MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_015732	CT	3	6	29201	29206	0 %	50 %	0 %	50 %	339498673
503	NC_015732	A	6	6	29326	29331	100 %	0 %	0 %	0 %	339498673
504	NC_015732	GCT	2	6	29369	29374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498673
505	NC_015732	TGA	2	6	29380	29385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498673
506	NC_015732	AAT	2	6	29525	29530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498673
507	NC_015732	GAA	2	6	29570	29575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498673
508	NC_015732	TGC	2	6	29628	29633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498673
509	NC_015732	TAC	2	6	29642	29647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498673
510	NC_015732	TGG	2	6	29696	29701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498673
511	NC_015732	AGA	2	6	29710	29715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498673
512	NC_015732	ACC	2	6	29764	29769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498673
513	NC_015732	ACC	2	6	29798	29803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498673
514	NC_015732	TG	3	6	29825	29830	0 %	50 %	50 %	0 %	339498673
515	NC_015732	AAG	2	6	29847	29852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498673
516	NC_015732	A	6	6	29890	29895	100 %	0 %	0 %	0 %	339498673
517	NC_015732	TGG	2	6	29935	29940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498673
518	NC_015732	TGC	2	6	29950	29955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498673
519	NC_015732	TGT	2	6	29974	29979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498673
520	NC_015732	T	6	6	30014	30019	0 %	100 %	0 %	0 %	339498673
521	NC_015732	TGGC	2	8	30024	30031	0 %	25 %	50 %	25 %	339498673
522	NC_015732	GACG	2	8	30035	30042	25 %	0 %	50 %	25 %	339498673
523	NC_015732	ATT	2	6	30057	30062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498673
524	NC_015732	TAA	2	6	30133	30138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498673
525	NC_015732	TGG	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498673
526	NC_015732	AAG	2	6	30234	30239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498673
527	NC_015732	TC	3	6	30379	30384	0 %	50 %	0 %	50 %	339498673
528	NC_015732	TGG	2	6	30519	30524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498674
529	NC_015732	GAA	2	6	30588	30593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498674
530	NC_015732	CTG	2	6	30598	30603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498674
531	NC_015732	TCA	3	9	30656	30664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498674
532	NC_015732	T	6	6	30676	30681	0 %	100 %	0 %	0 %	339498674
533	NC_015732	AAT	2	6	30786	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498674
534	NC_015732	ATT	2	6	30805	30810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498674
535	NC_015732	TGA	2	6	30926	30931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498675
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537	NC_015732	GTA	2	6	30978	30983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498675
538	NC_015732	AT	3	6	31002	31007	50 %	50 %	0 %	0 %	339498675
539	NC_015732	CTGC	2	8	31012	31019	0 %	25 %	25 %	50 %	339498675
540	NC_015732	TGG	2	6	31136	31141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498675
541	NC_015732	TTG	2	6	31144	31149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498675
542	NC_015732	GAA	2	6	31167	31172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498675
543	NC_015732	GAA	2	6	31194	31199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498675
544	NC_015732	TTCCT	2	10	31241	31250	0 %	60 %	0 %	40 %	339498675
545	NC_015732	T	8	8	31296	31303	0 %	100 %	0 %	0 %	339498675
546	NC_015732	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	339498675
547	NC_015732	CCA	2	6	31417	31422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498675
548	NC_015732	ACT	2	6	31436	31441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498675
549	NC_015732	GCA	2	6	31585	31590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498676
550	NC_015732	AT	4	8	31612	31619	50 %	50 %	0 %	0 %	339498676
551	NC_015732	A	6	6	31666	31671	100 %	0 %	0 %	0 %	339498676
552	NC_015732	TGC	2	6	31684	31689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498676
553	NC_015732	CAT	2	6	31697	31702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498676
554	NC_015732	GTG	2	6	31703	31708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498676
555	NC_015732	CAG	2	6	31748	31753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498676
556	NC_015732	AT	3	6	31777	31782	50 %	50 %	0 %	0 %	339498676
557	NC_015732	TCA	2	6	31857	31862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498676
558	NC_015732	ATG	2	6	31917	31922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498676
559	NC_015732	A	7	7	31928	31934	100 %	0 %	0 %	0 %	339498676
560	NC_015732	GCTCA	2	10	31937	31946	20 %	20 %	20 %	40 %	339498676
561	NC_015732	A	8	8	31948	31955	100 %	0 %	0 %	0 %	339498676
562	NC_015732	AT	3	6	32009	32014	50 %	50 %	0 %	0 %	339498676
563	NC_015732	TTAT	2	8	32124	32131	25 %	75 %	0 %	0 %	339498676
564	NC_015732	ATA	2	6	32135	32140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498676
565	NC_015732	A	6	6	32140	32145	100 %	0 %	0 %	0 %	339498676
566	NC_015732	TGC	3	9	32194	32202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498676
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568	NC_015732	TTA	2	6	32295	32300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498676
569	NC_015732	TAA	2	6	32313	32318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498676
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572	NC_015732	ATATT	2	10	32521	32530	40 %	60 %	0 %	0 %	339498677
573	NC_015732	CTA	2	6	32531	32536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498677
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576	NC_015732	AT	3	6	32758	32763	50 %	50 %	0 %	0 %	339498677
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584	NC_015732	ATG	2	6	32882	32887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498677
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591	NC_015732	A	6	6	33172	33177	100 %	0 %	0 %	0 %	339498677
592	NC_015732	TA	3	6	33190	33195	50 %	50 %	0 %	0 %	339498677
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595	NC_015732	T	6	6	33321	33326	0 %	100 %	0 %	0 %	339498677
596	NC_015732	TATC	2	8	33400	33407	25 %	50 %	0 %	25 %	339498677
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599	NC_015732	GAA	2	6	33544	33549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498677
600	NC_015732	ATTGT	2	10	33602	33611	20 %	60 %	20 %	0 %	339498677
601	NC_015732	AAT	2	6	33625	33630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498677
602	NC_015732	ATT	2	6	33643	33648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498677
603	NC_015732	TCCTAT	2	12	33744	33755	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	339498677
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612	NC_015732	ATGG	2	8	34086	34093	25 %	25 %	50 %	0 %	339498678
613	NC_015732	TAT	2	6	34144	34149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498678
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615	NC_015732	AGA	2	6	34253	34258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498678
616	NC_015732	T	6	6	34329	34334	0 %	100 %	0 %	0 %	339498678
617	NC_015732	GGT	2	6	34350	34355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498678
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619	NC_015732	GAT	2	6	34365	34370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498678
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623	NC_015732	T	6	6	34530	34535	0 %	100 %	0 %	0 %	339498678
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627	NC_015732	AG	3	6	34725	34730	50 %	0 %	50 %	0 %	339498678
628	NC_015732	A	7	7	34755	34761	100 %	0 %	0 %	0 %	339498678
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