MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	GA	3	6	940	945	50 %	0 %	50 %	0 %	338731760
2	NC_015710	CT	3	6	1118	1123	0 %	50 %	0 %	50 %	338731761
3	NC_015710	GA	3	6	1179	1184	50 %	0 %	50 %	0 %	338731761
4	NC_015710	AG	3	6	2522	2527	50 %	0 %	50 %	0 %	338731762
5	NC_015710	GA	3	6	2798	2803	50 %	0 %	50 %	0 %	338731762
6	NC_015710	TC	3	6	3135	3140	0 %	50 %	0 %	50 %	338731763
7	NC_015710	GA	3	6	3459	3464	50 %	0 %	50 %	0 %	338731763
8	NC_015710	TA	3	6	3613	3618	50 %	50 %	0 %	0 %	338731763
9	NC_015710	TC	3	6	3682	3687	0 %	50 %	0 %	50 %	338731763
10	NC_015710	AT	3	6	3882	3887	50 %	50 %	0 %	0 %	338731763
11	NC_015710	GA	3	6	4596	4601	50 %	0 %	50 %	0 %	338731765
12	NC_015710	AT	3	6	5245	5250	50 %	50 %	0 %	0 %	338731765
13	NC_015710	AG	3	6	6917	6922	50 %	0 %	50 %	0 %	338731767
14	NC_015710	TC	3	6	8544	8549	0 %	50 %	0 %	50 %	338731770
15	NC_015710	AG	3	6	8569	8574	50 %	0 %	50 %	0 %	338731770
16	NC_015710	GA	3	6	9029	9034	50 %	0 %	50 %	0 %	338731771
17	NC_015710	TC	3	6	9714	9719	0 %	50 %	0 %	50 %	338731771
18	NC_015710	TC	3	6	10752	10757	0 %	50 %	0 %	50 %	338731772
19	NC_015710	TC	3	6	11242	11247	0 %	50 %	0 %	50 %	338731773
20	NC_015710	AG	3	6	11325	11330	50 %	0 %	50 %	0 %	338731773
21	NC_015710	TC	3	6	11697	11702	0 %	50 %	0 %	50 %	338731774
22	NC_015710	AT	3	6	12546	12551	50 %	50 %	0 %	0 %	338731776
23	NC_015710	GA	3	6	13778	13783	50 %	0 %	50 %	0 %	338731778
24	NC_015710	TA	4	8	15144	15151	50 %	50 %	0 %	0 %	338731780
25	NC_015710	GT	3	6	15330	15335	0 %	50 %	50 %	0 %	338731780
26	NC_015710	AG	3	6	15820	15825	50 %	0 %	50 %	0 %	338731780
27	NC_015710	AG	3	6	17186	17191	50 %	0 %	50 %	0 %	338731781
28	NC_015710	AG	3	6	17315	17320	50 %	0 %	50 %	0 %	338731781
29	NC_015710	TC	3	6	17667	17672	0 %	50 %	0 %	50 %	338731782
30	NC_015710	AT	3	6	17872	17877	50 %	50 %	0 %	0 %	338731782
31	NC_015710	GA	3	6	18289	18294	50 %	0 %	50 %	0 %	338731782
32	NC_015710	CT	3	6	18461	18466	0 %	50 %	0 %	50 %	338731782
33	NC_015710	TC	4	8	19448	19455	0 %	50 %	0 %	50 %	338731783
34	NC_015710	AG	3	6	19592	19597	50 %	0 %	50 %	0 %	338731783
35	NC_015710	TA	3	6	20087	20092	50 %	50 %	0 %	0 %	338731784
36	NC_015710	AG	3	6	21444	21449	50 %	0 %	50 %	0 %	338731786
37	NC_015710	GC	3	6	21529	21534	0 %	0 %	50 %	50 %	338731786
38	NC_015710	TC	3	6	21943	21948	0 %	50 %	0 %	50 %	338731786
39	NC_015710	GA	3	6	22155	22160	50 %	0 %	50 %	0 %	338731786
40	NC_015710	AG	3	6	23247	23252	50 %	0 %	50 %	0 %	338731788
41	NC_015710	GA	3	6	24987	24992	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
42	NC_015710	CA	3	6	25661	25666	50 %	0 %	0 %	50 %	338731790
43	NC_015710	TA	3	6	26058	26063	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
44	NC_015710	GA	4	8	26099	26106	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
45	NC_015710	AT	3	6	26129	26134	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
46	NC_015710	GC	3	6	26366	26371	0 %	0 %	50 %	50 %	338731790
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49	NC_015710	GA	3	6	27467	27472	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
50	NC_015710	AG	3	6	28637	28642	50 %	0 %	50 %	0 %	338731793
51	NC_015710	TA	3	6	28928	28933	50 %	50 %	0 %	0 %	338731794
52	NC_015710	AG	3	6	29179	29184	50 %	0 %	50 %	0 %	338731794
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55	NC_015710	GA	3	6	33138	33143	50 %	0 %	50 %	0 %	338731800
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57	NC_015710	AG	3	6	34619	34624	50 %	0 %	50 %	0 %	338731802
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61	NC_015710	GA	3	6	36166	36171	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
62	NC_015710	AG	4	8	37074	37081	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
63	NC_015710	TA	3	6	37175	37180	50 %	50 %	0 %	0 %	338731804
64	NC_015710	GA	3	6	37688	37693	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
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66	NC_015710	TC	3	6	38857	38862	0 %	50 %	0 %	50 %	338731804
67	NC_015710	AG	3	6	39028	39033	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
68	NC_015710	CT	4	8	39054	39061	0 %	50 %	0 %	50 %	338731804
69	NC_015710	AG	3	6	39145	39150	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
70	NC_015710	GA	3	6	40417	40422	50 %	0 %	50 %	0 %	338731804
71	NC_015710	TA	5	10	41828	41837	50 %	50 %	0 %	0 %	338731807
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80	NC_015710	AT	3	6	44572	44577	50 %	50 %	0 %	0 %	338731810
81	NC_015710	AG	3	6	44599	44604	50 %	0 %	50 %	0 %	338731810
82	NC_015710	AG	3	6	45320	45325	50 %	0 %	50 %	0 %	338731811
83	NC_015710	CT	3	6	46115	46120	0 %	50 %	0 %	50 %	338731811
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91	NC_015710	CT	3	6	51738	51743	0 %	50 %	0 %	50 %	338731815
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93	NC_015710	GA	3	6	52390	52395	50 %	0 %	50 %	0 %	338731815
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111	NC_015710	CT	3	6	61446	61451	0 %	50 %	0 %	50 %	338731822
112	NC_015710	CT	3	6	61472	61477	0 %	50 %	0 %	50 %	338731822
113	NC_015710	CT	3	6	63628	63633	0 %	50 %	0 %	50 %	338731826
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.