MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 37418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	CAG	2	6	87	92	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
2	NC_015732	GAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
3	NC_015732	AGA	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
4	NC_015732	ATT	3	9	159	167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498646
5	NC_015732	GAA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
6	NC_015732	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
7	NC_015732	ACA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
8	NC_015732	ACA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
9	NC_015732	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498646
10	NC_015732	ATA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
11	NC_015732	CTG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498646
12	NC_015732	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
13	NC_015732	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498646
14	NC_015732	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
15	NC_015732	CCA	2	6	915	920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498646
16	NC_015732	AGC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
17	NC_015732	CAA	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
18	NC_015732	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
19	NC_015732	CGG	2	6	1319	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498646
20	NC_015732	GAA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
21	NC_015732	AGA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
22	NC_015732	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
23	NC_015732	TGA	3	9	2090	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
24	NC_015732	GAC	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498647
25	NC_015732	TTA	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
26	NC_015732	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
27	NC_015732	TTA	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
28	NC_015732	ATC	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498647
29	NC_015732	CCG	2	6	2381	2386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498647
30	NC_015732	GTA	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
31	NC_015732	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
32	NC_015732	GAA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
33	NC_015732	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
34	NC_015732	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498648
35	NC_015732	ATC	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
36	NC_015732	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
37	NC_015732	CCT	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498648
38	NC_015732	TAT	2	6	3092	3097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498648
39	NC_015732	ACG	3	9	3140	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
40	NC_015732	AAG	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
41	NC_015732	TCA	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
42	NC_015732	CGA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
43	NC_015732	GAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
44	NC_015732	GAA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
45	NC_015732	GAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
46	NC_015732	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498649
47	NC_015732	TCG	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498649
48	NC_015732	GTT	2	6	4184	4189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498649
49	NC_015732	GGC	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498650
50	NC_015732	CGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498650
51	NC_015732	CGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498650
52	NC_015732	TTC	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498651
53	NC_015732	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
54	NC_015732	TGT	2	6	5159	5164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
55	NC_015732	CCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498652
56	NC_015732	AAC	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
57	NC_015732	CAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
58	NC_015732	ATC	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
59	NC_015732	GAA	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
60	NC_015732	GTT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
61	NC_015732	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
62	NC_015732	CAG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
63	NC_015732	TCA	2	6	5902	5907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
64	NC_015732	CTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
65	NC_015732	TTC	2	6	6079	6084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
66	NC_015732	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
67	NC_015732	CTG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498652
68	NC_015732	ATT	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
69	NC_015732	AAT	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
70	NC_015732	CAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
71	NC_015732	CAA	2	6	6406	6411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
72	NC_015732	TAA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
73	NC_015732	CAG	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
74	NC_015732	AAT	2	6	6720	6725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
75	NC_015732	TTC	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
76	NC_015732	ATG	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498652
77	NC_015732	CAG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
78	NC_015732	ATT	2	6	6849	6854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
79	NC_015732	AGA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
80	NC_015732	TAT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498653
81	NC_015732	GAA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
82	NC_015732	TTC	2	6	7313	7318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498653
83	NC_015732	GAA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498653
84	NC_015732	TTC	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498653
85	NC_015732	ACA	2	6	7554	7559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498653
86	NC_015732	CAA	2	6	7840	7845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498654
87	NC_015732	TAT	2	6	7882	7887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
88	NC_015732	ATT	2	6	7902	7907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
89	NC_015732	TAT	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
90	NC_015732	CAT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498654
91	NC_015732	ATT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498654
92	NC_015732	TGG	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498654
93	NC_015732	AAC	2	6	8351	8356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498654
94	NC_015732	GTT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498655
95	NC_015732	TCA	2	6	8931	8936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498655
96	NC_015732	TCT	2	6	9228	9233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498655
97	NC_015732	ATG	2	6	9285	9290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498655
98	NC_015732	TGG	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498655
99	NC_015732	CAT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498655
100	NC_015732	TAA	2	6	9535	9540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498655
101	NC_015732	GAT	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498656
102	NC_015732	GTG	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498656
103	NC_015732	GTG	2	6	10081	10086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498656
104	NC_015732	ATG	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498656
105	NC_015732	AAT	2	6	10125	10130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498656
106	NC_015732	AGT	2	6	10146	10151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498656
107	NC_015732	ATC	2	6	10394	10399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498657
108	NC_015732	TGT	2	6	10647	10652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498657
109	NC_015732	GAA	2	6	10720	10725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498657
110	NC_015732	GAA	2	6	10837	10842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498657
111	NC_015732	AGA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498657
112	NC_015732	TTA	2	6	10867	10872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498657
113	NC_015732	AAG	2	6	11075	11080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498658
114	NC_015732	ATC	2	6	11155	11160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498658
115	NC_015732	ATT	2	6	11324	11329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498659
116	NC_015732	TAT	2	6	11406	11411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498659
117	NC_015732	TGA	2	6	11479	11484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498659
118	NC_015732	TCC	2	6	11488	11493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498659
119	NC_015732	ATT	2	6	11558	11563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498659
120	NC_015732	GTC	2	6	11595	11600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498659
121	NC_015732	AGG	2	6	11616	11621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498659
122	NC_015732	GGT	2	6	11767	11772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498659
123	NC_015732	GTG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498659
124	NC_015732	CTT	2	6	11828	11833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498659
125	NC_015732	TTC	2	6	12007	12012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498659
126	NC_015732	CTG	2	6	12042	12047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498659
127	NC_015732	ATG	2	6	12396	12401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498659
128	NC_015732	TTG	2	6	12573	12578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498660
129	NC_015732	TGA	2	6	12613	12618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498660
130	NC_015732	TGA	2	6	12621	12626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498660
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134	NC_015732	TTG	2	6	13068	13073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498660
135	NC_015732	GAA	2	6	13079	13084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498660
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