MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 108163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015947	GCC	2	6	226361	226366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205621
5502	NC_015947	GCC	2	6	226494	226499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205621
5503	NC_015947	GGCG	2	8	226537	226544	0 %	0 %	75 %	25 %	344205621
5504	NC_015947	GTC	2	6	226574	226579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205621
5505	NC_015947	ACC	2	6	226605	226610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205621
5506	NC_015947	CCA	2	6	226657	226662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205621
5507	NC_015947	CG	3	6	226697	226702	0 %	0 %	50 %	50 %	344205621
5508	NC_015947	CAG	2	6	226744	226749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205621
5509	NC_015947	CAG	2	6	226751	226756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205621
5510	NC_015947	TGG	2	6	226783	226788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205621
5511	NC_015947	CCA	2	6	227354	227359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
5512	NC_015947	CGC	2	6	227390	227395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5513	NC_015947	ACC	2	6	227434	227439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
5514	NC_015947	TGG	2	6	227444	227449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205622
5515	NC_015947	CGTG	2	8	227463	227470	0 %	25 %	50 %	25 %	344205622
5516	NC_015947	TTC	2	6	227481	227486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205622
5517	NC_015947	CCA	2	6	227555	227560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
5518	NC_015947	CCG	2	6	227591	227596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5519	NC_015947	CTG	2	6	227599	227604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5520	NC_015947	GCC	2	6	227627	227632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5521	NC_015947	GC	3	6	227638	227643	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5522	NC_015947	CTG	2	6	227644	227649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5523	NC_015947	CTG	2	6	227746	227751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5524	NC_015947	CG	3	6	227769	227774	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5525	NC_015947	GC	3	6	227798	227803	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5526	NC_015947	CTG	2	6	227854	227859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5527	NC_015947	GCA	2	6	227895	227900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5528	NC_015947	TTC	2	6	227902	227907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205622
5529	NC_015947	GC	3	6	227921	227926	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5530	NC_015947	CAC	2	6	228018	228023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
5531	NC_015947	AGC	2	6	228029	228034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5532	NC_015947	CTG	2	6	228049	228054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5533	NC_015947	CGC	2	6	228059	228064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5534	NC_015947	CGG	2	6	228126	228131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205622
5535	NC_015947	TCG	2	6	228232	228237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5536	NC_015947	GGC	2	6	228256	228261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205622
5537	NC_015947	ACA	2	6	228335	228340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205622
5538	NC_015947	CCG	2	6	228354	228359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5539	NC_015947	AACCTG	2	12	228367	228378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344205622
5540	NC_015947	CG	3	6	228446	228451	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5541	NC_015947	CG	3	6	228543	228548	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5542	NC_015947	ATG	2	6	228565	228570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205622
5543	NC_015947	GC	3	6	228645	228650	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5544	NC_015947	CGA	2	6	228759	228764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5545	NC_015947	CCGC	2	8	228863	228870	0 %	0 %	25 %	75 %	344205622
5546	NC_015947	TTC	2	6	228928	228933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205622
5547	NC_015947	GAA	2	6	228978	228983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205622
5548	NC_015947	CCT	2	6	229019	229024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205622
5549	NC_015947	CGT	2	6	229055	229060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5550	NC_015947	CGC	2	6	229074	229079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5551	NC_015947	GTG	2	6	229111	229116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205622
5552	NC_015947	GC	3	6	229146	229151	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
5553	NC_015947	TGA	2	6	229184	229189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205622
5554	NC_015947	GCT	2	6	229229	229234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
5555	NC_015947	GAA	2	6	229329	229334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205622
5556	NC_015947	ACCGC	2	10	229433	229442	20 %	0 %	20 %	60 %	344205622
5557	NC_015947	GCC	2	6	229477	229482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
5558	NC_015947	TCC	2	6	229555	229560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205622
5559	NC_015947	ATGTAC	2	12	229561	229572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344205622
5560	NC_015947	ACC	2	6	229594	229599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
5561	NC_015947	TAC	2	6	229600	229605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205622
5562	NC_015947	CCA	2	6	229622	229627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
5563	NC_015947	TGC	2	6	229878	229883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205623
5564	NC_015947	TTC	2	6	230063	230068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205623
5565	NC_015947	CAA	2	6	230092	230097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205623
5566	NC_015947	GC	3	6	230138	230143	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
5567	NC_015947	GAA	2	6	230168	230173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205623
5568	NC_015947	GC	3	6	230233	230238	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
5569	NC_015947	CGG	2	6	230250	230255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205623
5570	NC_015947	AAG	3	9	230276	230284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205623
5571	NC_015947	CG	3	6	230342	230347	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
5572	NC_015947	CGC	2	6	230383	230388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205623
5573	NC_015947	TTC	3	9	230405	230413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205623
5574	NC_015947	TAC	2	6	230432	230437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205623
5575	NC_015947	CG	3	6	230445	230450	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
5576	NC_015947	CTG	2	6	230453	230458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205623
5577	NC_015947	CGA	2	6	230494	230499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205623
5578	NC_015947	GC	3	6	230502	230507	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
5579	NC_015947	GTG	2	6	230537	230542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205623
5580	NC_015947	AGC	2	6	230580	230585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205623
5581	NC_015947	CGG	2	6	230650	230655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205623
5582	NC_015947	GCA	2	6	230695	230700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205623
5583	NC_015947	AAG	2	6	230738	230743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205623
5584	NC_015947	CTT	2	6	230803	230808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205623
5585	NC_015947	CGC	2	6	230813	230818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205623
5586	NC_015947	GCC	2	6	231040	231045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205624
5587	NC_015947	CAGC	2	8	231092	231099	25 %	0 %	25 %	50 %	344205624
5588	NC_015947	GC	3	6	231122	231127	0 %	0 %	50 %	50 %	344205624
5589	NC_015947	TGC	2	6	231145	231150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205624
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5591	NC_015947	GCA	3	9	231223	231231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
5592	NC_015947	GCA	2	6	231265	231270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
5593	NC_015947	CAG	2	6	231302	231307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
5594	NC_015947	GCC	2	6	231383	231388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205624
5595	NC_015947	CAG	2	6	231416	231421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
5596	NC_015947	GC	3	6	231427	231432	0 %	0 %	50 %	50 %	344205624
5597	NC_015947	CGT	2	6	231448	231453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205624
5598	NC_015947	TCA	2	6	231469	231474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205624
5599	NC_015947	GCCA	2	8	231551	231558	25 %	0 %	25 %	50 %	344205624
5600	NC_015947	CAG	2	6	231647	231652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
5601	NC_015947	GCC	2	6	231784	231789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205625
5602	NC_015947	ACCA	2	8	231830	231837	50 %	0 %	0 %	50 %	344205625
5603	NC_015947	ATGG	2	8	231871	231878	25 %	25 %	50 %	0 %	344205625
5604	NC_015947	GCC	2	6	231884	231889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205625
5605	NC_015947	GCC	3	9	231896	231904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205625
5606	NC_015947	CGC	2	6	231914	231919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205625
5607	NC_015947	GTG	2	6	231923	231928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205625
5608	NC_015947	CG	3	6	231931	231936	0 %	0 %	50 %	50 %	344205625
5609	NC_015947	TGG	2	6	231981	231986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205625
5610	NC_015947	TCG	2	6	232002	232007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205625
5611	NC_015947	AGGTCG	2	12	232029	232040	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205625
5612	NC_015947	GCG	2	6	232065	232070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205625
5613	NC_015947	TGA	2	6	232101	232106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205625
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5616	NC_015947	GGA	2	6	232447	232452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205626
5617	NC_015947	A	6	6	232538	232543	100 %	0 %	0 %	0 %	344205626
5618	NC_015947	CGC	2	6	232547	232552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205626
5619	NC_015947	GTT	2	6	232614	232619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205626
5620	NC_015947	TGC	2	6	232634	232639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205626
5621	NC_015947	T	7	7	232734	232740	0 %	100 %	0 %	0 %	344205626
5622	NC_015947	TTC	2	6	232744	232749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205626
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5626	NC_015947	CGT	2	6	232922	232927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205626
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5735	NC_015947	GC	3	6	237973	237978	0 %	0 %	50 %	50 %	344205630
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5743	NC_015947	GCG	2	6	238271	238276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205631
5744	NC_015947	CAG	2	6	238297	238302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205631
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5984	NC_015947	ACGC	2	8	247884	247891	25 %	0 %	25 %	50 %	344205639
5985	NC_015947	TGCA	2	8	247892	247899	25 %	25 %	25 %	25 %	344205639
5986	NC_015947	CG	3	6	247905	247910	0 %	0 %	50 %	50 %	344205639
5987	NC_015947	CGAT	2	8	247932	247939	25 %	25 %	25 %	25 %	344205639
5988	NC_015947	TGC	2	6	247997	248002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205639
5989	NC_015947	CTG	2	6	248063	248068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205639
5990	NC_015947	GCCA	2	8	248078	248085	25 %	0 %	25 %	50 %	344205639
5991	NC_015947	GC	3	6	248110	248115	0 %	0 %	50 %	50 %	344205639
5992	NC_015947	ACC	2	6	248179	248184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205639
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5997	NC_015947	CGCA	2	8	248377	248384	25 %	0 %	25 %	50 %	344205639
5998	NC_015947	GA	3	6	248429	248434	50 %	0 %	50 %	0 %	344205639
5999	NC_015947	GC	4	8	248477	248484	0 %	0 %	50 %	50 %	344205639
6000	NC_015947	CAC	2	6	248485	248490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205639

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