MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015732	AGG	2	6	172743	172748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498790
3002	NC_015732	GAA	2	6	172756	172761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498790
3003	NC_015732	CGG	2	6	172782	172787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498790
3004	NC_015732	TAA	2	6	172800	172805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498790
3005	NC_015732	GCTG	2	8	172873	172880	0 %	25 %	50 %	25 %	339498790
3006	NC_015732	TCT	2	6	172932	172937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498790
3007	NC_015732	GCC	2	6	173029	173034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498790
3008	NC_015732	TTG	2	6	173162	173167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498790
3009	NC_015732	CCA	2	6	173179	173184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498790
3010	NC_015732	CCG	2	6	173270	173275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498790
3011	NC_015732	CAT	2	6	173283	173288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498790
3012	NC_015732	GGT	2	6	173416	173421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498790
3013	NC_015732	TGA	2	6	173517	173522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498790
3014	NC_015732	TGC	2	6	173554	173559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498790
3015	NC_015732	ATT	2	6	173774	173779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498791
3016	NC_015732	AATA	2	8	173808	173815	75 %	25 %	0 %	0 %	339498791
3017	NC_015732	TCCCGT	2	12	173909	173920	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339498791
3018	NC_015732	T	6	6	173948	173953	0 %	100 %	0 %	0 %	339498791
3019	NC_015732	G	6	6	174018	174023	0 %	0 %	100 %	0 %	339498791
3020	NC_015732	GCA	2	6	174059	174064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498791
3021	NC_015732	CTT	2	6	174111	174116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498791
3022	NC_015732	CTCATC	2	12	174136	174147	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	339498791
3023	NC_015732	ACT	2	6	174326	174331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498791
3024	NC_015732	AAGG	2	8	174355	174362	50 %	0 %	50 %	0 %	339498791
3025	NC_015732	CAAA	2	8	174378	174385	75 %	0 %	0 %	25 %	339498791
3026	NC_015732	T	6	6	174414	174419	0 %	100 %	0 %	0 %	339498791
3027	NC_015732	TACC	2	8	174423	174430	25 %	25 %	0 %	50 %	339498791
3028	NC_015732	CCT	2	6	174465	174470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498792
3029	NC_015732	TCC	2	6	174497	174502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498792
3030	NC_015732	TTC	2	6	174518	174523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498792
3031	NC_015732	CAT	2	6	174571	174576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498792
3032	NC_015732	GGT	2	6	174595	174600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498792
3033	NC_015732	CAA	2	6	174604	174609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498792
3034	NC_015732	CA	3	6	174624	174629	50 %	0 %	0 %	50 %	339498792
3035	NC_015732	G	6	6	174716	174721	0 %	0 %	100 %	0 %	339498792
3036	NC_015732	GGTG	2	8	174811	174818	0 %	25 %	75 %	0 %	339498792
3037	NC_015732	CCTT	2	8	174864	174871	0 %	50 %	0 %	50 %	339498792
3038	NC_015732	GTG	2	6	174888	174893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498792
3039	NC_015732	GCC	2	6	174909	174914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498792
3040	NC_015732	GCC	2	6	174923	174928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498792
3041	NC_015732	GAT	2	6	174956	174961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498792
3042	NC_015732	GTTCC	2	10	175010	175019	0 %	40 %	20 %	40 %	339498792
3043	NC_015732	CTT	2	6	175030	175035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498792
3044	NC_015732	CGG	2	6	175039	175044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498792
3045	NC_015732	GCC	2	6	175125	175130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498792
3046	NC_015732	CAAG	2	8	175255	175262	50 %	0 %	25 %	25 %	339498792
3047	NC_015732	GGCC	2	8	175322	175329	0 %	0 %	50 %	50 %	339498792
3048	NC_015732	A	6	6	175330	175335	100 %	0 %	0 %	0 %	339498792
3049	NC_015732	A	6	6	175355	175360	100 %	0 %	0 %	0 %	339498792
3050	NC_015732	CGG	2	6	175363	175368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498792
3051	NC_015732	GGTAA	2	10	175385	175394	40 %	20 %	40 %	0 %	339498792
3052	NC_015732	TAA	2	6	175484	175489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498792
3053	NC_015732	GAT	2	6	175517	175522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498792
3054	NC_015732	AGG	2	6	175593	175598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498792
3055	NC_015732	ATG	2	6	175659	175664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498793
3056	NC_015732	AGG	2	6	175701	175706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498793
3057	NC_015732	CCGAT	2	10	175729	175738	20 %	20 %	20 %	40 %	339498793
3058	NC_015732	AAT	2	6	175865	175870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498793
3059	NC_015732	TAT	2	6	175880	175885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498793
3060	NC_015732	CGT	2	6	175978	175983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498793
3061	NC_015732	ACC	2	6	176058	176063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498793
3062	NC_015732	T	6	6	176317	176322	0 %	100 %	0 %	0 %	339498793
3063	NC_015732	CACGGA	2	12	176386	176397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498793
3064	NC_015732	TTGA	2	8	176519	176526	25 %	50 %	25 %	0 %	339498793
3065	NC_015732	CAG	2	6	176534	176539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498793
3066	NC_015732	CAG	2	6	176546	176551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498793
3067	NC_015732	TTC	2	6	176552	176557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498793
3068	NC_015732	AAT	2	6	176637	176642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498794
3069	NC_015732	AGA	2	6	176690	176695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498794
3070	NC_015732	CTG	2	6	176710	176715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498794
3071	NC_015732	GAG	2	6	176740	176745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498794
3072	NC_015732	CATC	2	8	176829	176836	25 %	25 %	0 %	50 %	339498794
3073	NC_015732	AGG	2	6	176837	176842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498794
3074	NC_015732	C	6	6	176894	176899	0 %	0 %	0 %	100 %	339498794
3075	NC_015732	CTA	2	6	176949	176954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498794
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3077	NC_015732	TCA	2	6	177083	177088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498794
3078	NC_015732	TGA	2	6	177102	177107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498794
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3080	NC_015732	TGC	2	6	177511	177516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498795
3081	NC_015732	TAG	2	6	177587	177592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498795
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3083	NC_015732	TGA	2	6	177642	177647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498795
3084	NC_015732	GAG	2	6	177661	177666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498795
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3086	NC_015732	TAA	2	6	177693	177698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498795
3087	NC_015732	GAG	2	6	177758	177763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498795
3088	NC_015732	TGC	2	6	177775	177780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498795
3089	NC_015732	AGC	2	6	177790	177795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498795
3090	NC_015732	AAT	2	6	177826	177831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498795
3091	NC_015732	GGA	2	6	177927	177932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498795
3092	NC_015732	CTC	2	6	177934	177939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498795
3093	NC_015732	GAG	2	6	177952	177957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498795
3094	NC_015732	T	8	8	177990	177997	0 %	100 %	0 %	0 %	339498795
3095	NC_015732	T	7	7	178052	178058	0 %	100 %	0 %	0 %	339498795
3096	NC_015732	GGTTTT	2	12	178150	178161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498795
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3099	NC_015732	CGC	2	6	178438	178443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498796
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3101	NC_015732	TGG	2	6	178538	178543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498796
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3103	NC_015732	CGG	2	6	178694	178699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498796
3104	NC_015732	CAGG	2	8	178737	178744	25 %	0 %	50 %	25 %	339498796
3105	NC_015732	TAA	2	6	178829	178834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498796
3106	NC_015732	TA	3	6	179030	179035	50 %	50 %	0 %	0 %	339498797
3107	NC_015732	CTT	2	6	179078	179083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498797
3108	NC_015732	TAG	2	6	179107	179112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498797
3109	NC_015732	TGC	2	6	179182	179187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498797
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3112	NC_015732	ATC	2	6	179449	179454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498797
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3118	NC_015732	TAG	2	6	179782	179787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498797
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3120	NC_015732	CGG	2	6	179988	179993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498797
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3122	NC_015732	CATC	2	8	180116	180123	25 %	25 %	0 %	50 %	339498797
3123	NC_015732	CAG	2	6	180155	180160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498797
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3126	NC_015732	TCA	2	6	180286	180291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498797
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3227	NC_015732	CAC	2	6	186022	186027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498804
3228	NC_015732	TAGC	2	8	186100	186107	25 %	25 %	25 %	25 %	339498804
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3231	NC_015732	GCA	2	6	186432	186437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498804
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3235	NC_015732	T	6	6	186756	186761	0 %	100 %	0 %	0 %	339498804
3236	NC_015732	TGA	2	6	186769	186774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498804
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3238	NC_015732	GAA	2	6	186986	186991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498805
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3240	NC_015732	GAA	2	6	187285	187290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498805
3241	NC_015732	CAC	2	6	187291	187296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498805
3242	NC_015732	AAT	2	6	187358	187363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498805
3243	NC_015732	AAT	2	6	187447	187452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498805
3244	NC_015732	CGA	2	6	187474	187479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498805
3245	NC_015732	GACT	2	8	187645	187652	25 %	25 %	25 %	25 %	339498805
3246	NC_015732	GCT	2	6	187684	187689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498805
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3282	NC_015732	AT	3	6	190021	190026	50 %	50 %	0 %	0 %	339498808
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3488	NC_015732	GCA	2	6	201834	201839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498819
3489	NC_015732	GCC	2	6	202161	202166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498819
3490	NC_015732	TCA	2	6	202228	202233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498819
3491	NC_015732	GTC	2	6	202249	202254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498819
3492	NC_015732	CTAT	2	8	202256	202263	25 %	50 %	0 %	25 %	339498819
3493	NC_015732	TGG	2	6	202426	202431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498819
3494	NC_015732	TGGTG	2	10	202478	202487	0 %	40 %	60 %	0 %	339498819
3495	NC_015732	TGA	2	6	202523	202528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498819
3496	NC_015732	ATT	2	6	202566	202571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498819
3497	NC_015732	GCG	2	6	202657	202662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498820
3498	NC_015732	CGGT	2	8	202681	202688	0 %	25 %	50 %	25 %	339498820
3499	NC_015732	TCC	3	9	202690	202698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498820
3500	NC_015732	T	7	7	202713	202719	0 %	100 %	0 %	0 %	339498820

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