MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015732	GCG	2	6	82504	82509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498714
1502	NC_015732	AGA	2	6	82513	82518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498714
1503	NC_015732	CCA	2	6	82542	82547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498714
1504	NC_015732	TAC	2	6	82618	82623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498714
1505	NC_015732	ATG	2	6	82631	82636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498714
1506	NC_015732	TGG	2	6	82704	82709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498714
1507	NC_015732	GAC	2	6	82712	82717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498714
1508	NC_015732	CTGAAA	2	12	82805	82816	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339498714
1509	NC_015732	A	7	7	82818	82824	100 %	0 %	0 %	0 %	339498714
1510	NC_015732	TTAA	2	8	82926	82933	50 %	50 %	0 %	0 %	339498715
1511	NC_015732	AC	3	6	83006	83011	50 %	0 %	0 %	50 %	339498715
1512	NC_015732	CTG	2	6	83058	83063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498715
1513	NC_015732	GCTA	2	8	83121	83128	25 %	25 %	25 %	25 %	339498715
1514	NC_015732	CT	3	6	83133	83138	0 %	50 %	0 %	50 %	339498715
1515	NC_015732	CCTGC	2	10	83145	83154	0 %	20 %	20 %	60 %	339498715
1516	NC_015732	CCG	2	6	83200	83205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498715
1517	NC_015732	CTG	2	6	83247	83252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498715
1518	NC_015732	GAC	2	6	83266	83271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498715
1519	NC_015732	CT	3	6	83315	83320	0 %	50 %	0 %	50 %	339498715
1520	NC_015732	CCT	2	6	83354	83359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498715
1521	NC_015732	AAT	2	6	83431	83436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498715
1522	NC_015732	GGTA	2	8	83456	83463	25 %	25 %	50 %	0 %	339498716
1523	NC_015732	TGGA	2	8	83474	83481	25 %	25 %	50 %	0 %	339498716
1524	NC_015732	TATTG	2	10	83495	83504	20 %	60 %	20 %	0 %	339498716
1525	NC_015732	T	6	6	83518	83523	0 %	100 %	0 %	0 %	339498716
1526	NC_015732	TCT	2	6	83542	83547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498716
1527	NC_015732	GAG	2	6	83565	83570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498716
1528	NC_015732	C	6	6	83590	83595	0 %	0 %	0 %	100 %	339498716
1529	NC_015732	GCA	2	6	83603	83608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498716
1530	NC_015732	GATC	2	8	83648	83655	25 %	25 %	25 %	25 %	339498716
1531	NC_015732	TAG	2	6	83750	83755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498716
1532	NC_015732	TAA	2	6	83818	83823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498716
1533	NC_015732	GTT	2	6	83842	83847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498716
1534	NC_015732	TCA	2	6	83929	83934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498716
1535	NC_015732	CCA	2	6	83937	83942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498716
1536	NC_015732	CTG	2	6	84160	84165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498716
1537	NC_015732	TCCA	2	8	84377	84384	25 %	25 %	0 %	50 %	339498716
1538	NC_015732	TAAA	2	8	84385	84392	75 %	25 %	0 %	0 %	339498716
1539	NC_015732	ATTTC	2	10	84406	84415	20 %	60 %	0 %	20 %	339498716
1540	NC_015732	AGC	2	6	84426	84431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498716
1541	NC_015732	T	6	6	84445	84450	0 %	100 %	0 %	0 %	339498716
1542	NC_015732	TCA	2	6	84556	84561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498716
1543	NC_015732	TGA	2	6	84568	84573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498716
1544	NC_015732	T	8	8	84815	84822	0 %	100 %	0 %	0 %	339498716
1545	NC_015732	CCA	2	6	84831	84836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498716
1546	NC_015732	C	6	6	84840	84845	0 %	0 %	0 %	100 %	339498716
1547	NC_015732	TAC	2	6	84914	84919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498716
1548	NC_015732	GCT	2	6	84944	84949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498716
1549	NC_015732	AGC	2	6	85115	85120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498717
1550	NC_015732	CT	3	6	85148	85153	0 %	50 %	0 %	50 %	339498717
1551	NC_015732	GAAG	2	8	85166	85173	50 %	0 %	50 %	0 %	339498717
1552	NC_015732	ATG	2	6	85341	85346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498717
1553	NC_015732	T	6	6	85358	85363	0 %	100 %	0 %	0 %	339498717
1554	NC_015732	GGC	2	6	85370	85375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498717
1555	NC_015732	CCG	2	6	85518	85523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498717
1556	NC_015732	TGG	2	6	85553	85558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498717
1557	NC_015732	GCC	2	6	85622	85627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498717
1558	NC_015732	TTC	2	6	85691	85696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498717
1559	NC_015732	GCC	2	6	85759	85764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498717
1560	NC_015732	CCA	3	9	85780	85788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498717
1561	NC_015732	CTG	2	6	85812	85817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498717
1562	NC_015732	AAG	2	6	85934	85939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498717
1563	NC_015732	AGA	2	6	85945	85950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498717
1564	NC_015732	TGC	2	6	85954	85959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498717
1565	NC_015732	GTT	2	6	85982	85987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498717
1566	NC_015732	GCG	2	6	86008	86013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498717
1567	NC_015732	TCA	2	6	86026	86031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498717
1568	NC_015732	AAG	2	6	86037	86042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498717
1569	NC_015732	TG	3	6	86098	86103	0 %	50 %	50 %	0 %	339498717
1570	NC_015732	TGG	2	6	86153	86158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498717
1571	NC_015732	ATGA	2	8	86213	86220	50 %	25 %	25 %	0 %	339498717
1572	NC_015732	CGGTT	2	10	86230	86239	0 %	40 %	40 %	20 %	339498717
1573	NC_015732	GGA	2	6	86245	86250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498717
1574	NC_015732	TAT	2	6	86368	86373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498717
1575	NC_015732	CTGT	2	8	86480	86487	0 %	50 %	25 %	25 %	339498717
1576	NC_015732	GGATGC	2	12	86533	86544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339498717
1577	NC_015732	AT	3	6	86671	86676	50 %	50 %	0 %	0 %	339498717
1578	NC_015732	GCT	2	6	86827	86832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498717
1579	NC_015732	GGACC	2	10	86929	86938	20 %	0 %	40 %	40 %	339498717
1580	NC_015732	ACC	2	6	87020	87025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498717
1581	NC_015732	GAT	2	6	87104	87109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498717
1582	NC_015732	TGAGCT	2	12	87145	87156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339498717
1583	NC_015732	AGC	2	6	87193	87198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498717
1584	NC_015732	GCC	2	6	87209	87214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498717
1585	NC_015732	ATTT	2	8	87460	87467	25 %	75 %	0 %	0 %	339498718
1586	NC_015732	CAA	2	6	87519	87524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498718
1587	NC_015732	CAGG	2	8	87557	87564	25 %	0 %	50 %	25 %	339498718
1588	NC_015732	AAATC	2	10	87598	87607	60 %	20 %	0 %	20 %	339498718
1589	NC_015732	GCGAT	2	10	87688	87697	20 %	20 %	40 %	20 %	339498718
1590	NC_015732	GATT	2	8	87727	87734	25 %	50 %	25 %	0 %	339498718
1591	NC_015732	TTG	2	6	87753	87758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498718
1592	NC_015732	CAC	2	6	87838	87843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498718
1593	NC_015732	TAT	2	6	87877	87882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498718
1594	NC_015732	TAC	2	6	87889	87894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498718
1595	NC_015732	TAC	2	6	87964	87969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498718
1596	NC_015732	CTA	2	6	87993	87998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498718
1597	NC_015732	GATG	2	8	88003	88010	25 %	25 %	50 %	0 %	339498718
1598	NC_015732	AT	3	6	88090	88095	50 %	50 %	0 %	0 %	339498718
1599	NC_015732	ATG	2	6	88154	88159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498718
1600	NC_015732	AGG	2	6	88234	88239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498718
1601	NC_015732	CCT	2	6	88240	88245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498718
1602	NC_015732	TGA	2	6	88465	88470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498718
1603	NC_015732	ATT	2	6	88475	88480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498718
1604	NC_015732	TGA	2	6	88546	88551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498718
1605	NC_015732	CTAT	2	8	88560	88567	25 %	50 %	0 %	25 %	339498718
1606	NC_015732	ATG	2	6	88591	88596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498719
1607	NC_015732	A	6	6	88606	88611	100 %	0 %	0 %	0 %	339498719
1608	NC_015732	TTA	2	6	88646	88651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498719
1609	NC_015732	AGA	2	6	88682	88687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498719
1610	NC_015732	ACA	2	6	88691	88696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498719
1611	NC_015732	GAA	2	6	88725	88730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498719
1612	NC_015732	AAT	2	6	88803	88808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498719
1613	NC_015732	TAT	2	6	88826	88831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498719
1614	NC_015732	T	6	6	88877	88882	0 %	100 %	0 %	0 %	339498719
1615	NC_015732	AT	4	8	88917	88924	50 %	50 %	0 %	0 %	339498719
1616	NC_015732	TA	3	6	88992	88997	50 %	50 %	0 %	0 %	339498719
1617	NC_015732	ACA	2	6	89002	89007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498719
1618	NC_015732	AAT	2	6	89010	89015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498719
1619	NC_015732	TAAA	2	8	89047	89054	75 %	25 %	0 %	0 %	339498719
1620	NC_015732	GAT	2	6	89226	89231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498719
1621	NC_015732	AGA	2	6	89249	89254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498719
1622	NC_015732	TC	3	6	89278	89283	0 %	50 %	0 %	50 %	339498719
1623	NC_015732	A	6	6	89336	89341	100 %	0 %	0 %	0 %	339498719
1624	NC_015732	CGG	2	6	89342	89347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498719
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1997	NC_015732	AATT	2	8	111213	111220	50 %	50 %	0 %	0 %	339498733
1998	NC_015732	TCA	2	6	111239	111244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498733
1999	NC_015732	T	6	6	111329	111334	0 %	100 %	0 %	0 %	339498733
2000	NC_015732	AGG	2	6	111367	111372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498733

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