MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 56044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_015732	CAGAA	2	10	3208625	3208634	60 %	0 %	20 %	20 %	339501408
55502	NC_015732	ATTCC	2	10	3208677	3208686	20 %	40 %	0 %	40 %	339501408
55503	NC_015732	AAT	2	6	3208688	3208693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501408
55504	NC_015732	GGT	2	6	3208711	3208716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501408
55505	NC_015732	TTA	2	6	3208834	3208839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501408
55506	NC_015732	CA	3	6	3208848	3208853	50 %	0 %	0 %	50 %	339501408
55507	NC_015732	GCT	2	6	3208934	3208939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501408
55508	NC_015732	ATCC	2	8	3209025	3209032	25 %	25 %	0 %	50 %	339501408
55509	NC_015732	A	6	6	3209065	3209070	100 %	0 %	0 %	0 %	339501409
55510	NC_015732	TAC	2	6	3209092	3209097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501409
55511	NC_015732	CTT	2	6	3209107	3209112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501409
55512	NC_015732	TATTTC	2	12	3209306	3209317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	339501409
55513	NC_015732	ACT	2	6	3209415	3209420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501409
55514	NC_015732	GAT	2	6	3209477	3209482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501409
55515	NC_015732	T	6	6	3209498	3209503	0 %	100 %	0 %	0 %	339501409
55516	NC_015732	TAA	2	6	3209605	3209610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501409
55517	NC_015732	TAA	2	6	3209702	3209707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501409
55518	NC_015732	CTAT	2	8	3209776	3209783	25 %	50 %	0 %	25 %	339501410
55519	NC_015732	AAAG	2	8	3209844	3209851	75 %	0 %	25 %	0 %	339501410
55520	NC_015732	ATA	2	6	3209880	3209885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501410
55521	NC_015732	A	6	6	3210060	3210065	100 %	0 %	0 %	0 %	339501410
55522	NC_015732	CAGGAT	2	12	3210130	3210141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339501410
55523	NC_015732	ATC	2	6	3210147	3210152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501410
55524	NC_015732	ATG	2	6	3210159	3210164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501410
55525	NC_015732	TCC	2	6	3210188	3210193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501410
55526	NC_015732	CAG	2	6	3210289	3210294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501410
55527	NC_015732	ATA	2	6	3210327	3210332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501410
55528	NC_015732	A	9	9	3210374	3210382	100 %	0 %	0 %	0 %	339501410
55529	NC_015732	CAG	2	6	3210412	3210417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501410
55530	NC_015732	ACC	2	6	3210429	3210434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501410
55531	NC_015732	ACC	2	6	3210509	3210514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501410
55532	NC_015732	ATA	2	6	3210519	3210524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501410
55533	NC_015732	A	6	6	3210583	3210588	100 %	0 %	0 %	0 %	339501410
55534	NC_015732	ATA	2	6	3210635	3210640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501410
55535	NC_015732	A	6	6	3210668	3210673	100 %	0 %	0 %	0 %	339501410
55536	NC_015732	CAAG	2	8	3210675	3210682	50 %	0 %	25 %	25 %	339501410
55537	NC_015732	GGT	2	6	3210713	3210718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501410
55538	NC_015732	TAA	2	6	3210733	3210738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501410
55539	NC_015732	T	8	8	3210739	3210746	0 %	100 %	0 %	0 %	339501410
55540	NC_015732	CCT	2	6	3210813	3210818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501410
55541	NC_015732	AGC	2	6	3210828	3210833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501410
55542	NC_015732	TAA	2	6	3210847	3210852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501410
55543	NC_015732	AAG	2	6	3210875	3210880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501410
55544	NC_015732	AGT	2	6	3210882	3210887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501410
55545	NC_015732	GTT	2	6	3211199	3211204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501411
55546	NC_015732	TTA	2	6	3211386	3211391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501411
55547	NC_015732	CAT	3	9	3211406	3211414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501411
55548	NC_015732	TGA	2	6	3211476	3211481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501411
55549	NC_015732	GAA	2	6	3211496	3211501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501411
55550	NC_015732	T	6	6	3211634	3211639	0 %	100 %	0 %	0 %	339501411
55551	NC_015732	CTA	2	6	3211647	3211652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501411
55552	NC_015732	GCC	2	6	3211691	3211696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501411
55553	NC_015732	T	6	6	3211697	3211702	0 %	100 %	0 %	0 %	339501411
55554	NC_015732	CT	3	6	3211881	3211886	0 %	50 %	0 %	50 %	339501411
55555	NC_015732	GAAC	2	8	3211909	3211916	50 %	0 %	25 %	25 %	339501411
55556	NC_015732	CGAA	2	8	3212073	3212080	50 %	0 %	25 %	25 %	339501411
55557	NC_015732	AAT	2	6	3212193	3212198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501412
55558	NC_015732	CAC	2	6	3212214	3212219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501412
55559	NC_015732	C	6	6	3212237	3212242	0 %	0 %	0 %	100 %	339501412
55560	NC_015732	GTTTTT	2	12	3212290	3212301	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	339501412
55561	NC_015732	A	6	6	3212342	3212347	100 %	0 %	0 %	0 %	339501412
55562	NC_015732	CGTT	2	8	3212412	3212419	0 %	50 %	25 %	25 %	339501412
55563	NC_015732	TTC	2	6	3212448	3212453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501412
55564	NC_015732	A	7	7	3212475	3212481	100 %	0 %	0 %	0 %	339501412
55565	NC_015732	CTA	2	6	3212552	3212557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501412
55566	NC_015732	AATA	2	8	3212575	3212582	75 %	25 %	0 %	0 %	339501412
55567	NC_015732	GA	3	6	3212694	3212699	50 %	0 %	50 %	0 %	339501412
55568	NC_015732	A	6	6	3212699	3212704	100 %	0 %	0 %	0 %	339501412
55569	NC_015732	CAG	2	6	3212708	3212713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501412
55570	NC_015732	CAA	2	6	3212720	3212725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501412
55571	NC_015732	A	7	7	3212738	3212744	100 %	0 %	0 %	0 %	339501412
55572	NC_015732	CTG	2	6	3212773	3212778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501412
55573	NC_015732	GGA	2	6	3212812	3212817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501412
55574	NC_015732	TGA	2	6	3212847	3212852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501412
55575	NC_015732	AAC	2	6	3212886	3212891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501412
55576	NC_015732	ATA	2	6	3212897	3212902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501412
55577	NC_015732	TCC	2	6	3212956	3212961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501413
55578	NC_015732	TCATAA	2	12	3212993	3213004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	339501413
55579	NC_015732	CCA	2	6	3213005	3213010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501413
55580	NC_015732	GAA	2	6	3213018	3213023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501413
55581	NC_015732	ACT	2	6	3213028	3213033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501413
55582	NC_015732	TA	3	6	3213079	3213084	50 %	50 %	0 %	0 %	339501413
55583	NC_015732	AATA	2	8	3213128	3213135	75 %	25 %	0 %	0 %	339501413
55584	NC_015732	CAC	2	6	3213171	3213176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501413
55585	NC_015732	ACT	2	6	3213187	3213192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501413
55586	NC_015732	AGA	2	6	3213221	3213226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501413
55587	NC_015732	CAT	2	6	3213312	3213317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501413
55588	NC_015732	CAA	2	6	3213338	3213343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501413
55589	NC_015732	TAAC	2	8	3213344	3213351	50 %	25 %	0 %	25 %	339501413
55590	NC_015732	CCAAT	2	10	3213425	3213434	40 %	20 %	0 %	40 %	339501413
55591	NC_015732	TAAAA	2	10	3213599	3213608	80 %	20 %	0 %	0 %	339501413
55592	NC_015732	AGC	2	6	3213621	3213626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501413
55593	NC_015732	A	6	6	3213734	3213739	100 %	0 %	0 %	0 %	339501413
55594	NC_015732	CAT	2	6	3213750	3213755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501413
55595	NC_015732	CAA	2	6	3213761	3213766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501413
55596	NC_015732	CT	3	6	3213820	3213825	0 %	50 %	0 %	50 %	339501413
55597	NC_015732	CGC	2	6	3213920	3213925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501414
55598	NC_015732	AAT	2	6	3213930	3213935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501414
55599	NC_015732	CTTT	2	8	3213943	3213950	0 %	75 %	0 %	25 %	339501414
55600	NC_015732	GCA	2	6	3213951	3213956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501414
55601	NC_015732	CAG	2	6	3214045	3214050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501414
55602	NC_015732	TATC	2	8	3214180	3214187	25 %	50 %	0 %	25 %	339501414
55603	NC_015732	T	6	6	3214251	3214256	0 %	100 %	0 %	0 %	339501414
55604	NC_015732	ACA	2	6	3214287	3214292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501414
55605	NC_015732	GAT	2	6	3214300	3214305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501414
55606	NC_015732	CTG	2	6	3214318	3214323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501414
55607	NC_015732	T	6	6	3214554	3214559	0 %	100 %	0 %	0 %	339501414
55608	NC_015732	CAC	2	6	3214567	3214572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501414
55609	NC_015732	CCG	2	6	3214606	3214611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501414
55610	NC_015732	CAC	2	6	3214612	3214617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501414
55611	NC_015732	GCT	3	9	3214674	3214682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501414
55612	NC_015732	TCA	2	6	3214689	3214694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501414
55613	NC_015732	GTT	2	6	3214698	3214703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501414
55614	NC_015732	ATA	2	6	3214742	3214747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501414
55615	NC_015732	T	8	8	3214855	3214862	0 %	100 %	0 %	0 %	339501414
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55617	NC_015732	CCAT	2	8	3214895	3214902	25 %	25 %	0 %	50 %	339501414
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55733	NC_015732	CTC	2	6	3220951	3220956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501420
55734	NC_015732	CCAT	2	8	3220980	3220987	25 %	25 %	0 %	50 %	339501420
55735	NC_015732	T	6	6	3221051	3221056	0 %	100 %	0 %	0 %	339501420
55736	NC_015732	AGA	2	6	3221082	3221087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501420
55737	NC_015732	GGC	2	6	3221104	3221109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501420
55738	NC_015732	AGG	2	6	3221183	3221188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501420
55739	NC_015732	TCG	2	6	3221238	3221243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501420
55740	NC_015732	TGA	2	6	3221298	3221303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501420
55741	NC_015732	C	6	6	3221325	3221330	0 %	0 %	0 %	100 %	339501420
55742	NC_015732	ATT	2	6	3221343	3221348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501420
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55744	NC_015732	C	6	6	3221435	3221440	0 %	0 %	0 %	100 %	339501420
55745	NC_015732	TCA	2	6	3221444	3221449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501420
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55804	NC_015732	ACA	2	6	3225177	3225182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501422
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55807	NC_015732	TATT	2	8	3225375	3225382	25 %	75 %	0 %	0 %	339501422
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55832	NC_015732	A	7	7	3227008	3227014	100 %	0 %	0 %	0 %	339501423
55833	NC_015732	GAT	2	6	3227252	3227257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501423
55834	NC_015732	GGCT	2	8	3227366	3227373	0 %	25 %	50 %	25 %	339501423
55835	NC_015732	GGCT	2	8	3227390	3227397	0 %	25 %	50 %	25 %	339501423
55836	NC_015732	GCCG	2	8	3227423	3227430	0 %	0 %	50 %	50 %	339501423
55837	NC_015732	CCT	2	6	3227440	3227445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501423
55838	NC_015732	GAG	2	6	3227486	3227491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501423
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55841	NC_015732	ATCC	2	8	3227676	3227683	25 %	25 %	0 %	50 %	339501423
55842	NC_015732	TCA	2	6	3227763	3227768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501423
55843	NC_015732	CTA	2	6	3227772	3227777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501423
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55845	NC_015732	AT	3	6	3227827	3227832	50 %	50 %	0 %	0 %	339501423
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55847	NC_015732	GAG	2	6	3228073	3228078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501424
55848	NC_015732	CAC	2	6	3228083	3228088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501424
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55968	NC_015732	TAA	2	6	3235005	3235010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501433
55969	NC_015732	GGT	2	6	3235030	3235035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501433
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55999	NC_015732	TCA	2	6	3236375	3236380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501433
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