MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 38129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015760	CAA	2	6	159960	159965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
2502	NC_015760	TGG	3	9	159996	160004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398001
2503	NC_015760	ACA	2	6	160034	160039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
2504	NC_015760	CAT	2	6	160050	160055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398001
2505	NC_015760	CAA	2	6	160080	160085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
2506	NC_015760	AG	3	6	160126	160131	50 %	0 %	50 %	0 %	340398001
2507	NC_015760	GCT	2	6	160181	160186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2508	NC_015760	CATCA	2	10	160195	160204	40 %	20 %	0 %	40 %	340398001
2509	NC_015760	ACA	2	6	160316	160321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
2510	NC_015760	AGC	2	6	160324	160329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2511	NC_015760	ATTA	2	8	160352	160359	50 %	50 %	0 %	0 %	340398001
2512	NC_015760	GTT	2	6	160364	160369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398001
2513	NC_015760	CAG	2	6	160383	160388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2514	NC_015760	ATC	2	6	160436	160441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398001
2515	NC_015760	ACAA	2	8	160523	160530	75 %	0 %	0 %	25 %	340398001
2516	NC_015760	GTA	2	6	160572	160577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
2517	NC_015760	CAAG	2	8	160584	160591	50 %	0 %	25 %	25 %	340398001
2518	NC_015760	GAT	2	6	160613	160618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
2519	NC_015760	TCT	2	6	160749	160754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398001
2520	NC_015760	ATG	2	6	160755	160760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
2521	NC_015760	CAG	2	6	160920	160925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2522	NC_015760	TGC	2	6	160957	160962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2523	NC_015760	AAG	2	6	160994	160999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398001
2524	NC_015760	ACC	2	6	161172	161177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340398001
2525	NC_015760	CA	3	6	161202	161207	50 %	0 %	0 %	50 %	340398001
2526	NC_015760	TTA	2	6	161232	161237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398001
2527	NC_015760	TAC	2	6	161267	161272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398001
2528	NC_015760	CAAT	2	8	161277	161284	50 %	25 %	0 %	25 %	340398001
2529	NC_015760	TGG	2	6	161293	161298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398001
2530	NC_015760	TGT	2	6	161332	161337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398001
2531	NC_015760	TGG	2	6	161359	161364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398001
2532	NC_015760	GAA	2	6	161471	161476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398001
2533	NC_015760	CTT	2	6	161570	161575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398001
2534	NC_015760	TTC	2	6	161655	161660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398001
2535	NC_015760	TTA	2	6	161668	161673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398001
2536	NC_015760	TCT	2	6	161755	161760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398001
2537	NC_015760	GTG	2	6	161763	161768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398001
2538	NC_015760	ATG	2	6	161915	161920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
2539	NC_015760	ATA	2	6	161961	161966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398001
2540	NC_015760	AAG	2	6	162027	162032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398001
2541	NC_015760	GAT	2	6	162071	162076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
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2543	NC_015760	CAAG	2	8	162104	162111	50 %	0 %	25 %	25 %	340398001
2544	NC_015760	AACT	2	8	162162	162169	50 %	25 %	0 %	25 %	340398001
2545	NC_015760	ACA	2	6	162200	162205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
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2547	NC_015760	AAGC	2	8	162285	162292	50 %	0 %	25 %	25 %	340398001
2548	NC_015760	ACA	2	6	162317	162322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
2549	NC_015760	TGA	2	6	162382	162387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
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2551	NC_015760	CAG	2	6	162429	162434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2552	NC_015760	AAGA	2	8	162476	162483	75 %	0 %	25 %	0 %	340398001
2553	NC_015760	TCA	2	6	162581	162586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398001
2554	NC_015760	ATC	2	6	162610	162615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398001
2555	NC_015760	CAG	2	6	162642	162647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2556	NC_015760	ACG	2	6	162674	162679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
2557	NC_015760	AGT	2	6	162703	162708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398001
2558	NC_015760	CTT	2	6	162720	162725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398001
2559	NC_015760	AG	3	6	162736	162741	50 %	0 %	50 %	0 %	340398001
2560	NC_015760	ATC	2	6	162826	162831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398001
2561	NC_015760	TCAGAA	2	12	162920	162931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340398001
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2564	NC_015760	CTC	2	6	163089	163094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340398001
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2567	NC_015760	TTC	2	6	163213	163218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398001
2568	NC_015760	TATC	2	8	163245	163252	25 %	50 %	0 %	25 %	340398001
2569	NC_015760	CAA	3	9	163284	163292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398001
2570	NC_015760	TTG	2	6	163302	163307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398001
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2573	NC_015760	ATA	2	6	163386	163391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398001
2574	NC_015760	ACG	2	6	163433	163438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398001
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2578	NC_015760	ATAA	2	8	163605	163612	75 %	25 %	0 %	0 %	340398001
2579	NC_015760	A	6	6	163764	163769	100 %	0 %	0 %	0 %	340398002
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2583	NC_015760	CTA	2	6	163887	163892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398002
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2585	NC_015760	GTG	2	6	163928	163933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398002
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2591	NC_015760	GGT	2	6	164275	164280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398002
2592	NC_015760	GTG	2	6	164354	164359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398002
2593	NC_015760	GC	3	6	164370	164375	0 %	0 %	50 %	50 %	340398002
2594	NC_015760	GAA	2	6	164407	164412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398002
2595	NC_015760	AGGT	2	8	164447	164454	25 %	25 %	50 %	0 %	340398002
2596	NC_015760	TGA	2	6	164505	164510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398002
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2602	NC_015760	ATG	2	6	164885	164890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398002
2603	NC_015760	AAC	2	6	165199	165204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398003
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2605	NC_015760	AGC	2	6	165343	165348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398003
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2608	NC_015760	TGG	2	6	165415	165420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398003
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2610	NC_015760	GAA	2	6	165555	165560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398003
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2613	NC_015760	TCAT	2	8	165662	165669	25 %	50 %	0 %	25 %	340398003
2614	NC_015760	ATCA	2	8	165670	165677	50 %	25 %	0 %	25 %	340398003
2615	NC_015760	TGGC	2	8	165680	165687	0 %	25 %	50 %	25 %	340398003
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2619	NC_015760	TCT	2	6	165990	165995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398004
2620	NC_015760	TAGC	2	8	166038	166045	25 %	25 %	25 %	25 %	340398004
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2743	NC_015760	T	6	6	172750	172755	0 %	100 %	0 %	0 %	340398009
2744	NC_015760	T	6	6	172764	172769	0 %	100 %	0 %	0 %	340398009
2745	NC_015760	TG	3	6	172818	172823	0 %	50 %	50 %	0 %	340398010
2746	NC_015760	TGC	2	6	172898	172903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398010
2747	NC_015760	TTGATA	2	12	173007	173018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340398010
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2764	NC_015760	GAT	2	6	173783	173788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398010
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2767	NC_015760	TTG	2	6	173888	173893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398010
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2823	NC_015760	TTGG	2	8	177319	177326	0 %	50 %	50 %	0 %	340398014
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2858	NC_015760	CAAGT	2	10	179557	179566	40 %	20 %	20 %	20 %	340398016
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2983	NC_015760	CAC	2	6	186986	186991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340398024
2984	NC_015760	GTCT	2	8	187012	187019	0 %	50 %	25 %	25 %	340398024
2985	NC_015760	TGA	2	6	187020	187025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398024
2986	NC_015760	GTT	2	6	187104	187109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398024
2987	NC_015760	GAG	2	6	187133	187138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340398024
2988	NC_015760	ATT	2	6	187157	187162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398025
2989	NC_015760	TTC	2	6	187243	187248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398025
2990	NC_015760	GTC	2	6	187249	187254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398025
2991	NC_015760	TGA	2	6	187261	187266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398025
2992	NC_015760	TTGTGG	2	12	187345	187356	0 %	50 %	50 %	0 %	340398025
2993	NC_015760	AGT	2	6	187482	187487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398025
2994	NC_015760	ATC	2	6	187518	187523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398025
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2996	NC_015760	CTC	2	6	187671	187676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340398025
2997	NC_015760	CAT	2	6	187745	187750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398025
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2999	NC_015760	TATTGG	2	12	187814	187825	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	340398025
3000	NC_015760	TTGG	2	8	187827	187834	0 %	50 %	50 %	0 %	340398025

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