MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella bongori NCTC 12419

Total Repeats: 54457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015761	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998037
2	NC_015761	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998037
3	NC_015761	CGG	2	6	367	372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
4	NC_015761	TGG	2	6	489	494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
5	NC_015761	GAT	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998038
6	NC_015761	CGG	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
7	NC_015761	CGT	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
8	NC_015761	CTG	2	6	677	682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
9	NC_015761	CGC	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
10	NC_015761	GTG	2	6	723	728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
11	NC_015761	CAT	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998038
12	NC_015761	CCG	2	6	862	867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
13	NC_015761	CGC	2	6	871	876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
14	NC_015761	CGA	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
15	NC_015761	CTG	2	6	921	926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
16	NC_015761	TGG	2	6	945	950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
17	NC_015761	GCC	2	6	992	997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
18	NC_015761	CTG	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
19	NC_015761	AAT	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998038
20	NC_015761	GGC	2	6	1342	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
21	NC_015761	CCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998038
22	NC_015761	AAG	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998038
23	NC_015761	GGT	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998038
24	NC_015761	TTC	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998038
25	NC_015761	ACG	2	6	1694	1699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
26	NC_015761	CGG	2	6	1768	1773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
27	NC_015761	CGG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
28	NC_015761	AGC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
29	NC_015761	CAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998038
30	NC_015761	GAA	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998038
31	NC_015761	GCG	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
32	NC_015761	GTT	2	6	1873	1878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998038
33	NC_015761	ATC	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998038
34	NC_015761	TCG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
35	NC_015761	TGT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998038
36	NC_015761	TCG	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
37	NC_015761	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339998038
38	NC_015761	CGC	2	6	2131	2136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
39	NC_015761	ACG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
40	NC_015761	CTG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
41	NC_015761	GAC	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998038
42	NC_015761	GCC	2	6	2537	2542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998038
43	NC_015761	TGA	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998038
44	NC_015761	TAT	2	6	2699	2704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339998038
45	NC_015761	CGG	2	6	2754	2759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998038
46	NC_015761	CTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998038
47	NC_015761	CGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998039
48	NC_015761	GAT	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998039
49	NC_015761	GCA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998039
50	NC_015761	TGA	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998039
51	NC_015761	GAA	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339998039
52	NC_015761	CCG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998039
53	NC_015761	GCC	2	6	3477	3482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998039
54	NC_015761	TGA	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998039
55	NC_015761	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998039
56	NC_015761	GGA	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339998040
57	NC_015761	GTT	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998040
58	NC_015761	CGG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998040
59	NC_015761	GCG	2	6	4111	4116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998040
60	NC_015761	GTC	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998040
61	NC_015761	GGC	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998040
62	NC_015761	GAC	3	9	4338	4346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998040
63	NC_015761	CTG	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998040
64	NC_015761	CTA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998040
65	NC_015761	TGG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998040
66	NC_015761	CGC	2	6	4556	4561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998040
67	NC_015761	CCG	2	6	4694	4699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998040
68	NC_015761	GAT	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998040
69	NC_015761	CCA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998040
70	NC_015761	CAT	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998040
71	NC_015761	TGA	3	9	5014	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998040
72	NC_015761	CTT	2	6	5168	5173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998041
73	NC_015761	GTT	2	6	5210	5215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998041
74	NC_015761	ATG	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998041
75	NC_015761	TCA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998041
76	NC_015761	ACC	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998041
77	NC_015761	TTC	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998041
78	NC_015761	ACC	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998041
79	NC_015761	GCG	2	6	5765	5770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998041
80	NC_015761	ACC	2	6	6106	6111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998042
81	NC_015761	CGA	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
82	NC_015761	TAA	2	6	6240	6245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998042
83	NC_015761	CAG	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
84	NC_015761	ATC	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998042
85	NC_015761	TGA	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998042
86	NC_015761	GCC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998042
87	NC_015761	TGC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998042
88	NC_015761	AGC	2	6	6766	6771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
89	NC_015761	CAA	2	6	6950	6955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998042
90	NC_015761	AGG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339998042
91	NC_015761	AAT	2	6	7104	7109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998042
92	NC_015761	GCC	2	6	7143	7148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998042
93	NC_015761	ATG	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998042
94	NC_015761	AGC	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998042
95	NC_015761	TAA	2	6	7382	7387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998042
96	NC_015761	CAC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339998043
97	NC_015761	CAG	2	6	7876	7881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998043
98	NC_015761	TAT	2	6	8016	8021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339998043
99	NC_015761	ATG	2	6	8033	8038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339998043
100	NC_015761	TGT	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998043
101	NC_015761	TAC	2	6	8308	8313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998043
102	NC_015761	ACA	2	6	8316	8321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998043
103	NC_015761	CGT	2	6	8334	8339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998043
104	NC_015761	TTG	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998043
105	NC_015761	GCA	2	6	8523	8528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998043
106	NC_015761	CTG	2	6	8620	8625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998043
107	NC_015761	TCT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339998044
108	NC_015761	TTG	2	6	8821	8826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998044
109	NC_015761	TCA	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998044
110	NC_015761	TGT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339998044
111	NC_015761	CAA	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998044
112	NC_015761	GCG	2	6	9170	9175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998045
113	NC_015761	TGG	2	6	9302	9307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998045
114	NC_015761	GGT	2	6	9657	9662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998045
115	NC_015761	CAG	2	6	9987	9992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998046
116	NC_015761	AGC	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998046
117	NC_015761	CAG	2	6	10233	10238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998046
118	NC_015761	AAT	2	6	10287	10292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339998046
119	NC_015761	TGG	2	6	10337	10342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339998046
120	NC_015761	GCG	2	6	10367	10372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998046
121	NC_015761	CAT	2	6	10567	10572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998047
122	NC_015761	TCG	2	6	10573	10578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339998047
123	NC_015761	CCG	2	6	10599	10604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998047
124	NC_015761	CGC	2	6	10683	10688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339998047
125	NC_015761	GGC	2	6	10717	10722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339998047
126	NC_015761	TCA	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339998047
127	NC_015761	GCA	2	6	10806	10811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998047
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129	NC_015761	CAG	2	6	10909	10914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339998047
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249	NC_015761	AAC	2	6	19121	19126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339998055
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