MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015732	TCA	2	6	229845	229850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498842
4002	NC_015732	ACC	2	6	229881	229886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498843
4003	NC_015732	GGA	2	6	229967	229972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498843
4004	NC_015732	GCT	2	6	230099	230104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498843
4005	NC_015732	T	6	6	230129	230134	0 %	100 %	0 %	0 %	339498843
4006	NC_015732	AGG	2	6	230235	230240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498844
4007	NC_015732	T	6	6	230362	230367	0 %	100 %	0 %	0 %	339498844
4008	NC_015732	AAT	2	6	230400	230405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498844
4009	NC_015732	GCT	2	6	230433	230438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498844
4010	NC_015732	T	6	6	230471	230476	0 %	100 %	0 %	0 %	339498844
4011	NC_015732	T	6	6	230505	230510	0 %	100 %	0 %	0 %	339498844
4012	NC_015732	TGA	2	6	230519	230524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4013	NC_015732	GAT	2	6	230584	230589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4014	NC_015732	TGA	2	6	230590	230595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4015	NC_015732	TGT	2	6	230703	230708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498844
4016	NC_015732	T	6	6	230732	230737	0 %	100 %	0 %	0 %	339498844
4017	NC_015732	GCA	2	6	230782	230787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498844
4018	NC_015732	GTGA	2	8	230809	230816	25 %	25 %	50 %	0 %	339498844
4019	NC_015732	GGT	2	6	230818	230823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498844
4020	NC_015732	ATG	2	6	230862	230867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4021	NC_015732	CCT	2	6	230879	230884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498844
4022	NC_015732	TAG	2	6	230936	230941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4023	NC_015732	CTT	2	6	230975	230980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498844
4024	NC_015732	CGG	2	6	231004	231009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498844
4025	NC_015732	GAG	2	6	231050	231055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498844
4026	NC_015732	CTG	2	6	231114	231119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498844
4027	NC_015732	CTA	2	6	231134	231139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498844
4028	NC_015732	TGA	2	6	231144	231149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4029	NC_015732	GAG	2	6	231171	231176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498844
4030	NC_015732	CAA	2	6	231353	231358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498844
4031	NC_015732	TCC	2	6	231487	231492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498844
4032	NC_015732	GGCA	2	8	231512	231519	25 %	0 %	50 %	25 %	339498844
4033	NC_015732	CTG	2	6	231570	231575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498844
4034	NC_015732	GGC	2	6	231646	231651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498844
4035	NC_015732	AGG	2	6	231667	231672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498844
4036	NC_015732	GAT	2	6	231711	231716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4037	NC_015732	AT	3	6	231715	231720	50 %	50 %	0 %	0 %	339498844
4038	NC_015732	AGG	2	6	231741	231746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498844
4039	NC_015732	TTGC	2	8	231793	231800	0 %	50 %	25 %	25 %	339498844
4040	NC_015732	CA	3	6	231846	231851	50 %	0 %	0 %	50 %	339498844
4041	NC_015732	GCCA	2	8	232026	232033	25 %	0 %	25 %	50 %	339498844
4042	NC_015732	TCT	2	6	232056	232061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498844
4043	NC_015732	TAG	2	6	232085	232090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
4044	NC_015732	GA	4	8	232377	232384	50 %	0 %	50 %	0 %	339498845
4045	NC_015732	CGG	2	6	232447	232452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498845
4046	NC_015732	GCC	2	6	232459	232464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498845
4047	NC_015732	TCC	2	6	232468	232473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498845
4048	NC_015732	CAT	2	6	233170	233175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498846
4049	NC_015732	TAG	2	6	233196	233201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498846
4050	NC_015732	TGA	2	6	233212	233217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498846
4051	NC_015732	ACA	2	6	233257	233262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498846
4052	NC_015732	TC	4	8	233305	233312	0 %	50 %	0 %	50 %	339498846
4053	NC_015732	CA	3	6	233437	233442	50 %	0 %	0 %	50 %	339498846
4054	NC_015732	AT	3	6	233467	233472	50 %	50 %	0 %	0 %	339498846
4055	NC_015732	TA	3	6	233534	233539	50 %	50 %	0 %	0 %	339498846
4056	NC_015732	AT	3	6	233591	233596	50 %	50 %	0 %	0 %	339498846
4057	NC_015732	ATGAG	2	10	233631	233640	40 %	20 %	40 %	0 %	339498846
4058	NC_015732	TGGT	2	8	233709	233716	0 %	50 %	50 %	0 %	339498846
4059	NC_015732	TA	3	6	233769	233774	50 %	50 %	0 %	0 %	339498846
4060	NC_015732	TGTA	2	8	233990	233997	25 %	50 %	25 %	0 %	339498847
4061	NC_015732	GTT	2	6	234068	234073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498847
4062	NC_015732	GA	3	6	234133	234138	50 %	0 %	50 %	0 %	339498847
4063	NC_015732	GAT	2	6	234194	234199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498847
4064	NC_015732	CTT	3	9	234306	234314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498847
4065	NC_015732	TGA	2	6	234352	234357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498847
4066	NC_015732	GTA	2	6	234365	234370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498847
4067	NC_015732	TCG	2	6	234394	234399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498847
4068	NC_015732	GAT	2	6	234410	234415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498847
4069	NC_015732	ACA	2	6	234429	234434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498847
4070	NC_015732	GAA	2	6	234458	234463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498847
4071	NC_015732	TGC	2	6	234511	234516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498847
4072	NC_015732	TCA	2	6	234523	234528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498847
4073	NC_015732	ACT	2	6	234599	234604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498847
4074	NC_015732	CAT	2	6	234615	234620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498847
4075	NC_015732	TTC	2	6	234649	234654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498847
4076	NC_015732	CTT	2	6	234897	234902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498847
4077	NC_015732	ATA	2	6	234969	234974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498847
4078	NC_015732	A	6	6	234974	234979	100 %	0 %	0 %	0 %	339498847
4079	NC_015732	TCA	2	6	234993	234998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498847
4080	NC_015732	GGA	2	6	235024	235029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498847
4081	NC_015732	TGC	2	6	235162	235167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498847
4082	NC_015732	ATG	2	6	235212	235217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498847
4083	NC_015732	TAT	2	6	235289	235294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498847
4084	NC_015732	TAT	2	6	235321	235326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498847
4085	NC_015732	AAT	2	6	235334	235339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498847
4086	NC_015732	ACT	2	6	235463	235468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498847
4087	NC_015732	GTAC	2	8	235511	235518	25 %	25 %	25 %	25 %	339498847
4088	NC_015732	TAT	2	6	235649	235654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498847
4089	NC_015732	TAA	2	6	235657	235662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498847
4090	NC_015732	A	7	7	235661	235667	100 %	0 %	0 %	0 %	339498847
4091	NC_015732	A	7	7	235879	235885	100 %	0 %	0 %	0 %	339498847
4092	NC_015732	ATA	2	6	235978	235983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498848
4093	NC_015732	TTTG	2	8	236014	236021	0 %	75 %	25 %	0 %	339498848
4094	NC_015732	TGC	2	6	236213	236218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498848
4095	NC_015732	GGT	2	6	236228	236233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498848
4096	NC_015732	TGA	2	6	236245	236250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498848
4097	NC_015732	TGC	2	6	236267	236272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498848
4098	NC_015732	TAAA	2	8	236433	236440	75 %	25 %	0 %	0 %	339498848
4099	NC_015732	A	6	6	236438	236443	100 %	0 %	0 %	0 %	339498848
4100	NC_015732	GCTTT	2	10	236463	236472	0 %	60 %	20 %	20 %	339498848
4101	NC_015732	CCA	2	6	236508	236513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498848
4102	NC_015732	GCT	2	6	236535	236540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498848
4103	NC_015732	AGAA	2	8	236574	236581	75 %	0 %	25 %	0 %	339498848
4104	NC_015732	GCC	2	6	236626	236631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498848
4105	NC_015732	ATT	2	6	236747	236752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498848
4106	NC_015732	GCC	2	6	236768	236773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498848
4107	NC_015732	GCTCCT	2	12	236775	236786	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339498848
4108	NC_015732	A	6	6	236789	236794	100 %	0 %	0 %	0 %	339498848
4109	NC_015732	CAA	2	6	236803	236808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498848
4110	NC_015732	CAGG	2	8	236817	236824	25 %	0 %	50 %	25 %	339498848
4111	NC_015732	CCCCA	2	10	236885	236894	20 %	0 %	0 %	80 %	339498848
4112	NC_015732	TGA	2	6	236953	236958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498848
4113	NC_015732	GAG	2	6	237023	237028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498848
4114	NC_015732	GAT	2	6	237084	237089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498848
4115	NC_015732	CT	3	6	237403	237408	0 %	50 %	0 %	50 %	339498849
4116	NC_015732	ACA	2	6	237598	237603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498849
4117	NC_015732	TTTC	2	8	237617	237624	0 %	75 %	0 %	25 %	339498849
4118	NC_015732	G	7	7	237644	237650	0 %	0 %	100 %	0 %	339498849
4119	NC_015732	TCA	2	6	237743	237748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498849
4120	NC_015732	TAG	2	6	237751	237756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498849
4121	NC_015732	ATG	2	6	237772	237777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498849
4122	NC_015732	T	6	6	237819	237824	0 %	100 %	0 %	0 %	339498849
4123	NC_015732	GTT	2	6	237827	237832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498849
4124	NC_015732	TA	3	6	237875	237880	50 %	50 %	0 %	0 %	339498849
4125	NC_015732	AAT	2	6	237973	237978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498849
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4127	NC_015732	GTT	2	6	238127	238132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498849
4128	NC_015732	TGT	2	6	238213	238218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498849
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4135	NC_015732	GTC	2	6	238482	238487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498849
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4141	NC_015732	TCA	2	6	238920	238925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498850
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4144	NC_015732	AT	3	6	239044	239049	50 %	50 %	0 %	0 %	339498850
4145	NC_015732	ATT	2	6	239073	239078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498850
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4230	NC_015732	TC	3	6	243662	243667	0 %	50 %	0 %	50 %	339498855
4231	NC_015732	GGT	2	6	243700	243705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498855
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4242	NC_015732	GTG	2	6	244217	244222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498855
4243	NC_015732	GCG	2	6	244319	244324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498855
4244	NC_015732	CAC	2	6	244327	244332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498855
4245	NC_015732	AAT	2	6	244353	244358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498855
4246	NC_015732	GGC	2	6	244411	244416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498855
4247	NC_015732	ACC	2	6	244424	244429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498855
4248	NC_015732	GCG	2	6	244452	244457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498855
4249	NC_015732	CGC	2	6	244470	244475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498855
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4254	NC_015732	CCACAA	2	12	244629	244640	50 %	0 %	0 %	50 %	339498855
4255	NC_015732	AATAT	2	10	244693	244702	60 %	40 %	0 %	0 %	339498855
4256	NC_015732	TGA	2	6	244734	244739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498855
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4259	NC_015732	GGC	2	6	244925	244930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498856
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4265	NC_015732	TTG	2	6	245291	245296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498857
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4269	NC_015732	TTG	2	6	245453	245458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498857
4270	NC_015732	AGGA	2	8	245763	245770	50 %	0 %	50 %	0 %	339498858
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4273	NC_015732	GGT	2	6	246055	246060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498859
4274	NC_015732	GT	3	6	246098	246103	0 %	50 %	50 %	0 %	339498859
4275	NC_015732	AAG	2	6	246116	246121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498859
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4283	NC_015732	CGGAT	2	10	246411	246420	20 %	20 %	40 %	20 %	339498859
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4350	NC_015732	GGCAG	2	10	249901	249910	20 %	0 %	60 %	20 %	339498862
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4356	NC_015732	GAA	2	6	250271	250276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498862
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4358	NC_015732	CGG	2	6	250378	250383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498862
4359	NC_015732	CCT	2	6	250510	250515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498862
4360	NC_015732	CAAG	2	8	250611	250618	50 %	0 %	25 %	25 %	339498862
4361	NC_015732	GCA	2	6	250827	250832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498863
4362	NC_015732	TGCCGC	2	12	250847	250858	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339498863
4363	NC_015732	GGC	2	6	250890	250895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498863
4364	NC_015732	TGG	3	9	250904	250912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498863
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4366	NC_015732	TCCA	2	8	250992	250999	25 %	25 %	0 %	50 %	339498863
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4488	NC_015732	AG	3	6	258309	258314	50 %	0 %	50 %	0 %	339498868
4489	NC_015732	GTA	2	6	258381	258386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498868
4490	NC_015732	TGTA	2	8	258391	258398	25 %	50 %	25 %	0 %	339498868
4491	NC_015732	CTTTT	2	10	258456	258465	0 %	80 %	0 %	20 %	339498868
4492	NC_015732	GCT	2	6	258508	258513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498868
4493	NC_015732	TTG	2	6	258518	258523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498868
4494	NC_015732	T	8	8	258557	258564	0 %	100 %	0 %	0 %	339498868
4495	NC_015732	GTT	2	6	258597	258602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498868
4496	NC_015732	TGT	2	6	258658	258663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498868
4497	NC_015732	CTT	2	6	258845	258850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498868
4498	NC_015732	TCC	2	6	258856	258861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498868
4499	NC_015732	TTC	2	6	258870	258875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498868
4500	NC_015732	CAT	2	6	258893	258898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498868

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