MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella bongori NCTC 12419

Total Repeats: 2531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015761	TCCGG	2	10	1310	1319	0 %	20 %	40 %	40 %	339998038
2	NC_015761	AGGTA	2	10	2566	2575	40 %	20 %	40 %	0 %	339998038
3	NC_015761	ATTGC	2	10	3409	3418	20 %	40 %	20 %	20 %	339998039
4	NC_015761	CGGCG	2	10	4157	4166	0 %	0 %	60 %	40 %	339998040
5	NC_015761	TGAGA	2	10	5880	5889	40 %	20 %	40 %	0 %	339998041
6	NC_015761	GGCCG	2	10	7017	7026	0 %	0 %	60 %	40 %	339998042
7	NC_015761	CCGCG	2	10	7194	7203	0 %	0 %	40 %	60 %	339998042
8	NC_015761	ATGAG	2	10	9308	9317	40 %	20 %	40 %	0 %	339998045
9	NC_015761	CGTGA	2	10	9361	9370	20 %	20 %	40 %	20 %	339998045
10	NC_015761	GTTGC	2	10	13013	13022	0 %	40 %	40 %	20 %	339998049
11	NC_015761	GCGTG	2	10	14447	14456	0 %	20 %	60 %	20 %	339998050
12	NC_015761	AGGCG	2	10	14753	14762	20 %	0 %	60 %	20 %	339998050
13	NC_015761	AGAGC	2	10	19866	19875	40 %	0 %	40 %	20 %	339998055
14	NC_015761	TCTTA	2	10	24314	24323	20 %	60 %	0 %	20 %	339998057
15	NC_015761	CTGAA	2	10	24447	24456	40 %	20 %	20 %	20 %	339998057
16	NC_015761	TATTT	2	10	25919	25928	20 %	80 %	0 %	0 %	339998059
17	NC_015761	CGCAG	2	10	26873	26882	20 %	0 %	40 %	40 %	339998060
18	NC_015761	AGGCC	2	10	27807	27816	20 %	0 %	40 %	40 %	339998060
19	NC_015761	CAATG	2	10	28564	28573	40 %	20 %	20 %	20 %	339998060
20	NC_015761	CAGAA	2	10	29040	29049	60 %	0 %	20 %	20 %	339998061
21	NC_015761	TTACG	2	10	31505	31514	20 %	40 %	20 %	20 %	339998064
22	NC_015761	GGGCG	2	10	32275	32284	0 %	0 %	80 %	20 %	339998065
23	NC_015761	TGAAA	2	10	39054	39063	60 %	20 %	20 %	0 %	339998071
24	NC_015761	CTGGA	2	10	40156	40165	20 %	20 %	40 %	20 %	339998071
25	NC_015761	ACGGT	2	10	43793	43802	20 %	20 %	40 %	20 %	339998074
26	NC_015761	TTTAT	2	10	44296	44305	20 %	80 %	0 %	0 %	339998074
27	NC_015761	GGGCT	2	10	45495	45504	0 %	20 %	60 %	20 %	339998075
28	NC_015761	TGTGC	2	10	48322	48331	0 %	40 %	40 %	20 %	339998079
29	NC_015761	TTCGC	2	10	48911	48920	0 %	40 %	20 %	40 %	339998079
30	NC_015761	TCACG	2	10	49992	50001	20 %	20 %	20 %	40 %	339998080
31	NC_015761	CGGCG	2	10	52301	52310	0 %	0 %	60 %	40 %	339998081
32	NC_015761	TTCAC	2	10	52557	52566	20 %	40 %	0 %	40 %	339998082
33	NC_015761	GCGAA	2	10	60326	60335	40 %	0 %	40 %	20 %	339998088
34	NC_015761	TTGCC	2	10	62851	62860	0 %	40 %	20 %	40 %	339998090
35	NC_015761	CGTCC	2	10	62961	62970	0 %	20 %	20 %	60 %	339998090
36	NC_015761	TCAGC	2	10	66069	66078	20 %	20 %	20 %	40 %	339998093
37	NC_015761	GGCCA	2	10	66217	66226	20 %	0 %	40 %	40 %	339998093
38	NC_015761	GTACG	2	10	68788	68797	20 %	20 %	40 %	20 %	339998095
39	NC_015761	TGATG	2	10	71290	71299	20 %	40 %	40 %	0 %	339998097
40	NC_015761	CCGCA	2	10	71620	71629	20 %	0 %	20 %	60 %	339998097
41	NC_015761	CGGTT	2	10	72125	72134	0 %	40 %	40 %	20 %	339998098
42	NC_015761	TGGCG	2	10	73906	73915	0 %	20 %	60 %	20 %	339998100
43	NC_015761	TTCCC	2	10	77664	77673	0 %	40 %	0 %	60 %	339998104
44	NC_015761	GTGGC	2	10	78232	78241	0 %	20 %	60 %	20 %	339998104
45	NC_015761	TGCAC	2	10	80629	80638	20 %	20 %	20 %	40 %	339998106
46	NC_015761	ACGTT	2	10	81315	81324	20 %	40 %	20 %	20 %	339998107
47	NC_015761	AACGT	2	10	84559	84568	40 %	20 %	20 %	20 %	339998110
48	NC_015761	ATCTG	2	10	88000	88009	20 %	40 %	20 %	20 %	339998114
49	NC_015761	CGGTA	2	10	88588	88597	20 %	20 %	40 %	20 %	339998114
50	NC_015761	GCTTC	2	10	88796	88805	0 %	40 %	20 %	40 %	339998114
51	NC_015761	TGATC	2	10	90783	90792	20 %	40 %	20 %	20 %	339998115
52	NC_015761	GGGCG	2	10	90933	90942	0 %	0 %	80 %	20 %	339998115
53	NC_015761	CCGCG	2	10	95602	95611	0 %	0 %	40 %	60 %	339998118
54	NC_015761	CGTGT	2	10	96943	96952	0 %	40 %	40 %	20 %	339998118
55	NC_015761	CAGAT	2	10	98204	98213	40 %	20 %	20 %	20 %	339998119
56	NC_015761	GCGTG	2	10	98904	98913	0 %	20 %	60 %	20 %	339998120
57	NC_015761	CAGCG	2	10	99334	99343	20 %	0 %	40 %	40 %	339998121
58	NC_015761	GCGCA	2	10	104875	104884	20 %	0 %	40 %	40 %	339998125
59	NC_015761	CACCG	2	10	105437	105446	20 %	0 %	20 %	60 %	339998126
60	NC_015761	CCCAG	2	10	107426	107435	20 %	0 %	20 %	60 %	339998127
61	NC_015761	TTGGG	2	10	110226	110235	0 %	40 %	60 %	0 %	339998129
62	NC_015761	GGTAA	2	10	113009	113018	40 %	20 %	40 %	0 %	339998131
63	NC_015761	TGGTC	2	10	116032	116041	0 %	40 %	40 %	20 %	339998133
64	NC_015761	ATTCC	2	10	118404	118413	20 %	40 %	0 %	40 %	339998136
65	NC_015761	CCCGG	2	10	118589	118598	0 %	0 %	40 %	60 %	339998136
66	NC_015761	AAAGC	2	10	120705	120714	60 %	0 %	20 %	20 %	339998138
67	NC_015761	GACCC	2	10	123090	123099	20 %	0 %	20 %	60 %	339998140
68	NC_015761	AGTTC	2	10	123609	123618	20 %	40 %	20 %	20 %	339998140
69	NC_015761	CCTGG	2	10	131068	131077	0 %	20 %	40 %	40 %	339998147
70	NC_015761	CGTAT	2	10	131736	131745	20 %	40 %	20 %	20 %	339998147
71	NC_015761	CGGGG	2	10	132948	132957	0 %	0 %	80 %	20 %	339998148
72	NC_015761	ATCAG	2	10	133572	133581	40 %	20 %	20 %	20 %	339998149
73	NC_015761	CTGCC	2	10	135581	135590	0 %	20 %	20 %	60 %	339998150
74	NC_015761	TGCGT	2	10	137330	137339	0 %	40 %	40 %	20 %	339998152
75	NC_015761	TGGCG	2	10	138663	138672	0 %	20 %	60 %	20 %	339998153
76	NC_015761	CCTTG	2	10	140612	140621	0 %	40 %	20 %	40 %	339998155
77	NC_015761	CCGGC	2	10	141673	141682	0 %	0 %	40 %	60 %	339998156
78	NC_015761	ACTCT	2	10	141887	141896	20 %	40 %	0 %	40 %	339998156
79	NC_015761	CGATG	2	10	144806	144815	20 %	20 %	40 %	20 %	339998158
80	NC_015761	TAGCG	2	10	149783	149792	20 %	20 %	40 %	20 %	339998164
81	NC_015761	AGTGT	2	10	150116	150125	20 %	40 %	40 %	0 %	339998164
82	NC_015761	GCCCG	2	10	150841	150850	0 %	0 %	40 %	60 %	339998165
83	NC_015761	GGCGC	2	10	153330	153339	0 %	0 %	60 %	40 %	339998168
84	NC_015761	ATGAC	2	10	153856	153865	40 %	20 %	20 %	20 %	339998168
85	NC_015761	CTGGA	2	10	154446	154455	20 %	20 %	40 %	20 %	339998169
86	NC_015761	TTCGC	2	10	154524	154533	0 %	40 %	20 %	40 %	339998169
87	NC_015761	ATTCA	2	10	155802	155811	40 %	40 %	0 %	20 %	339998171
88	NC_015761	CAGAA	2	10	156565	156574	60 %	0 %	20 %	20 %	339998171
89	NC_015761	AAAGT	2	10	161170	161179	60 %	20 %	20 %	0 %	339998173
90	NC_015761	GACTG	2	10	164413	164422	20 %	20 %	40 %	20 %	339998175
91	NC_015761	AGCAA	2	10	164825	164834	60 %	0 %	20 %	20 %	339998175
92	NC_015761	TGGTC	2	10	167549	167558	0 %	40 %	40 %	20 %	339998176
93	NC_015761	TGGCA	2	10	169936	169945	20 %	20 %	40 %	20 %	339998178
94	NC_015761	GGCCA	2	10	170358	170367	20 %	0 %	40 %	40 %	339998179
95	NC_015761	GCGCC	2	10	170371	170380	0 %	0 %	40 %	60 %	339998179
96	NC_015761	CCCAC	2	10	181697	181706	20 %	0 %	0 %	80 %	339998187
97	NC_015761	TTTCA	2	10	188713	188722	20 %	60 %	0 %	20 %	339998194
98	NC_015761	GCCGC	2	10	192415	192424	0 %	0 %	40 %	60 %	339998198
99	NC_015761	ACGGC	2	10	192563	192572	20 %	0 %	40 %	40 %	339998198
100	NC_015761	GAACC	2	10	194649	194658	40 %	0 %	20 %	40 %	339998200
101	NC_015761	GCCCA	2	10	196215	196224	20 %	0 %	20 %	60 %	339998202
102	NC_015761	CGTTT	2	10	197777	197786	0 %	60 %	20 %	20 %	339998202
103	NC_015761	CCGCG	2	10	203300	203309	0 %	0 %	40 %	60 %	339998208
104	NC_015761	GCCAG	2	10	203603	203612	20 %	0 %	40 %	40 %	339998208
105	NC_015761	CGGGG	2	10	205987	205996	0 %	0 %	80 %	20 %	339998212
106	NC_015761	GCGCA	2	10	206657	206666	20 %	0 %	40 %	40 %	339998212
107	NC_015761	ACGCA	2	10	206825	206834	40 %	0 %	20 %	40 %	339998212
108	NC_015761	GGCGA	2	10	208106	208115	20 %	0 %	60 %	20 %	339998212
109	NC_015761	AACCT	2	10	214630	214639	40 %	20 %	0 %	40 %	339998216
110	NC_015761	GGCGT	2	10	215660	215669	0 %	20 %	60 %	20 %	339998217
111	NC_015761	CGGCG	2	10	219323	219332	0 %	0 %	60 %	40 %	339998219
112	NC_015761	GGGCG	2	10	219665	219674	0 %	0 %	80 %	20 %	339998219
113	NC_015761	TGCTT	2	10	219817	219826	0 %	60 %	20 %	20 %	339998219
114	NC_015761	CCGGG	2	10	226970	226979	0 %	0 %	60 %	40 %	339998226
115	NC_015761	ACTGG	2	10	227745	227754	20 %	20 %	40 %	20 %	339998227
116	NC_015761	AGTCC	2	10	229162	229171	20 %	20 %	20 %	40 %	339998227
117	NC_015761	TCGGA	2	10	232159	232168	20 %	20 %	40 %	20 %	339998229
118	NC_015761	CGGCG	2	10	233404	233413	0 %	0 %	60 %	40 %	339998230
119	NC_015761	CTGAA	2	10	237742	237751	40 %	20 %	20 %	20 %	339998233
120	NC_015761	AAGCG	2	10	237806	237815	40 %	0 %	40 %	20 %	339998233
121	NC_015761	TGGTG	2	10	239709	239718	0 %	40 %	60 %	0 %	339998235
122	NC_015761	TGCGC	2	10	240228	240237	0 %	20 %	40 %	40 %	339998235
123	NC_015761	AGCAG	2	10	240788	240797	40 %	0 %	40 %	20 %	339998236
124	NC_015761	ATGGC	2	10	241977	241986	20 %	20 %	40 %	20 %	339998237
125	NC_015761	ACTTT	2	10	243272	243281	20 %	60 %	0 %	20 %	339998238
126	NC_015761	CGGTA	2	10	244436	244445	20 %	20 %	40 %	20 %	339998240
127	NC_015761	TACGG	2	10	247185	247194	20 %	20 %	40 %	20 %	339998241
128	NC_015761	ATGTC	2	10	248472	248481	20 %	40 %	20 %	20 %	339998242
129	NC_015761	GGGTC	2	10	249298	249307	0 %	20 %	60 %	20 %	339998243
130	NC_015761	GTGAA	2	10	250500	250509	40 %	20 %	40 %	0 %	339998245
131	NC_015761	GAAGC	2	10	250985	250994	40 %	0 %	40 %	20 %	339998245
132	NC_015761	ATGCC	2	10	251591	251600	20 %	20 %	20 %	40 %	339998246
133	NC_015761	ACCGC	2	10	255523	255532	20 %	0 %	20 %	60 %	339998248
134	NC_015761	AAAGA	2	10	256715	256724	80 %	0 %	20 %	0 %	339998249
135	NC_015761	GCCGC	2	10	257554	257563	0 %	0 %	40 %	60 %	339998250
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