MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 1658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	TTTGA	2	10	1797	1806	20 %	60 %	20 %	0 %	338731898
2	NC_015713	AATGA	2	10	2094	2103	60 %	20 %	20 %	0 %	338731898
3	NC_015713	ATGAA	2	10	4982	4991	60 %	20 %	20 %	0 %	338731900
4	NC_015713	AACCC	2	10	6119	6128	40 %	0 %	0 %	60 %	338731900
5	NC_015713	ATGCA	2	10	7378	7387	40 %	20 %	20 %	20 %	338731900
6	NC_015713	GCAAT	2	10	9787	9796	40 %	20 %	20 %	20 %	338731903
7	NC_015713	CAATT	2	10	10374	10383	40 %	40 %	0 %	20 %	338731905
8	NC_015713	CAAGT	2	10	13555	13564	40 %	20 %	20 %	20 %	338731907
9	NC_015713	TGAGA	2	10	14345	14354	40 %	20 %	40 %	0 %	338731911
10	NC_015713	AAATC	2	10	14869	14878	60 %	20 %	0 %	20 %	338731912
11	NC_015713	TTTAA	2	10	16047	16056	40 %	60 %	0 %	0 %	338731913
12	NC_015713	GAATG	2	10	16441	16450	40 %	20 %	40 %	0 %	338731913
13	NC_015713	GCTCG	2	10	19656	19665	0 %	20 %	40 %	40 %	338731916
14	NC_015713	TTTGA	2	10	22424	22433	20 %	60 %	20 %	0 %	338731918
15	NC_015713	CATTT	2	10	23558	23567	20 %	60 %	0 %	20 %	338731918
16	NC_015713	GCGCG	2	10	25304	25313	0 %	0 %	60 %	40 %	338731919
17	NC_015713	AGCAA	2	10	25798	25807	60 %	0 %	20 %	20 %	338731919
18	NC_015713	CACTC	2	10	25889	25898	20 %	20 %	0 %	60 %	338731919
19	NC_015713	ATTTC	2	10	28641	28650	20 %	60 %	0 %	20 %	338731922
20	NC_015713	CACAA	2	10	29932	29941	60 %	0 %	0 %	40 %	338731924
21	NC_015713	CGAAG	2	10	30204	30213	40 %	0 %	40 %	20 %	338731925
22	NC_015713	TCTTT	2	10	30378	30387	0 %	80 %	0 %	20 %	338731925
23	NC_015713	TTGAT	2	10	31136	31145	20 %	60 %	20 %	0 %	338731925
24	NC_015713	TTCTT	2	10	31920	31929	0 %	80 %	0 %	20 %	338731926
25	NC_015713	TTTTG	2	10	33210	33219	0 %	80 %	20 %	0 %	338731926
26	NC_015713	AAAGT	2	10	35184	35193	60 %	20 %	20 %	0 %	338731929
27	NC_015713	TGAGA	2	10	35768	35777	40 %	20 %	40 %	0 %	338731930
28	NC_015713	AAAGA	2	10	36650	36659	80 %	0 %	20 %	0 %	338731931
29	NC_015713	GTGTT	2	10	40142	40151	0 %	60 %	40 %	0 %	338731934
30	NC_015713	TCTTT	2	10	40545	40554	0 %	80 %	0 %	20 %	338731934
31	NC_015713	TTTTC	2	10	43950	43959	0 %	80 %	0 %	20 %	338731935
32	NC_015713	ACTTC	2	10	45212	45221	20 %	40 %	0 %	40 %	338731937
33	NC_015713	AAGCC	2	10	46226	46235	40 %	0 %	20 %	40 %	338731938
34	NC_015713	ATCTT	2	10	47393	47402	20 %	60 %	0 %	20 %	338731940
35	NC_015713	TCTTG	2	10	47738	47747	0 %	60 %	20 %	20 %	338731940
36	NC_015713	GGTGA	2	10	48515	48524	20 %	20 %	60 %	0 %	338731941
37	NC_015713	CTTTT	2	10	57223	57232	0 %	80 %	0 %	20 %	338731947
38	NC_015713	GAATC	2	10	57298	57307	40 %	20 %	20 %	20 %	338731947
39	NC_015713	AAGGA	2	10	60566	60575	60 %	0 %	40 %	0 %	338731950
40	NC_015713	GTGAT	2	10	61177	61186	20 %	40 %	40 %	0 %	338731951
41	NC_015713	AAAAG	2	10	61864	61873	80 %	0 %	20 %	0 %	338731952
42	NC_015713	AAATA	2	10	63139	63148	80 %	20 %	0 %	0 %	338731956
43	NC_015713	TCAGA	2	10	64798	64807	40 %	20 %	20 %	20 %	338731957
44	NC_015713	ATAAA	2	10	65415	65424	80 %	20 %	0 %	0 %	338731958
45	NC_015713	GTTGA	2	10	69334	69343	20 %	40 %	40 %	0 %	338731959
46	NC_015713	TTGAG	2	10	69596	69605	20 %	40 %	40 %	0 %	338731959
47	NC_015713	TGGGT	2	10	70187	70196	0 %	40 %	60 %	0 %	338731959
48	NC_015713	AGCGA	2	10	71753	71762	40 %	0 %	40 %	20 %	338731961
49	NC_015713	GATTC	2	10	73670	73679	20 %	40 %	20 %	20 %	338731963
50	NC_015713	AGGAA	2	10	74058	74067	60 %	0 %	40 %	0 %	338731963
51	NC_015713	TGTTC	2	10	74144	74153	0 %	60 %	20 %	20 %	338731963
52	NC_015713	GAAAC	2	10	76038	76047	60 %	0 %	20 %	20 %	338731964
53	NC_015713	ATTTC	2	10	78929	78938	20 %	60 %	0 %	20 %	338731968
54	NC_015713	TGAAA	2	10	79120	79129	60 %	20 %	20 %	0 %	338731968
55	NC_015713	GGAAA	2	10	80571	80580	60 %	0 %	40 %	0 %	338731969
56	NC_015713	AGCAA	2	10	81284	81293	60 %	0 %	20 %	20 %	338731970
57	NC_015713	GAAAT	2	10	81567	81576	60 %	20 %	20 %	0 %	338731970
58	NC_015713	GGAAA	2	10	85179	85188	60 %	0 %	40 %	0 %	338731972
59	NC_015713	ATACA	2	10	90317	90326	60 %	20 %	0 %	20 %	338731972
60	NC_015713	CCTTC	2	10	90720	90729	0 %	40 %	0 %	60 %	338731972
61	NC_015713	AGCCA	2	10	92198	92207	40 %	0 %	20 %	40 %	338731974
62	NC_015713	CCACA	2	10	94405	94414	40 %	0 %	0 %	60 %	338731977
63	NC_015713	CAAAG	2	10	95608	95617	60 %	0 %	20 %	20 %	338731978
64	NC_015713	TTTGG	2	10	97197	97206	0 %	60 %	40 %	0 %	338731980
65	NC_015713	TTCTT	2	10	101152	101161	0 %	80 %	0 %	20 %	338731984
66	NC_015713	CTTGA	2	10	101986	101995	20 %	40 %	20 %	20 %	338731984
67	NC_015713	AGACA	2	10	102111	102120	60 %	0 %	20 %	20 %	338731984
68	NC_015713	GCTTT	2	10	106059	106068	0 %	60 %	20 %	20 %	338731988
69	NC_015713	CCCTT	2	10	106841	106850	0 %	40 %	0 %	60 %	338731989
70	NC_015713	CTTGG	2	10	108053	108062	0 %	40 %	40 %	20 %	338731990
71	NC_015713	AAAAG	2	10	109532	109541	80 %	0 %	20 %	0 %	338731991
72	NC_015713	GAATT	2	10	111264	111273	40 %	40 %	20 %	0 %	338731991
73	NC_015713	CGAAG	2	10	111790	111799	40 %	0 %	40 %	20 %	338731992
74	NC_015713	CTTCT	2	10	111906	111915	0 %	60 %	0 %	40 %	338731992
75	NC_015713	TTGGC	2	10	113142	113151	0 %	40 %	40 %	20 %	338731994
76	NC_015713	GAAGG	2	10	114208	114217	40 %	0 %	60 %	0 %	338731994
77	NC_015713	ATGAG	2	10	114389	114398	40 %	20 %	40 %	0 %	338731994
78	NC_015713	TGAAG	2	10	114631	114640	40 %	20 %	40 %	0 %	338731995
79	NC_015713	TTCCC	2	10	115815	115824	0 %	40 %	0 %	60 %	338731995
80	NC_015713	CAAAA	2	10	116769	116778	80 %	0 %	0 %	20 %	338731995
81	NC_015713	CTTAC	2	10	116937	116946	20 %	40 %	0 %	40 %	338731996
82	NC_015713	CCCTT	2	10	116969	116978	0 %	40 %	0 %	60 %	338731996
83	NC_015713	GCTCT	2	10	118948	118957	0 %	40 %	20 %	40 %	338731997
84	NC_015713	TCAAC	2	10	126682	126691	40 %	20 %	0 %	40 %	338732007
85	NC_015713	TTTGG	2	10	128766	128775	0 %	60 %	40 %	0 %	338732010
86	NC_015713	TGAGA	2	10	129361	129370	40 %	20 %	40 %	0 %	338732010
87	NC_015713	CTTTT	2	10	130248	130257	0 %	80 %	0 %	20 %	338732010
88	NC_015713	TCAAG	2	10	131126	131135	40 %	20 %	20 %	20 %	338732010
89	NC_015713	ACGTT	2	10	132488	132497	20 %	40 %	20 %	20 %	338732011
90	NC_015713	AGTTG	2	10	132749	132758	20 %	40 %	40 %	0 %	338732011
91	NC_015713	TCTGC	2	10	133756	133765	0 %	40 %	20 %	40 %	338732011
92	NC_015713	ATTGC	2	10	135467	135476	20 %	40 %	20 %	20 %	338732012
93	NC_015713	ATTCG	2	10	135740	135749	20 %	40 %	20 %	20 %	338732012
94	NC_015713	GTTTT	2	10	136328	136337	0 %	80 %	20 %	0 %	338732013
95	NC_015713	TTCAG	2	10	137743	137752	20 %	40 %	20 %	20 %	338732014
96	NC_015713	TTTGC	2	10	139370	139379	0 %	60 %	20 %	20 %	338732016
97	NC_015713	GAAGA	2	10	140342	140351	60 %	0 %	40 %	0 %	338732017
98	NC_015713	CGATG	2	10	140853	140862	20 %	20 %	40 %	20 %	338732017
99	NC_015713	AAACA	2	10	140985	140994	80 %	0 %	0 %	20 %	338732017
100	NC_015713	GCGAT	2	10	142793	142802	20 %	20 %	40 %	20 %	338732020
101	NC_015713	CGACA	2	10	144459	144468	40 %	0 %	20 %	40 %	338732021
102	NC_015713	GATAA	2	10	146568	146577	60 %	20 %	20 %	0 %	338732025
103	NC_015713	CTAAC	2	10	147937	147946	40 %	20 %	0 %	40 %	338732028
104	NC_015713	GTTTG	2	10	149244	149253	0 %	60 %	40 %	0 %	338732031
105	NC_015713	AGTGA	2	10	149911	149920	40 %	20 %	40 %	0 %	338732031
106	NC_015713	AGATA	2	10	151708	151717	60 %	20 %	20 %	0 %	338732032
107	NC_015713	TCCAT	2	10	153961	153970	20 %	40 %	0 %	40 %	338732035
108	NC_015713	TTTCT	2	10	157648	157657	0 %	80 %	0 %	20 %	338732039
109	NC_015713	CTCAT	2	10	158477	158486	20 %	40 %	0 %	40 %	338732040
110	NC_015713	CAGAT	2	10	158657	158666	40 %	20 %	20 %	20 %	338732040
111	NC_015713	GTGGA	2	10	159313	159322	20 %	20 %	60 %	0 %	338732041
112	NC_015713	GGCAC	2	10	163443	163452	20 %	0 %	40 %	40 %	338732044
113	NC_015713	TCTTT	2	10	166718	166727	0 %	80 %	0 %	20 %	338732048
114	NC_015713	GTGAA	2	10	167676	167685	40 %	20 %	40 %	0 %	338732049
115	NC_015713	ATCTT	2	10	168119	168128	20 %	60 %	0 %	20 %	338732049
116	NC_015713	TGATT	2	10	169280	169289	20 %	60 %	20 %	0 %	338732051
117	NC_015713	TGGGC	2	10	169321	169330	0 %	20 %	60 %	20 %	338732051
118	NC_015713	GCTTT	2	10	170065	170074	0 %	60 %	20 %	20 %	338732052
119	NC_015713	AAAAG	2	10	171641	171650	80 %	0 %	20 %	0 %	338732057
120	NC_015713	TCGAT	2	10	172741	172750	20 %	40 %	20 %	20 %	338732059
121	NC_015713	CTTTG	2	10	173553	173562	0 %	60 %	20 %	20 %	338732060
122	NC_015713	AAGAA	2	10	175440	175449	80 %	0 %	20 %	0 %	338732061
123	NC_015713	GGATT	2	10	176973	176982	20 %	40 %	40 %	0 %	338732061
124	NC_015713	TGATT	2	10	177920	177929	20 %	60 %	20 %	0 %	338732062
125	NC_015713	TTTGC	2	10	179674	179683	0 %	60 %	20 %	20 %	338732064
126	NC_015713	AAAGC	2	10	181463	181472	60 %	0 %	20 %	20 %	338732065
127	NC_015713	TGGGA	2	10	184524	184533	20 %	20 %	60 %	0 %	338732067
128	NC_015713	TATCT	2	10	184779	184788	20 %	60 %	0 %	20 %	338732067
129	NC_015713	CGAAA	2	10	188810	188819	60 %	0 %	20 %	20 %	338732073
130	NC_015713	TTTGA	2	10	190574	190583	20 %	60 %	20 %	0 %	338732074
131	NC_015713	TCCGA	2	10	193392	193401	20 %	20 %	20 %	40 %	338732078
132	NC_015713	CAATA	2	10	196968	196977	60 %	20 %	0 %	20 %	338732079
133	NC_015713	GCCTT	2	10	206151	206160	0 %	40 %	20 %	40 %	338732092
134	NC_015713	CAAGA	2	10	209402	209411	60 %	0 %	20 %	20 %	338732095
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253	NC_015713	GGATT	2	10	384086	384095	20 %	40 %	40 %	0 %	338732283
254	NC_015713	TCGGG	2	10	389130	389139	0 %	20 %	60 %	20 %	338732285
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262	NC_015713	CTTTT	2	10	396780	396789	0 %	80 %	0 %	20 %	338732291
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