MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	CAATAT	2	12	385	396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731897
2	NC_015713	TTTTCT	2	12	2912	2923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338731899
3	NC_015713	GATTTA	2	12	6382	6393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338731900
4	NC_015713	ATCAAT	2	12	11384	11395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731906
5	NC_015713	TTACTA	2	12	12869	12880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338731907
6	NC_015713	AAGGGA	2	12	25902	25913	50 %	0 %	50 %	0 %	338731919
7	NC_015713	CAATAA	2	12	27518	27529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338731920
8	NC_015713	TGGAGG	2	12	30895	30906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338731925
9	NC_015713	GAAGGG	2	12	33193	33204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731926
10	NC_015713	TCTCCT	2	12	43118	43129	0 %	50 %	0 %	50 %	338731935
11	NC_015713	CCACCT	2	12	45035	45046	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338731936
12	NC_015713	TTTTGA	2	12	46628	46639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338731938
13	NC_015713	ACCCAA	2	12	48223	48234	50 %	0 %	0 %	50 %	338731941
14	NC_015713	GAAGTG	2	12	55502	55513	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338731946
15	NC_015713	TGATGC	2	12	55663	55674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338731946
16	NC_015713	AAAAGA	2	12	61089	61100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338731950
17	NC_015713	ATTTTT	2	12	61840	61851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	338731952
18	NC_015713	TGAGCA	2	12	65538	65549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338731958
19	NC_015713	AGTTCC	2	12	68661	68672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731959
20	NC_015713	TCCAAA	2	12	72802	72813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338731962
21	NC_015713	CTGTCA	2	12	73764	73775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731963
22	NC_015713	AGGAAG	2	12	78474	78485	50 %	0 %	50 %	0 %	338731967
23	NC_015713	ACCAAG	2	12	81123	81134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731970
24	NC_015713	TTAAAA	2	12	81339	81350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731970
25	NC_015713	GATCTC	2	12	82345	82356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731971
26	NC_015713	CTTGGG	2	12	82358	82369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338731971
27	NC_015713	AACTTC	2	12	82420	82431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731971
28	NC_015713	TAAAGC	2	12	83624	83635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338731972
29	NC_015713	AAAATA	2	12	84772	84783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338731972
30	NC_015713	ATCAAG	2	12	87136	87147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338731972
31	NC_015713	AAACAA	2	12	88861	88872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338731972
32	NC_015713	CTATAC	2	12	89942	89953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731972
33	NC_015713	CTTATG	2	12	90883	90894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338731972
34	NC_015713	AGAAAA	2	12	93859	93870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338731976
35	NC_015713	GAGGTT	2	12	95900	95911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338731979
36	NC_015713	GCCTTG	2	12	95990	96001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731979
37	NC_015713	CATTCC	2	12	114919	114930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338731995
38	NC_015713	AGGGTG	2	12	127730	127741	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338732009
39	NC_015713	GATAAA	2	12	129042	129053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338732010
40	NC_015713	TATAAC	2	12	141812	141823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338732018
41	NC_015713	TTTGGG	2	12	144080	144091	0 %	50 %	50 %	0 %	338732021
42	NC_015713	ACCTGC	2	12	145031	145042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338732022
43	NC_015713	CTTGAA	2	12	150740	150751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732032
44	NC_015713	GGGTGT	2	12	150972	150983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338732032
45	NC_015713	AGTACC	2	12	151413	151424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732032
46	NC_015713	TGAGCT	2	12	152159	152170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338732033
47	NC_015713	AAAACC	2	12	152361	152372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338732033
48	NC_015713	TCAACC	2	12	152653	152664	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	338732033
49	NC_015713	ATGGCT	2	12	157749	157760	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338732039
50	NC_015713	TGAAAT	2	12	157939	157950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338732039
51	NC_015713	TATCGA	2	12	159015	159026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732040
52	NC_015713	AAATTC	2	12	159905	159916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338732041
53	NC_015713	CATATG	2	12	169884	169895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732051
54	NC_015713	TTTCTT	2	12	170152	170163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338732052
55	NC_015713	TTCAAT	2	12	170545	170556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338732054
56	NC_015713	CCTGAA	2	12	172178	172189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732059
57	NC_015713	CAGACG	2	12	176264	176275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338732061
58	NC_015713	AAAAGA	2	12	181323	181334	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732065
59	NC_015713	TGAAAT	2	12	185226	185237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338732067
60	NC_015713	GAAAAA	2	12	185320	185331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732067
61	NC_015713	CTGATC	2	12	189503	189514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338732073
62	NC_015713	GGGAAT	2	12	189636	189647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338732073
63	NC_015713	TCGATT	2	12	191217	191228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732075
64	NC_015713	ATCTTC	2	12	195642	195653	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338732079
65	NC_015713	GCTCCA	2	12	199765	199776	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338732084
66	NC_015713	TTTCGA	2	12	200986	200997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732085
67	NC_015713	CGAGAC	2	12	204849	204860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338732091
68	NC_015713	AAATGG	2	12	210606	210617	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732097
69	NC_015713	TGAAGA	2	12	210655	210666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732097
70	NC_015713	TTTGAG	2	12	215269	215280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338732102
71	NC_015713	CATCTT	2	12	219599	219610	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338732104
72	NC_015713	TAGTCT	2	12	224532	224543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338732111
73	NC_015713	TGTTTC	2	12	225054	225065	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732111
74	NC_015713	AGGAAA	2	12	232546	232557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338732119
75	NC_015713	AAATCA	2	12	234274	234285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	338732120
76	NC_015713	TGCCAA	2	12	234925	234936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732121
77	NC_015713	GCAGAA	2	12	235178	235189	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732121
78	NC_015713	TTTGAG	2	12	236884	236895	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338732122
79	NC_015713	TCCAAA	2	12	237322	237333	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338732122
80	NC_015713	TTTTCT	2	12	240793	240804	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338732126
81	NC_015713	GATTCA	2	12	244033	244044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732127
82	NC_015713	CAATGA	2	12	245256	245267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338732128
83	NC_015713	CAATTT	2	12	248811	248822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	338732129
84	NC_015713	GAAAAA	2	12	255480	255491	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732136
85	NC_015713	TTTTCC	2	12	256829	256840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338732137
86	NC_015713	GCAAAG	2	12	262920	262931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732144
87	NC_015713	ATTTCT	2	12	266359	266370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338732149
88	NC_015713	GCAAGA	2	12	276544	276555	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732162
89	NC_015713	AAAAAG	2	12	276678	276689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732162
90	NC_015713	TCTCAA	2	12	279889	279900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732167
91	NC_015713	TTTCTG	2	12	283208	283219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732171
92	NC_015713	TGTTAT	2	12	286537	286548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338732175
93	NC_015713	TGGTTG	2	12	289882	289893	0 %	50 %	50 %	0 %	338732182
94	NC_015713	ATTTTA	2	12	294320	294331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338732187
95	NC_015713	CTTTTC	2	12	295769	295780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338732189
96	NC_015713	AAAGGG	2	12	301196	301207	50 %	0 %	50 %	0 %	338732193
97	NC_015713	GGCACT	2	12	311014	311025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338732203
98	NC_015713	GAAAGA	2	12	313953	313964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338732206
99	NC_015713	TGGGGG	2	12	316140	316151	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	338732208
100	NC_015713	GAAATG	2	12	316389	316400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338732210
101	NC_015713	TGAGGT	2	12	317088	317099	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338732211
102	NC_015713	GCCAAT	2	12	321353	321364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732219
103	NC_015713	GCTCTT	2	12	324320	324331	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732222
104	NC_015713	TTTGTC	2	12	324477	324488	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338732222
105	NC_015713	GACTAT	2	12	326083	326094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732226
106	NC_015713	GCAAAA	2	12	326607	326618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338732226
107	NC_015713	GATTTA	2	12	330651	330662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338732229
108	NC_015713	GCCAGA	2	12	335517	335528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338732236
109	NC_015713	TTTGTT	2	12	339149	339160	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338732239
110	NC_015713	GTTGAG	2	12	340866	340877	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	338732240
111	NC_015713	AGCTCC	2	12	344863	344874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338732244
112	NC_015713	CTTGAA	2	12	345196	345207	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732245
113	NC_015713	GGATCA	2	12	346944	346955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732246
114	NC_015713	GATCGA	2	12	348284	348295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732248
115	NC_015713	AATTAA	2	12	349149	349160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338732248
116	NC_015713	AACACA	2	12	353765	353776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338732255
117	NC_015713	CTTTGC	2	12	356032	356043	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732259
118	NC_015713	AGGGAT	2	12	356659	356670	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338732259
119	NC_015713	TCTAAC	2	12	359055	359066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732262
120	NC_015713	CTTCCT	2	12	359382	359393	0 %	50 %	0 %	50 %	338732263
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220	NC_015713	ATATTA	2	12	727811	727822	50 %	50 %	0 %	0 %	338732587
221	NC_015713	TTTCTA	2	12	731338	731349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338732592
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225	NC_015713	GGATTA	2	12	742648	742659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338732603
226	NC_015713	ATCTCG	2	12	747909	747920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338732608
227	NC_015713	TTTTTC	2	12	749511	749522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338732611
228	NC_015713	CGTGAA	2	12	753255	753266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338732615
229	NC_015713	TTTGCC	2	12	753498	753509	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732615
230	NC_015713	GCTTTC	2	12	755898	755909	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	338732616
231	NC_015713	GAATTG	2	12	757891	757902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338732618
232	NC_015713	AACTTC	2	12	758181	758192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732619
233	NC_015713	AAAGGC	2	12	760182	760193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338732622
234	NC_015713	ATGTCA	2	12	762309	762320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338732624
235	NC_015713	AAAAGA	2	12	766291	766302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732627
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342	NC_015713	CCACCC	2	12	1093565	1093576	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	338732950
343	NC_015713	CTTCAA	2	12	1094947	1094958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338732951
344	NC_015713	ACCGCC	2	12	1094981	1094992	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338732951
345	NC_015713	AGTAAA	2	12	1097722	1097733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338732953
346	NC_015713	CGTCAA	2	12	1098196	1098207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338732953
347	NC_015713	GAAAAA	2	12	1101803	1101814	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338732956
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455	NC_015713	AGATTG	2	12	1486447	1486458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338733330
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458	NC_015713	CAATGA	2	12	1495681	1495692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338733334
459	NC_015713	CGTGTC	2	12	1496657	1496668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338733335
460	NC_015713	ATGAGG	2	12	1500889	1500900	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338733339
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483	NC_015713	CGATAA	2	12	1541961	1541972	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338733370
484	NC_015713	TTCCAA	2	12	1542318	1542329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338733370
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487	NC_015713	CACCAA	2	12	1554037	1554048	50 %	0 %	0 %	50 %	338733380
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