MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	GAAA	2	8	65	72	75 %	0 %	25 %	0 %	339498646
2	NC_015732	CATT	2	8	128	135	25 %	50 %	0 %	25 %	339498646
3	NC_015732	TACA	2	8	594	601	50 %	25 %	0 %	25 %	339498646
4	NC_015732	AAAT	2	8	698	705	75 %	25 %	0 %	0 %	339498646
5	NC_015732	TCTG	2	8	860	867	0 %	50 %	25 %	25 %	339498646
6	NC_015732	GTAA	2	8	1002	1009	50 %	25 %	25 %	0 %	339498646
7	NC_015732	TCTT	2	8	1196	1203	0 %	75 %	0 %	25 %	339498646
8	NC_015732	ATGC	3	12	1344	1355	25 %	25 %	25 %	25 %	339498646
9	NC_015732	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	339498647
10	NC_015732	GTTT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	25 %	0 %	339498648
11	NC_015732	TCTA	2	8	3183	3190	25 %	50 %	0 %	25 %	339498648
12	NC_015732	TTCT	2	8	3840	3847	0 %	75 %	0 %	25 %	339498649
13	NC_015732	TAAG	2	8	3867	3874	50 %	25 %	25 %	0 %	339498649
14	NC_015732	TAAT	2	8	4071	4078	50 %	50 %	0 %	0 %	339498649
15	NC_015732	CATA	2	8	4289	4296	50 %	25 %	0 %	25 %	339498649
16	NC_015732	TTGT	2	8	4862	4869	0 %	75 %	25 %	0 %	339498651
17	NC_015732	TGGA	2	8	6563	6570	25 %	25 %	50 %	0 %	339498652
18	NC_015732	TTTA	2	8	6660	6667	25 %	75 %	0 %	0 %	339498652
19	NC_015732	CGAT	2	8	7000	7007	25 %	25 %	25 %	25 %	339498653
20	NC_015732	GATT	2	8	7298	7305	25 %	50 %	25 %	0 %	339498653
21	NC_015732	TAAT	2	8	7888	7895	50 %	50 %	0 %	0 %	339498654
22	NC_015732	GGAA	2	8	8486	8493	50 %	0 %	50 %	0 %	339498654
23	NC_015732	CCGG	2	8	9128	9135	0 %	0 %	50 %	50 %	339498655
24	NC_015732	GATT	2	8	9433	9440	25 %	50 %	25 %	0 %	339498655
25	NC_015732	TAGA	2	8	9886	9893	50 %	25 %	25 %	0 %	339498656
26	NC_015732	TACC	2	8	10314	10321	25 %	25 %	0 %	50 %	339498657
27	NC_015732	CAGG	2	8	10564	10571	25 %	0 %	50 %	25 %	339498657
28	NC_015732	GTAT	2	8	10917	10924	25 %	50 %	25 %	0 %	339498657
29	NC_015732	GAAA	2	8	10928	10935	75 %	0 %	25 %	0 %	339498657
30	NC_015732	CAGA	2	8	11724	11731	50 %	0 %	25 %	25 %	339498659
31	NC_015732	GGAG	2	8	12214	12221	25 %	0 %	75 %	0 %	339498659
32	NC_015732	ACAG	2	8	12661	12668	50 %	0 %	25 %	25 %	339498660
33	NC_015732	TAGA	2	8	13032	13039	50 %	25 %	25 %	0 %	339498660
34	NC_015732	TTTC	2	8	14431	14438	0 %	75 %	0 %	25 %	339498661
35	NC_015732	CGGG	2	8	14969	14976	0 %	0 %	75 %	25 %	339498662
36	NC_015732	ATTG	2	8	15631	15638	25 %	50 %	25 %	0 %	339498662
37	NC_015732	GTAG	2	8	16002	16009	25 %	25 %	50 %	0 %	339498662
38	NC_015732	ATCC	2	8	16587	16594	25 %	25 %	0 %	50 %	339498662
39	NC_015732	CAAT	2	8	17474	17481	50 %	25 %	0 %	25 %	339498663
40	NC_015732	AGAT	2	8	17584	17591	50 %	25 %	25 %	0 %	339498663
41	NC_015732	AATC	2	8	18124	18131	50 %	25 %	0 %	25 %	339498663
42	NC_015732	TCTT	2	8	18302	18309	0 %	75 %	0 %	25 %	339498664
43	NC_015732	AAGG	2	8	19002	19009	50 %	0 %	50 %	0 %	339498664
44	NC_015732	GTCC	2	8	19076	19083	0 %	25 %	25 %	50 %	339498665
45	NC_015732	ATGT	2	8	19823	19830	25 %	50 %	25 %	0 %	339498665
46	NC_015732	TTTA	2	8	20252	20259	25 %	75 %	0 %	0 %	339498665
47	NC_015732	TGTT	2	8	21675	21682	0 %	75 %	25 %	0 %	339498667
48	NC_015732	CTTT	2	8	21886	21893	0 %	75 %	0 %	25 %	339498668
49	NC_015732	CTTT	2	8	22199	22206	0 %	75 %	0 %	25 %	339498669
50	NC_015732	TGAA	2	8	22229	22236	50 %	25 %	25 %	0 %	339498669
51	NC_015732	AACA	2	8	25430	25437	75 %	0 %	0 %	25 %	339498671
52	NC_015732	GAAG	2	8	26631	26638	50 %	0 %	50 %	0 %	339498672
53	NC_015732	GCAG	2	8	26813	26820	25 %	0 %	50 %	25 %	339498672
54	NC_015732	TTTA	2	8	26858	26865	25 %	75 %	0 %	0 %	339498672
55	NC_015732	ACTG	2	8	27840	27847	25 %	25 %	25 %	25 %	339498672
56	NC_015732	TGGC	2	8	30024	30031	0 %	25 %	50 %	25 %	339498673
57	NC_015732	GACG	2	8	30035	30042	25 %	0 %	50 %	25 %	339498673
58	NC_015732	CTGC	2	8	31012	31019	0 %	25 %	25 %	50 %	339498675
59	NC_015732	TTAT	2	8	32124	32131	25 %	75 %	0 %	0 %	339498676
60	NC_015732	ATGA	2	8	32219	32226	50 %	25 %	25 %	0 %	339498676
61	NC_015732	AAGA	2	8	33239	33246	75 %	0 %	25 %	0 %	339498677
62	NC_015732	TATC	2	8	33400	33407	25 %	50 %	0 %	25 %	339498677
63	NC_015732	ATTG	2	8	33917	33924	25 %	50 %	25 %	0 %	339498677
64	NC_015732	ATGG	2	8	34086	34093	25 %	25 %	50 %	0 %	339498678
65	NC_015732	AGAT	2	8	34603	34610	50 %	25 %	25 %	0 %	339498678
66	NC_015732	ATAA	2	8	34692	34699	75 %	25 %	0 %	0 %	339498678
67	NC_015732	ATTT	2	8	34927	34934	25 %	75 %	0 %	0 %	339498678
68	NC_015732	TTAC	2	8	35434	35441	25 %	50 %	0 %	25 %	339498679
69	NC_015732	GGAT	2	8	36372	36379	25 %	25 %	50 %	0 %	339498679
70	NC_015732	CAAA	2	8	36798	36805	75 %	0 %	0 %	25 %	339498680
71	NC_015732	CACC	2	8	37082	37089	25 %	0 %	0 %	75 %	339498680
72	NC_015732	TGAG	2	8	37761	37768	25 %	25 %	50 %	0 %	339498681
73	NC_015732	ATTC	2	8	37856	37863	25 %	50 %	0 %	25 %	339498681
74	NC_015732	GAAA	2	8	37963	37970	75 %	0 %	25 %	0 %	339498681
75	NC_015732	AGGT	2	8	38148	38155	25 %	25 %	50 %	0 %	339498681
76	NC_015732	AACC	2	8	38265	38272	50 %	0 %	0 %	50 %	339498681
77	NC_015732	TAAA	2	8	38868	38875	75 %	25 %	0 %	0 %	339498681
78	NC_015732	AATG	2	8	39199	39206	50 %	25 %	25 %	0 %	339498681
79	NC_015732	AATA	2	8	40362	40369	75 %	25 %	0 %	0 %	339498682
80	NC_015732	GAAC	2	8	40693	40700	50 %	0 %	25 %	25 %	339498683
81	NC_015732	ACCA	2	8	40907	40914	50 %	0 %	0 %	50 %	339498683
82	NC_015732	AATC	2	8	41242	41249	50 %	25 %	0 %	25 %	339498683
83	NC_015732	GGCG	2	8	41293	41300	0 %	0 %	75 %	25 %	339498683
84	NC_015732	AGGT	2	8	42062	42069	25 %	25 %	50 %	0 %	339498684
85	NC_015732	AAAG	2	8	42751	42758	75 %	0 %	25 %	0 %	339498685
86	NC_015732	ATCT	2	8	43584	43591	25 %	50 %	0 %	25 %	339498686
87	NC_015732	TACA	2	8	44157	44164	50 %	25 %	0 %	25 %	339498687
88	NC_015732	AATC	2	8	44428	44435	50 %	25 %	0 %	25 %	339498687
89	NC_015732	CATT	2	8	45212	45219	25 %	50 %	0 %	25 %	339498688
90	NC_015732	AGGA	2	8	45249	45256	50 %	0 %	50 %	0 %	339498688
91	NC_015732	CGGC	2	8	45340	45347	0 %	0 %	50 %	50 %	339498688
92	NC_015732	TAAT	2	8	45712	45719	50 %	50 %	0 %	0 %	339498689
93	NC_015732	CAGA	2	8	45822	45829	50 %	0 %	25 %	25 %	339498689
94	NC_015732	CCTG	2	8	46363	46370	0 %	25 %	25 %	50 %	339498690
95	NC_015732	CAGC	2	8	47416	47423	25 %	0 %	25 %	50 %	339498690
96	NC_015732	GCCA	2	8	47807	47814	25 %	0 %	25 %	50 %	339498690
97	NC_015732	ACAT	2	8	48520	48527	50 %	25 %	0 %	25 %	339498691
98	NC_015732	AATA	2	8	49612	49619	75 %	25 %	0 %	0 %	339498692
99	NC_015732	TTCT	2	8	50532	50539	0 %	75 %	0 %	25 %	339498692
100	NC_015732	CATA	2	8	50890	50897	50 %	25 %	0 %	25 %	339498692
101	NC_015732	TAAA	2	8	51922	51929	75 %	25 %	0 %	0 %	339498693
102	NC_015732	TGGT	2	8	52195	52202	0 %	50 %	50 %	0 %	339498693
103	NC_015732	CAAC	2	8	52667	52674	50 %	0 %	0 %	50 %	339498693
104	NC_015732	AATG	2	8	53126	53133	50 %	25 %	25 %	0 %	339498694
105	NC_015732	AGTT	2	8	53908	53915	25 %	50 %	25 %	0 %	339498694
106	NC_015732	TCGA	2	8	54917	54924	25 %	25 %	25 %	25 %	339498695
107	NC_015732	GATT	2	8	55138	55145	25 %	50 %	25 %	0 %	339498695
108	NC_015732	CAAA	2	8	55312	55319	75 %	0 %	0 %	25 %	339498695
109	NC_015732	ATCC	2	8	56034	56041	25 %	25 %	0 %	50 %	339498696
110	NC_015732	TTAT	2	8	56183	56190	25 %	75 %	0 %	0 %	339498696
111	NC_015732	TGAA	2	8	56905	56912	50 %	25 %	25 %	0 %	339498698
112	NC_015732	AAAT	2	8	57669	57676	75 %	25 %	0 %	0 %	339498698
113	NC_015732	TATT	2	8	57927	57934	25 %	75 %	0 %	0 %	339498698
114	NC_015732	GATA	2	8	58296	58303	50 %	25 %	25 %	0 %	339498698
115	NC_015732	TGGA	2	8	58380	58387	25 %	25 %	50 %	0 %	339498698
116	NC_015732	TTGG	2	8	58762	58769	0 %	50 %	50 %	0 %	339498699
117	NC_015732	CTTC	2	8	59083	59090	0 %	50 %	0 %	50 %	339498699
118	NC_015732	TCCT	2	8	60415	60422	0 %	50 %	0 %	50 %	339498700
119	NC_015732	TATT	2	8	60665	60672	25 %	75 %	0 %	0 %	339498700
120	NC_015732	GGGA	2	8	60731	60738	25 %	0 %	75 %	0 %	339498700
121	NC_015732	GGAT	2	8	60839	60846	25 %	25 %	50 %	0 %	339498700
122	NC_015732	AGGA	2	8	61090	61097	50 %	0 %	50 %	0 %	339498700
123	NC_015732	GACC	2	8	61708	61715	25 %	0 %	25 %	50 %	339498701
124	NC_015732	GCCT	2	8	61801	61808	0 %	25 %	25 %	50 %	339498701
125	NC_015732	GATC	2	8	61963	61970	25 %	25 %	25 %	25 %	339498701
126	NC_015732	AAGG	2	8	63155	63162	50 %	0 %	50 %	0 %	339498702
127	NC_015732	ATTA	2	8	63238	63245	50 %	50 %	0 %	0 %	339498702
128	NC_015732	GCTG	2	8	63944	63951	0 %	25 %	50 %	25 %	339498703
129	NC_015732	TTGC	2	8	64104	64111	0 %	50 %	25 %	25 %	339498703
130	NC_015732	TGCT	2	8	65300	65307	0 %	50 %	25 %	25 %	339498704
131	NC_015732	CCTT	2	8	65450	65457	0 %	50 %	0 %	50 %	339498704
132	NC_015732	CTTC	2	8	65729	65736	0 %	50 %	0 %	50 %	339498704
133	NC_015732	AAAT	2	8	65959	65966	75 %	25 %	0 %	0 %	339498704
134	NC_015732	TTCT	2	8	66163	66170	0 %	75 %	0 %	25 %	339498705
135	NC_015732	AGAA	2	8	68366	68373	75 %	0 %	25 %	0 %	339498707
136	NC_015732	GATT	2	8	69273	69280	25 %	50 %	25 %	0 %	339498707
137	NC_015732	GCTG	2	8	69364	69371	0 %	25 %	50 %	25 %	339498707
138	NC_015732	TGGC	2	8	70172	70179	0 %	25 %	50 %	25 %	339498708
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