MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 37428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015875	GGT	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162706
502	NC_015875	AGT	2	6	26255	26260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162706
503	NC_015875	CGT	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162707
504	NC_015875	AAG	2	6	26414	26419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162707
505	NC_015875	CAA	2	6	26529	26534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162707
506	NC_015875	CTA	2	6	26540	26545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162707
507	NC_015875	GT	4	8	26561	26568	0 %	50 %	50 %	0 %	342162707
508	NC_015875	ATC	2	6	26624	26629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162707
509	NC_015875	A	7	7	26705	26711	100 %	0 %	0 %	0 %	342162708
510	NC_015875	TGC	2	6	26746	26751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162708
511	NC_015875	TC	3	6	26940	26945	0 %	50 %	0 %	50 %	342162708
512	NC_015875	GA	3	6	27088	27093	50 %	0 %	50 %	0 %	342162708
513	NC_015875	GT	3	6	27105	27110	0 %	50 %	50 %	0 %	342162708
514	NC_015875	TTAT	2	8	27179	27186	25 %	75 %	0 %	0 %	342162709
515	NC_015875	T	7	7	27260	27266	0 %	100 %	0 %	0 %	342162709
516	NC_015875	GAA	2	6	27268	27273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162709
517	NC_015875	TGA	2	6	27297	27302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162709
518	NC_015875	TGA	2	6	27345	27350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162709
519	NC_015875	ATCA	2	8	27379	27386	50 %	25 %	0 %	25 %	342162709
520	NC_015875	GAA	2	6	27410	27415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162709
521	NC_015875	GTT	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162709
522	NC_015875	TTG	2	6	27589	27594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162710
523	NC_015875	AAG	2	6	27601	27606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162710
524	NC_015875	ACT	2	6	27645	27650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162710
525	NC_015875	AAG	2	6	27666	27671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162710
526	NC_015875	GCA	2	6	27765	27770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162710
527	NC_015875	GAC	2	6	27771	27776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162710
528	NC_015875	AAG	2	6	27777	27782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162710
529	NC_015875	GCGGTG	2	12	27856	27867	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	342162710
530	NC_015875	ATTGC	2	10	27897	27906	20 %	40 %	20 %	20 %	342162710
531	NC_015875	TTAA	2	8	27941	27948	50 %	50 %	0 %	0 %	342162710
532	NC_015875	TCATC	2	10	28009	28018	20 %	40 %	0 %	40 %	342162711
533	NC_015875	AGC	2	6	28020	28025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162711
534	NC_015875	GAA	2	6	28033	28038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162711
535	NC_015875	A	6	6	28037	28042	100 %	0 %	0 %	0 %	342162711
536	NC_015875	CCT	2	6	28099	28104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162711
537	NC_015875	TGG	2	6	28206	28211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162711
538	NC_015875	AAC	2	6	28218	28223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162711
539	NC_015875	AAG	2	6	28303	28308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162711
540	NC_015875	AGT	2	6	28317	28322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162711
541	NC_015875	AGA	2	6	28477	28482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162712
542	NC_015875	GAT	2	6	28508	28513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162712
543	NC_015875	GTT	2	6	28583	28588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162712
544	NC_015875	AGA	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162712
545	NC_015875	ACA	2	6	28598	28603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162712
546	NC_015875	TTG	2	6	28638	28643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162712
547	NC_015875	AGGA	2	8	28689	28696	50 %	0 %	50 %	0 %	342162712
548	NC_015875	AATG	2	8	28700	28707	50 %	25 %	25 %	0 %	342162712
549	NC_015875	CAAT	2	8	32639	32646	50 %	25 %	0 %	25 %	342162713
550	NC_015875	GAA	2	6	32794	32799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162713
551	NC_015875	ATC	2	6	32823	32828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162713
552	NC_015875	T	6	6	32833	32838	0 %	100 %	0 %	0 %	342162713
553	NC_015875	ATGG	2	8	32860	32867	25 %	25 %	50 %	0 %	342162713
554	NC_015875	AG	3	6	32967	32972	50 %	0 %	50 %	0 %	342162713
555	NC_015875	GAC	2	6	32997	33002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162714
556	NC_015875	AAGGA	2	10	33026	33035	60 %	0 %	40 %	0 %	342162714
557	NC_015875	TGG	2	6	33127	33132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162714
558	NC_015875	TACC	2	8	33232	33239	25 %	25 %	0 %	50 %	342162714
559	NC_015875	TCA	2	6	33264	33269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162714
560	NC_015875	ATGG	2	8	33317	33324	25 %	25 %	50 %	0 %	342162714
561	NC_015875	GAAA	2	8	33483	33490	75 %	0 %	25 %	0 %	342162714
562	NC_015875	GAT	2	6	33526	33531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162714
563	NC_015875	TTC	2	6	33545	33550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162714
564	NC_015875	AAG	2	6	33686	33691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162714
565	NC_015875	GGTC	2	8	33716	33723	0 %	25 %	50 %	25 %	342162714
566	NC_015875	CAA	2	6	33868	33873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162714
567	NC_015875	GAAA	2	8	33874	33881	75 %	0 %	25 %	0 %	342162714
568	NC_015875	GGT	2	6	33923	33928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162714
569	NC_015875	CAA	2	6	34013	34018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162714
570	NC_015875	AGC	2	6	34054	34059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162714
571	NC_015875	GAA	2	6	34139	34144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162714
572	NC_015875	CAAG	2	8	34147	34154	50 %	0 %	25 %	25 %	342162714
573	NC_015875	ATCA	2	8	34169	34176	50 %	25 %	0 %	25 %	342162714
574	NC_015875	ATG	2	6	34194	34199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162714
575	NC_015875	CT	3	6	34261	34266	0 %	50 %	0 %	50 %	342162714
576	NC_015875	CAGT	2	8	34283	34290	25 %	25 %	25 %	25 %	342162714
577	NC_015875	T	6	6	34318	34323	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
578	NC_015875	GTA	2	6	34357	34362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162715
579	NC_015875	CTG	2	6	34407	34412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
580	NC_015875	TTC	2	6	34783	34788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
581	NC_015875	CTTTTG	2	12	34836	34847	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	342162715
582	NC_015875	TTCAGC	2	12	34906	34917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	342162715
583	NC_015875	ATT	2	6	34945	34950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162715
584	NC_015875	TTC	2	6	34988	34993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
585	NC_015875	CTG	2	6	34998	35003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
586	NC_015875	CTT	3	9	35037	35045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
587	NC_015875	TCT	2	6	35063	35068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
588	NC_015875	CTT	2	6	35097	35102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
589	NC_015875	CTT	2	6	35106	35111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
590	NC_015875	TTG	2	6	35120	35125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162715
591	NC_015875	ATC	2	6	35128	35133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162715
592	NC_015875	CAA	2	6	35166	35171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162715
593	NC_015875	CTG	3	9	35199	35207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
594	NC_015875	CTT	2	6	35223	35228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
595	NC_015875	T	6	6	35238	35243	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
596	NC_015875	GGCTTT	2	12	35278	35289	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	342162715
597	NC_015875	GCTT	2	8	35294	35301	0 %	50 %	25 %	25 %	342162715
598	NC_015875	AG	3	6	35306	35311	50 %	0 %	50 %	0 %	342162715
599	NC_015875	CTT	2	6	35379	35384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
600	NC_015875	TAC	2	6	35430	35435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162715
601	NC_015875	ATTC	2	8	35484	35491	25 %	50 %	0 %	25 %	342162715
602	NC_015875	ACA	2	6	35492	35497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162715
603	NC_015875	GCT	2	6	35564	35569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
604	NC_015875	GCTTCC	2	12	35618	35629	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	342162715
605	NC_015875	GCT	2	6	35648	35653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
606	NC_015875	TCT	2	6	35675	35680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
607	NC_015875	T	6	6	35680	35685	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
608	NC_015875	CTT	2	6	35698	35703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
609	NC_015875	TTG	2	6	35726	35731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162715
610	NC_015875	AATT	2	8	35748	35755	50 %	50 %	0 %	0 %	342162715
611	NC_015875	CTG	2	6	35757	35762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
612	NC_015875	T	6	6	35857	35862	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
613	NC_015875	AATC	2	8	35904	35911	50 %	25 %	0 %	25 %	342162715
614	NC_015875	CTT	2	6	35973	35978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
615	NC_015875	GTA	2	6	36044	36049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162715
616	NC_015875	TTG	2	6	36072	36077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162715
617	NC_015875	CAC	2	6	36111	36116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342162715
618	NC_015875	T	6	6	36163	36168	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
619	NC_015875	GCT	3	9	36173	36181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
620	NC_015875	TCT	2	6	36215	36220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
621	NC_015875	TTTCGC	2	12	36262	36273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	342162715
622	NC_015875	TC	3	6	36287	36292	0 %	50 %	0 %	50 %	342162715
623	NC_015875	T	7	7	36304	36310	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
624	NC_015875	GTC	2	6	36325	36330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162715
625	NC_015875	TCT	2	6	36347	36352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
626	NC_015875	CTT	2	6	36420	36425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162715
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628	NC_015875	T	6	6	36460	36465	0 %	100 %	0 %	0 %	342162715
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