG	4	8	174580	174587	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
4236	NC_015947	TGC	2	6	174649	174654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
4237	NC_015947	CGG	2	6	174724	174729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205574
4238	NC_015947	CTG	2	6	174770	174775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
4239	NC_015947	GCCA	2	8	174777	174784	25 %	0 %	25 %	50 %	344205574
4240	NC_015947	TGA	2	6	174805	174810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205574
4241	NC_015947	GCA	2	6	174841	174846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205574
4242	NC_015947	TGC	2	6	174859	174864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
4243	NC_015947	GC	4	8	174863	174870	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
4244	NC_015947	TCG	2	6	174894	174899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205574
4245	NC_015947	GC	4	8	174961	174968	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
4246	NC_015947	CACCG	2	10	174977	174986	20 %	0 %	20 %	60 %	344205574
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4248	NC_015947	GCAC	2	8	175024	175031	25 %	0 %	25 %	50 %	344205574
4249	NC_015947	CGGC	2	8	175044	175051	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
4250	NC_015947	CG	3	6	175058	175063	0 %	0 %	50 %	50 %	344205574
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4255	NC_015947	TGC	2	6	175587	175592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205575
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4359	NC_015947	CG	3	6	181172	181177	0 %	0 %	50 %	50 %	344205578
4360	NC_015947	GGTGC	2	10	181198	181207	0 %	20 %	60 %	20 %	344205578
4361	NC_015947	GGT	2	6	181230	181235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205578
4362	NC_015947	GCC	2	6	181236	181241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205578
4363	NC_015947	GCC	2	6	181249	181254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205578
4364	NC_015947	GGT	2	6	181291	181296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205578
4365	NC_015947	GC	4	8	181352	181359	0 %	0 %	50 %	50 %	344205578
4366	NC_015947	GC	3	6	181403	181408	0 %	0 %	50 %	50 %	344205578
4367	NC_015947	CCGGC	2	10	181427	181436	0 %	0 %	40 %	60 %	344205578
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4482	NC_015947	GGT	2	6	186071	186076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205583
4483	NC_015947	CG	3	6	186102	186107	0 %	0 %	50 %	50 %	344205583
4484	NC_015947	GTG	2	6	186144	186149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205583
4485	NC_015947	CAT	2	6	186167	186172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205583
4486	NC_015947	GGCCG	2	10	186251	186260	0 %	0 %	60 %	40 %	344205583
4487	NC_015947	CCG	3	9	186298	186306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205583
4488	NC_015947	GCA	2	6	186334	186339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205583
4489	NC_015947	GCC	2	6	186388	186393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205583
4490	NC_015947	GC	3	6	186492	186497	0 %	0 %	50 %	50 %	344205583
4491	NC_015947	GTTGGC	2	12	186507	186518	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344205583
4492	NC_015947	CGG	2	6	186520	186525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205583
4493	NC_015947	GC	3	6	186599	186604	0 %	0 %	50 %	50 %	344205583
4494	NC_015947	GCA	2	6	186638	186643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205583
4495	NC_015947	GA	3	6	186700	186705	50 %	0 %	50 %	0 %	344205583
4496	NC_015947	GC	3	6	186740	186745	0 %	0 %	50 %	50 %	344205583
4497	NC_015947	GGT	4	12	186764	186775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205584
4498	NC_015947	CCA	2	6	186817	186822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205584
4499	NC_015947	TGC	2	6	186912	186917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205584
4500	NC_015947	ACC	2	6	186990	186995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205584

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