MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015947	GCC	2	6	248531	248536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205639
6002	NC_015947	CTG	2	6	248548	248553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205639
6003	NC_015947	GCC	2	6	248583	248588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205639
6004	NC_015947	GGC	2	6	248632	248637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205639
6005	NC_015947	CCA	2	6	248643	248648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205639
6006	NC_015947	GAA	2	6	248776	248781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205639
6007	NC_015947	GCCG	2	8	248797	248804	0 %	0 %	50 %	50 %	344205639
6008	NC_015947	TGC	2	6	248811	248816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205639
6009	NC_015947	GCG	2	6	248849	248854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205639
6010	NC_015947	GGC	2	6	248877	248882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205639
6011	NC_015947	CAG	2	6	248893	248898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205639
6012	NC_015947	CG	3	6	248899	248904	0 %	0 %	50 %	50 %	344205639
6013	NC_015947	GC	4	8	248931	248938	0 %	0 %	50 %	50 %	344205639
6014	NC_015947	GCG	2	6	249005	249010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205639
6015	NC_015947	TCG	2	6	249020	249025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205639
6016	NC_015947	CTT	2	6	249061	249066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205639
6017	NC_015947	TTG	2	6	249092	249097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205639
6018	NC_015947	CGCAGC	2	12	249176	249187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205639
6019	NC_015947	G	6	6	249210	249215	0 %	0 %	100 %	0 %	344205639
6020	NC_015947	AAT	2	6	249219	249224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344205639
6021	NC_015947	CCA	2	6	249468	249473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205640
6022	NC_015947	CGC	2	6	249487	249492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6023	NC_015947	CGC	3	9	249496	249504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6024	NC_015947	GC	3	6	249551	249556	0 %	0 %	50 %	50 %	344205640
6025	NC_015947	CAG	2	6	249572	249577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205640
6026	NC_015947	GAGC	2	8	249595	249602	25 %	0 %	50 %	25 %	344205640
6027	NC_015947	CCG	2	6	249618	249623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6028	NC_015947	CGC	3	9	249688	249696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6029	NC_015947	CAA	2	6	249727	249732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205640
6030	NC_015947	GAT	2	6	249814	249819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205640
6031	NC_015947	CGT	2	6	249955	249960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205640
6032	NC_015947	TCGT	2	8	250019	250026	0 %	50 %	25 %	25 %	344205640
6033	NC_015947	GTGCA	2	10	250085	250094	20 %	20 %	40 %	20 %	344205640
6034	NC_015947	GTG	2	6	250118	250123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205640
6035	NC_015947	CAA	2	6	250135	250140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205640
6036	NC_015947	GCC	2	6	250169	250174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6037	NC_015947	GCC	2	6	250202	250207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6038	NC_015947	CTGGTG	2	12	250214	250225	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344205640
6039	NC_015947	GCG	2	6	250284	250289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205640
6040	NC_015947	TCG	2	6	250440	250445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205640
6041	NC_015947	CAC	2	6	250468	250473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205640
6042	NC_015947	GAA	2	6	250493	250498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205640
6043	NC_015947	AACGGC	2	12	250574	250585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205640
6044	NC_015947	GCC	2	6	250610	250615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205640
6045	NC_015947	GC	3	6	250616	250621	0 %	0 %	50 %	50 %	344205640
6046	NC_015947	CGGTGC	2	12	250674	250685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205640
6047	NC_015947	CG	4	8	250707	250714	0 %	0 %	50 %	50 %	344205640
6048	NC_015947	GGT	2	6	250750	250755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205640
6049	NC_015947	CG	3	6	250786	250791	0 %	0 %	50 %	50 %	344205640
6050	NC_015947	GAC	2	6	250878	250883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205641
6051	NC_015947	GAA	2	6	250891	250896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205641
6052	NC_015947	GCA	2	6	250899	250904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205641
6053	NC_015947	GGC	2	6	250917	250922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6054	NC_015947	GC	3	6	250921	250926	0 %	0 %	50 %	50 %	344205641
6055	NC_015947	CGC	2	6	250956	250961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205641
6056	NC_015947	CG	3	6	250988	250993	0 %	0 %	50 %	50 %	344205641
6057	NC_015947	GGC	2	6	251053	251058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6058	NC_015947	CGC	2	6	251079	251084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205641
6059	NC_015947	CGT	2	6	251085	251090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205641
6060	NC_015947	GAG	2	6	251095	251100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205641
6061	NC_015947	CGG	2	6	251123	251128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6062	NC_015947	CAA	2	6	251223	251228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205641
6063	NC_015947	GCG	2	6	251272	251277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6064	NC_015947	ACC	2	6	251287	251292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205641
6065	NC_015947	GCT	2	6	251364	251369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205641
6066	NC_015947	GGT	2	6	251370	251375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205641
6067	NC_015947	GGT	2	6	251389	251394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205641
6068	NC_015947	CGG	2	6	251403	251408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6069	NC_015947	CGG	2	6	251429	251434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6070	NC_015947	GAAGA	2	10	251464	251473	60 %	0 %	40 %	0 %	344205641
6071	NC_015947	CAGC	2	8	251484	251491	25 %	0 %	25 %	50 %	344205641
6072	NC_015947	GGC	3	9	251554	251562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6073	NC_015947	GGC	2	6	251590	251595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6074	NC_015947	CGC	2	6	251607	251612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205641
6075	NC_015947	GCG	2	6	251626	251631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205641
6076	NC_015947	GC	3	6	251636	251641	0 %	0 %	50 %	50 %	344205641
6077	NC_015947	CG	3	6	251649	251654	0 %	0 %	50 %	50 %	344205641
6078	NC_015947	GCC	2	6	251672	251677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205641
6079	NC_015947	TGG	2	6	251744	251749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205641
6080	NC_015947	GC	3	6	251776	251781	0 %	0 %	50 %	50 %	344205641
6081	NC_015947	GTG	2	6	251814	251819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205641
6082	NC_015947	GGCTAC	2	12	251890	251901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205641
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6084	NC_015947	AGGTGG	2	12	252064	252075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	344205642
6085	NC_015947	CCG	2	6	252085	252090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205642
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6087	NC_015947	CCG	2	6	252108	252113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205642
6088	NC_015947	TGG	2	6	252157	252162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205642
6089	NC_015947	GC	3	6	252163	252168	0 %	0 %	50 %	50 %	344205642
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6092	NC_015947	CG	3	6	252287	252292	0 %	0 %	50 %	50 %	344205642
6093	NC_015947	CGC	2	6	252344	252349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205642
6094	NC_015947	GCG	2	6	252370	252375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205642
6095	NC_015947	CAT	2	6	252407	252412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205642
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6099	NC_015947	GAA	2	6	252629	252634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205642
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6101	NC_015947	TGG	2	6	252718	252723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205642
6102	NC_015947	TCG	2	6	252739	252744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205642
6103	NC_015947	GC	3	6	252797	252802	0 %	0 %	50 %	50 %	344205642
6104	NC_015947	GAA	2	6	252812	252817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205642
6105	NC_015947	CGA	2	6	252841	252846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205643
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6107	NC_015947	GCATCG	2	12	252891	252902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205643
6108	NC_015947	CTG	3	9	252956	252964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205643
6109	NC_015947	AGC	2	6	252966	252971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205643
6110	NC_015947	CGA	3	9	252985	252993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205643
6111	NC_015947	TGG	2	6	253005	253010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205643
6112	NC_015947	TGC	2	6	253011	253016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205643
6113	NC_015947	CGG	2	6	253045	253050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205643
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6115	NC_015947	CGC	2	6	253126	253131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205643
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6117	NC_015947	GCG	2	6	253221	253226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205643
6118	NC_015947	GCCA	2	8	253247	253254	25 %	0 %	25 %	50 %	344205643
6119	NC_015947	AGCG	2	8	253265	253272	25 %	0 %	50 %	25 %	344205643
6120	NC_015947	GCTG	2	8	253329	253336	0 %	25 %	50 %	25 %	344205643
6121	NC_015947	GGC	2	6	253358	253363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205643
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6345	NC_015947	ACC	3	9	263234	263242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205655
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6348	NC_015947	TCG	2	6	263334	263339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205655
6349	NC_015947	GCCG	2	8	263387	263394	0 %	0 %	50 %	50 %	344205655
6350	NC_015947	TG	3	6	263436	263441	0 %	50 %	50 %	0 %	344205655
6351	NC_015947	GGC	2	6	263465	263470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205655
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6353	NC_015947	GCA	2	6	263647	263652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205656
6354	NC_015947	ACA	2	6	263689	263694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205656
6355	NC_015947	CCA	2	6	263699	263704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205656
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6357	NC_015947	ACC	2	6	263758	263763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205656
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6362	NC_015947	CGCTC	2	10	263838	263847	0 %	20 %	20 %	60 %	344205656
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6478	NC_015947	CG	3	6	268951	268956	0 %	0 %	50 %	50 %	344205660
6479	NC_015947	CAC	2	6	269001	269006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205660
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6482	NC_015947	CG	3	6	269052	269057	0 %	0 %	50 %	50 %	344205660
6483	NC_015947	CTGGC	2	10	269080	269089	0 %	20 %	40 %	40 %	344205660
6484	NC_015947	GCC	2	6	269158	269163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205660
6485	NC_015947	CGG	2	6	269219	269224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205660
6486	NC_015947	TTCTGG	2	12	269233	269244	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344205660
6487	NC_015947	CAG	2	6	269316	269321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205660
6488	NC_015947	GCCG	2	8	269350	269357	0 %	0 %	50 %	50 %	344205660
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6490	NC_015947	ACG	2	6	269474	269479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205660
6491	NC_015947	CTG	2	6	269504	269509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205660
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6495	NC_015947	GAC	2	6	269716	269721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205660
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6499	NC_015947	AGC	3	9	269975	269983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205660
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